MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC33

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003921	TGC	2	6	488	493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264186
2	NC_003921	GCG	2	6	564	569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264186
3	NC_003921	CAC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264186
4	NC_003921	TGG	2	6	789	794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264186
5	NC_003921	CAT	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264186
6	NC_003921	GCC	3	9	916	924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264186
7	NC_003921	GTT	2	6	1107	1112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264186
8	NC_003921	CTT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264186
9	NC_003921	CGG	2	6	1177	1182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264186
10	NC_003921	TGG	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264186
11	NC_003921	CTG	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264186
12	NC_003921	TGA	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264188
13	NC_003921	GCC	2	6	1428	1433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264188
14	NC_003921	CAG	2	6	1478	1483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264188
15	NC_003921	GTT	2	6	1492	1497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264188
16	NC_003921	CTT	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264188
17	NC_003921	GGT	2	6	1555	1560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264188
18	NC_003921	CCA	2	6	1635	1640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264188
19	NC_003921	CCT	2	6	1805	1810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21264188
20	NC_003921	CCG	4	12	1814	1825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264188
21	NC_003921	CAA	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21264187
22	NC_003921	GAA	2	6	2133	2138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264189
23	NC_003921	ATC	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264189
24	NC_003921	CGG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264189
25	NC_003921	GGA	3	9	2307	2315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21264189
26	NC_003921	CCG	2	6	2319	2324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264189
27	NC_003921	AAG	2	6	2329	2334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264189
28	NC_003921	CTG	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264189
29	NC_003921	GAA	2	6	2690	2695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264190
30	NC_003921	CGA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264190
31	NC_003921	ATC	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264190
32	NC_003921	CCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264190
33	NC_003921	CAG	2	6	3030	3035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264190
34	NC_003921	CGG	2	6	3176	3181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264190
35	NC_003921	TGG	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264191
36	NC_003921	CTG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264191
37	NC_003921	CGG	2	6	3375	3380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264191
38	NC_003921	TGA	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264191
39	NC_003921	GCG	3	9	3416	3424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264191
40	NC_003921	GCC	2	6	3504	3509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264191
41	NC_003921	GTG	3	9	3518	3526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264191
42	NC_003921	GCC	2	6	3624	3629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264191
43	NC_003921	CCG	2	6	3777	3782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264191
44	NC_003921	TGC	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264192
45	NC_003921	GGC	2	6	4121	4126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264192
46	NC_003921	CCA	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264192
47	NC_003921	GAA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264192
48	NC_003921	GGC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264192
49	NC_003921	TGT	2	6	4279	4284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264192
50	NC_003921	TCG	2	6	4828	4833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264193
51	NC_003921	GGT	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264193
52	NC_003921	CAG	3	9	4902	4910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264193
53	NC_003921	GCG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264193
54	NC_003921	CGT	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264193
55	NC_003921	CAG	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264193
56	NC_003921	TCC	2	6	5122	5127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21264193
57	NC_003921	CTG	2	6	5678	5683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264195
58	NC_003921	CGG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264196
59	NC_003921	CCT	2	6	6011	6016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21264196
60	NC_003921	GCG	2	6	6026	6031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264196
61	NC_003921	CAG	2	6	6047	6052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264196
62	NC_003921	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264197
63	NC_003921	TCC	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21264197
64	NC_003921	CTT	2	6	6304	6309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264197
65	NC_003921	AGC	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264197
66	NC_003921	GGC	2	6	6974	6979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264198
67	NC_003921	AAG	2	6	7119	7124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264198
68	NC_003921	GCA	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264198
69	NC_003921	CAC	2	6	7180	7185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264198
70	NC_003921	ACC	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264198
71	NC_003921	TGA	2	6	7282	7287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264198
72	NC_003921	GAA	2	6	7299	7304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264198
73	NC_003921	ATC	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264199
74	NC_003921	CGG	2	6	7525	7530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264199
75	NC_003921	TGA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264199
76	NC_003921	TCA	2	6	7601	7606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264199
77	NC_003921	ACT	2	6	7646	7651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264199
78	NC_003921	AGC	2	6	7679	7684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264199
79	NC_003921	GAA	2	6	7737	7742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264200
80	NC_003921	GTG	2	6	7750	7755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264200
81	NC_003921	CAA	2	6	7758	7763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21264200
82	NC_003921	ACG	2	6	7784	7789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264200
83	NC_003921	GAT	2	6	7806	7811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264200
84	NC_003921	GTG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264200
85	NC_003921	GTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264200
86	NC_003921	TGA	2	6	8071	8076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264200
87	NC_003921	GCG	2	6	8339	8344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264201
88	NC_003921	GTC	2	6	8353	8358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264201
89	NC_003921	GCG	2	6	8368	8373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264201
90	NC_003921	GCG	2	6	8388	8393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264201
91	NC_003921	TGC	3	9	8399	8407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264201
