MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces coelicolor A3(2) plasmid SCP2

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003904	CGCC	2	8	425	432	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_003904	CGGC	2	8	817	824	0 %	0 %	50 %	50 %	21233965
3	NC_003904	GGGC	2	8	1045	1052	0 %	0 %	75 %	25 %	21233966
4	NC_003904	GGTG	2	8	1738	1745	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003904	CCCG	2	8	1812	1819	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_003904	CCGA	2	8	2897	2904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_003904	GGCC	2	8	2981	2988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_003904	CCGG	2	8	3392	3399	0 %	0 %	50 %	50 %	21233967
9	NC_003904	ACCG	2	8	4596	4603	25 %	0 %	25 %	50 %	21233968
10	NC_003904	GGCC	2	8	4699	4706	0 %	0 %	50 %	50 %	21233968
11	NC_003904	GCCG	2	8	5712	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	21233969
12	NC_003904	TCCG	2	8	6174	6181	0 %	25 %	25 %	50 %	21233970
13	NC_003904	CGGT	2	8	6854	6861	0 %	25 %	50 %	25 %	21233970
14	NC_003904	GCCG	2	8	6964	6971	0 %	0 %	50 %	50 %	21233970
15	NC_003904	ACGG	2	8	7108	7115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_003904	ACAG	2	8	7118	7125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003904	AGCA	2	8	7210	7217	50 %	0 %	25 %	25 %	21233971
18	NC_003904	CGGT	2	8	8019	8026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003904	TTGG	2	8	8146	8153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003904	TCCT	2	8	8397	8404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003904	GTTC	2	8	8595	8602	0 %	50 %	25 %	25 %	21233973
22	NC_003904	CGGT	2	8	8793	8800	0 %	25 %	50 %	25 %	21233973
23	NC_003904	CCGG	2	8	9169	9176	0 %	0 %	50 %	50 %	21233973
24	NC_003904	GCCG	2	8	9429	9436	0 %	0 %	50 %	50 %	21233974
25	NC_003904	GGCC	2	8	9630	9637	0 %	0 %	50 %	50 %	21233974
26	NC_003904	GCTC	2	8	9681	9688	0 %	25 %	25 %	50 %	21233974
27	NC_003904	CCAG	2	8	9799	9806	25 %	0 %	25 %	50 %	21233975
28	NC_003904	GGCG	2	8	10072	10079	0 %	0 %	75 %	25 %	21233975
29	NC_003904	GTGG	2	8	10112	10119	0 %	25 %	75 %	0 %	21233975
30	NC_003904	CCGG	2	8	10285	10292	0 %	0 %	50 %	50 %	21233975
31	NC_003904	CCGT	2	8	10323	10330	0 %	25 %	25 %	50 %	21233975
32	NC_003904	GCCG	2	8	10457	10464	0 %	0 %	50 %	50 %	21233975
33	NC_003904	GCAC	2	8	11143	11150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003904	CTGC	2	8	11465	11472	0 %	25 %	25 %	50 %	21233976
35	NC_003904	GCCG	2	8	12071	12078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_003904	CCCT	2	8	12339	12346	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_003904	AGCC	2	8	12355	12362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003904	CCGG	2	8	12558	12565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003904	CGTG	2	8	13469	13476	0 %	25 %	50 %	25 %	21233977
40	NC_003904	GCCC	2	8	13674	13681	0 %	0 %	25 %	75 %	21233977
41	NC_003904	CAGG	2	8	13746	13753	25 %	0 %	50 %	25 %	21233977
42	NC_003904	GGCC	2	8	13910	13917	0 %	0 %	50 %	50 %	21233977
43	NC_003904	CGGA	2	8	13934	13941	25 %	0 %	50 %	25 %	21233977
44	NC_003904	GGCG	2	8	13973	13980	0 %	0 %	75 %	25 %	21233977
45	NC_003904	GCAG	2	8	14212	14219	25 %	0 %	50 %	25 %	21233977
46	NC_003904	CGGG	2	8	14355	14362	0 %	0 %	75 %	25 %	21233977
47	NC_003904	GCAG	2	8	14514	14521	25 %	0 %	50 %	25 %	21233977
48	NC_003904	CGGC	2	8	14640	14647	0 %	0 %	50 %	50 %	21233977
49	NC_003904	TCGG	2	8	15104	15111	0 %	25 %	50 %	25 %	21233978
50	NC_003904	CGGG	2	8	15593	15600	0 %	0 %	75 %	25 %	21233979
51	NC_003904	CGGA	2	8	15752	15759	25 %	0 %	50 %	25 %	21233980
