MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces coelicolor A3(2) plasmid SCP1

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003903	GCGTG	2	10	434	443	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_003903	GTGCC	2	10	1579	1588	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_003903	GGGCT	2	10	2891	2900	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_003903	GAAAG	2	10	6587	6596	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003903	CCGTG	2	10	19844	19853	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_003903	AGCGC	2	10	21987	21996	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_003903	CAGCA	2	10	22002	22011	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_003903	CACCG	2	10	22019	22028	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_003903	GCCCC	2	10	28966	28975	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_003903	CCGAA	2	10	33005	33014	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_003903	CGTTC	2	10	37231	37240	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_003903	GCGCT	2	10	39893	39902	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_003903	CCGCC	2	10	43437	43446	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14	NC_003903	CGGGG	2	10	45935	45944	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003903	GCCAG	2	10	46560	46569	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_003903	GCCAG	2	10	47744	47753	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_003903	CCTGG	2	10	48023	48032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_003903	GGGCT	2	10	72225	72234	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_003903	GGCCG	2	10	77239	77248	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_003903	GGCTG	2	10	77561	77570	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_003903	TGTTC	2	10	78563	78572	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_003903	CCGAG	2	10	80423	80432	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_003903	CACCT	2	10	82470	82479	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_003903	AGAGA	2	10	84825	84834	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003903	GTCGC	2	10	84928	84937	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_003903	CGTGC	2	10	90344	90353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_003903	TCCCT	2	10	92910	92919	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_003903	GCGGT	2	10	104494	104503	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003903	TGCCC	2	10	104994	105003	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_003903	CGGCC	2	10	107188	107197	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_003903	CTGCC	2	10	109932	109941	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_003903	CGCCC	2	10	112254	112263	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_003903	CCGTC	2	10	113721	113730	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_003903	GTCCT	2	10	119822	119831	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_003903	GCGAC	2	10	119903	119912	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_003903	GCTCG	2	10	123491	123500	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_003903	CGGCC	2	10	131238	131247	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_003903	GTGGC	2	10	133413	133422	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_003903	AGGGG	2	10	133678	133687	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003903	CCCCT	2	10	144281	144290	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
41	NC_003903	GGGAT	2	10	144427	144436	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003903	TGGCG	2	10	151765	151774	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003903	CCGGC	2	10	178078	178087	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_003903	TTCCG	2	10	183349	183358	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_003903	CGTGG	2	10	192508	192517	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_003903	TCCAG	2	10	197597	197606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_003903	CGCTG	2	10	197910	197919	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_003903	GAACG	2	10	206870	206879	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_003903	GCTGA	2	10	208158	208167	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003903	CGGGA	2	10	215213	215222	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003903	CGGGT	2	10	221070	221079	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_003903	CCTGC	2	10	237448	237457	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_003903	GCTGT	2	10	256895	256904	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_003903	CGGCC	2	10	257446	257455	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_003903	GTCTG	2	10	259929	259938	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_003903	CGGTG	2	10	261050	261059	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003903	GGCCC	2	10	263244	263253	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_003903	ACCAC	2	10	266224	266233	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_003903	TCCCG	2	10	266327	266336	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_003903	AGGGC	2	10	266709	266718	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_003903	AGCCC	2	10	283790	283799	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_003903	CTGGC	2	10	309455	309464	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_003903	CCCCG	2	10	310080	310089	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_003903	GGGGC	2	10	312576	312585	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_003903	GGTCT	2	10	316096	316105	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_003903	CAGCG	2	10	316121	316130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_003903	GAACG	2	10	318784	318793	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_003903	TTCGG	2	10	323010	323019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003903	ACCGG	2	10	326976	326985	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_003903	GGGGC	2	10	327049	327058	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
71	NC_003903	CGGTG	2	10	333996	334005	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_003903	GTGCT	2	10	334012	334021	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_003903	CACGG	2	10	336171	336180	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_003903	CATCC	2	10	343015	343024	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_003903	CTTTC	2	10	349428	349437	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_003903	TGCGC	2	10	349596	349605	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_003903	AGCCC	2	10	353124	353133	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_003903	CACGC	2	10	355581	355590	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.