MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 4675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003919	GCCTG	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	21240775
2	NC_003919	ACCAC	2	10	1264	1273	40 %	0 %	0 %	60 %	21240775
3	NC_003919	GTGGA	2	10	4012	4021	20 %	20 %	60 %	0 %	21240777
4	NC_003919	TGCGC	2	10	4135	4144	0 %	20 %	40 %	40 %	21240777
5	NC_003919	GGCGC	2	10	5607	5616	0 %	0 %	60 %	40 %	21240778
6	NC_003919	GAGCG	2	10	8155	8164	20 %	0 %	60 %	20 %	21240779
7	NC_003919	CGGCC	2	10	8206	8215	0 %	0 %	40 %	60 %	21240779
8	NC_003919	CCGGC	2	10	8459	8468	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_003919	CAACA	2	10	9512	9521	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_003919	CACTG	2	10	11087	11096	20 %	20 %	20 %	40 %	21240782
11	NC_003919	CAACA	2	10	13405	13414	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_003919	GCGCC	2	10	14725	14734	0 %	0 %	40 %	60 %	21240787
13	NC_003919	GCACC	2	10	14753	14762	20 %	0 %	20 %	60 %	21240787
14	NC_003919	CAGCG	2	10	15734	15743	20 %	0 %	40 %	40 %	21240788
15	NC_003919	AGAGC	2	10	17059	17068	40 %	0 %	40 %	20 %	21240789
16	NC_003919	CAAGT	2	10	17319	17328	40 %	20 %	20 %	20 %	21240789
17	NC_003919	CCGCT	2	10	19214	19223	0 %	20 %	20 %	60 %	21240791
18	NC_003919	GCGCT	2	10	20272	20281	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_003919	GGTCG	2	10	20506	20515	0 %	20 %	60 %	20 %	21240793
20	NC_003919	CTGCC	2	10	23138	23147	0 %	20 %	20 %	60 %	21240796
21	NC_003919	TGCGC	2	10	26661	26670	0 %	20 %	40 %	40 %	21240798
22	NC_003919	GCCCG	2	10	27997	28006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_003919	TGTCA	2	10	30026	30035	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003919	ACGTG	2	10	30195	30204	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003919	CGTGC	2	10	30952	30961	0 %	20 %	40 %	40 %	21240802
26	NC_003919	CTGCG	2	10	31542	31551	0 %	20 %	40 %	40 %	21240802
27	NC_003919	CGCAC	2	10	33980	33989	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_003919	TGCGT	2	10	34066	34075	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003919	CGGCG	2	10	34556	34565	0 %	0 %	60 %	40 %	21240804
30	NC_003919	CCAGC	2	10	34674	34683	20 %	0 %	20 %	60 %	21240804
31	NC_003919	TGCGC	2	10	36570	36579	0 %	20 %	40 %	40 %	21240805
32	NC_003919	GCCGC	2	10	36667	36676	0 %	0 %	40 %	60 %	21240805
33	NC_003919	CGCAG	2	10	41642	41651	20 %	0 %	40 %	40 %	21240807
34	NC_003919	CACCG	2	10	41751	41760	20 %	0 %	20 %	60 %	21240807
35	NC_003919	CGCTG	2	10	42950	42959	0 %	20 %	40 %	40 %	21240807
36	NC_003919	ACACC	2	10	43307	43316	40 %	0 %	0 %	60 %	21240807
37	NC_003919	GCGCA	2	10	46647	46656	20 %	0 %	40 %	40 %	21240811
38	NC_003919	CGGCG	2	10	47024	47033	0 %	0 %	60 %	40 %	21240811
39	NC_003919	AGCGC	2	10	48774	48783	20 %	0 %	40 %	40 %	21240813
40	NC_003919	ATGCA	2	10	49155	49164	40 %	20 %	20 %	20 %	21240813
41	NC_003919	TTGCC	2	10	50633	50642	0 %	40 %	20 %	40 %	21240815
42	NC_003919	CAGTT	2	10	51223	51232	20 %	40 %	20 %	20 %	21240815
43	NC_003919	TCGCT	2	10	51522	51531	0 %	40 %	20 %	40 %	21240816
44	NC_003919	TCTGC	2	10	52928	52937	0 %	40 %	20 %	40 %	21240817
45	NC_003919	CGGTC	2	10	54729	54738	0 %	20 %	40 %	40 %	21240818
46	NC_003919	GCGTC	2	10	55042	55051	0 %	20 %	40 %	40 %	21240818
