MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 86119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003919	GAT	2	6	27	32	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003919	TCG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
3	NC_003919	TCG	2	6	232	237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
4	NC_003919	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
5	NC_003919	GGC	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240775
6	NC_003919	TGC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
7	NC_003919	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
8	NC_003919	GCC	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240775
9	NC_003919	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240775
10	NC_003919	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240775
11	NC_003919	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
12	NC_003919	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
13	NC_003919	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
14	NC_003919	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240775
15	NC_003919	TTC	2	6	714	719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240775
16	NC_003919	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240775
17	NC_003919	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240775
18	NC_003919	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240775
19	NC_003919	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240775
20	NC_003919	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
21	NC_003919	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240775
22	NC_003919	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240775
23	NC_003919	CTG	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
24	NC_003919	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240775
25	NC_003919	TAC	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240775
26	NC_003919	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
27	NC_003919	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240775
28	NC_003919	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
29	NC_003919	TGG	2	6	1558	1563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003919	CAC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_003919	TGG	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240776
32	NC_003919	CGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240776
33	NC_003919	CAG	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240776
34	NC_003919	TGT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240776
35	NC_003919	TGC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240776
36	NC_003919	ATC	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240776
37	NC_003919	AGG	3	9	2542	2550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240776
38	NC_003919	CGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240776
39	NC_003919	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240776
40	NC_003919	CAG	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240776
41	NC_003919	GCG	2	6	3015	3020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_003919	GCA	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_003919	GGC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_003919	TCG	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240777
45	NC_003919	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240777
46	NC_003919	CAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240777
47	NC_003919	AAG	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240777
48	NC_003919	GCG	3	9	4028	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240777
49	NC_003919	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240777
50	NC_003919	GGT	2	6	4192	4197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240777
51	NC_003919	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240777
52	NC_003919	AAC	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240777
53	NC_003919	CCT	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21240777
54	NC_003919	CAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240777
55	NC_003919	TGC	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240777
56	NC_003919	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240777
57	NC_003919	GCA	2	6	4851	4856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240777
58	NC_003919	CGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
59	NC_003919	TGC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
60	NC_003919	GGT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240778
61	NC_003919	CGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
62	NC_003919	CGA	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
63	NC_003919	GCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
64	NC_003919	GAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240778
65	NC_003919	CGG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
66	NC_003919	CGG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
67	NC_003919	CGA	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
68	NC_003919	CGG	2	6	5385	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
69	NC_003919	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240778
70	NC_003919	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
71	NC_003919	AGC	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
72	NC_003919	CGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
73	NC_003919	GCG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
74	NC_003919	CGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
75	NC_003919	GGC	2	6	5707	5712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
76	NC_003919	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
77	NC_003919	CAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240778
78	NC_003919	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240778
79	NC_003919	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
80	NC_003919	GCG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
81	NC_003919	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
82	NC_003919	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
83	NC_003919	TCG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
84	NC_003919	GCG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
85	NC_003919	CGC	2	6	6226	6231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
86	NC_003919	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
87	NC_003919	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
88	NC_003919	CGA	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
89	NC_003919	ACC	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240778
90	NC_003919	CAT	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240778
91	NC_003919	TGA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240778
92	NC_003919	CTG	3	9	6574	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
93	NC_003919	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240778
94	NC_003919	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
95	NC_003919	GAC	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
96	NC_003919	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
97	NC_003919	GCG	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
98	NC_003919	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
99	NC_003919	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240778
100	NC_003919	GCC	2	6	6885	6890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
101	NC_003919	TGG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240778
102	NC_003919	CCG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
103	NC_003919	TGC	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
104	NC_003919	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
105	NC_003919	CAA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240778
106	NC_003919	AAG	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240778
107	NC_003919	GCC	2	6	7247	7252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
108	NC_003919	AGC	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
109	NC_003919	GCC	2	6	7363	7368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
110	NC_003919	CGC	2	6	7411	7416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
111	NC_003919	GAC	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_003919	CAC	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_003919	GCC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_003919	GCT	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_003919	GGC	2	6	7634	7639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_003919	CTG	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003919	GGC	2	6	7708	7713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240779
118	NC_003919	GCC	2	6	7754	7759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240779
119	NC_003919	GCT	2	6	7786	7791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240779
120	NC_003919	GCT	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240779
121	NC_003919	TAC	2	6	7832	7837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240779
122	NC_003919	CGC	2	6	7844	7849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240779
123	NC_003919	CGC	3	9	7924	7932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240779
124	NC_003919	CTG	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240779
125	NC_003919	GGC	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240779
126	NC_003919	CCA	2	6	7995	8000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240779
127	NC_003919	TGA	2	6	8010	8015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240779
128	NC_003919	AAG	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240779
129	NC_003919	ATC	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240779
130	NC_003919	CTG	2	6	8087	8092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240779
131	NC_003919	GCC	2	6	8126	8131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240779
132	NC_003919	GCA	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240779
133	NC_003919	GCG	2	6	8255	8260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240779
134	NC_003919	CAA	2	6	8320	8325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240779
135	NC_003919	GCG	2	6	8405	8410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_003919	GTT	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240780
137	NC_003919	CCA	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240780
138	NC_003919	GCC	2	6	8625	8630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240780
139	NC_003919	GGT	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240780
140	NC_003919	GCG	2	6	8643	8648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240780
141	NC_003919	CAG	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240780
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146	NC_003919	CAT	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240780
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150	NC_003919	CTG	2	6	9098	9103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240780
151	NC_003919	ATG	2	6	9206	9211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240780
152	NC_003919	GCC	2	6	9212	9217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240780
153	NC_003919	CAG	2	6	9317	9322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240780
154	NC_003919	GAC	2	6	9366	9371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_003919	CGG	2	6	9613	9618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_003919	TGT	2	6	9664	9669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240781
157	NC_003919	CGC	2	6	9680	9685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240781
158	NC_003919	GTC	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240781
159	NC_003919	TCC	2	6	9735	9740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21240781
160	NC_003919	GAG	2	6	9777	9782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240781
161	NC_003919	CGA	2	6	9811	9816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240781
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163	NC_003919	CAA	2	6	9869	9874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240781
164	NC_003919	GCG	2	6	9930	9935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240781
165	NC_003919	ACG	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240781
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168	NC_003919	CCG	2	6	10000	10005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240781
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174	NC_003919	GGA	2	6	10148	10153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240781
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185	NC_003919	ATC	2	6	10812	10817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240781
186	NC_003919	ATC	2	6	10939	10944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_003919	AAC	2	6	10990	10995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240782
188	NC_003919	ATG	2	6	11097	11102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240782
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241	NC_003919	GCA	2	6	13378	13383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240785
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243	NC_003919	GCA	2	6	13574	13579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_003919	ATC	2	6	13620	13625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_003919	GCG	2	6	14449	14454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240787
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