MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Streptomyces coelicolor A3(2) plasmid SCP1

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003903	G	6	6	1	6	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003903	G	6	6	290	295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003903	G	6	6	1726	1731	0 %	0 %	100 %	0 %	21234001
4	NC_003903	C	6	6	6628	6633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_003903	C	6	6	11503	11508	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_003903	C	6	6	12202	12207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_003903	G	6	6	14631	14636	0 %	0 %	100 %	0 %	21234017
8	NC_003903	G	6	6	24937	24942	0 %	0 %	100 %	0 %	21234026
9	NC_003903	G	6	6	26487	26492	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003903	C	6	6	26509	26514	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_003903	C	6	6	27321	27326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_003903	G	6	6	28218	28223	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003903	G	6	6	33978	33983	0 %	0 %	100 %	0 %	21234035
14	NC_003903	G	6	6	38737	38742	0 %	0 %	100 %	0 %	21234040
15	NC_003903	G	6	6	40419	40424	0 %	0 %	100 %	0 %	21234041
16	NC_003903	C	6	6	42285	42290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_003903	G	6	6	46834	46839	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003903	C	6	6	48672	48677	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_003903	G	6	6	52491	52496	0 %	0 %	100 %	0 %	21234048
20	NC_003903	G	6	6	52498	52503	0 %	0 %	100 %	0 %	21234048
21	NC_003903	C	6	6	68662	68667	0 %	0 %	0 %	100 %	21234067
22	NC_003903	C	6	6	74712	74717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_003903	G	6	6	75934	75939	0 %	0 %	100 %	0 %	21234075
24	NC_003903	G	6	6	76324	76329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003903	G	6	6	78641	78646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003903	C	6	6	82773	82778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_003903	G	6	6	84000	84005	0 %	0 %	100 %	0 %	21234081
28	NC_003903	G	6	6	85855	85860	0 %	0 %	100 %	0 %	21234083
29	NC_003903	C	6	6	89949	89954	0 %	0 %	0 %	100 %	21234087
30	NC_003903	C	6	6	95961	95966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_003903	C	6	6	109258	109263	0 %	0 %	0 %	100 %	21234110
32	NC_003903	C	6	6	109313	109318	0 %	0 %	0 %	100 %	21234111
33	NC_003903	C	6	6	112231	112236	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_003903	G	6	6	117909	117914	0 %	0 %	100 %	0 %	21234121
35	NC_003903	C	6	6	118887	118892	0 %	0 %	0 %	100 %	21234123
36	NC_003903	C	6	6	120084	120089	0 %	0 %	0 %	100 %	21234124
37	NC_003903	G	6	6	122686	122691	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003903	C	7	7	123638	123644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_003903	C	6	6	132633	132638	0 %	0 %	0 %	100 %	21234136
40	NC_003903	C	6	6	133224	133229	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_003903	G	8	8	133328	133335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003903	G	6	6	146628	146633	0 %	0 %	100 %	0 %	21234148
43	NC_003903	C	6	6	147601	147606	0 %	0 %	0 %	100 %	21234149
44	NC_003903	G	6	6	148191	148196	0 %	0 %	100 %	0 %	21234150
45	NC_003903	C	6	6	149421	149426	0 %	0 %	0 %	100 %	21234150
46	NC_003903	G	6	6	153087	153092	0 %	0 %	100 %	0 %	21234154
47	NC_003903	G	6	6	159192	159197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003903	C	6	6	162559	162564	0 %	0 %	0 %	100 %	21234163
49	NC_003903	C	6	6	171785	171790	0 %	0 %	0 %	100 %	21234172
50	NC_003903	C	7	7	174175	174181	0 %	0 %	0 %	100 %	21234175
51	NC_003903	G	7	7	176669	176675	0 %	0 %	100 %	0 %	21234178
52	NC_003903	G	6	6	176724	176729	0 %	0 %	100 %	0 %	21234178
53	NC_003903	C	6	6	178330	178335	0 %	0 %	0 %	100 %	21234180
54	NC_003903	T	7	7	184352	184358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003903	C	8	8	184787	184794	0 %	0 %	0 %	100 %	21234189