47	NC_003919	ATGGC	2	10	55109	55118	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003919	GACGC	2	10	55127	55136	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_003919	GCGCG	2	10	55700	55709	0 %	0 %	60 %	40 %	21240819
50	NC_003919	GCCAC	2	10	56064	56073	20 %	0 %	20 %	60 %	21240819
51	NC_003919	GCCAG	2	10	56522	56531	20 %	0 %	40 %	40 %	77748501
52	NC_003919	ACCAG	2	10	59236	59245	40 %	0 %	20 %	40 %	21240822
53	NC_003919	GGCCA	2	10	59810	59819	20 %	0 %	40 %	40 %	21240823
54	NC_003919	CACCG	2	10	62465	62474	20 %	0 %	20 %	60 %	21240825
55	NC_003919	AGATC	2	10	63289	63298	40 %	20 %	20 %	20 %	21240825
56	NC_003919	GCGCA	2	10	63501	63510	20 %	0 %	40 %	40 %	21240825
57	NC_003919	GGCCG	2	10	64284	64293	0 %	0 %	60 %	40 %	21240826
58	NC_003919	CCAAG	2	10	64952	64961	40 %	0 %	20 %	40 %	21240826
59	NC_003919	ATCGC	2	10	66175	66184	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_003919	GCCGC	2	10	66643	66652	0 %	0 %	40 %	60 %	21240828
61	NC_003919	GGCCC	2	10	67531	67540	0 %	0 %	40 %	60 %	21240829
62	NC_003919	CCAGC	2	10	68752	68761	20 %	0 %	20 %	60 %	21240830
63	NC_003919	AGCAC	2	10	69360	69369	40 %	0 %	20 %	40 %	21240830
64	NC_003919	CAGCG	2	10	70089	70098	20 %	0 %	40 %	40 %	21240831
65	NC_003919	CTGCC	2	10	71301	71310	0 %	20 %	20 %	60 %	21240831
66	NC_003919	AAGCC	2	10	71832	71841	40 %	0 %	20 %	40 %	21240832
67	NC_003919	GCCAG	2	10	72323	72332	20 %	0 %	40 %	40 %	21240833
68	NC_003919	CACGG	2	10	73491	73500	20 %	0 %	40 %	40 %	21240833
69	NC_003919	GTTGC	2	10	74293	74302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_003919	CAGCT	2	10	74788	74797	20 %	20 %	20 %	40 %	21240834
71	NC_003919	GCGCA	2	10	77452	77461	20 %	0 %	40 %	40 %	21240837
72	NC_003919	AGCCG	2	10	77626	77635	20 %	0 %	40 %	40 %	21240838
73	NC_003919	CAGAT	2	10	78722	78731	40 %	20 %	20 %	20 %	21240840
74	NC_003919	TGCCC	2	10	79038	79047	0 %	20 %	20 %	60 %	21240840
75	NC_003919	GTTGC	2	10	80383	80392	0 %	40 %	40 %	20 %	21240842
76	NC_003919	CTTGG	2	10	81393	81402	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_003919	ACGCA	2	10	81414	81423	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_003919	GCCGG	2	10	81426	81435	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_003919	CGTGG	2	10	82144	82153	0 %	20 %	60 %	20 %	21240843
80	NC_003919	GGCAT	2	10	84218	84227	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003919	ACTCA	2	10	84611	84620	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_003919	CTGTG	2	10	84662	84671	0 %	40 %	40 %	20 %	21240845
83	NC_003919	CACCT	2	10	84765	84774	20 %	20 %	0 %	60 %	21240845
84	NC_003919	CGCTG	2	10	84912	84921	0 %	20 %	40 %	40 %	21240845
85	NC_003919	GCACG	2	10	85203	85212	20 %	0 %	40 %	40 %	21240845
86	NC_003919	CAGCG	2	10	86916	86925	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_003919	CAACG	2	10	87027	87036	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_003919	TCTGC	2	10	87165	87174	0 %	40 %	20 %	40 %	21240847
89	NC_003919	CCAGG	2	10	88097	88106	20 %	0 %	40 %	40 %	77748503
90	NC_003919	CGGGT	2	10	89190	89199	0 %	20 %	60 %	20 %	77748503
91	NC_003919	CGGGC	2	10	89917	89926	0 %	0 %	60 %	40 %	77748503
92	NC_003919	GCGCA	2	10	90185	90194	20 %	0 %	40 %	40 %	77748503
93	NC_003919	GGCGT	2	10	91644	91653	0 %	20 %	60 %	20 %	21240849
94	NC_003919	GCCGA	2	10	92076	92085	20 %	0 %	40 %	40 %	21240850
95	NC_003919	CGGCG	2	10	92553	92562	0 %	0 %	60 %	40 %	21240850
96	NC_003919	GCGCC	3	15	93269	93283	0 %	0 %	40 %	60 %	21240850
