MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913 chromosome

Total Repeats: 14869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003902	CAGC	2	8	15	22	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003902	GATG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	21229479
3	NC_003902	CCCG	2	8	86	93	0 %	0 %	25 %	75 %	21229479
4	NC_003902	CGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	50 %	50 %	21229479
5	NC_003902	CGCA	2	8	699	706	25 %	0 %	25 %	50 %	21229479
6	NC_003902	TGCG	2	8	1066	1073	0 %	25 %	50 %	25 %	21229479
7	NC_003902	GCCG	2	8	1254	1261	0 %	0 %	50 %	50 %	21229479
8	NC_003902	GACC	2	8	1783	1790	25 %	0 %	25 %	50 %	21229480
9	NC_003902	CCTG	2	8	1885	1892	0 %	25 %	25 %	50 %	21229480
10	NC_003902	TGCG	2	8	2433	2440	0 %	25 %	50 %	25 %	21229480
11	NC_003902	CGAA	2	8	2466	2473	50 %	0 %	25 %	25 %	21229480
12	NC_003902	TGCC	2	8	2843	2850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003902	CGCA	2	8	2959	2966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_003902	TGGC	2	8	3030	3037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003902	CGAT	2	8	3627	3634	25 %	25 %	25 %	25 %	21229481
16	NC_003902	TCCA	2	8	3651	3658	25 %	25 %	0 %	50 %	21229481
17	NC_003902	CCAG	2	8	3693	3700	25 %	0 %	25 %	50 %	21229481
18	NC_003902	GCCT	2	8	4488	4495	0 %	25 %	25 %	50 %	21229481
19	NC_003902	CGTG	2	8	4823	4830	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003902	CGAA	2	8	5976	5983	50 %	0 %	25 %	25 %	21229482
21	NC_003902	GATC	2	8	6709	6716	25 %	25 %	25 %	25 %	21229482
22	NC_003902	GCAG	2	8	6781	6788	25 %	0 %	50 %	25 %	21229482
23	NC_003902	CGTG	2	8	7544	7551	0 %	25 %	50 %	25 %	21229483
24	NC_003902	CGCC	2	8	7687	7694	0 %	0 %	25 %	75 %	21229483
25	NC_003902	GCCT	2	8	7904	7911	0 %	25 %	25 %	50 %	21229483
26	NC_003902	TGAA	2	8	8261	8268	50 %	25 %	25 %	0 %	21229484
27	NC_003902	GCAA	2	8	8439	8446	50 %	0 %	25 %	25 %	21229484
28	NC_003902	CCAC	2	8	8958	8965	25 %	0 %	0 %	75 %	21229484
29	NC_003902	GGCC	2	8	9532	9539	0 %	0 %	50 %	50 %	21229485
30	NC_003902	ACCT	2	8	10175	10182	25 %	25 %	0 %	50 %	21229485
31	NC_003902	GCCG	2	8	11005	11012	0 %	0 %	50 %	50 %	21229486
32	NC_003902	GTCG	2	8	11086	11093	0 %	25 %	50 %	25 %	21229486
33	NC_003902	CGGC	2	8	11246	11253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003902	GGTG	2	8	11911	11918	0 %	25 %	75 %	0 %	21229487
35	NC_003902	GAAG	2	8	12281	12288	50 %	0 %	50 %	0 %	21229488
36	NC_003902	GCAA	2	8	13303	13310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003902	CACT	2	8	13682	13689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003902	GCCG	2	8	13693	13700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003902	CATC	2	8	13812	13819	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_003902	GACG	2	8	14057	14064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_003902	CGGT	2	8	14163	14170	0 %	25 %	50 %	25 %	21229490
42	NC_003902	GGCC	2	8	14298	14305	0 %	0 %	50 %	50 %	21229490
43	NC_003902	CATG	2	8	14682	14689	25 %	25 %	25 %	25 %	21229490
44	NC_003902	TGCG	2	8	15019	15026	0 %	25 %	50 %	25 %	21229491
45	NC_003902	CGGC	2	8	15292	15299	0 %	0 %	50 %	50 %	21229492
46	NC_003902	ACGC	2	8	15511	15518	25 %	0 %	25 %	50 %	21229492
47	NC_003902	GCCC	2	8	15609	15616	0 %	0 %	25 %	75 %	21229492
48	NC_003902	CCAG	2	8	15675	15682	25 %	0 %	25 %	50 %	21229492
49	NC_003902	GTTC	2	8	15951	15958	0 %	50 %	25 %	25 %	21229492
