MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 3183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003910	TAAA	2	8	6237	6244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003910	TAAT	2	8	6301	6308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003910	AAAT	2	8	9470	9477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003910	TTGA	2	8	9616	9623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003910	TAAA	2	8	10769	10776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003910	TTAC	2	8	11566	11573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003910	TGAA	2	8	15507	15514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003910	AATT	2	8	20742	20749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003910	GTAA	3	12	24796	24807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003910	TAAT	2	8	25350	25357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003910	TAGC	2	8	34174	34181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003910	TAAC	2	8	34465	34472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003910	TAGG	2	8	34733	34740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003910	AATG	2	8	34755	34762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003910	AAAT	2	8	34773	34780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003910	TTAT	2	8	34785	34792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003910	GGAA	2	8	35616	35623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003910	AAAG	2	8	36660	36667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003910	TGAA	2	8	36867	36874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003910	AGGT	2	8	37217	37224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003910	GCGA	2	8	37324	37331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003910	AAAG	2	8	38151	38158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003910	GACA	2	8	39419	39426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003910	TATT	2	8	40299	40306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003910	GTAA	2	8	40327	40334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003910	CCTC	2	8	40680	40687	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_003910	AACA	2	8	43740	43747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003910	ACTT	2	8	44008	44015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003910	TAGG	2	8	44153	44160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003910	AATG	2	8	44176	44183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003910	AAAT	2	8	44194	44201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003910	TTAG	2	8	44216	44223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003910	GGAA	2	8	45035	45042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003910	GCCT	2	8	45994	46001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_003910	AAAG	2	8	46066	46073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003910	AGGT	2	8	46621	46628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003910	GCGA	2	8	46728	46735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003910	AAAG	2	8	47555	47562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003910	GACA	2	8	48823	48830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003910	CTCA	2	8	49846	49853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_003910	AATG	2	8	50020	50027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003910	AAAT	2	8	50038	50045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003910	TTAT	2	8	50050	50057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003910	TTAG	2	8	50060	50067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003910	GGAA	2	8	50879	50886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003910	GCCT	2	8	51838	51845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_003910	AAAG	2	8	51910	51917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003910	TGAA	2	8	52115	52122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003910	AGGT	2	8	52465	52472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003910	GCGA	2	8	52572	52579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003910	AAAG	2	8	53399	53406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003910	GACA	2	8	54667	54674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003910	ATTA	2	8	56138	56145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003910	TTAA	2	8	60568	60575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003910	GAAA	3	12	63595	63606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003910	CAAT	2	8	67870	67877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003910	ATTT	2	8	67954	67961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003910	AAAT	2	8	68182	68189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003910	AAAT	2	8	78845	78852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003910	TAAA	2	8	81782	81789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003910	TAAT	2	8	88497	88504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003910	TAAT	2	8	88620	88627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003910	TAAC	2	8	88655	88662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003910	ACTA	2	8	88892	88899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003910	TTAT	2	8	89223	89230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003910	ATTT	2	8	91481	91488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003910	AAAT	2	8	93971	93978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003910	TATC	2	8	94562	94569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_003910	TATT	2	8	95731	95738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003910	AGAA	2	8	99455	99462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003910	TTGA	2	8	100632	100639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003910	TAAC	2	8	108856	108863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003910	TATT	2	8	108878	108885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003910	ATTC	2	8	118923	118930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_003910	AATT	2	8	118988	118995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003910	TAGT	2	8	120445	120452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003910	TTAC	2	8	120466	120473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_003910	ATTG	2	8	120613	120620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003910	TCAA	2	8	120893	120900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_003910	TTAA	2	8	120944	120951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003910	CTAT	2	8	125015	125022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003910	AATT	2	8	125043	125050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003910	ATTA	2	8	125073	125080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003910	CTAC	2	8	128008	128015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_003910	AATA	3	12	130597	130608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003910	TTAT	2	8	134530	134537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003910	TAAT	2	8	134706	134713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003910	TCAA	2	8	138890	138897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_003910	TGTC	2	8	146331	146338	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003910	TTTA	2	8	147257	147264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003910	ATAG	2	8	152565	152572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003910	TCTA	2	8	157269	157276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003910	ATTG	2	8	157449	157456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003910	TGTA	2	8	157542	157549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003910	TAAA	2	8	157717	157724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003910	ATTC	2	8	160210	160217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_003910	TCAA	2	8	163259	163266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003910	GATA	2	8	165726	165733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003910	TTTG	2	8	167103	167110	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003910	CAAA	2	8	167121	167128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003910	CAAT	2	8	168828	168835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_003910	CTAT	2	8	170808	170815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_003910	TAAA	2	8	171785	171792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003910	CAAA	2	8	174522	174529	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_003910	ATAA	2	8	179522	179529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003910	TAGT	2	8	179534	179541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003910	TAAT	2	8	183722	183729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003910	TTGA	2	8	183798	183805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003910	TGTT	2	8	183819	183826	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003910	TTAA	2	8	183925	183932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003910	TAAA	2	8	184356	184363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003910	TTAC	2	8	184419	184426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_003910	TTTG	2	8	187514	187521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003910	ATTA	2	8	187536	187543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003910	AAAT	2	8	188442	188449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003910	TAGT	2	8	189192	189199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003910	ATTG	2	8	191365	191372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003910	AATT	2	8	191520	191527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003910	TTAG	2	8	193562	193569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003910	AATA	2	8	193608	193615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003910	TGCA	2	8	202985	202992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_003910	TGCG	2	8	203042	203049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_003910	TAGA	2	8	203285	203292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003910	TAAA	2	8	204578	204585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003910	TCAT	2	8	204599	204606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_003910	TATT	2	8	205050	205057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003910	TATT	2	8	205308	205315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003910	TATT	2	8	205566	205573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003910	TAGG	2	8	205861	205868	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003910	GTTA	2	8	205885	205892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003910	TAAT	2	8	208582	208589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003910	TCAA	2	8	208854	208861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_003910	TAGA	2	8	209174	209181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003910	AATT	2	8	211045	211052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003910	AATA	2	8	211220	211227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003910	TTTA	2	8	211466	211473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003910	AACT	2	8	211482	211489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_003910	ATTA	2	8	213971	213978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003910	CTTG	2	8	214789	214796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_003910	ATTT	2	8	215790	215797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003910	ATGT	2	8	216000	216007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003910	AAAT	2	8	216014	216021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003910	CACT	2	8	216119	216126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_003910	ATTG	2	8	216367	216374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003910	ACTT	2	8	216497	216504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_003910	TTAT	2	8	216934	216941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003910	AATA	2	8	220852	220859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003910	AATT	2	8	222684	222691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003910	CAAA	2	8	227403	227410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_003910	CTTT	2	8	229184	229191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_003910	AAGT	2	8	230518	230525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003910	ATAA	2	8	240254	240261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003910	CTAA	2	8	241048	241055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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