MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 59001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003911	TGC	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694929
2	NC_003911	GAA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694929
3	NC_003911	TCG	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694929
4	NC_003911	CGT	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694929
5	NC_003911	CGC	3	9	599	607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694929
6	NC_003911	AAC	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694929
7	NC_003911	GCG	2	6	1135	1140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694929
8	NC_003911	TGA	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694929
9	NC_003911	CGA	2	6	1236	1241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694929
10	NC_003911	GCT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694929
11	NC_003911	AGC	2	6	1441	1446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694929
12	NC_003911	GAC	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694929
13	NC_003911	GCG	2	6	1810	1815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694929
14	NC_003911	ATG	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694929
15	NC_003911	GTG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694930
16	NC_003911	CGG	2	6	2330	2335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694930
17	NC_003911	CGC	2	6	2384	2389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694930
18	NC_003911	ACG	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694930
19	NC_003911	GCG	2	6	2531	2536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694931
20	NC_003911	CGC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694931
21	NC_003911	TGG	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694931
22	NC_003911	GAC	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694931
23	NC_003911	CGG	2	6	2768	2773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694931
24	NC_003911	CTG	2	6	2809	2814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694931
25	NC_003911	GCA	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694931
26	NC_003911	CAA	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694931
27	NC_003911	GCA	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694931
28	NC_003911	TGA	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694931
29	NC_003911	CGC	2	6	3267	3272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694931
30	NC_003911	GCC	2	6	3374	3379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694932
31	NC_003911	CGT	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694932
32	NC_003911	CGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694932
33	NC_003911	CGA	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694932
34	NC_003911	ATC	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694932
35	NC_003911	GGC	2	6	3709	3714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694932
36	NC_003911	TGC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694932
37	NC_003911	GAC	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694932
38	NC_003911	TTG	2	6	3843	3848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694932
39	NC_003911	TCA	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694932
40	NC_003911	TCG	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694932
41	NC_003911	AAG	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694932
42	NC_003911	GGT	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694932
43	NC_003911	TGA	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694932
44	NC_003911	CAC	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694933
45	NC_003911	CAG	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694933
46	NC_003911	CGG	2	6	4286	4291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694933
47	NC_003911	GCC	2	6	4306	4311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694933
48	NC_003911	TGC	2	6	4342	4347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694933
49	NC_003911	ATC	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694933
50	NC_003911	TGA	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694933
51	NC_003911	GGC	2	6	4428	4433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694933
52	NC_003911	AGC	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694933
53	NC_003911	GCA	2	6	4457	4462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694933
54	NC_003911	GCG	2	6	4670	4675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694934
55	NC_003911	CAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694934
56	NC_003911	TCG	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694934
57	NC_003911	CAC	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694934
58	NC_003911	CGG	2	6	5021	5026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694934
59	NC_003911	CGT	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694934
60	NC_003911	CGG	2	6	5036	5041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694934
61	NC_003911	GGC	2	6	5352	5357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694934
62	NC_003911	CGG	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694934
63	NC_003911	CAT	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694934
64	NC_003911	CCG	2	6	5488	5493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694934
65	NC_003911	TGC	2	6	5674	5679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694934
66	NC_003911	GCG	2	6	5822	5827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694935
67	NC_003911	CGG	2	6	6021	6026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694935
68	NC_003911	CGG	2	6	6183	6188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694935
69	NC_003911	CAA	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694935
70	NC_003911	GGA	2	6	6216	6221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56694935
71	NC_003911	TTG	2	6	6248	6253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694935
72	NC_003911	CAG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694935
73	NC_003911	GGC	2	6	6303	6308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694936
74	NC_003911	AGC	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694936
75	NC_003911	ATG	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694936
76	NC_003911	CGG	2	6	6524	6529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694936
77	NC_003911	TCA	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694936
78	NC_003911	ACC	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694936
79	NC_003911	GCC	2	6	6636	6641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694936
80	NC_003911	GCC	2	6	6753	6758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694936
81	NC_003911	GGC	2	6	6771	6776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694936
82	NC_003911	CGC	2	6	6781	6786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694936
83	NC_003911	TGG	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694936
84	NC_003911	GCA	2	6	6809	6814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694936
85	NC_003911	CGG	2	6	6824	6829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694936
86	NC_003911	TGG	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694936
87	NC_003911	GCG	2	6	7215	7220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694937
88	NC_003911	GCT	2	6	7387	7392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694937
89	NC_003911	GAT	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694937
90	NC_003911	TGG	2	6	7596	7601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694937
91	NC_003911	GCC	2	6	7645	7650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694937
92	NC_003911	GGC	2	6	7681	7686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694937
93	NC_003911	GCC	2	6	7734	7739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694937
94	NC_003911	CAG	2	6	7766	7771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694937
95	NC_003911	GCC	2	6	7841	7846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694937
96	NC_003911	CTG	2	6	7874	7879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694937
97	NC_003911	CGA	2	6	7927	7932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694937
98	NC_003911	TGG	2	6	8046	8051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694937
99	NC_003911	AAC	2	6	8217	8222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694938
100	NC_003911	CCG	2	6	8248	8253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694938
