MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni RM1221

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003912	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003912	AATTTA	2	12	19228	19239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003912	ATTTAT	2	12	39325	39336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003912	TACAGC	2	12	66626	66637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_003912	CTTTTA	2	12	66780	66791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_003912	TTAAAT	2	12	139289	139300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003912	AAATAA	2	12	145289	145300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003912	ATTTTT	2	12	164464	164475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003912	AATATT	2	12	170894	170905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003912	GCAGGT	2	12	196420	196431	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_003912	AAAATT	2	12	206967	206978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003912	GCTAAA	2	12	224348	224359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_003912	TTTAAG	2	12	244155	244166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003912	TTTGAA	2	12	244379	244390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003912	TATTTT	2	12	244479	244490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003912	TTAATT	2	12	259361	259372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003912	TATATT	2	12	259933	259944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003912	AAAAAT	2	12	261343	261354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003912	TATATT	2	12	278477	278488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003912	AAAATT	2	12	305301	305312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003912	TATTTT	2	12	401886	401897	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003912	TGTGTT	2	12	409317	409328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003912	ATTTAA	2	12	422063	422074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003912	ATTTAT	2	12	434140	434151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003912	TTTATT	2	12	437993	438004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003912	TAAGGA	2	12	451481	451492	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003912	AATGAA	2	12	488017	488028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003912	ATTATA	2	12	532312	532323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003912	AATTTA	2	12	556113	556124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003912	AGGCAA	2	12	567545	567556	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_003912	AAAATA	2	12	572486	572497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003912	TTTTAA	2	12	601049	601060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003912	TTTAGG	2	12	601314	601325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003912	ATTAAA	2	12	653767	653778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003912	TAATAG	2	12	695318	695329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003912	ATTTAA	2	12	704262	704273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003912	TACAAA	2	12	706471	706482	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_003912	ATTGCT	2	12	712095	712106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_003912	CTAATG	3	18	712161	712178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003912	TTTATT	2	12	714309	714320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003912	TAAATT	2	12	714378	714389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003912	ATTTTT	2	12	720560	720571	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003912	CTTGAA	2	12	739734	739745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_003912	ATAATT	2	12	748038	748049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003912	TTAAAT	2	12	767621	767632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003912	AAATTT	2	12	768787	768798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003912	AATTTA	2	12	774229	774240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003912	ATTTAT	2	12	777099	777110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003912	TCTTAT	2	12	780926	780937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_003912	AATTAA	2	12	782321	782332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003912	TTAGCT	2	12	782803	782814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_003912	CTTCTA	2	12	782821	782832	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_003912	AAATTT	2	12	846646	846657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003912	AATTTT	2	12	859944	859955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003912	AAATTA	2	12	888510	888521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003912	ACAAAG	2	12	901712	901723	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_003912	TTTTTA	2	12	904189	904200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003912	AATAAA	2	12	950583	950594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003912	ATCTTA	2	12	979738	979749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_003912	CTTAAA	2	12	983067	983078	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_003912	CATTAA	2	12	983918	983929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_003912	CAATCT	2	12	984500	984511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_003912	ATCTTA	2	12	984772	984783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_003912	TATAAA	2	12	985030	985041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003912	ATCTTA	2	12	985056	985067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_003912	TAAAAG	2	12	987052	987063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003912	TCAAAT	2	12	987482	987493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_003912	TGGAGA	2	12	988442	988453	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003912	ATATTT	2	12	1022990	1023001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003912	ATTTTT	2	12	1023695	1023706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003912	AATATA	2	12	1023836	1023847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003912	AAAATA	2	12	1039774	1039785	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003912	AATGCA	2	12	1092704	1092715	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_003912	GCAAGT	2	12	1127775	1127786	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_003912	ATTTTA	2	12	1155736	1155747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003912	CAATAC	2	12	1198083	1198094	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_003912	TTAATT	2	12	1248997	1249008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003912	TTAATT	2	12	1276984	1276995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003912	TACTAA	2	12	1308434	1308445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_003912	AATTTT	2	12	1312249	1312260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003912	TTTATT	2	12	1341013	1341024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003912	AATTTA	2	12	1341043	1341054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003912	GAAAAA	2	12	1345624	1345635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003912	TATAAT	2	12	1348105	1348116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003912	ATAATT	2	12	1351761	1351772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003912	GCAAGG	2	12	1364133	1364144	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_003912	ATAAAA	2	12	1370732	1370743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003912	TATGTA	2	12	1371934	1371945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003912	CAAATT	2	12	1406206	1406217	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_003912	TATAAA	2	12	1406769	1406780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003912	AATTTG	2	12	1447756	1447767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003912	TTAATT	2	12	1476941	1476952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003912	AAATGA	2	12	1480855	1480866	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003912	AAAGAA	2	12	1480871	1480882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003912	TATTTT	2	12	1486464	1486475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003912	ACTAAA	2	12	1590112	1590123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_003912	TTTCAT	2	12	1594281	1594292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_003912	CTTTGT	2	12	1596865	1596876	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_003912	AAAACT	2	12	1597014	1597025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_003912	TTTGAT	2	12	1597603	1597614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003912	TATAAT	2	12	1598778	1598789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003912	GAAAAA	2	12	1619836	1619847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003912	AGAGCA	2	12	1623862	1623873	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_003912	AAAGGC	2	12	1623904	1623915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_003912	AAGAAA	2	12	1661031	1661042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003912	TAAAAA	2	12	1666479	1666490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003912	TTCTTT	2	12	1698131	1698142	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_003912	ATTTTT	2	12	1724834	1724845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003912	TAAAAA	2	12	1762203	1762214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003912	TAAAAT	2	12	1774306	1774317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003912	AAGCCT	2	12	1774409	1774420	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.