MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 3329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003911	ACGGT	2	10	4445	4454	20 %	20 %	40 %	20 %	56694933
2	NC_003911	CACGC	2	10	5159	5168	20 %	0 %	20 %	60 %	56694934
3	NC_003911	CCCGG	2	10	5516	5525	0 %	0 %	40 %	60 %	56694934
4	NC_003911	CCAGA	2	10	5839	5848	40 %	0 %	20 %	40 %	56694935
5	NC_003911	GCCAG	2	10	5892	5901	20 %	0 %	40 %	40 %	56694935
6	NC_003911	ATCAC	2	10	6652	6661	40 %	20 %	0 %	40 %	56694936
7	NC_003911	CCCAG	2	10	6833	6842	20 %	0 %	20 %	60 %	56694936
8	NC_003911	CGGTG	2	10	8086	8095	0 %	20 %	60 %	20 %	56694937
9	NC_003911	GCATC	2	10	8902	8911	20 %	20 %	20 %	40 %	56694939
10	NC_003911	GCGCC	2	10	11026	11035	0 %	0 %	40 %	60 %	56694939
11	NC_003911	CCCAT	2	10	11590	11599	20 %	20 %	0 %	60 %	56694940
12	NC_003911	GCACG	2	10	12092	12101	20 %	0 %	40 %	40 %	56694940
13	NC_003911	TGCCG	2	10	13901	13910	0 %	20 %	40 %	40 %	56694941
14	NC_003911	CGGGC	2	10	13919	13928	0 %	0 %	60 %	40 %	56694941
15	NC_003911	CACGG	2	10	14673	14682	20 %	0 %	40 %	40 %	56694941
16	NC_003911	CAGGT	2	10	15726	15735	20 %	20 %	40 %	20 %	56694943
17	NC_003911	TCGCC	2	10	17638	17647	0 %	20 %	20 %	60 %	56694946
18	NC_003911	CGGGT	2	10	21719	21728	0 %	20 %	60 %	20 %	56694950
19	NC_003911	TGCGC	2	10	22396	22405	0 %	20 %	40 %	40 %	56694951
20	NC_003911	GCCCG	2	10	24805	24814	0 %	0 %	40 %	60 %	56694954
21	NC_003911	GGCGC	2	10	24858	24867	0 %	0 %	60 %	40 %	56694954
22	NC_003911	CCGAT	2	10	25190	25199	20 %	20 %	20 %	40 %	56694954
23	NC_003911	GCCCA	2	10	26787	26796	20 %	0 %	20 %	60 %	56694955
24	NC_003911	GCAGG	2	10	27227	27236	20 %	0 %	60 %	20 %	56694955
25	NC_003911	CCCGC	2	10	30487	30496	0 %	0 %	20 %	80 %	56694957
26	NC_003911	CGCGC	2	10	31059	31068	0 %	0 %	40 %	60 %	56694958
27	NC_003911	CGCGG	2	10	34084	34093	0 %	0 %	60 %	40 %	56694962
28	NC_003911	GCCCG	2	10	37940	37949	0 %	0 %	40 %	60 %	56694965
29	NC_003911	ATCCA	2	10	38391	38400	40 %	20 %	0 %	40 %	56694965
30	NC_003911	GCGCG	2	10	39194	39203	0 %	0 %	60 %	40 %	56694966
31	NC_003911	CCACG	2	10	40016	40025	20 %	0 %	20 %	60 %	56694967
32	NC_003911	GACCT	2	10	41484	41493	20 %	20 %	20 %	40 %	56694969
33	NC_003911	GGCCA	2	10	42246	42255	20 %	0 %	40 %	40 %	56694970
34	NC_003911	GAGCT	2	10	43493	43502	20 %	20 %	40 %	20 %	56694971
35	NC_003911	CGACC	2	10	44353	44362	20 %	0 %	20 %	60 %	56694971
36	NC_003911	GGCGA	2	10	44483	44492	20 %	0 %	60 %	20 %	56694971
37	NC_003911	TCGGG	2	10	44949	44958	0 %	20 %	60 %	20 %	56694972
38	NC_003911	GGGTC	2	10	45322	45331	0 %	20 %	60 %	20 %	56694972
39	NC_003911	TGCGC	2	10	48569	48578	0 %	20 %	40 %	40 %	56694975
40	NC_003911	CGGTG	2	10	53302	53311	0 %	20 %	60 %	20 %	56694981
41	NC_003911	GAGCT	2	10	54242	54251	20 %	20 %	40 %	20 %	56694982
42	NC_003911	CCGGG	2	10	54442	54451	0 %	0 %	60 %	40 %	56694983
43	NC_003911	CGCGT	2	10	54478	54487	0 %	20 %	40 %	40 %	56694983
44	NC_003911	CGGCG	2	10	54822	54831	0 %	0 %	60 %	40 %	56694983
45	NC_003911	TCGCC	2	10	57880	57889	0 %	20 %	20 %	60 %	56694985
46	NC_003911	GCTGG	2	10	60436	60445	0 %	20 %	60 %	20 %	56694986