50	NC_003902	TGGG	2	8	16070	16077	0 %	25 %	75 %	0 %	21229492
51	NC_003902	GCCG	2	8	16099	16106	0 %	0 %	50 %	50 %	21229492
52	NC_003902	CATC	2	8	16155	16162	25 %	25 %	0 %	50 %	21229492
53	NC_003902	CCGC	2	8	16450	16457	0 %	0 %	25 %	75 %	21229492
54	NC_003902	GCCA	2	8	16658	16665	25 %	0 %	25 %	50 %	21229492
55	NC_003902	GCAG	2	8	16889	16896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003902	TGGC	2	8	17064	17071	0 %	25 %	50 %	25 %	21229493
57	NC_003902	GGTG	2	8	18259	18266	0 %	25 %	75 %	0 %	77747724
58	NC_003902	GCAG	2	8	18499	18506	25 %	0 %	50 %	25 %	77747724
59	NC_003902	CACG	2	8	18934	18941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_003902	CGTG	2	8	19238	19245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003902	GCCG	2	8	20662	20669	0 %	0 %	50 %	50 %	21229495
62	NC_003902	GGGT	2	8	21033	21040	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003902	CTGG	2	8	21145	21152	0 %	25 %	50 %	25 %	21229496
64	NC_003902	GCCG	2	8	21361	21368	0 %	0 %	50 %	50 %	21229496
65	NC_003902	ATTC	2	8	21574	21581	25 %	50 %	0 %	25 %	21229496
66	NC_003902	GCCG	2	8	22426	22433	0 %	0 %	50 %	50 %	21229498
67	NC_003902	CGGG	2	8	22606	22613	0 %	0 %	75 %	25 %	21229498
68	NC_003902	GCCG	2	8	22871	22878	0 %	0 %	50 %	50 %	21229498
69	NC_003902	CGGC	2	8	23412	23419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_003902	ATCG	2	8	23453	23460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003902	GTGC	2	8	23488	23495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003902	AGTG	2	8	23756	23763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003902	CGGC	2	8	24050	24057	0 %	0 %	50 %	50 %	21229499
74	NC_003902	GGCG	3	12	24126	24137	0 %	0 %	75 %	25 %	21229499
75	NC_003902	CACG	2	8	24992	24999	25 %	0 %	25 %	50 %	21229499
76	NC_003902	CGCC	2	8	25094	25101	0 %	0 %	25 %	75 %	21229499
77	NC_003902	CTGG	2	8	25565	25572	0 %	25 %	50 %	25 %	21229499
78	NC_003902	CAGC	2	8	25793	25800	25 %	0 %	25 %	50 %	21229500
79	NC_003902	CTGG	2	8	25813	25820	0 %	25 %	50 %	25 %	21229500
80	NC_003902	GCCC	2	8	25861	25868	0 %	0 %	25 %	75 %	21229500
81	NC_003902	CGTG	2	8	26770	26777	0 %	25 %	50 %	25 %	21229500
82	NC_003902	GCCA	2	8	27006	27013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_003902	GCGG	2	8	27021	27028	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_003902	CAGG	2	8	27090	27097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_003902	ACGT	2	8	27608	27615	25 %	25 %	25 %	25 %	21229501
86	NC_003902	CGCC	2	8	29933	29940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_003902	CAAT	2	8	30026	30033	50 %	25 %	0 %	25 %	21229503
88	NC_003902	AGTG	2	8	30374	30381	25 %	25 %	50 %	0 %	21229503
89	NC_003902	AGCA	2	8	30699	30706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003902	ACGC	2	8	31156	31163	25 %	0 %	25 %	50 %	21229504
91	NC_003902	TGCC	2	8	31399	31406	0 %	25 %	25 %	50 %	21229504
92	NC_003902	TCAT	2	8	31449	31456	25 %	50 %	0 %	25 %	21229504
93	NC_003902	CCCA	2	8	31544	31551	25 %	0 %	0 %	75 %	21229504
94	NC_003902	CGTT	2	8	32001	32008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003902	CAAA	2	8	32091	32098	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_003902	TGCG	2	8	32301	32308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_003902	TGGT	2	8	32496	32503	0 %	50 %	50 %	0 %	21229505
98	NC_003902	AGCC	2	8	32601	32608	25 %	0 %	25 %	50 %	21229505
99	NC_003902	ATTG	2	8	33055	33062	25 %	50 %	25 %	0 %	21229505
