MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 3952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003910	GCAAT	2	10	4555	4564	40 %	20 %	20 %	20 %	71281227
2	NC_003910	TGAAG	2	10	5754	5763	40 %	20 %	40 %	0 %	71281227
3	NC_003910	ACAAA	2	10	7985	7994	80 %	0 %	0 %	20 %	71281166
4	NC_003910	AAATA	2	10	9413	9422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003910	AGGCA	2	10	9606	9615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003910	TTCAA	2	10	10504	10513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003910	TGAAG	2	10	10561	10570	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003910	TGCCT	2	10	10657	10666	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_003910	CAATA	2	10	11531	11540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003910	ATTGG	2	10	12270	12279	20 %	40 %	40 %	0 %	71279252
11	NC_003910	GTTGA	2	10	13399	13408	20 %	40 %	40 %	0 %	71279252
12	NC_003910	AGCAA	2	10	13569	13578	60 %	0 %	20 %	20 %	71279252
13	NC_003910	ATCCT	2	10	15599	15608	20 %	40 %	0 %	40 %	71280265
14	NC_003910	TCAAG	2	10	18857	18866	40 %	20 %	20 %	20 %	71280386
15	NC_003910	AAAAT	2	10	21124	21133	80 %	20 %	0 %	0 %	71279830
16	NC_003910	CAATA	2	10	23023	23032	60 %	20 %	0 %	20 %	71278391
17	NC_003910	TGCTG	2	10	23066	23075	0 %	40 %	40 %	20 %	71278391
18	NC_003910	TGTTT	2	10	23377	23386	0 %	80 %	20 %	0 %	71278391
19	NC_003910	ATGTT	2	10	25363	25372	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003910	ATTTA	2	10	25687	25696	40 %	60 %	0 %	0 %	71278476
21	NC_003910	TGATT	2	10	26546	26555	20 %	60 %	20 %	0 %	71278476
22	NC_003910	AGAGA	2	10	35907	35916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003910	GGTGA	2	10	37156	37165	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003910	AGTCG	2	10	38173	38182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003910	CAGGG	2	10	38395	38404	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_003910	AGGCG	2	10	38419	38428	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_003910	ACGAG	2	10	38587	38596	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_003910	TTCAT	2	10	41025	41034	20 %	60 %	0 %	20 %	71279898
29	NC_003910	AGAGA	2	10	45326	45335	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003910	GGTGA	2	10	46560	46569	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003910	AGTCG	2	10	47577	47586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_003910	CAGGG	2	10	47799	47808	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_003910	AGGCG	2	10	47823	47832	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_003910	ACGAG	2	10	47991	48000	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003910	AGAGA	2	10	51170	51179	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003910	GGTGA	2	10	52404	52413	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003910	AGTCG	2	10	53421	53430	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_003910	CAGGG	2	10	53643	53652	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_003910	AGGCG	2	10	53667	53676	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_003910	ACGAG	2	10	53835	53844	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_003910	AGTGA	2	10	55668	55677	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003910	TCACT	2	10	56000	56009	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_003910	TGTTT	2	10	56714	56723	0 %	80 %	20 %	0 %	71278093
44	NC_003910	GTAAA	2	10	58873	58882	60 %	20 %	20 %	0 %	71282060
45	NC_003910	TTGTT	2	10	58889	58898	0 %	80 %	20 %	0 %	71282060
46	NC_003910	AGAAT	2	10	59056	59065	60 %	20 %	20 %	0 %	71280454
47	NC_003910	ACTTT	2	10	63537	63546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003910	ATTAG	2	10	63608	63617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003910	TAACC	2	10	64833	64842	40 %	20 %	0 %	40 %	71278638
50	NC_003910	TAGCG	2	10	65538	65547	20 %	20 %	40 %	20 %	71281279
51	NC_003910	TTATT	2	10	69476	69485	20 %	80 %	0 %	0 %	71279659
52	NC_003910	TTTAG	2	10	69742	69751	20 %	60 %	20 %	0 %	71279659
53	NC_003910	TTACT	2	10	72865	72874	20 %	60 %	0 %	20 %	71280040
54	NC_003910	TCATT	2	10	73839	73848	20 %	60 %	0 %	20 %	71278400
55	NC_003910	TCTTT	2	10	74534	74543	0 %	80 %	0 %	20 %	71279232
56	NC_003910	TAATA	2	10	77915	77924	60 %	40 %	0 %	0 %	71278494
