MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces coelicolor A3(2) plasmid SCP2

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003904	CGCC	2	8	425	432	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_003904	GGTG	2	8	1738	1745	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003904	CCCG	2	8	1812	1819	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_003904	CCGA	2	8	2897	2904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_003904	GGCC	2	8	2981	2988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_003904	ACGG	2	8	7108	7115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003904	ACAG	2	8	7118	7125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003904	CGGT	2	8	8019	8026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003904	TTGG	2	8	8146	8153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003904	TCCT	2	8	8397	8404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003904	GCAC	2	8	11143	11150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_003904	GCCG	2	8	12071	12078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003904	CCCT	2	8	12339	12346	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_003904	AGCC	2	8	12355	12362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_003904	CCGG	2	8	12558	12565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_003904	GTCA	2	8	21903	21910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003904	CCGG	2	8	21911	21918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_003904	GGCA	2	8	23009	23016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003904	CGGT	2	8	25704	25711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003904	CTTC	2	8	26508	26515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003904	TCAC	2	8	29768	29775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_003904	CCCG	2	8	29816	29823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_003904	CGGC	2	8	29979	29986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_003904	AGGA	2	8	29994	30001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003904	AGGG	2	8	30120	30127	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003904	TGGG	2	8	30163	30170	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003904	GGTA	2	8	30176	30183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003904	GCGA	2	8	30630	30637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003904	CCAG	2	8	30638	30645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_003904	GGCC	2	8	30696	30703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_003904	CCGC	2	8	30784	30791	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_003904	ACCG	2	8	31258	31265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.