100	NC_003902	CTGC	2	8	33082	33089	0 %	25 %	25 %	50 %	21229505
101	NC_003902	TTGC	2	8	33179	33186	0 %	50 %	25 %	25 %	21229505
102	NC_003902	TGCA	2	8	33717	33724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_003902	GACA	2	8	33847	33854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003902	CAGG	2	8	33926	33933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_003902	GCCT	2	8	33994	34001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_003902	GCTC	2	8	34057	34064	0 %	25 %	25 %	50 %	21229506
107	NC_003902	GCCG	2	8	34142	34149	0 %	0 %	50 %	50 %	21229506
108	NC_003902	GCGG	2	8	35379	35386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_003902	CGCA	2	8	35552	35559	25 %	0 %	25 %	50 %	21229507
110	NC_003902	ATCT	2	8	36563	36570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_003902	TAGC	2	8	36629	36636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_003902	CAAG	2	8	37123	37130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_003902	AGCC	2	8	37157	37164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_003902	AAGT	2	8	37430	37437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003902	GCCA	2	8	37677	37684	25 %	0 %	25 %	50 %	21229508
116	NC_003902	CGCA	2	8	38111	38118	25 %	0 %	25 %	50 %	21229509
117	NC_003902	TCGA	2	8	38402	38409	25 %	25 %	25 %	25 %	21229509
118	NC_003902	CGGC	2	8	38641	38648	0 %	0 %	50 %	50 %	21229509
119	NC_003902	GCTT	2	8	39467	39474	0 %	50 %	25 %	25 %	21229509
120	NC_003902	CCAG	2	8	39664	39671	25 %	0 %	25 %	50 %	21229510
121	NC_003902	CAGG	2	8	40058	40065	25 %	0 %	50 %	25 %	21229510
122	NC_003902	GCCG	2	8	40129	40136	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
123	NC_003902	CGGT	2	8	40323	40330	0 %	25 %	50 %	25 %	21229510
124	NC_003902	ACGC	2	8	40568	40575	25 %	0 %	25 %	50 %	21229510
125	NC_003902	TCGA	2	8	41106	41113	25 %	25 %	25 %	25 %	21229510
126	NC_003902	GCCC	2	8	41383	41390	0 %	0 %	25 %	75 %	21229510
127	NC_003902	GGCC	2	8	42274	42281	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
128	NC_003902	GCTG	2	8	42370	42377	0 %	25 %	50 %	25 %	21229510
129	NC_003902	AGGT	2	8	42744	42751	25 %	25 %	50 %	0 %	21229510
130	NC_003902	GATC	2	8	42841	42848	25 %	25 %	25 %	25 %	21229510
131	NC_003902	CGGC	2	8	42895	42902	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
132	NC_003902	GCCG	2	8	43028	43035	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
133	NC_003902	CATG	2	8	43213	43220	25 %	25 %	25 %	25 %	21229510
134	NC_003902	GCCG	2	8	43787	43794	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
135	NC_003902	TTGC	2	8	44718	44725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_003902	CGGC	2	8	44952	44959	0 %	0 %	50 %	50 %	21229512
137	NC_003902	GCTG	2	8	45340	45347	0 %	25 %	50 %	25 %	21229512
138	NC_003902	AGCC	2	8	45996	46003	25 %	0 %	25 %	50 %	21229512
139	NC_003902	GGTA	2	8	46217	46224	25 %	25 %	50 %	0 %	21229513
140	NC_003902	CGCC	2	8	46441	46448	0 %	0 %	25 %	75 %	21229513
141	NC_003902	CATC	2	8	46481	46488	25 %	25 %	0 %	50 %	21229513
142	NC_003902	GCGT	2	8	46939	46946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_003902	AGCG	2	8	47048	47055	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_003902	ATCG	2	8	47949	47956	25 %	25 %	25 %	25 %	21229514
145	NC_003902	TGGT	2	8	47974	47981	0 %	50 %	50 %	0 %	21229514
146	NC_003902	GCAT	2	8	48798	48805	25 %	25 %	25 %	25 %	21229515
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