MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 12359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003919	GATG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	21240775
2	NC_003919	CCCG	2	8	86	93	0 %	0 %	25 %	75 %	21240775
3	NC_003919	CGGT	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	21240775
4	NC_003919	CGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
5	NC_003919	CGCT	2	8	1167	1174	0 %	25 %	25 %	50 %	21240775
6	NC_003919	CGAT	2	8	3793	3800	25 %	25 %	25 %	25 %	21240777
7	NC_003919	GGCT	2	8	4059	4066	0 %	25 %	50 %	25 %	21240777
8	NC_003919	CCGT	2	8	5560	5567	0 %	25 %	25 %	50 %	21240778
9	NC_003919	TCCT	2	8	5629	5636	0 %	50 %	0 %	50 %	21240778
10	NC_003919	CACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	0 %	75 %	21240778
11	NC_003919	CGAA	2	8	6143	6150	50 %	0 %	25 %	25 %	21240778
12	NC_003919	ACCC	2	8	9248	9255	25 %	0 %	0 %	75 %	21240780
13	NC_003919	GCAA	2	8	9652	9659	50 %	0 %	25 %	25 %	21240781
14	NC_003919	TGGG	2	8	9691	9698	0 %	25 %	75 %	0 %	21240781
15	NC_003919	GTCG	2	8	11510	11517	0 %	25 %	50 %	25 %	21240782
16	NC_003919	GGTG	2	8	12336	12343	0 %	25 %	75 %	0 %	21240783
17	NC_003919	GAAG	2	8	12706	12713	50 %	0 %	50 %	0 %	21240784
18	NC_003919	AACC	2	8	14563	14570	50 %	0 %	0 %	50 %	21240787
19	NC_003919	ATGG	2	8	15233	15240	25 %	25 %	50 %	0 %	21240788
20	NC_003919	CTGG	2	8	15377	15384	0 %	25 %	50 %	25 %	21240788
21	NC_003919	GGTG	2	8	15556	15563	0 %	25 %	75 %	0 %	21240788
22	NC_003919	CATC	2	8	15688	15695	25 %	25 %	0 %	50 %	21240788
23	NC_003919	GGTA	2	8	17282	17289	25 %	25 %	50 %	0 %	21240789
24	NC_003919	TCCT	2	8	17895	17902	0 %	50 %	0 %	50 %	21240790
25	NC_003919	GCCG	2	8	18425	18432	0 %	0 %	50 %	50 %	21240791
26	NC_003919	GCAG	2	8	19771	19778	25 %	0 %	50 %	25 %	77748500
27	NC_003919	GTGC	2	8	19779	19786	0 %	25 %	50 %	25 %	77748500
28	NC_003919	GGTG	2	8	20526	20533	0 %	25 %	75 %	0 %	21240793
29	NC_003919	GACG	2	8	20561	20568	25 %	0 %	50 %	25 %	21240793
30	NC_003919	GCCG	2	8	21562	21569	0 %	0 %	50 %	50 %	21240793
31	NC_003919	TTCC	2	8	21985	21992	0 %	50 %	0 %	50 %	21240794
32	NC_003919	ACCC	2	8	22001	22008	25 %	0 %	0 %	75 %	21240794
33	NC_003919	GCCG	2	8	22069	22076	0 %	0 %	50 %	50 %	21240794
34	NC_003919	GCCG	2	8	22259	22266	0 %	0 %	50 %	50 %	21240794
35	NC_003919	ACGC	2	8	23257	23264	25 %	0 %	25 %	50 %	21240796
36	NC_003919	GCCG	2	8	23404	23411	0 %	0 %	50 %	50 %	21240796
37	NC_003919	GCAT	2	8	23464	23471	25 %	25 %	25 %	25 %	21240796
38	NC_003919	GCAG	2	8	23638	23645	25 %	0 %	50 %	25 %	21240796
39	NC_003919	GCCG	2	8	23853	23860	0 %	0 %	50 %	50 %	21240796
40	NC_003919	TGCC	2	8	24340	24347	0 %	25 %	25 %	50 %	21240797
41	NC_003919	ATCG	2	8	25313	25320	25 %	25 %	25 %	25 %	21240797
42	NC_003919	CACG	2	8	25537	25544	25 %	0 %	25 %	50 %	21240797
43	NC_003919	GGCC	2	8	25702	25709	0 %	0 %	50 %	50 %	21240797
44	NC_003919	CAGC	2	8	25894	25901	25 %	0 %	25 %	50 %	21240798
45	NC_003919	GCCC	2	8	25962	25969	0 %	0 %	25 %	75 %	21240798
46	NC_003919	GCGA	2	8	26529	26536	25 %	0 %	50 %	25 %	21240798