57	NC_003910	GTTAA	2	10	78867	78876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003910	ATTAA	2	10	79868	79877	60 %	40 %	0 %	0 %	71278746
59	NC_003910	TTACT	2	10	80977	80986	20 %	60 %	0 %	20 %	71282521
60	NC_003910	AAATT	2	10	87014	87023	60 %	40 %	0 %	0 %	71282216
61	NC_003910	AGGCA	2	10	88761	88770	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_003910	CCGTA	2	10	89553	89562	20 %	20 %	20 %	40 %	71277809
63	NC_003910	GGTAT	2	10	89593	89602	20 %	40 %	40 %	0 %	71277809
64	NC_003910	TTTGG	2	10	90509	90518	0 %	60 %	40 %	0 %	71277809
65	NC_003910	CAAAT	2	10	92527	92536	60 %	20 %	0 %	20 %	71278732
66	NC_003910	AGTAA	2	10	92630	92639	60 %	20 %	20 %	0 %	71278732
67	NC_003910	TCAGT	2	10	93659	93668	20 %	40 %	20 %	20 %	71278732
68	NC_003910	GGTAT	2	10	94147	94156	20 %	40 %	40 %	0 %	71282214
69	NC_003910	GATTC	2	10	95656	95665	20 %	40 %	20 %	20 %	71282010
70	NC_003910	AAGTA	2	10	95739	95748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003910	ATTTC	2	10	99526	99535	20 %	60 %	0 %	20 %	71280633
72	NC_003910	GAGGT	2	10	100479	100488	20 %	20 %	60 %	0 %	71280633
73	NC_003910	AGGCA	2	10	100622	100631	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_003910	GAAAC	2	10	106030	106039	60 %	0 %	20 %	20 %	71277993
75	NC_003910	TGTTT	2	10	107609	107618	0 %	80 %	20 %	0 %	71282477
76	NC_003910	TATTG	2	10	108299	108308	20 %	60 %	20 %	0 %	71281924
77	NC_003910	GCATT	2	10	108467	108476	20 %	40 %	20 %	20 %	71281924
78	NC_003910	AGAAA	2	10	109233	109242	80 %	0 %	20 %	0 %	71278418
79	NC_003910	TAAAC	2	10	109382	109391	60 %	20 %	0 %	20 %	71278418
80	NC_003910	TTACA	2	10	109766	109775	40 %	40 %	0 %	20 %	71278418
81	NC_003910	GGAAT	2	10	110315	110324	40 %	20 %	40 %	0 %	71277981
82	NC_003910	TTTAT	2	10	112449	112458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003910	AGGCA	2	10	115331	115340	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_003910	TTTTA	2	10	115630	115639	20 %	80 %	0 %	0 %	71282300
85	NC_003910	GATCA	2	10	117396	117405	40 %	20 %	20 %	20 %	71281278
86	NC_003910	CTTTT	2	10	121435	121444	0 %	80 %	0 %	20 %	71281794
87	NC_003910	GATTG	2	10	121775	121784	20 %	40 %	40 %	0 %	71281794
88	NC_003910	TGATG	2	10	122071	122080	20 %	40 %	40 %	0 %	71281794
89	NC_003910	ATTTT	2	10	122525	122534	20 %	80 %	0 %	0 %	71282504
90	NC_003910	CTTTA	2	10	127175	127184	20 %	60 %	0 %	20 %	71282364
91	NC_003910	TTACT	2	10	128789	128798	20 %	60 %	0 %	20 %	71281635
92	NC_003910	TTGGG	2	10	128839	128848	0 %	40 %	60 %	0 %	71281635
93	NC_003910	TTTAG	2	10	130777	130786	20 %	60 %	20 %	0 %	71281364
94	NC_003910	TGGCA	2	10	130935	130944	20 %	20 %	40 %	20 %	71281364
95	NC_003910	TTTGG	2	10	130945	130954	0 %	60 %	40 %	0 %	71281364
96	NC_003910	TATTT	2	10	131235	131244	20 %	80 %	0 %	0 %	71281364
97	NC_003910	AAGGG	2	10	131531	131540	40 %	0 %	60 %	0 %	71278425
98	NC_003910	TAAGC	2	10	132254	132263	40 %	20 %	20 %	20 %	71278425
99	NC_003910	AATAG	2	10	132524	132533	60 %	20 %	20 %	0 %	71278425
100	NC_003910	GTGCT	2	10	132778	132787	0 %	40 %	40 %	20 %	71278425
101	NC_003910	ATTAT	2	10	133686	133695	40 %	60 %	0 %	0 %	71277902
102	NC_003910	AATAG	2	10	133926	133935	60 %	20 %	20 %	0 %	71277902
103	NC_003910	TTCTT	2	10	134121	134130	0 %	80 %	0 %	20 %	71277902
104	NC_003910	TGCAT	2	10	135914	135923	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_003910	AGCGG	2	10	136701	136710	20 %	0 %	60 %	20 %	71281242
106	NC_003910	TTATC	2	10	137237	137246	20 %	60 %	0 %	20 %	71281242
107	NC_003910	TTTAT	2	10	137619	137628	20 %	80 %	0 %	0 %	71281242
108	NC_003910	AAATT	2	10	141020	141029	60 %	40 %	0 %	0 %	71281428
109	NC_003910	AGTTT	2	10	142804	142813	20 %	60 %	20 %	0 %	71278784
110	NC_003910	AATTA	2	10	143024	143033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003910	TGAGT	2	10	144287	144296	20 %	40 %	40 %	0 %	71279517
112	NC_003910	AACAG	2	10	148343	148352	60 %	0 %	20 %	20 %	71280909
113	NC_003910	GCTAT	2	10	152162	152171	20 %	40 %	20 %	20 %	71280394
114	NC_003910	AAAGT	2	10	155690	155699	60 %	20 %	20 %	0 %	71280524
115	NC_003910	AAATT	2	10	159973	159982	60 %	40 %	0 %	0 %	71282557
116	NC_003910	CAATT	2	10	160227	160236	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_003910	TTATA	2	10	160502	160511	40 %	60 %	0 %	0 %	71278303
118	NC_003910	TTGAA	2	10	160791	160800	40 %	40 %	20 %	0 %	71278303
119	NC_003910	GAAAA	2	10	160820	160829	80 %	0 %	20 %	0 %	71278303
