MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 9640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003911	TCAT	2	8	482	489	25 %	50 %	0 %	25 %	56694929
2	NC_003911	GACC	2	8	526	533	25 %	0 %	25 %	50 %	56694929
3	NC_003911	TGGA	2	8	557	564	25 %	25 %	50 %	0 %	56694929
4	NC_003911	GGAC	2	8	612	619	25 %	0 %	50 %	25 %	56694929
5	NC_003911	TCGA	2	8	829	836	25 %	25 %	25 %	25 %	56694929
6	NC_003911	TCTT	2	8	878	885	0 %	75 %	0 %	25 %	56694929
7	NC_003911	TGCG	2	8	1310	1317	0 %	25 %	50 %	25 %	56694929
8	NC_003911	TCAG	2	8	1484	1491	25 %	25 %	25 %	25 %	56694929
9	NC_003911	GTTG	2	8	2679	2686	0 %	50 %	50 %	0 %	56694931
10	NC_003911	GATG	2	8	2838	2845	25 %	25 %	50 %	0 %	56694931
11	NC_003911	GCCC	2	8	2876	2883	0 %	0 %	25 %	75 %	56694931
12	NC_003911	GCCG	2	8	3364	3371	0 %	0 %	50 %	50 %	56694932
13	NC_003911	ATCA	2	8	4094	4101	50 %	25 %	0 %	25 %	56694932
14	NC_003911	CCAG	2	8	4805	4812	25 %	0 %	25 %	50 %	56694934
15	NC_003911	GGGC	2	8	4945	4952	0 %	0 %	75 %	25 %	56694934
16	NC_003911	GGGC	2	8	6084	6091	0 %	0 %	75 %	25 %	56694935
17	NC_003911	GCCT	2	8	6456	6463	0 %	25 %	25 %	50 %	56694936
18	NC_003911	TTGC	2	8	6759	6766	0 %	50 %	25 %	25 %	56694936
19	NC_003911	CCGC	2	8	7039	7046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_003911	GCGG	2	8	7860	7867	0 %	0 %	75 %	25 %	56694937
21	NC_003911	GGCG	2	8	8669	8676	0 %	0 %	75 %	25 %	56694938
22	NC_003911	GGCG	2	8	9802	9809	0 %	0 %	75 %	25 %	56694939
23	NC_003911	GCCC	2	8	10360	10367	0 %	0 %	25 %	75 %	56694939
24	NC_003911	CAGC	2	8	10882	10889	25 %	0 %	25 %	50 %	56694939
25	NC_003911	GCGG	2	8	10969	10976	0 %	0 %	75 %	25 %	56694939
26	NC_003911	TCGA	2	8	11919	11926	25 %	25 %	25 %	25 %	56694940
27	NC_003911	GAAG	2	8	12053	12060	50 %	0 %	50 %	0 %	56694940
28	NC_003911	CCGC	2	8	12774	12781	0 %	0 %	25 %	75 %	56694940
29	NC_003911	CACC	2	8	14113	14120	25 %	0 %	0 %	75 %	56694941
30	NC_003911	GGGC	2	8	14563	14570	0 %	0 %	75 %	25 %	56694941
31	NC_003911	GGAT	2	8	14599	14606	25 %	25 %	50 %	0 %	56694941
32	NC_003911	CCGG	2	8	15497	15504	0 %	0 %	50 %	50 %	56694943
33	NC_003911	CGGT	2	8	15836	15843	0 %	25 %	50 %	25 %	56694943
34	NC_003911	CTGG	2	8	15966	15973	0 %	25 %	50 %	25 %	56694943
35	NC_003911	CCGC	2	8	16278	16285	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_003911	AGTT	2	8	17037	17044	25 %	50 %	25 %	0 %	56694945
37	NC_003911	GCGG	2	8	18212	18219	0 %	0 %	75 %	25 %	56694946
38	NC_003911	AGCC	2	8	18743	18750	25 %	0 %	25 %	50 %	56694947
39	NC_003911	CCTG	2	8	19013	19020	0 %	25 %	25 %	50 %	56694947
40	NC_003911	GGTG	2	8	19868	19875	0 %	25 %	75 %	0 %	56694948
41	NC_003911	CCTG	2	8	19954	19961	0 %	25 %	25 %	50 %	56694948
42	NC_003911	GTCG	2	8	20177	20184	0 %	25 %	50 %	25 %	56694948
43	NC_003911	TGCC	2	8	20778	20785	0 %	25 %	25 %	50 %	56694949
44	NC_003911	GACA	2	8	21060	21067	50 %	0 %	25 %	25 %	56694950
45	NC_003911	CCGG	2	8	22466	22473	0 %	0 %	50 %	50 %	56694951
46	NC_003911	CAGA	2	8	22485	22492	50 %	0 %	25 %	25 %	56694951
47	NC_003911	CAGC	2	8	22569	22576	25 %	0 %	25 %	50 %	56694951
48	NC_003911	CTGG	2	8	22674	22681	0 %	25 %	50 %	25 %	56694951
49	NC_003911	GGTG	2	8	23214	23221	0 %	25 %	75 %	0 %	56694952
50	NC_003911	GACC	2	8	23595	23602	25 %	0 %	25 %	50 %	56694952
51	NC_003911	TCGG	2	8	23806	23813	0 %	25 %	50 %	25 %	56694952