52	NC_003904	GCGG	2	8	17157	17164	0 %	0 %	75 %	25 %	21233983
53	NC_003904	CGGG	2	8	17317	17324	0 %	0 %	75 %	25 %	21233983
54	NC_003904	CCCG	2	8	17602	17609	0 %	0 %	25 %	75 %	21233983
55	NC_003904	TGGA	2	8	17673	17680	25 %	25 %	50 %	0 %	21233983
56	NC_003904	GCCG	2	8	18145	18152	0 %	0 %	50 %	50 %	21233983
57	NC_003904	CCGT	2	8	18273	18280	0 %	25 %	25 %	50 %	21233983
58	NC_003904	CCGG	2	8	18541	18548	0 %	0 %	50 %	50 %	21233984
59	NC_003904	GCGG	2	8	19668	19675	0 %	0 %	75 %	25 %	21233985
60	NC_003904	GCGG	2	8	19769	19776	0 %	0 %	75 %	25 %	21233986
61	NC_003904	CGTC	2	8	20119	20126	0 %	25 %	25 %	50 %	21233986
62	NC_003904	CCCG	2	8	20144	20151	0 %	0 %	25 %	75 %	21233986
63	NC_003904	GCGG	2	8	20273	20280	0 %	0 %	75 %	25 %	21233986
64	NC_003904	GGGT	2	8	20321	20328	0 %	25 %	75 %	0 %	21233986
65	NC_003904	GCCG	2	8	20780	20787	0 %	0 %	50 %	50 %	21233986
66	NC_003904	GCGG	2	8	20885	20892	0 %	0 %	75 %	25 %	21233986
67	NC_003904	CCGG	2	8	21254	21261	0 %	0 %	50 %	50 %	21233986
68	NC_003904	GCCG	2	8	21506	21513	0 %	0 %	50 %	50 %	21233986
69	NC_003904	CGGT	2	8	21766	21773	0 %	25 %	50 %	25 %	21233986
70	NC_003904	GTCA	2	8	21903	21910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003904	CCGG	2	8	21911	21918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_003904	CGGC	2	8	22417	22424	0 %	0 %	50 %	50 %	21233988
73	NC_003904	GGAC	2	8	22712	22719	25 %	0 %	50 %	25 %	21233988
74	NC_003904	GGCA	2	8	23009	23016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_003904	GGCG	2	8	23806	23813	0 %	0 %	75 %	25 %	21233989
76	NC_003904	GCCG	2	8	24284	24291	0 %	0 %	50 %	50 %	21233989
77	NC_003904	GGTC	2	8	24869	24876	0 %	25 %	50 %	25 %	21233990
78	NC_003904	ACGG	2	8	24966	24973	25 %	0 %	50 %	25 %	21233990
79	NC_003904	GCCA	2	8	24990	24997	25 %	0 %	25 %	50 %	21233990
80	NC_003904	CGGT	2	8	25704	25711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_003904	CGGT	2	8	26045	26052	0 %	25 %	50 %	25 %	21233993
82	NC_003904	CTTC	2	8	26508	26515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_003904	GTAC	2	8	26918	26925	25 %	25 %	25 %	25 %	21233994
84	NC_003904	CCGG	2	8	27177	27184	0 %	0 %	50 %	50 %	21233994
85	NC_003904	GTGG	2	8	27193	27200	0 %	25 %	75 %	0 %	21233994
86	NC_003904	ACGA	2	8	27462	27469	50 %	0 %	25 %	25 %	21233994
87	NC_003904	CACG	2	8	27560	27567	25 %	0 %	25 %	50 %	21233995
88	NC_003904	CCGT	2	8	27737	27744	0 %	25 %	25 %	50 %	21233995
89	NC_003904	GGCC	2	8	27794	27801	0 %	0 %	50 %	50 %	21233995
90	NC_003904	GGCG	2	8	28758	28765	0 %	0 %	75 %	25 %	21233997
91	NC_003904	CTCC	2	8	29105	29112	0 %	25 %	0 %	75 %	21233998
92	NC_003904	TCAC	2	8	29768	29775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_003904	CCCG	2	8	29816	29823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_003904	CGGC	2	8	29979	29986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_003904	AGGA	2	8	29994	30001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003904	AGGG	2	8	30120	30127	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003904	TGGG	2	8	30163	30170	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003904	GGTA	2	8	30176	30183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003904	GCGA	2	8	30630	30637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_003904	CCAG	2	8	30638	30645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_003904	GGCC	2	8	30696	30703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_003904	CCGC	2	8	30784	30791	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_003904	ACCG	2	8	31258	31265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.