120	NC_003910	AAACC	2	10	161926	161935	60 %	0 %	0 %	40 %	71281073
121	NC_003910	AGTAA	2	10	162137	162146	60 %	20 %	20 %	0 %	71281073
122	NC_003910	TGCCT	2	10	163267	163276	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_003910	AGCCT	2	10	164083	164092	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_003910	AAATA	2	10	164100	164109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003910	GATTG	2	10	165304	165313	20 %	40 %	40 %	0 %	71280373
126	NC_003910	TTTAA	2	10	165604	165613	40 %	60 %	0 %	0 %	71280373
127	NC_003910	CCAAA	2	10	166512	166521	60 %	0 %	0 %	40 %	71280110
128	NC_003910	CTTAC	2	10	170924	170933	20 %	40 %	0 %	40 %	71280363
129	NC_003910	ATGAA	2	10	173928	173937	60 %	20 %	20 %	0 %	71280824
130	NC_003910	ATCAG	2	10	174984	174993	40 %	20 %	20 %	20 %	71277787
131	NC_003910	CGAAT	2	10	176207	176216	40 %	20 %	20 %	20 %	71278984
132	NC_003910	TTAAC	2	10	176772	176781	40 %	40 %	0 %	20 %	71280723
133	NC_003910	CAAAC	2	10	178421	178430	60 %	0 %	0 %	40 %	71279107
134	NC_003910	AGAAT	2	10	179559	179568	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003910	CATTA	2	10	179728	179737	40 %	40 %	0 %	20 %	71282473
136	NC_003910	AATTT	2	10	181196	181205	40 %	60 %	0 %	0 %	71280441
137	NC_003910	AAGCT	2	10	182605	182614	40 %	20 %	20 %	20 %	71281498
138	NC_003910	AATTG	2	10	187806	187815	40 %	40 %	20 %	0 %	71279498
139	NC_003910	GGCAA	2	10	188174	188183	40 %	0 %	40 %	20 %	71279498
140	NC_003910	TTGCT	2	10	188830	188839	0 %	60 %	20 %	20 %	71279910
141	NC_003910	TTAGC	2	10	189037	189046	20 %	40 %	20 %	20 %	71279910
142	NC_003910	CTAAA	2	10	189663	189672	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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144	NC_003910	GGAAA	2	10	198948	198957	60 %	0 %	40 %	0 %	71279081
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192	NC_003910	TGTTT	2	10	261254	261263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_003910	ATTTT	2	10	266323	266332	20 %	80 %	0 %	0 %	71281705
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249	NC_003910	TACTT	2	10	341816	341825	20 %	60 %	0 %	20 %	71279403
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254	NC_003910	AAAGA	2	10	347527	347536	80 %	0 %	20 %	0 %	71280025
255	NC_003910	AGAGA	2	10	351923	351932	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
256	NC_003910	GGTGA	2	10	353157	353166	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
257	NC_003910	AGTCG	2	10	354174	354183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
258	NC_003910	CAGGG	2	10	354396	354405	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
259	NC_003910	AGGCG	2	10	354420	354429	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_003910	ACGAG	2	10	354588	354597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_003910	AGAGA	2	10	357774	357783	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_003910	GGTGA	2	10	359008	359017	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
263	NC_003910	AGTCG	2	10	360025	360034	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
264	NC_003910	CAGGG	2	10	360247	360256	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
265	NC_003910	AGGCG	2	10	360271	360280	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
266	NC_003910	ACGAG	2	10	360439	360448	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_003910	AGTGA	2	10	362272	362281	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
268	NC_003910	TAGCT	2	10	362864	362873	20 %	40 %	20 %	20 %	71278473
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271	NC_003910	AGTAA	2	10	367330	367339	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_003910	AAAAC	2	10	369553	369562	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_003910	TTATT	2	10	371743	371752	20 %	80 %	0 %	0 %	71280562
274	NC_003910	GGTGA	2	10	375253	375262	20 %	20 %	60 %	0 %	71280289
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407	NC_003910	GGGGC	2	10	536576	536585	0 %	0 %	80 %	20 %	71278710
408	NC_003910	TAATG	2	10	538557	538566	40 %	40 %	20 %	0 %	71282574
409	NC_003910	TTTAA	2	10	541122	541131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_003910	CAGGG	2	10	563947	563956	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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