52	NC_003911	CGAC	2	8	24887	24894	25 %	0 %	25 %	50 %	56694954
53	NC_003911	CGCC	2	8	25406	25413	0 %	0 %	25 %	75 %	56694954
54	NC_003911	TCAA	2	8	25586	25593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003911	GTCG	2	8	26153	26160	0 %	25 %	50 %	25 %	56694955
56	NC_003911	TTTC	2	8	26741	26748	0 %	75 %	0 %	25 %	56694955
57	NC_003911	GGGC	2	8	27539	27546	0 %	0 %	75 %	25 %	56694955
58	NC_003911	CGGG	2	8	27574	27581	0 %	0 %	75 %	25 %	56694955
59	NC_003911	GGCA	2	8	27739	27746	25 %	0 %	50 %	25 %	56694956
60	NC_003911	CCGG	2	8	27877	27884	0 %	0 %	50 %	50 %	56694956
61	NC_003911	CGGG	2	8	28235	28242	0 %	0 %	75 %	25 %	56694956
62	NC_003911	GGCT	2	8	28382	28389	0 %	25 %	50 %	25 %	56694956
63	NC_003911	GGGC	2	8	28788	28795	0 %	0 %	75 %	25 %	56694956
64	NC_003911	GCGA	2	8	28982	28989	25 %	0 %	50 %	25 %	56694956
65	NC_003911	GGGC	2	8	30846	30853	0 %	0 %	75 %	25 %	56694958
66	NC_003911	TTCA	2	8	31934	31941	25 %	50 %	0 %	25 %	56694959
67	NC_003911	GCTG	2	8	32000	32007	0 %	25 %	50 %	25 %	56694959
68	NC_003911	GCTG	2	8	32765	32772	0 %	25 %	50 %	25 %	56694961
69	NC_003911	CAGC	2	8	33917	33924	25 %	0 %	25 %	50 %	56694962
70	NC_003911	AGAT	2	8	34032	34039	50 %	25 %	25 %	0 %	56694962
71	NC_003911	GAAG	2	8	34339	34346	50 %	0 %	50 %	0 %	56694962
72	NC_003911	TGCT	2	8	35115	35122	0 %	50 %	25 %	25 %	56694963
73	NC_003911	GCCA	2	8	35463	35470	25 %	0 %	25 %	50 %	56694963
74	NC_003911	AGCG	2	8	35817	35824	25 %	0 %	50 %	25 %	56694963
75	NC_003911	GCCC	2	8	36115	36122	0 %	0 %	25 %	75 %	56694963
76	NC_003911	GGCA	2	8	36219	36226	25 %	0 %	50 %	25 %	56694963
77	NC_003911	GCCC	2	8	36903	36910	0 %	0 %	25 %	75 %	56694964
78	NC_003911	CAGT	2	8	37088	37095	25 %	25 %	25 %	25 %	56694964
79	NC_003911	CGGG	2	8	37108	37115	0 %	0 %	75 %	25 %	56694964
80	NC_003911	GATA	2	8	37128	37135	50 %	25 %	25 %	0 %	56694964
81	NC_003911	CCAG	2	8	38272	38279	25 %	0 %	25 %	50 %	56694965
82	NC_003911	GCGG	2	8	39537	39544	0 %	0 %	75 %	25 %	56694966
83	NC_003911	GGAC	2	8	39557	39564	25 %	0 %	50 %	25 %	56694966
84	NC_003911	CGCC	2	8	40310	40317	0 %	0 %	25 %	75 %	56694967
85	NC_003911	CGTC	2	8	40566	40573	0 %	25 %	25 %	50 %	56694968
86	NC_003911	GGTG	2	8	40749	40756	0 %	25 %	75 %	0 %	56694968
87	NC_003911	GCCG	2	8	41696	41703	0 %	0 %	50 %	50 %	56694969
88	NC_003911	GGCC	2	8	42425	42432	0 %	0 %	50 %	50 %	56694970
89	NC_003911	CGGA	2	8	42488	42495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003911	GGTC	2	8	42841	42848	0 %	25 %	50 %	25 %	56694971
91	NC_003911	AAGA	2	8	43412	43419	75 %	0 %	25 %	0 %	56694971
92	NC_003911	GAAG	2	8	43465	43472	50 %	0 %	50 %	0 %	56694971
93	NC_003911	GTCG	2	8	44326	44333	0 %	25 %	50 %	25 %	56694971
94	NC_003911	CGTC	2	8	44546	44553	0 %	25 %	25 %	50 %	56694971
95	NC_003911	AGCA	2	8	45719	45726	50 %	0 %	25 %	25 %	56694972
96	NC_003911	GGGC	2	8	46686	46693	0 %	0 %	75 %	25 %	56694973
97	NC_003911	GGTC	2	8	46932	46939	0 %	25 %	50 %	25 %	56694974
98	NC_003911	GCGG	2	8	47054	47061	0 %	0 %	75 %	25 %	56694974
99	NC_003911	ATCA	2	8	47246	47253	50 %	25 %	0 %	25 %	56694974
100	NC_003911	GGCA	2	8	49484	49491	25 %	0 %	50 %	25 %	56694977
101	NC_003911	GGGC	2	8	49657	49664	0 %	0 %	75 %	25 %	56694977
102	NC_003911	CCGC	2	8	50237	50244	0 %	0 %	25 %	75 %	56694977
103	NC_003911	GGCT	2	8	50294	50301	0 %	25 %	50 %	25 %	56694977