97	NC_003919	CCTGC	2	10	95873	95882	0 %	20 %	20 %	60 %	77748504
98	NC_003919	TGGTG	2	10	97974	97983	0 %	40 %	60 %	0 %	21240852
99	NC_003919	GGCAC	2	10	99685	99694	20 %	0 %	40 %	40 %	21240854
100	NC_003919	GGCCG	2	10	100785	100794	0 %	0 %	60 %	40 %	21240856
101	NC_003919	CAATG	2	10	101929	101938	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_003919	CCGCA	2	10	103819	103828	20 %	0 %	20 %	60 %	21240859
103	NC_003919	GCCCA	2	10	105953	105962	20 %	0 %	20 %	60 %	21240862
104	NC_003919	GATCC	2	10	106480	106489	20 %	20 %	20 %	40 %	21240863
105	NC_003919	TGAAA	2	10	108852	108861	60 %	20 %	20 %	0 %	21240866
106	NC_003919	GTTGC	2	10	109744	109753	0 %	40 %	40 %	20 %	21240867
107	NC_003919	TGCCG	2	10	110944	110953	0 %	20 %	40 %	40 %	21240868
108	NC_003919	CTGGC	2	10	112622	112631	0 %	20 %	40 %	40 %	21240870
109	NC_003919	AAGTC	2	10	113976	113985	40 %	20 %	20 %	20 %	21240871
110	NC_003919	CGTCG	2	10	117759	117768	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_003919	CGCTG	2	10	118445	118454	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_003919	CGGCG	2	10	120028	120037	0 %	0 %	60 %	40 %	21240878
113	NC_003919	GTCCA	2	10	120377	120386	20 %	20 %	20 %	40 %	21240879
114	NC_003919	ACCAC	2	10	120606	120615	40 %	0 %	0 %	60 %	21240879
115	NC_003919	GCGTG	2	10	122396	122405	0 %	20 %	60 %	20 %	21240881
116	NC_003919	CGGCG	2	10	124194	124203	0 %	0 %	60 %	40 %	21240881
117	NC_003919	GCGCC	3	15	124563	124577	0 %	0 %	40 %	60 %	21240881
118	NC_003919	CATTG	2	10	126442	126451	20 %	40 %	20 %	20 %	21240883
119	NC_003919	TGGCC	2	10	128282	128291	0 %	20 %	40 %	40 %	21240884
120	NC_003919	TCCAG	2	10	129342	129351	20 %	20 %	20 %	40 %	21240885
121	NC_003919	CGCAG	2	10	129421	129430	20 %	0 %	40 %	40 %	21240885
122	NC_003919	CGGCG	2	10	129439	129448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_003919	ATCGC	2	10	131421	131430	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_003919	GCCAG	2	10	131587	131596	20 %	0 %	40 %	40 %	21240888
125	NC_003919	TGCGG	2	10	132237	132246	0 %	20 %	60 %	20 %	21240888
126	NC_003919	GCGCG	2	10	133529	133538	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
127	NC_003919	GCGCG	2	10	134006	134015	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
128	NC_003919	CGGGC	2	10	134625	134634	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
129	NC_003919	GGCGC	2	10	135369	135378	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
130	NC_003919	CGGCG	2	10	135759	135768	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
131	NC_003919	CGGCG	2	10	136301	136310	0 %	0 %	60 %	40 %	21240890
132	NC_003919	GCGCA	2	10	137703	137712	20 %	0 %	40 %	40 %	21240891
133	NC_003919	GGCAC	2	10	137909	137918	20 %	0 %	40 %	40 %	21240892
134	NC_003919	GCGCG	2	10	140420	140429	0 %	0 %	60 %	40 %	21240894
135	NC_003919	AGCCC	2	10	142097	142106	20 %	0 %	20 %	60 %	21240895
136	NC_003919	TGACC	2	10	143460	143469	20 %	20 %	20 %	40 %	21240896
137	NC_003919	GGCAC	2	10	145417	145426	20 %	0 %	40 %	40 %	21240897
138	NC_003919	GCCGC	2	10	146012	146021	0 %	0 %	40 %	60 %	21240898
139	NC_003919	GATGC	2	10	146137	146146	20 %	20 %	40 %	20 %	21240898
140	NC_003919	CAGCG	2	10	149439	149448	20 %	0 %	40 %	40 %	77748509
141	NC_003919	CACCG	2	10	149625	149634	20 %	0 %	20 %	60 %	77748509
142	NC_003919	GCCCG	2	10	150599	150608	0 %	0 %	40 %	60 %	77748509
