MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 1217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003911	CCGC	2	8	7039	7046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_003911	CCGC	2	8	16278	16285	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_003911	TCAA	2	8	25586	25593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003911	CGGA	2	8	42488	42495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003911	TTAA	2	8	62375	62382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003911	CGGA	3	12	62627	62638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003911	GGAT	2	8	68380	68387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003911	GGAA	2	8	71041	71048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003911	AATC	2	8	76515	76522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003911	AGAA	2	8	82136	82143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003911	CCGG	2	8	84273	84280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_003911	GCGG	2	8	99640	99647	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003911	TGCG	2	8	112497	112504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_003911	TCAT	2	8	112569	112576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003911	TCAG	2	8	113125	113132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_003911	ATGA	2	8	123861	123868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003911	ACGG	2	8	124146	124153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003911	GGGA	2	8	125126	125133	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003911	CCTG	2	8	125318	125325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003911	CAGC	2	8	125504	125511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003911	CATC	2	8	125786	125793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_003911	AGTG	2	8	126168	126175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003911	GCTT	2	8	126216	126223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003911	CAGC	2	8	129501	129508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_003911	GAGC	2	8	129592	129599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003911	TTCG	2	8	129647	129654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_003911	AGGT	2	8	129729	129736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003911	CCAT	2	8	129783	129790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_003911	GGTC	2	8	156716	156723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003911	AGAA	2	8	158188	158195	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003911	AAGG	2	8	164028	164035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003911	TGTC	2	8	164189	164196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003911	AGGG	2	8	167166	167173	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003911	GAAG	2	8	170245	170252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003911	GCCC	2	8	176447	176454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_003911	GCCG	2	8	176740	176747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_003911	GAGT	2	8	176992	176999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003911	CGGG	2	8	189571	189578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_003911	GGCC	2	8	195311	195318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_003911	CGGC	2	8	214880	214887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_003911	GCCG	2	8	214900	214907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003911	GCAG	2	8	214989	214996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_003911	CCAG	2	8	223215	223222	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_003911	GGCG	2	8	231643	231650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_003911	GTGG	2	8	231662	231669	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003911	CCAC	2	8	235564	235571	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_003911	GATG	2	8	235761	235768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003911	CATC	2	8	236430	236437	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003911	TCGG	2	8	239569	239576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003911	GCCG	2	8	241053	241060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003911	CAGA	2	8	242953	242960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_003911	GGGC	2	8	243971	243978	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003911	GTCG	2	8	250631	250638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_003911	CCCG	3	12	250644	250655	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_003911	GAGG	2	8	250696	250703	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003911	CGGG	2	8	251725	251732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003911	TTGG	2	8	261401	261408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003911	GGCG	2	8	261508	261515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_003911	CAGA	2	8	261751	261758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003911	GAAC	2	8	261929	261936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003911	GTGA	2	8	262274	262281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003911	GCAA	2	8	263527	263534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003911	ATCA	2	8	263898	263905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003911	GCGA	2	8	264541	264548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003911	AGCC	2	8	266599	266606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_003911	CCCG	2	8	267259	267266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_003911	CTGC	2	8	267305	267312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_003911	TATT	2	8	267344	267351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003911	AGCG	2	8	267367	267374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_003911	CGTG	2	8	267563	267570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003911	GGGC	2	8	271663	271670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003911	GATA	2	8	288109	288116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003911	CATG	2	8	288151	288158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_003911	AGAA	2	8	292609	292616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003911	GCAG	2	8	300201	300208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_003911	GGCA	2	8	300359	300366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_003911	TGCC	2	8	300372	300379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_003911	CCTG	2	8	300505	300512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_003911	CGGG	2	8	300675	300682	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_003911	GAGC	2	8	303468	303475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_003911	TTGC	2	8	311423	311430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003911	ATAC	2	8	311466	311473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_003911	TGCC	2	8	318071	318078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_003911	GCGG	2	8	320045	320052	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_003911	GACA	2	8	328578	328585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_003911	CATC	2	8	332395	332402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_003911	GCTG	2	8	335682	335689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_003911	TTCT	2	8	344268	344275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_003911	AGGC	2	8	349227	349234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003911	CCTC	2	8	351634	351641	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_003911	CGTG	2	8	353495	353502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_003911	CCCG	2	8	353572	353579	