104	NC_003911	CGCC	2	8	50454	50461	0 %	0 %	25 %	75 %	56694978
105	NC_003911	CTGC	2	8	50728	50735	0 %	25 %	25 %	50 %	56694978
106	NC_003911	CGCC	2	8	50763	50770	0 %	0 %	25 %	75 %	56694978
107	NC_003911	GGAT	2	8	51060	51067	25 %	25 %	50 %	0 %	56694978
108	NC_003911	GCAA	2	8	51133	51140	50 %	0 %	25 %	25 %	56694978
109	NC_003911	CCTG	2	8	52123	52130	0 %	25 %	25 %	50 %	56694980
110	NC_003911	GACC	2	8	52819	52826	25 %	0 %	25 %	50 %	56694981
111	NC_003911	GCTG	2	8	52884	52891	0 %	25 %	50 %	25 %	56694981
112	NC_003911	GTGG	2	8	53320	53327	0 %	25 %	75 %	0 %	56694981
113	NC_003911	GACC	2	8	53380	53387	25 %	0 %	25 %	50 %	56694981
114	NC_003911	GGCG	2	8	53467	53474	0 %	0 %	75 %	25 %	56694981
115	NC_003911	GGCG	2	8	55098	55105	0 %	0 %	75 %	25 %	56694983
116	NC_003911	GCAG	2	8	55607	55614	25 %	0 %	50 %	25 %	56694983
117	NC_003911	CAAG	2	8	55770	55777	50 %	0 %	25 %	25 %	56694983
118	NC_003911	TCGA	2	8	56097	56104	25 %	25 %	25 %	25 %	56694984
119	NC_003911	CGCT	2	8	57927	57934	0 %	25 %	25 %	50 %	56694985
120	NC_003911	GGCG	2	8	58300	58307	0 %	0 %	75 %	25 %	56694985
121	NC_003911	CCTT	2	8	58329	58336	0 %	50 %	0 %	50 %	56694985
122	NC_003911	TCGA	2	8	58368	58375	25 %	25 %	25 %	25 %	56694985
123	NC_003911	CTCA	2	8	59120	59127	25 %	25 %	0 %	50 %	56694985
124	NC_003911	CCAT	2	8	59281	59288	25 %	25 %	0 %	50 %	56694985
125	NC_003911	GTCC	2	8	60411	60418	0 %	25 %	25 %	50 %	56694986
126	NC_003911	CGGG	2	8	61100	61107	0 %	0 %	75 %	25 %	56694987
127	NC_003911	GCCA	2	8	62189	62196	25 %	0 %	25 %	50 %	56694988
128	NC_003911	TGCC	2	8	62233	62240	0 %	25 %	25 %	50 %	56694988
129	NC_003911	GTGC	2	8	62291	62298	0 %	25 %	50 %	25 %	56694988
130	NC_003911	TTAA	2	8	62375	62382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003911	CGGA	3	12	62627	62638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_003911	GCGA	2	8	64679	64686	25 %	0 %	50 %	25 %	56694989
133	NC_003911	GCAC	2	8	64901	64908	25 %	0 %	25 %	50 %	56694989
134	NC_003911	CCGG	2	8	65177	65184	0 %	0 %	50 %	50 %	56694989
135	NC_003911	GTCC	2	8	65270	65277	0 %	25 %	25 %	50 %	56694989
136	NC_003911	CCAA	2	8	65523	65530	50 %	0 %	0 %	50 %	56694990
137	NC_003911	TCCG	2	8	65580	65587	0 %	25 %	25 %	50 %	56694990
138	NC_003911	GGCC	2	8	65879	65886	0 %	0 %	50 %	50 %	56694990
139	NC_003911	TCGG	2	8	66079	66086	0 %	25 %	50 %	25 %	56694991
140	NC_003911	GCTG	2	8	66626	66633	0 %	25 %	50 %	25 %	56694991
141	NC_003911	TCGA	2	8	66880	66887	25 %	25 %	25 %	25 %	56694991
142	NC_003911	GGAT	2	8	68380	68387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003911	CCCA	2	8	68424	68431	25 %	0 %	0 %	75 %	56694993
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270	NC_003911	GCTT	2	8	126216	126223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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276	NC_003911	GCTC	2	8	129033	129040	0 %	25 %	25 %	50 %	56695046
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278	NC_003911	GAGC	2	8	129592	129599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
279	NC_003911	TTCG	2	8	129647	129654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
280	NC_003911	AGGT	2	8	129729	129736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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