56	NC_003903	C	6	6	185530	185535	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_003903	C	6	6	188350	188355	0 %	0 %	0 %	100 %	21234192
58	NC_003903	C	6	6	190119	190124	0 %	0 %	0 %	100 %	21234194
59	NC_003903	C	6	6	203214	203219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_003903	C	6	6	207704	207709	0 %	0 %	0 %	100 %	21234203
61	NC_003903	G	6	6	213129	213134	0 %	0 %	100 %	0 %	21234208
62	NC_003903	C	6	6	221798	221803	0 %	0 %	0 %	100 %	21234217
63	NC_003903	G	6	6	229179	229184	0 %	0 %	100 %	0 %	21234222
64	NC_003903	A	6	6	232886	232891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003903	C	6	6	234640	234645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_003903	A	6	6	236393	236398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003903	G	6	6	240357	240362	0 %	0 %	100 %	0 %	21234234
68	NC_003903	G	7	7	242548	242554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003903	C	6	6	243677	243682	0 %	0 %	0 %	100 %	21234238
70	NC_003903	C	6	6	243691	243696	0 %	0 %	0 %	100 %	21234238
71	NC_003903	G	6	6	245894	245899	0 %	0 %	100 %	0 %	21234240
72	NC_003903	C	6	6	247232	247237	0 %	0 %	0 %	100 %	21234242
73	NC_003903	C	6	6	247703	247708	0 %	0 %	0 %	100 %	21234242
74	NC_003903	G	6	6	250032	250037	0 %	0 %	100 %	0 %	21234244
75	NC_003903	C	6	6	256312	256317	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_003903	G	6	6	257506	257511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003903	C	6	6	260564	260569	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_003903	G	6	6	261671	261676	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003903	C	6	6	262535	262540	0 %	0 %	0 %	100 %	21234263
80	NC_003903	C	6	6	266416	266421	0 %	0 %	0 %	100 %	21234269
81	NC_003903	T	6	6	269521	269526	0 %	100 %	0 %	0 %	21234272
82	NC_003903	G	7	7	271007	271013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003903	C	7	7	271843	271849	0 %	0 %	0 %	100 %	21234273
84	NC_003903	G	6	6	277083	277088	0 %	0 %	100 %	0 %	21234273
85	NC_003903	G	6	6	277225	277230	0 %	0 %	100 %	0 %	21234273
86	NC_003903	A	6	6	277273	277278	100 %	0 %	0 %	0 %	21234273
87	NC_003903	G	6	6	277313	277318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003903	G	6	6	278049	278054	0 %	0 %	100 %	0 %	21234274
89	NC_003903	G	6	6	281307	281312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003903	G	6	6	287357	287362	0 %	0 %	100 %	0 %	21234283
91	NC_003903	C	6	6	303521	303526	0 %	0 %	0 %	100 %	21234302
92	NC_003903	C	6	6	303528	303533	0 %	0 %	0 %	100 %	21234302
93	NC_003903	G	6	6	307347	307352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003903	C	6	6	309185	309190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_003903	G	6	6	313734	313739	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003903	C	6	6	315600	315605	0 %	0 %	0 %	100 %	21234309
97	NC_003903	C	6	6	317282	317287	0 %	0 %	0 %	100 %	21234310
98	NC_003903	C	6	6	322041	322046	0 %	0 %	0 %	100 %	21234315
99	NC_003903	C	6	6	327801	327806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_003903	G	6	6	328698	328703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003903	G	6	6	329510	329515	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003903	C	6	6	329532	329537	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_003903	C	6	6	331082	331087	0 %	0 %	0 %	100 %	21234324
104	NC_003903	C	6	6	341388	341393	0 %	0 %	0 %	100 %	21234333
105	NC_003903	G	6	6	343817	343822	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003903	G	6	6	344516	344521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003903	G	6	6	349391	349396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003903	C	6	6	354293	354298	0 %	0 %	0 %	100 %	21234349
109	NC_003903	C	6	6	355729	355734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_003903	C	6	6	356018	356023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.