47	NC_003911	GTCAG	2	10	62847	62856	20 %	20 %	40 %	20 %	56694989
48	NC_003911	CGGTC	2	10	65954	65963	0 %	20 %	40 %	40 %	56694990
49	NC_003911	CCCAG	2	10	66092	66101	20 %	0 %	20 %	60 %	56694991
50	NC_003911	GGATC	2	10	68035	68044	20 %	20 %	40 %	20 %	56694992
51	NC_003911	CCGCC	2	10	68788	68797	0 %	0 %	20 %	80 %	56694993
52	NC_003911	CCGCG	2	10	69082	69091	0 %	0 %	40 %	60 %	56694993
53	NC_003911	GCCGG	2	10	73149	73158	0 %	0 %	60 %	40 %	56694999
54	NC_003911	GGCTG	2	10	75108	75117	0 %	20 %	60 %	20 %	56695001
55	NC_003911	TTCGG	2	10	76891	76900	0 %	40 %	40 %	20 %	56695004
56	NC_003911	GGCGA	2	10	76957	76966	20 %	0 %	60 %	20 %	56695004
57	NC_003911	GTTTG	2	10	77630	77639	0 %	60 %	40 %	0 %	56695005
58	NC_003911	GTCGG	2	10	79676	79685	0 %	20 %	60 %	20 %	56695007
59	NC_003911	GTCAT	2	10	82575	82584	20 %	40 %	20 %	20 %	56695012
60	NC_003911	AGGCG	2	10	85444	85453	20 %	0 %	60 %	20 %	56695014
61	NC_003911	ACCCC	2	10	85899	85908	20 %	0 %	0 %	80 %	56695015
62	NC_003911	GGCGC	2	10	86697	86706	0 %	0 %	60 %	40 %	56695016
63	NC_003911	TGCCG	2	10	87726	87735	0 %	20 %	40 %	40 %	56695016
64	NC_003911	CCGCT	2	10	87965	87974	0 %	20 %	20 %	60 %	56695016
65	NC_003911	GCGCG	2	10	91316	91325	0 %	0 %	60 %	40 %	56695021
66	NC_003911	CCGCG	2	10	92915	92924	0 %	0 %	40 %	60 %	56695020
67	NC_003911	CGTGA	2	10	94278	94287	20 %	20 %	40 %	20 %	56695022
68	NC_003911	TGCTC	2	10	97105	97114	0 %	40 %	20 %	40 %	56695024
69	NC_003911	TCTCG	2	10	98139	98148	0 %	40 %	20 %	40 %	56695025
70	NC_003911	GCGCC	2	10	98787	98796	0 %	0 %	40 %	60 %	56695025
71	NC_003911	GGTGC	2	10	99155	99164	0 %	20 %	60 %	20 %	56695025
72	NC_003911	CGCGG	2	10	99790	99799	0 %	0 %	60 %	40 %	56695026
73	NC_003911	AGGTC	2	10	99947	99956	20 %	20 %	40 %	20 %	56695026
74	NC_003911	CGACC	2	10	103927	103936	20 %	0 %	20 %	60 %	56695029
75	NC_003911	TCCGG	2	10	107739	107748	0 %	20 %	40 %	40 %	56695032
76	NC_003911	TGGCC	2	10	108322	108331	0 %	20 %	40 %	40 %	56695033
77	NC_003911	CCGCA	2	10	110118	110127	20 %	0 %	20 %	60 %	56695034
78	NC_003911	CATGT	2	10	114264	114273	20 %	40 %	20 %	20 %	56695036
79	NC_003911	CAAGG	2	10	114286	114295	40 %	0 %	40 %	20 %	56695037
80	NC_003911	AAGGC	2	10	115316	115325	40 %	0 %	40 %	20 %	56695037
81	NC_003911	CCCGT	2	10	115678	115687	0 %	20 %	20 %	60 %	56695037
82	NC_003911	GCCTT	2	10	116015	116024	0 %	40 %	20 %	40 %	56695037
83	NC_003911	GCGAT	2	10	116744	116753	20 %	20 %	40 %	20 %	56695037
84	NC_003911	GGATC	2	10	117233	117242	20 %	20 %	40 %	20 %	56695038
85	NC_003911	CTTGG	2	10	117702	117711	0 %	40 %	40 %	20 %	56695038
86	NC_003911	CATTG	2	10	117967	117976	20 %	40 %	20 %	20 %	56695038
87	NC_003911	CTGGA	2	10	118474	118483	20 %	20 %	40 %	20 %	56695039
88	NC_003911	TCTGG	2	10	119526	119535	0 %	40 %	40 %	20 %	56695039
89	NC_003911	GACCT	2	10	119812	119821	20 %	20 %	20 %	40 %	56695039
90	NC_003911	TCATG	2	10	120864	120873	20 %	40 %	20 %	20 %	56695040
91	NC_003911	CTCGC	2	10	123597	123606	0 %	20 %	20 %	60 %	56695043
92	NC_003911	TAAAA	2	10	126671	126680	80 %	20 %	0 %	0 %	56695044
93	NC_003911	GCTGG	2	10	131459	131468	0 %	20 %	60 %	20 %	56695048