143	NC_003919	GCGAT	2	10	151317	151326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_003919	GCTGC	2	10	151861	151870	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_003919	CATGA	2	10	151891	151900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_003919	GCAGA	2	10	152540	152549	40 %	0 %	40 %	20 %	77748510
147	NC_003919	TGGCG	2	10	154628	154637	0 %	20 %	60 %	20 %	21240905
148	NC_003919	GACTG	2	10	154828	154837	20 %	20 %	40 %	20 %	21240905
149	NC_003919	GACGG	2	10	157190	157199	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
150	NC_003919	GTCAG	2	10	160865	160874	20 %	20 %	40 %	20 %	21240911
151	NC_003919	TCGCC	2	10	161839	161848	0 %	20 %	20 %	60 %	21240912
152	NC_003919	AGCGC	2	10	163159	163168	20 %	0 %	40 %	40 %	21240914
153	NC_003919	GATCA	2	10	164045	164054	40 %	20 %	20 %	20 %	21240914
154	NC_003919	CGCTG	2	10	164857	164866	0 %	20 %	40 %	40 %	21240914
155	NC_003919	GCGCG	2	10	165187	165196	0 %	0 %	60 %	40 %	21240914
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158	NC_003919	GGCAC	2	10	166172	166181	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
159	NC_003919	GGCCT	2	10	166549	166558	0 %	20 %	40 %	40 %	21240915
160	NC_003919	ATGGC	2	10	167998	168007	20 %	20 %	40 %	20 %	21240916
161	NC_003919	GGGAG	2	10	169497	169506	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
162	NC_003919	CGACC	2	10	170844	170853	20 %	0 %	20 %	60 %	21240918
163	NC_003919	CCGCG	2	10	172426	172435	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
164	NC_003919	GGCCA	2	10	173750	173759	20 %	0 %	40 %	40 %	21240919
165	NC_003919	GTTGC	2	10	179805	179814	0 %	40 %	40 %	20 %	21240922
166	NC_003919	GTTTT	2	10	181966	181975	0 %	80 %	20 %	0 %	21240923
167	NC_003919	CTTAA	2	10	182103	182112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_003919	TGGAA	2	10	182734	182743	40 %	20 %	40 %	0 %	21240924
169	NC_003919	CGCTG	2	10	183623	183632	0 %	20 %	40 %	40 %	21240925
170	NC_003919	CCGCG	2	10	188712	188721	0 %	0 %	40 %	60 %	77748512
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172	NC_003919	CGGTG	2	10	192742	192751	0 %	20 %	60 %	20 %	77748513
173	NC_003919	GTGGC	2	10	195740	195749	0 %	20 %	60 %	20 %	21240932
174	NC_003919	TGCGC	2	10	196947	196956	0 %	20 %	40 %	40 %	21240933
175	NC_003919	GCGCC	2	10	197129	197138	0 %	0 %	40 %	60 %	21240933
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182	NC_003919	CCGCG	2	10	204579	204588	0 %	0 %	40 %	60 %	21240939
183	NC_003919	GGGCG	2	10	204670	204679	0 %	0 %	80 %	20 %	21240939
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185	NC_003919	GGGTC	2	10	205202	205211	0 %	20 %	60 %	20 %	21240940
186	NC_003919	GCGCC	2	10	207195	207204	0 %	0 %	40 %	60 %	21240942
187	NC_003919	CGAAG	2	10	208220	208229	40 %	0 %	40 %	20 %	21240943
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191	NC_003919	AGGGC	2	10	215514	215523	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
192	NC_003919	ACGGT	2	10	215922	215931	20 %	20 %	40 %	20 %	77748514
193	NC_003919	GCCGA	2	10	218621	218630	20 %	0 %	40 %	40 %	21240951
194	NC_003919	CTGGT	2	10	219092	219101	0 %	40 %	40 %	20 %	21240951
195	NC_003919	GCCAG	2	10	220911	220920	20 %	0 %	40 %	40 %	77748515
196	NC_003919	GGTGG	2	10	221203	221212	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
197	NC_003919	CCGAT	2	10	222215	222224	20 %	20 %	20 %	40 %	77748516
