MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 1218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003901	TACAG	2	10	9426	9435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_003901	AATAA	2	10	10939	10948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003901	AGTAA	2	10	11415	11424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003901	AATAA	2	10	11450	11459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003901	CTGTA	2	10	11581	11590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003901	CATGG	2	10	11837	11846	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003901	GAAAA	2	10	13801	13810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003901	ATGGG	2	10	13863	13872	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003901	TTTCT	2	10	17830	17839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003901	TAATT	2	10	18552	18561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003901	TCTTT	2	10	18582	18591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003901	TTTCA	2	10	19529	19538	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003901	TCAAT	2	10	24130	24139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_003901	CCGAT	2	10	28118	28127	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_003901	CAATT	2	10	33206	33215	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003901	CAATT	2	10	33477	33486	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003901	AAAAT	2	10	33502	33511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003901	TTACC	2	10	34131	34140	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_003901	ATGAA	2	10	36081	36090	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003901	ATTTT	2	10	39026	39035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003901	AAGTT	2	10	44529	44538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003901	CCGCC	2	10	46047	46056	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
23	NC_003901	CTTTA	2	10	46157	46166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003901	ATTTT	2	10	50741	50750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003901	CAATT	2	10	54767	54776	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_003901	ATATA	2	10	57716	57725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003901	AATAG	2	10	64774	64783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003901	ACATA	2	10	68659	68668	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003901	TATAA	2	10	76257	76266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003901	TAAAT	2	10	77724	77733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003901	TATTT	2	10	85583	85592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003901	TAAAA	2	10	85828	85837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003901	TTATT	2	10	89192	89201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003901	TAAAA	2	10	89461	89470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003901	AGAAA	2	10	101165	101174	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003901	AGGTC	2	10	104445	104454	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_003901	TTATT	2	10	104713	104722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003901	TGAAA	2	10	107518	107527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003901	TGAAA	2	10	107552	107561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003901	AGATG	2	10	107583	107592	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003901	TGAAA	2	10	107603	107612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003901	AGATA	2	10	113738	113747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003901	CTGAA	2	10	115790	115799	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_003901	GAAAA	2	10	116454	116463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003901	CTATC	2	10	121864	121873	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_003901	AATTT	2	10	128975	128984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003901	GAAAA	2	10	132528	132537	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003901	CATTT	2	10	133260	133269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_003901	GAATA	2	10	133463	133472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003901	TCTTT	2	10	146314	146323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003901	TGTTT	2	10	149728	149737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003901	GAAAG	2	10	154825	154834	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003901	ATTAA	2	10	155193	155202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003901	ACCTG	2	10	161112	161121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_003901	CTGCC	2	10	162417	162426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_003901	AGCGA	2	10	163642	163651	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003901	AGAAA	2	10	164104	164113	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003901	AGAAA	2	10	171537	171546	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003901	GAAAG	2	10	171551	171560	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003901	AAAGG	2	10	172439	172448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003901	AAAGA	2	10	172526	172535	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003901	GATTT	2	10	172611	172620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003901	AAACA	2	10	180024	180033	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_003901	TATTT	2	10	181254	181263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003901	TTAAT	2	10	186787	186796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003901	TGGAT	2	10	187253	187262	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003901	TCTCT	2	10	193447	193456	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_003901	AATTA	2	10	193574	193583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003901	GTAAT	2	10	208277	208286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003901	CTGAA	2	10	215414	215423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_003901	ATAAA	2	10	217409	217418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003901	AGATT	2	10	217702	217711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003901	AACTG	2	10	218993	219002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_003901	ATTAT	2	10	229308	229317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003901	TATAT	2	10	229320	229329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003901	GCATC	2	10	229740	229749	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_003901	TAAAA	2	10	229855	229864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003901	AAAAG	2	10	229981	229990	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003901	TCAAC	2	10	230035	230044	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_003901	TTTCT	2	10	230215	230224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003901	CAAAA	2	10	231538	231547	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_003901	