MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913 chromosome

Total Repeats: 76129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003902	TTG	2	6	175	180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229479
2	NC_003902	CGG	2	6	322	327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229479
3	NC_003902	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229479
4	NC_003902	CTG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229479
5	NC_003902	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229479
6	NC_003902	CGG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229479
7	NC_003902	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229479
8	NC_003902	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229479
9	NC_003902	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229479
10	NC_003902	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229479
11	NC_003902	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229479
12	NC_003902	GGA	2	6	707	712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21229479
13	NC_003902	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229479
14	NC_003902	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229479
15	NC_003902	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229479
16	NC_003902	GCG	2	6	873	878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229479
17	NC_003902	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229479
18	NC_003902	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229479
19	NC_003902	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229479
20	NC_003902	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229479
21	NC_003902	CAG	3	9	1074	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229479
22	NC_003902	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229479
23	NC_003902	ACT	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229479
24	NC_003902	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229479
25	NC_003902	GGT	2	6	1693	1698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229480
26	NC_003902	GTC	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229480
27	NC_003902	AAC	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21229480
28	NC_003902	CAG	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229480
29	NC_003902	TTA	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21229480
30	NC_003902	CTG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229480
31	NC_003902	CTG	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229480
32	NC_003902	ATC	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229480
33	NC_003902	GCT	2	6	2251	2256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229480
34	NC_003902	CTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229480
35	NC_003902	GGC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229480
36	NC_003902	GCG	2	6	2325	2330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229480
37	NC_003902	GCG	2	6	2453	2458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229480
38	NC_003902	GAA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229480
39	NC_003902	GAT	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229480
40	NC_003902	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229480
41	NC_003902	CGA	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229480
42	NC_003902	TCG	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229480
43	NC_003902	AGC	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229480
44	NC_003902	CGT	2	6	2722	2727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229480
45	NC_003902	TCG	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229481
46	NC_003902	GCC	2	6	3928	3933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229481
47	NC_003902	GGT	2	6	3983	3988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229481
48	NC_003902	GGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229481
49	NC_003902	CGG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229481
50	NC_003902	GCC	2	6	4321	4326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229481
51	NC_003902	CTG	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229481
52	NC_003902	GTT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229481
53	NC_003902	GGA	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21229481
54	NC_003902	CAT	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229481
55	NC_003902	GAT	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229481
56	NC_003902	TCA	3	9	4580	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229481
57	NC_003902	CGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
58	NC_003902	TGC	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
59	NC_003902	ACG	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
60	NC_003902	CAC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229482
61	NC_003902	GGT	2	6	5008	5013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229482
62	NC_003902	CGA	2	6	5026	5031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
63	NC_003902	GAA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229482
64	NC_003902	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
65	NC_003902	CGG	2	6	5182	5187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229482
66	NC_003902	CGA	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
67	NC_003902	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229482
68	NC_003902	GGT	2	6	5245	5250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229482
69	NC_003902	CAG	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
70	NC_003902	AGC	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
71	NC_003902	CAC	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229482
72	NC_003902	CGG	2	6	5394	5399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229482
73	NC_003902	CGA	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
74	NC_003902	GCG	2	6	5505	5510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229482
75	NC_003902	CGA	2	6	5521	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
76	NC_003902	GGC	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229482
77	NC_003902	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229482
78	NC_003902	GGC	2	6	5714	5719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229482
79	NC_003902	CGA	2	6	5818	5823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
80	NC_003902	CGG	2	6	5922	5927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229482
81	NC_003902	TCG	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
82	NC_003902	GCC	2	6	6014	6019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229482
83	NC_003902	GCC	2	6	6032	6037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229482
84	NC_003902	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229482
85	NC_003902	TCG	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
86	NC_003902	TGC	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
87	NC_003902	CGA	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
88	NC_003902	ACC	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229482
89	NC_003902	CAT	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229482
90	NC_003902	TGA	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229482
91	NC_003902	GCT	3	9	6406	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
92	NC_003902	TTC	2	6	6419	6424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229482
93	NC_003902	GCC	2	6	6475	6480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229482
94	NC_003902	GAC	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
95	NC_003902	CAG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