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_003911	CCTT	2	8	354953	354960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_003911	CTGG	2	8	358518	358525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003911	GAAA	2	8	360450	360457	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003911	GGCC	2	8	363513	363520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_003911	AAGT	2	8	376350	376357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003911	GTTC	2	8	376496	376503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_003911	CATG	2	8	376538	376545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_003911	ACGC	2	8	377116	377123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_003911	ACGG	2	8	386662	386669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_003911	GCCC	2	8	387492	387499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_003911	CGGG	2	8	394486	394493	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003911	CCTC	2	8	401819	401826	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_003911	CCGG	2	8	405934	405941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_003911	GGCA	2	8	417142	417149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_003911	ATCC	2	8	418302	418309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_003911	GCCT	2	8	424171	424178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_003911	AACG	2	8	425475	425482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_003911	CAAT	2	8	437692	437699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_003911	CGGG	2	8	443062	443069	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_003911	CCCG	2	8	445498	445505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_003911	ATGT	2	8	447647	447654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003911	GGCA	2	8	452730	452737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003911	CAAG	2	8	460440	460447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_003911	GGCG	2	8	467182	467189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_003911	GAAG	2	8	477752	477759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003911	CCGC	2	8	485349	485356	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_003911	TGGG	2	8	486380	486387	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003911	GAGT	2	8	490345	490352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003911	GCTG	2	8	491341	491348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_003911	GTTC	2	8	491462	491469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_003911	CTGT	2	8	493179	493186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_003911	CGTG	2	8	493302	493309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003911	TGGC	2	8	495484	495491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_003911	GGCG	2	8	496513	496520	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_003911	TTGT	2	8	496598	496605	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003911	GACC	2	8	501190	501197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_003911	AAGA	2	8	501630	501637	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003911	AAAC	2	8	501777	501784	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_003911	CAAG	2	8	502156	502163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_003911	CCTT	2	8	502243	502250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_003911	GTCC	2	8	502605	502612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_003911	CGGT	2	8	505574	505581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_003911	GCCC	2	8	508833	508840	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_003911	GCTA	2	8	508935	508942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_003911	CCCG	2	8	509404	509411	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_003911	CGGG	2	8	509418	509425	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_003911	GGCC	2	8	509458	509465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_003911	CCAC	2	8	512679	512686	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_003911	CCGC	2	8	512687	512694	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_003911	TTTC	2	8	512756	512763	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_003911	CGGG	2	8	512785	512792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_003911	CTGG	2	8	516519	516526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003911	CCGG	2	8	537687	537694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_003911	CGCC	2	8	541508	541515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_003911	AAGC	2	8	544620	544627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_003911	GCAG	2	8	553590	553597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003911	CGGG	2	8	560491	560498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_003911	GAGC	2	8	560894	560901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_003911	CGCT	2	8	561672	561679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_003911	GACA	2	8	562032	562039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_003911	TCTT	2	8	562111	562118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_003911	AGGG	2	8	563707	563714	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
155	NC_003911	AGAA	2	8	569776	569783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003911	TTCT	2	8	569800	569807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_003911	AGAA	2	8	597448	597455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_003911	TGGG	2	8	624401	624408	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_003911	CTGC	2	8	652893	652900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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188	NC_003911	CGAG	2	8	657649	657656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_003911	GTGA	2	8	667458	667465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_003911	GGCA	2	8	986317	986324	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_003911	CGGG	2	8	1001603	1001610	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
282	NC_003911	CCTG	2	8	1005423	1005430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
283	NC_003911	GGTG	2	8	1011204	1011211	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
284	NC_003911	GGCC	2	8	1012665	1012672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
285	NC_003911	GCAC	2	8	1013164	1013171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
286	NC_003911	AGAC	2	8	1015478	1015485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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294	NC_003911	ACAG	2	8	1028766	1028773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
295	NC_003911	CTTG	2	8	1031689	1031696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_003911	GGGT	2	8	1553429	1553436	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
484	NC_003911	GCAG	2	8	1560762	1560769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_003911	GAGG	2	8	1561644	1561651	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
486	NC_003911	GCCT	2	8	1569167	1569174	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_003911	GGGC	2	8	1579533	1579540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_003911	GAGG	2	8	1593607	1593614	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_003911	GCCC	2	8	1612772	1612779	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
498	NC_003911	GGGC	2	8	1612868	1612875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
499	NC_003911	CGCC	2	8	1613138	1613145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
500	NC_003911	GCTG	2	8	1613338	1613345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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