92	NC_003921	GTG	2	6	8434	8439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264201
93	NC_003921	GGC	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264201
94	NC_003921	GCG	2	6	8602	8607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264201
95	NC_003921	CCG	2	6	8732	8737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264201
96	NC_003921	CGG	2	6	8756	8761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264201
97	NC_003921	TCT	2	6	8874	8879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264201
98	NC_003921	CCG	2	6	9406	9411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264202
99	NC_003921	TCG	2	6	9467	9472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264202
100	NC_003921	CCA	3	9	9566	9574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264202
101	NC_003921	CGC	2	6	9581	9586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264202
102	NC_003921	TGG	2	6	9607	9612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264202
103	NC_003921	TGA	2	6	9617	9622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264202
104	NC_003921	CGG	2	6	9659	9664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264202
105	NC_003921	GCC	2	6	9793	9798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264202
106	NC_003921	GCG	2	6	9868	9873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264203
107	NC_003921	CCG	2	6	9889	9894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264203
108	NC_003921	GCT	2	6	9932	9937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264203
109	NC_003921	GGC	2	6	9974	9979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264203
110	NC_003921	CGT	2	6	9984	9989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264203
111	NC_003921	CAC	3	9	10013	10021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264203
112	NC_003921	CGT	3	9	10082	10090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264203
113	NC_003921	GGC	2	6	10098	10103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264203
114	NC_003921	GCT	3	9	10130	10138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264203
115	NC_003921	CTG	2	6	10200	10205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264203
116	NC_003921	GTC	2	6	10209	10214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264203
117	NC_003921	TGC	2	6	10255	10260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264203
118	NC_003921	TGC	2	6	10333	10338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264203
119	NC_003921	CCA	2	6	10339	10344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264203
120	NC_003921	CCG	2	6	10367	10372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264203
121	NC_003921	GCC	2	6	10419	10424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264203
122	NC_003921	CTT	2	6	10442	10447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264203
123	NC_003921	AGG	2	6	10450	10455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21264203
124	NC_003921	GCC	2	6	10501	10506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264204
125	NC_003921	TGG	2	6	10563	10568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264204
126	NC_003921	CTG	2	6	10572	10577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264204
127	NC_003921	CGC	2	6	10602	10607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264204
128	NC_003921	GCT	2	6	10610	10615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264204
129	NC_003921	GCG	2	6	10690	10695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264204
130	NC_003921	GGC	2	6	10724	10729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264204
131	NC_003921	ATG	2	6	10931	10936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264205
132	NC_003921	GAC	2	6	10939	10944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264205
133	NC_003921	CGC	2	6	10987	10992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264205
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135	NC_003921	GGC	2	6	11090	11095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264205
136	NC_003921	CGA	2	6	11236	11241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264205
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138	NC_003921	GAC	2	6	11607	11612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264206
139	NC_003921	GAT	2	6	11726	11731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264206
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246	NC_003921	CTG	2	6	21058	21063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264218
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250	NC_003921	GGA	2	6	21357	21362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21264218
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252	NC_003921	CAT	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264218
253	NC_003921	AAG	2	6	21706	21711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264218
254	NC_003921	CTG	2	6	21735	21740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264218
255	NC_003921	ACC	2	6	21751	21756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264218
256	NC_003921	CGC	2	6	21866	21871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264218
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258	NC_003921	CGC	2	6	22440	22445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264219
259	NC_003921	TCT	2	6	22529	22534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264219
260	NC_003921	CGC	2	6	22677	22682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264219
261	NC_003921	GGC	2	6	22716	22721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264219
262	NC_003921	GCA	2	6	22740	22745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264219
263	NC_003921	CGG	2	6	22757	22762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264219
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273	NC_003921	GTC	2	6	23425	23430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264219
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275	NC_003921	CAG	2	6	23632	23637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264219
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280	NC_003921	CAG	2	6	23920	23925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264219
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377	NC_003921	TGG	2	6	30229	30234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264224
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380	NC_003921	GCC	2	6	30476	30481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264224
381	NC_003921	AGC	2	6	31868	31873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264225
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383	NC_003921	CTG	2	6	31988	31993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264225
384	NC_003921	GCG	2	6	32018	32023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264225
385	NC_003921	TTG	2	6	32036	32041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264225
386	NC_003921	TTC	2	6	32066	32071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264225
387	NC_003921	GCC	2	6	32209	32214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264226
388	NC_003921	GGC	2	6	32232	32237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264226
389	NC_003921	TCG	2	6	32353	32358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264226
390	NC_003921	GCC	2	6	32359	32364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264226
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393	NC_003921	GCT	2	6	32560	32565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264226
394	NC_003921	CAG	2	6	32604	32609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264226
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414	NC_003921	CGC	2	6	33364	33369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264227
415	NC_003921	GCG	3	9	33478	33486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.