96	NC_003902	CGA	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229482
97	NC_003902	GCC	2	6	6598	6603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229482
98	NC_003902	CTG	3	9	6629	6637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
99	NC_003902	AGG	2	6	6654	6659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21229482
100	NC_003902	GCC	2	6	6718	6723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229482
101	NC_003902	GTG	2	6	6731	6736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229482
102	NC_003902	GCC	3	9	6854	6862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229482
103	NC_003902	TGC	2	6	6909	6914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
104	NC_003902	GTG	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229482
105	NC_003902	CAA	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21229482
106	NC_003902	GCT	2	6	7057	7062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
107	NC_003902	GAA	2	6	7064	7069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229482
108	NC_003902	GCC	2	6	7080	7085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229482
109	NC_003902	CTG	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229482
110	NC_003902	GGC	2	6	7195	7200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229482
111	NC_003902	TGG	2	6	7233	7238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229482
112	NC_003902	TTC	2	6	7375	7380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229483
113	NC_003902	CCG	2	6	7429	7434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229483
114	NC_003902	CTG	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229483
115	NC_003902	TGC	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229483
116	NC_003902	GCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229483
117	NC_003902	GGC	2	6	7557	7562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229483
118	NC_003902	GCC	2	6	7587	7592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229483
119	NC_003902	GCT	2	6	7619	7624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229483
120	NC_003902	CGG	2	6	7651	7656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229483
121	NC_003902	TGC	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229483
122	NC_003902	GCC	2	6	7758	7763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229483
123	NC_003902	GAA	2	6	7848	7853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229483
124	NC_003902	GAA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229483
125	NC_003902	CTG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229483
126	NC_003902	GTT	2	6	7937	7942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229483
127	NC_003902	CTG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229483
128	NC_003902	GGC	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229483
129	NC_003902	GTG	2	6	7980	7985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229483
130	NC_003902	CAG	2	6	7988	7993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229483
131	NC_003902	CGG	2	6	8075	8080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229483
132	NC_003902	GCG	2	6	8088	8093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229483
133	NC_003902	CAA	2	6	8153	8158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21229483
134	NC_003902	GTT	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229484
135	NC_003902	GTT	2	6	8285	8290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229484
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151	NC_003902	CAG	2	6	9029	9034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229484
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153	NC_003902	ATC	2	6	9248	9253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229485
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157	NC_003902	CGA	2	6	9484	9489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229485
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163	NC_003902	GCA	2	6	9598	9603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229485
164	NC_003902	ACA	2	6	9627	9632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21229485
165	NC_003902	CAG	2	6	9686	9691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229485
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258	NC_003902	TCC	2	6	15803	15808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21229492
259	NC_003902	GTT	2	6	15816	15821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229492
260	NC_003902	TCC	2	6	15866	15871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21229492
261	NC_003902	CAC	2	6	15895	15900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229492
262	NC_003902	TCG	2	6	15962	15967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229492
263	NC_003902	GCC	2	6	15979	15984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229492
264	NC_003902	AGC	2	6	16064	16069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229492
265	NC_003902	GTA	2	6	16246	16251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229492
266	NC_003902	GAT	2	6	16291	16296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229492
267	NC_003902	CGC	2	6	16297	16302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229492
268	NC_003902	CCA	2	6	16320	16325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229492
269	NC_003902	GCT	2	6	16345	16350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229492
270	NC_003902	GGT	2	6	16363	16368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229492
271	NC_003902	GCT	2	6	16420	16425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229492
272	NC_003902	AGT	2	6	16497	16502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229492
273	NC_003902	CAG	2	6	16507	16512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229492
274	NC_003902	GAT	2	6	16582	16587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229492
275	NC_003902	CAG	2	6	16603	16608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229492
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279	NC_003902	CGA	2	6	17085	17090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229493
280	NC_003902	CGA	2	6	17124	17129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229493
281	NC_003902	CAT	2	6	17142	17147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229493
282	NC_003902	GCT	2	6	17316	17321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229493
283	NC_003902	CGC	2	6	17606	17611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229493
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287	NC_003902	GTT	2	6	17793	17798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229493
288	NC_003902	CAC	2	6	17818	17823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229493
289	NC_003902	TGA	2	6	17843	17848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229493
290	NC_003902	GCG	2	6	17867	17872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229493
291	NC_003902	CTG	2	6	17932	17937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229493
292	NC_003902	CGC	2	6	17983	17988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229493
293	NC_003902	CCG	2	6	18015	18020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229493
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297	NC_003902	TGG	2	6	18217	18222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77747724
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383	NC_003902	CGG	2	6	25397	25402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229499
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500	NC_003902	GTC	2	6	34616	34621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229506

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