MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces coelicolor A3(2) plasmid SCP2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003904	GGGGA	2	10	53	62	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003904	GGATC	2	10	713	722	20 %	20 %	40 %	20 %	21233965
3	NC_003904	TCGAC	2	10	784	793	20 %	20 %	20 %	40 %	21233965
4	NC_003904	GCTCC	2	10	1715	1724	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_003904	CGGCC	2	10	1892	1901	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_003904	CGAGT	2	10	2574	2583	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003904	CTCGC	2	10	2727	2736	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_003904	AGCCC	2	10	3000	3009	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_003904	TCGGC	2	10	3320	3329	0 %	20 %	40 %	40 %	21233967
10	NC_003904	CGGCG	2	10	4388	4397	0 %	0 %	60 %	40 %	21233968
11	NC_003904	CGGTA	2	10	5004	5013	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003904	CGGGG	2	10	5536	5545	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003904	CGGCC	2	10	6724	6733	0 %	0 %	40 %	60 %	21233970
14	NC_003904	GGGGC	2	10	6748	6757	0 %	0 %	80 %	20 %	21233970
15	NC_003904	CGTCG	2	10	7630	7639	0 %	20 %	40 %	40 %	21233972
16	NC_003904	CTTGG	2	10	8180	8189	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003904	CCCGG	2	10	9032	9041	0 %	0 %	40 %	60 %	21233973
18	NC_003904	CCCGA	2	10	10715	10724	20 %	0 %	20 %	60 %	21233975
19	NC_003904	GAACA	2	10	11153	11162	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003904	TCTGC	2	10	11696	11705	0 %	40 %	20 %	40 %	21233976
21	NC_003904	GGCCC	2	10	11900	11909	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_003904	GCGCT	2	10	12122	12131	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_003904	GGACG	2	10	12314	12323	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003904	GGCGC	2	10	12927	12936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_003904	TGCGG	2	10	13507	13516	0 %	20 %	60 %	20 %	21233977
26	NC_003904	CGGTG	2	10	14905	14914	0 %	20 %	60 %	20 %	21233978
27	NC_003904	CTGGT	2	10	16806	16815	0 %	40 %	40 %	20 %	21233982
28	NC_003904	GACCG	2	10	17456	17465	20 %	0 %	40 %	40 %	21233983
29	NC_003904	GGACG	2	10	21368	21377	20 %	0 %	60 %	20 %	21233986
30	NC_003904	GAACG	2	10	21615	21624	40 %	0 %	40 %	20 %	21233986
31	NC_003904	CGGAG	2	10	22616	22625	20 %	0 %	60 %	20 %	21233988
32	NC_003904	CGGCG	2	10	23140	23149	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_003904	CGGGG	2	10	24116	24125	0 %	0 %	80 %	20 %	21233989
34	NC_003904	GGGCC	2	10	25473	25482	0 %	0 %	60 %	40 %	21233992
35	NC_003904	CTCGT	2	10	25716	25725	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_003904	GGACG	2	10	25945	25954	20 %	0 %	60 %	20 %	21233993
37	NC_003904	GGTCG	2	10	26128	26137	0 %	20 %	60 %	20 %	21233993
38	NC_003904	GTTCG	2	10	26793	26802	0 %	40 %	40 %	20 %	21233994
39	NC_003904	GCCAG	2	10	27779	27788	20 %	0 %	40 %	40 %	21233995
40	NC_003904	GGAGA	2	10	27986	27995	40 %	0 %	60 %	0 %	21233996
41	NC_003904	CCGGA	2	10	30360	30369	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.