47	NC_003919	GCGT	2	8	26671	26678	0 %	25 %	50 %	25 %	21240798
48	NC_003919	GCCA	2	8	27107	27114	25 %	0 %	25 %	50 %	21240798
49	NC_003919	CCGA	2	8	28195	28202	25 %	0 %	25 %	50 %	21240800
50	NC_003919	GGTC	2	8	29009	29016	0 %	25 %	50 %	25 %	21240800
51	NC_003919	GCCG	2	8	29835	29842	0 %	0 %	50 %	50 %	21240800
52	NC_003919	TCGT	2	8	31441	31448	0 %	50 %	25 %	25 %	21240802
53	NC_003919	TCAT	2	8	31585	31592	25 %	50 %	0 %	25 %	21240802
54	NC_003919	ACAG	2	8	32067	32074	50 %	0 %	25 %	25 %	21240802
55	NC_003919	TCAT	2	8	33271	33278	25 %	50 %	0 %	25 %	21240803
56	NC_003919	CGCC	2	8	34655	34662	0 %	0 %	25 %	75 %	21240804
57	NC_003919	GCCG	2	8	35178	35185	0 %	0 %	50 %	50 %	21240804
58	NC_003919	CGCA	2	8	36069	36076	25 %	0 %	25 %	50 %	21240805
59	NC_003919	GGTC	2	8	36471	36478	0 %	25 %	50 %	25 %	21240805
60	NC_003919	CGCA	2	8	37631	37638	25 %	0 %	25 %	50 %	21240806
61	NC_003919	TCGA	2	8	37922	37929	25 %	25 %	25 %	25 %	21240806
62	NC_003919	CAGC	2	8	38150	38157	25 %	0 %	25 %	50 %	21240806
63	NC_003919	CGGC	2	8	38161	38168	0 %	0 %	50 %	50 %	21240806
64	NC_003919	GGCC	2	8	38526	38533	0 %	0 %	50 %	50 %	21240806
65	NC_003919	CCGC	2	8	38710	38717	0 %	0 %	25 %	75 %	21240806
66	NC_003919	CGGC	2	8	38861	38868	0 %	0 %	50 %	50 %	21240806
67	NC_003919	CCAG	2	8	39191	39198	25 %	0 %	25 %	50 %	21240807
68	NC_003919	CGGC	2	8	39547	39554	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
69	NC_003919	CAGG	2	8	39585	39592	25 %	0 %	50 %	25 %	21240807
70	NC_003919	CGGT	2	8	39850	39857	0 %	25 %	50 %	25 %	21240807
71	NC_003919	AGCG	2	8	40090	40097	25 %	0 %	50 %	25 %	21240807
72	NC_003919	TCGA	2	8	40633	40640	25 %	25 %	25 %	25 %	21240807
73	NC_003919	GCCC	2	8	40910	40917	0 %	0 %	25 %	75 %	21240807
74	NC_003919	GCAC	2	8	41254	41261	25 %	0 %	25 %	50 %	21240807
75	NC_003919	GCAG	2	8	41582	41589	25 %	0 %	50 %	25 %	21240807
76	NC_003919	GCTG	2	8	41897	41904	0 %	25 %	50 %	25 %	21240807
77	NC_003919	CGGC	2	8	42422	42429	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
78	NC_003919	GCCG	2	8	42555	42562	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
79	NC_003919	GCAG	2	8	44119	44126	25 %	0 %	50 %	25 %	21240808
80	NC_003919	CGTG	2	8	44732	44739	0 %	25 %	50 %	25 %	21240809
81	NC_003919	TCGT	2	8	44918	44925	0 %	50 %	25 %	25 %	21240809
82	NC_003919	GACG	2	8	45865	45872	25 %	0 %	50 %	25 %	21240810
83	NC_003919	CAAT	2	8	47255	47262	50 %	25 %	0 %	25 %	21240811
84	NC_003919	TGCA	2	8	47681	47688	25 %	25 %	25 %	25 %	21240812
85	NC_003919	GCCA	2	8	47733	47740	25 %	0 %	25 %	50 %	21240812
86	NC_003919	GTGC	2	8	49439	49446	0 %	25 %	50 %	25 %	21240813
87	NC_003919	CGCA	2	8	49753	49760	25 %	0 %	25 %	50 %	21240814
88	NC_003919	GCCG	2	8	49878	49885	0 %	0 %	50 %	50 %	21240814
89	NC_003919	ATGG	2	8	49942	49949	25 %	25 %	50 %	0 %	21240814
90	NC_003919	CGGC	2	8	50419	50426	0 %	0 %	50 %	50 %	21240815
91	NC_003919	CCTG	2	8	50451	50458	0 %	25 %	25 %	50 %	21240815
92	NC_003919	GTGC	2	8	50833	50840	0 %	25 %	50 %	25 %	21240815
93	NC_003919	GCCT	2	8	50960	50967	0 %	25 %	25 %	50 %	21240815