198	NC_003919	GGCCA	2	10	223895	223904	20 %	0 %	40 %	40 %	21240956
199	NC_003919	GCTGG	2	10	224167	224176	0 %	20 %	60 %	20 %	21240956
200	NC_003919	GCGCC	2	10	226317	226326	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
201	NC_003919	ACCAC	2	10	226424	226433	40 %	0 %	0 %	60 %	21240958
202	NC_003919	CGCAG	2	10	227018	227027	20 %	0 %	40 %	40 %	21240958
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223	NC_003919	GCCCG	2	10	241409	241418	0 %	0 %	40 %	60 %	21240969
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232	NC_003919	GCGCT	2	10	255000	255009	0 %	20 %	40 %	40 %	21240981
233	NC_003919	CGGCG	2	10	256635	256644	0 %	0 %	60 %	40 %	21240982
234	NC_003919	CGAGC	2	10	257214	257223	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
235	NC_003919	TGCCG	2	10	257305	257314	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
236	NC_003919	CAGCG	2	10	259044	259053	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
237	NC_003919	GGGCA	2	10	259455	259464	20 %	0 %	60 %	20 %	21240985
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239	NC_003919	GGCGC	2	10	262570	262579	0 %	0 %	60 %	40 %	21240988
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244	NC_003919	CGGGC	2	10	271417	271426	0 %	0 %	60 %	40 %	21240998
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248	NC_003919	GCAGC	2	10	275482	275491	20 %	0 %	40 %	40 %	21241000
249	NC_003919	CCGCG	2	10	276612	276621	0 %	0 %	40 %	60 %	21241001
250	NC_003919	ATCGC	2	10	278609	278618	20 %	20 %	20 %	40 %	21241003
251	NC_003919	CAAGG	2	10	280311	280320	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
252	NC_003919	GCCCA	2	10	282042	282051	20 %	0 %	20 %	60 %	21241008
253	NC_003919	GAGCC	2	10	282703	282712	20 %	0 %	40 %	40 %	21241008
254	NC_003919	GCATC	2	10	283080	283089	20 %	20 %	20 %	40 %	21241008
255	NC_003919	TTGCG	2	10	284333	284342	0 %	40 %	40 %	20 %	21241010
256	NC_003919	CCGCG	2	10	284754	284763	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
257	NC_003919	GCGAT	2	10	285171	285180	20 %	20 %	40 %	20 %	77748519
258	NC_003919	CGGTG	2	10	287712	287721	0 %	20 %	60 %	20 %	21241012
259	NC_003919	CACGC	3	15	291796	291810	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
260	NC_003919	GTGGC	2	10	294917	294926	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
261	NC_003919	CCGGC	2	10	295061	295070	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
262	NC_003919	CGGTG	2	10	295281	295290	0 %	20 %	60 %	20 %	21241022
263	NC_003919	GCATG	2	10	297681	297690	20 %	20 %	40 %	20 %	21241023
264	NC_003919	TCCGA	2	10	297781	297790	20 %	20 %	20 %	40 %	21241023
265	NC_003919	CTGGC	2	10	297928	297937	0 %	20 %	40 %	40 %	21241023
266	NC_003919	GGACG	2	10	299807	299816	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
267	NC_003919	GGTGC	2	10	301237	301246	0 %	20 %	60 %	20 %	21241027
268	NC_003919	AGCCA	2	10	301461	301470	40 %	0 %	20 %	40 %	21241027
269	NC_003919	TCCGG	2	10	301716	301725	0 %	20 %	40 %	40 %	21241027
270	NC_003919	CAGAT	2	10	301749	301758	40 %	20 %	20 %	20 %	21241027
271	NC_003919	CGCAG	2	10	301982	301991	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
272	NC_003919	CGCAC	2	10	303236	303245	20 %	0 %	20 %	60 %	21241028
273	NC_003919	TCGGC	2	10	303329	303338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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