94	NC_003911	GGACC	2	10	131627	131636	20 %	0 %	40 %	40 %	56695048
95	NC_003911	TCGGC	2	10	134189	134198	0 %	20 %	40 %	40 %	56695051
96	NC_003911	ATCGC	2	10	136237	136246	20 %	20 %	20 %	40 %	56695054
97	NC_003911	TGACC	2	10	136841	136850	20 %	20 %	20 %	40 %	56695054
98	NC_003911	GGGCC	2	10	137263	137272	0 %	0 %	60 %	40 %	56695055
99	NC_003911	GTCTG	2	10	137331	137340	0 %	40 %	40 %	20 %	56695055
100	NC_003911	TGCGG	2	10	137889	137898	0 %	20 %	60 %	20 %	56695056
101	NC_003911	CGCGC	2	10	138862	138871	0 %	0 %	40 %	60 %	56695057
102	NC_003911	ACGGG	2	10	141273	141282	20 %	0 %	60 %	20 %	56695058
103	NC_003911	TGATC	2	10	141750	141759	20 %	40 %	20 %	20 %	56695058
104	NC_003911	GCGCC	2	10	144335	144344	0 %	0 %	40 %	60 %	56695058
105	NC_003911	GGCCG	2	10	144609	144618	0 %	0 %	60 %	40 %	56695058
106	NC_003911	CGCGC	2	10	145174	145183	0 %	0 %	40 %	60 %	56695058
107	NC_003911	GGTGC	2	10	148384	148393	0 %	20 %	60 %	20 %	56695060
108	NC_003911	GGGCC	2	10	148557	148566	0 %	0 %	60 %	40 %	56695060
109	NC_003911	GCCGC	2	10	149578	149587	0 %	0 %	40 %	60 %	56695061
110	NC_003911	TGGTC	2	10	150381	150390	0 %	40 %	40 %	20 %	56695061
111	NC_003911	GACCG	2	10	150478	150487	20 %	0 %	40 %	40 %	56695061
112	NC_003911	CCGCG	2	10	152780	152789	0 %	0 %	40 %	60 %	56695062
113	NC_003911	GGCCC	2	10	153027	153036	0 %	0 %	40 %	60 %	56695062
114	NC_003911	GGCCA	2	10	153168	153177	20 %	0 %	40 %	40 %	56695062
115	NC_003911	CGGCG	2	10	154150	154159	0 %	0 %	60 %	40 %	56695063
116	NC_003911	GGACG	2	10	155483	155492	20 %	0 %	60 %	20 %	56695065
117	NC_003911	ATCCG	2	10	155725	155734	20 %	20 %	20 %	40 %	56695065
118	NC_003911	ATGAC	2	10	156958	156967	40 %	20 %	20 %	20 %	56695067
119	NC_003911	GCTTG	2	10	158727	158736	0 %	40 %	40 %	20 %	56695068
120	NC_003911	CAGTC	2	10	158891	158900	20 %	20 %	20 %	40 %	56695068
121	NC_003911	GCCCA	2	10	160020	160029	20 %	0 %	20 %	60 %	56695069
122	NC_003911	GCGCG	2	10	160661	160670	0 %	0 %	60 %	40 %	56695069
123	NC_003911	ACATC	2	10	161389	161398	40 %	20 %	0 %	40 %	56695070
124	NC_003911	CCGGG	2	10	162170	162179	0 %	0 %	60 %	40 %	56695071
125	NC_003911	ACCAC	2	10	165631	165640	40 %	0 %	0 %	60 %	56695074
126	NC_003911	CTGCG	2	10	166512	166521	0 %	20 %	40 %	40 %	56695075
127	NC_003911	CCCGG	2	10	168593	168602	0 %	0 %	40 %	60 %	56695077
128	NC_003911	CGTTC	2	10	169117	169126	0 %	40 %	20 %	40 %	56695078
129	NC_003911	GGTGA	2	10	174111	174120	20 %	20 %	60 %	0 %	56695081
130	NC_003911	GGTCA	2	10	174849	174858	20 %	20 %	40 %	20 %	56695082
131	NC_003911	GCTCG	2	10	174874	174883	0 %	20 %	40 %	40 %	56695082
132	NC_003911	GCTGT	2	10	177733	177742	0 %	40 %	40 %	20 %	56695083
133	NC_003911	CGGCG	2	10	177976	177985	0 %	0 %	60 %	40 %	56695083
134	NC_003911	GATCA	2	10	178306	178315	40 %	20 %	20 %	20 %	56695083
135	NC_003911	CGGCC	2	10	179800	179809	0 %	0 %	40 %	60 %	56695085
136	NC_003911	AGGGC	2	10	180211	180220	20 %	0 %	60 %	20 %	56695086
137	NC_003911	CGCTG	2	10	183915	183924	0 %	20 %	40 %	40 %	56695087
138	NC_003911	GCGCA	2	10	187763	187772	20 %	0 %	40 %	40 %	56695090
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