101	NC_003911	GAG	2	6	8271	8276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56694938
102	NC_003911	CGA	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694938
103	NC_003911	GGC	2	6	8297	8302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694938
104	NC_003911	TGC	2	6	8449	8454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694938
105	NC_003911	ACA	2	6	8464	8469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694938
106	NC_003911	CGA	2	6	8495	8500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694938
107	NC_003911	GCT	2	6	8555	8560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694938
108	NC_003911	CGC	2	6	8596	8601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694938
109	NC_003911	ATC	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694938
110	NC_003911	TGC	2	6	8707	8712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694938
111	NC_003911	CTG	2	6	8721	8726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694938
112	NC_003911	TCG	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694938
113	NC_003911	GCC	2	6	8829	8834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694939
114	NC_003911	TCG	2	6	8880	8885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694939
115	NC_003911	GTG	2	6	8935	8940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694939
116	NC_003911	GGC	2	6	8946	8951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694939
117	NC_003911	TCG	2	6	8973	8978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694939
118	NC_003911	GCC	2	6	8996	9001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694939
119	NC_003911	ACC	2	6	9033	9038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694939
120	NC_003911	GGC	2	6	9060	9065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694939
121	NC_003911	CGG	2	6	9106	9111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694939
122	NC_003911	GTC	2	6	9350	9355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694939
123	NC_003911	GGC	2	6	9371	9376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694939
124	NC_003911	CCA	2	6	9382	9387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694939
125	NC_003911	AAC	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694939
126	NC_003911	ACC	2	6	9459	9464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694939
127	NC_003911	CGG	2	6	9481	9486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694939
128	NC_003911	CAG	2	6	9509	9514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694939
129	NC_003911	CAG	2	6	9572	9577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694939
130	NC_003911	CCA	2	6	9661	9666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694939
131	NC_003911	GGC	2	6	9673	9678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694939
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252	NC_003911	GAT	2	6	18299	18304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694946
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256	NC_003911	GAA	2	6	18789	18794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694947
257	NC_003911	GCC	2	6	18812	18817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694947
258	NC_003911	TGT	2	6	18896	18901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694947
259	NC_003911	TGC	3	9	18920	18928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694947
260	NC_003911	TGC	2	6	18973	18978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694947
261	NC_003911	ACT	2	6	19004	19009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694947
262	NC_003911	ACT	2	6	19078	19083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694947
263	NC_003911	CGC	2	6	19181	19186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694947
264	NC_003911	TGT	2	6	19201	19206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694947
265	NC_003911	GCT	2	6	19214	19219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694947
266	NC_003911	CGC	2	6	19364	19369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694948
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269	NC_003911	AGA	2	6	19645	19650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694948
270	NC_003911	AGA	2	6	19654	19659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694948
271	NC_003911	CGG	2	6	19670	19675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694948
272	NC_003911	GCC	2	6	19725	19730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694948
273	NC_003911	AGG	2	6	19750	19755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56694948
274	NC_003911	CGA	2	6	19778	19783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694948
275	NC_003911	GCG	2	6	19840	19845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694948
276	NC_003911	TGC	2	6	19861	19866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694948
277	NC_003911	GCG	2	6	19876	19881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694948
278	NC_003911	CGG	2	6	19888	19893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694948
279	NC_003911	GCG	2	6	19948	19953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694948
280	NC_003911	GGC	2	6	19973	19978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694948
281	NC_003911	TCG	2	6	20014	20019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694948
282	NC_003911	GCG	2	6	20025	20030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694948
283	NC_003911	CTG	2	6	20061	20066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694948
284	NC_003911	CAC	2	6	20117	20122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694948
285	NC_003911	CAT	2	6	20123	20128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694948
286	NC_003911	GGT	2	6	20225	20230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694948
287	NC_003911	CTG	2	6	20322	20327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694948
288	NC_003911	GAA	2	6	20411	20416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694948
289	NC_003911	TGA	2	6	20627	20632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694949
290	NC_003911	CGG	2	6	20663	20668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694949
291	NC_003911	TCC	2	6	20845	20850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56694949
292	NC_003911	CCG	2	6	21124	21129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694950
293	NC_003911	GTT	2	6	21137	21142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694950
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295	NC_003911	GAA	2	6	21184	21189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694950
296	NC_003911	GCG	2	6	21219	21224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694950
297	NC_003911	AGG	2	6	21225	21230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56694950
298	NC_003911	GCG	2	6	21297	21302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694950
299	NC_003911	CGA	2	6	21415	21420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694950
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302	NC_003911	TGG	2	6	21690	21695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694950
303	NC_003911	GAT	2	6	21769	21774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694950
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305	NC_003911	CGG	2	6	22029	22034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694950
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333	NC_003911	GGC	2	6	23857	23862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694953
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348	NC_003911	CAC	2	6	24693	24698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694954
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352	NC_003911	GGC	2	6	24987	24992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694954
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366	NC_003911	ATC	2	6	25911	25916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694955
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373	NC_003911	GGC	2	6	26303	26308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694955
374	NC_003911	GCT	3	9	26318	26326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
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376	NC_003911	GTG	2	6	26439	26444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694955
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382	NC_003911	TCG	2	6	26608	26613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694955
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