94	NC_003919	ATGC	2	8	52167	52174	25 %	25 %	25 %	25 %	21240816
95	NC_003919	CTAT	2	8	52289	52296	25 %	50 %	0 %	25 %	21240816
96	NC_003919	GCTT	2	8	52645	52652	0 %	50 %	25 %	25 %	21240817
97	NC_003919	GTCG	2	8	52668	52675	0 %	25 %	50 %	25 %	21240817
98	NC_003919	CCTG	2	8	53281	53288	0 %	25 %	25 %	50 %	21240817
99	NC_003919	AGCG	2	8	53399	53406	25 %	0 %	50 %	25 %	21240817
100	NC_003919	CCCG	2	8	53978	53985	0 %	0 %	25 %	75 %	21240818
101	NC_003919	GATC	2	8	54357	54364	25 %	25 %	25 %	25 %	21240818
102	NC_003919	AGGT	2	8	55550	55557	25 %	25 %	50 %	0 %	21240819
103	NC_003919	CAGC	2	8	55788	55795	25 %	0 %	25 %	50 %	21240819
104	NC_003919	GACC	2	8	56304	56311	25 %	0 %	25 %	50 %	21240819
105	NC_003919	GGCG	2	8	56471	56478	0 %	0 %	75 %	25 %	77748501
106	NC_003919	CGAA	2	8	56624	56631	50 %	0 %	25 %	25 %	77748501
107	NC_003919	GTGC	2	8	56823	56830	0 %	25 %	50 %	25 %	77748501
108	NC_003919	GCGG	2	8	56898	56905	0 %	0 %	75 %	25 %	77748501
109	NC_003919	ACGC	2	8	56973	56980	25 %	0 %	25 %	50 %	77748501
110	NC_003919	CGAC	2	8	57715	57722	25 %	0 %	25 %	50 %	77748501
111	NC_003919	GGCA	2	8	57765	57772	25 %	0 %	50 %	25 %	77748501
112	NC_003919	GCCG	2	8	59351	59358	0 %	0 %	50 %	50 %	21240822
113	NC_003919	CAGC	2	8	59736	59743	25 %	0 %	25 %	50 %	21240823
114	NC_003919	GGGT	2	8	60069	60076	0 %	25 %	75 %	0 %	21240823
115	NC_003919	GCGT	2	8	60393	60400	0 %	25 %	50 %	25 %	21240823
116	NC_003919	GGAT	2	8	60575	60582	25 %	25 %	50 %	0 %	21240823
117	NC_003919	CGGG	2	8	60693	60700	0 %	0 %	75 %	25 %	21240823
118	NC_003919	GGTC	2	8	61321	61328	0 %	25 %	50 %	25 %	21240824
119	NC_003919	GCAG	2	8	61392	61399	25 %	0 %	50 %	25 %	21240824
120	NC_003919	GGGC	2	8	61552	61559	0 %	0 %	75 %	25 %	21240824
121	NC_003919	CGGT	2	8	62235	62242	0 %	25 %	50 %	25 %	21240825
122	NC_003919	ATAC	2	8	62627	62634	50 %	25 %	0 %	25 %	21240825
123	NC_003919	CGCT	2	8	62742	62749	0 %	25 %	25 %	50 %	21240825
124	NC_003919	CCCG	2	8	62906	62913	0 %	0 %	25 %	75 %	21240825
125	NC_003919	CAGC	2	8	63074	63081	25 %	0 %	25 %	50 %	21240825
126	NC_003919	CGAG	2	8	63869	63876	25 %	0 %	50 %	25 %	21240826
127	NC_003919	GCAC	2	8	63965	63972	25 %	0 %	25 %	50 %	21240826
128	NC_003919	CGAC	2	8	64394	64401	25 %	0 %	25 %	50 %	21240826
129	NC_003919	GCCG	2	8	64484	64491	0 %	0 %	50 %	50 %	21240826
130	NC_003919	CAGC	2	8	64577	64584	25 %	0 %	25 %	50 %	21240826
131	NC_003919	CCGC	2	8	64689	64696	0 %	0 %	25 %	75 %	21240826
132	NC_003919	CCAG	2	8	64878	64885	25 %	0 %	25 %	50 %	21240826
133	NC_003919	GCAG	2	8	65916	65923	25 %	0 %	50 %	25 %	21240827
134	NC_003919	GCCG	2	8	66661	66668	0 %	0 %	50 %	50 %	21240828
135	NC_003919	GTCG	2	8	67168	67175	0 %	25 %	50 %	25 %	21240829
136	NC_003919	ATGC	2	8	67245	67252	25 %	25 %	25 %	25 %	21240829
137	NC_003919	GCCG	2	8	67343	67350	0 %	0 %	50 %	50 %	21240829
138	NC_003919	CCGA	2	8	67709	67716	25 %	0 %	25 %	50 %	21240829
139	NC_003919	CGTT	2	8	67790	67797	0 %	50 %	25 %	25 %	21240829
140	NC_003919	GCGA	2	8	68150	68157	25 %	0 %	50 %	25 %	21240829
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