MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC33

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003921	GC	3	6	504	509	0 %	0 %	50 %	50 %	21264186
2	NC_003921	GC	3	6	1022	1027	0 %	0 %	50 %	50 %	21264186
3	NC_003921	GC	3	6	1690	1695	0 %	0 %	50 %	50 %	21264188
4	NC_003921	CT	3	6	1788	1793	0 %	50 %	0 %	50 %	21264188
5	NC_003921	GC	3	6	3480	3485	0 %	0 %	50 %	50 %	21264191
6	NC_003921	GC	3	6	3573	3578	0 %	0 %	50 %	50 %	21264191
7	NC_003921	TC	3	6	4600	4605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_003921	GC	3	6	4996	5001	0 %	0 %	50 %	50 %	21264193
9	NC_003921	CG	3	6	5824	5829	0 %	0 %	50 %	50 %	21264195
10	NC_003921	GC	3	6	5830	5835	0 %	0 %	50 %	50 %	21264195
11	NC_003921	GC	3	6	6345	6350	0 %	0 %	50 %	50 %	21264197
12	NC_003921	CA	3	6	6872	6877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003921	GC	3	6	8504	8509	0 %	0 %	50 %	50 %	21264201
14	NC_003921	GC	3	6	9015	9020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_003921	TA	5	10	9501	9510	50 %	50 %	0 %	0 %	21264202
16	NC_003921	TA	3	6	9517	9522	50 %	50 %	0 %	0 %	21264202
17	NC_003921	TA	5	10	9736	9745	50 %	50 %	0 %	0 %	21264202
18	NC_003921	GT	3	6	9851	9856	0 %	50 %	50 %	0 %	21264203
19	NC_003921	TA	5	10	10791	10800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003921	TA	5	10	10811	10820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003921	GA	3	6	11260	11265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003921	GC	3	6	11447	11452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003921	CG	3	6	11635	11640	0 %	0 %	50 %	50 %	21264206
24	NC_003921	GC	3	6	12780	12785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_003921	GT	3	6	15794	15799	0 %	50 %	50 %	0 %	21264207
26	NC_003921	GT	3	6	15890	15895	0 %	50 %	50 %	0 %	21264207
27	NC_003921	GC	3	6	16062	16067	0 %	0 %	50 %	50 %	21264207
28	NC_003921	CG	3	6	16074	16079	0 %	0 %	50 %	50 %	21264207
29	NC_003921	CG	3	6	17419	17424	0 %	0 %	50 %	50 %	21264210
30	NC_003921	GC	5	10	18294	18303	0 %	0 %	50 %	50 %	21264212
31	NC_003921	TA	3	6	18838	18843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003921	GT	3	6	19039	19044	0 %	50 %	50 %	0 %	21264214
33	NC_003921	CT	3	6	19235	19240	0 %	50 %	0 %	50 %	21264214
34	NC_003921	GC	3	6	19376	19381	0 %	0 %	50 %	50 %	21264214
35	NC_003921	CG	3	6	19862	19867	0 %	0 %	50 %	50 %	21264215
36	NC_003921	GT	3	6	21137	21142	0 %	50 %	50 %	0 %	21264218
37	NC_003921	CG	3	6	21621	21626	0 %	0 %	50 %	50 %	21264218
38	NC_003921	GC	3	6	21799	21804	0 %	0 %	50 %	50 %	21264218
39	NC_003921	CG	3	6	21990	21995	0 %	0 %	50 %	50 %	21264218
40	NC_003921	GC	3	6	22123	22128	0 %	0 %	50 %	50 %	21264218
41	NC_003921	GC	3	6	22176	22181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003921	GC	3	6	22444	22449	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
43	NC_003921	GC	3	6	22629	22634	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
44	NC_003921	CG	3	6	22701	22706	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
45	NC_003921	CG	5	10	23566	23575	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
46	NC_003921	CG	3	6	23655	23660	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
47	NC_003921	GC	3	6	23665	23670	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
48	NC_003921	GC	3	6	23791	23796	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
49	NC_003921	CG	3	6	23826	23831	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
50	NC_003921	GC	3	6	24006	24011	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
51	NC_003921	GC	3	6	24504	24509	0 %	0 %	50 %	50 %	21264219
52	NC_003921	GC	3	6	25297	25302	0 %	0 %	50 %	50 %	21264220
53	NC_003921	TG	3	6	25352	25357	0 %	50 %	50 %	0 %	21264220
54	NC_003921	GC	3	6	25587	25592	0 %	0 %	50 %	50 %	21264221
55	NC_003921	GC	3	6	25916	25921	0 %	0 %	50 %	50 %	21264222
56	NC_003921	CT	3	6	26048	26053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_003921	GC	3	6	26272	26277	0 %	0 %	50 %	50 %	21264223
58	NC_003921	CG	3	6	26285	26290	0 %	0 %	50 %	50 %	21264223
59	NC_003921	CG	3	6	26376	26381	0 %	0 %	50 %	50 %	21264223
60	NC_003921	CG	3	6	26643	26648	0 %	0 %	50 %	50 %	21264223
61	NC_003921	AG	3	6	27138	27143	50 %	0 %	50 %	0 %	21264223
62	NC_003921	GT	3	6	29924	29929	0 %	50 %	50 %	0 %	21264224
63	NC_003921	GT	3	6	30020	30025	0 %	50 %	50 %	0 %	21264224
64	NC_003921	GC	3	6	30192	30197	0 %	0 %	50 %	50 %	21264224
65	NC_003921	CG	3	6	30204	30209	0 %	0 %	50 %	50 %	21264224
66	NC_003921	GC	3	6	31748	31753	0 %	0 %	50 %	50 %	21264225
67	NC_003921	GC	3	6	31808	31813	0 %	0 %	50 %	50 %	21264225
68	NC_003921	GC	3	6	31908	31913	0 %	0 %	50 %	50 %	21264225
69	NC_003921	TA	3	6	32318	32323	50 %	50 %	0 %	0 %	21264226
70	NC_003921	GC	3	6	32427	32432	0 %	0 %	50 %	50 %	21264226
71	NC_003921	CG	3	6	32838	32843	0 %	0 %	50 %	50 %	21264227
72	NC_003921	GC	3	6	33132	33137	0 %	0 %	50 %	50 %	21264227
73	NC_003921	CG	3	6	33240	33245	0 %	0 %	50 %	50 %	21264227
74	NC_003921	TG	3	6	33358	33363	0 %	50 %	50 %	0 %	21264227
75	NC_003921	TG	3	6	33630	33635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.