TCGCT	2	10	231745	231754	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_003901	AGATA	2	10	231802	231811	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003901	CAGTA	2	10	231967	231976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_003901	TCGTC	2	10	232638	232647	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_003901	GAGCC	2	10	234995	235004	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_003901	AACCG	2	10	236901	236910	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_003901	AATTA	2	10	237801	237810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003901	AAAAT	2	10	241912	241921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003901	AAATT	2	10	242708	242717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003901	AAATC	2	10	250569	250578	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_003901	CCCAT	2	10	257889	257898	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_003901	TCTCC	2	10	279940	279949	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_003901	GATAA	2	10	281293	281302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003901	ACTAT	2	10	281320	281329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_003901	AAATC	2	10	282625	282634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_003901	CTCTT	2	10	283962	283971	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_003901	AGCTT	2	10	292616	292625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_003901	AAAAT	2	10	295465	295474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003901	ATTAA	2	10	302443	302452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003901	CTACC	2	10	302597	302606	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_003901	AGTGA	2	10	307905	307914	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003901	TTTCC	2	10	310575	310584	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_003901	CATTT	2	10	313671	313680	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_003901	ATAAA	2	10	317183	317192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003901	GAAGG	2	10	321455	321464	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003901	TTTAA	2	10	327107	327116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003901	AACTC	2	10	329118	329127	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_003901	ATCTG	2	10	335052	335061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_003901	GTTAA	2	10	335314	335323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003901	ACAGC	2	10	336168	336177	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_003901	GGGAT	2	10	337105	337114	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003901	TGGCA	2	10	342532	342541	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_003901	GATGA	2	10	344655	344664	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003901	CCTTC	2	10	344889	344898	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_003901	AGGAA	2	10	357296	357305	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003901	TTAAA	2	10	358780	358789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003901	ACAGA	2	10	359260	359269	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_003901	TTCAG	2	10	359659	359668	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_003901	ATTTT	2	10	361790	361799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003901	CTATA	2	10	361937	361946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_003901	TAAAT	2	10	377659	377668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003901	AAAAT	2	10	385516	385525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003901	AAAAG	2	10	385820	385829	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003901	GAAAA	2	10	385867	385876	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003901	CATTT	2	10	386725	386734	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_003901	GATAA	2	10	388031	388040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003901	TAAAT	2	10	389443	389452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003901	TTTCC	2	10	392970	392979	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_003901	ATATT	2	10	393297	393306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003901	GTTTT	2	10	393401	393410	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003901	TTTTG	2	10	393416	393425	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003901	TATAT	2	10	399579	399588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003901	ATACA	2	10	406665	406674	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_003901	TATTT	2	10	408528	408537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003901	ATAAA	2	10	409005	409014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003901	TGATG	2	10	410188	410197	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003901	ATATA	2	10	410359	410368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003901	CACTG	2	10	421325	421334	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_003901	TTACG	2	10	421382	421391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_003901	ATTAA	2	10	430265	430274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003901	AATTA	2	10	440539	440548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003901	TAAAT	2	10	441204	441213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003901	AGTCC	2	10	441253	441262	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_003901	GTACT	2	10	443023	443032	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_003901	GGTCT	2	10	453983	453992	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_003901	TGATC	2	10	456894	456903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_003901	AGGAG	2	10	461504	461513	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003901	TTTCC	2	10	461596	461605	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_003901	CTGTG	2	10	461606	461615	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_003901	AGATA	2	10	467691	467700	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003901	ATTTG	2	10	469766	469775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003901	TTAAC	2	10	487768	487777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_003901	TAGGG	2	10	493712	493721	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_003901	AGATT	2	10	531510	531519	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_003901	TTAAA	2	10	561369	561378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_003901	TTGCT	2	10	568332	568341	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_003901	TAAAA	2	10	568727	568736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_003901	TCGCT	2	10	571784	571793	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
171	NC_003901	TTGAT	2	10	573959	573968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_003901	AAAAT	2	10	575076	575085	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_003901	TTCAA	2	10	576622	576631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_003901	AAAAG	2	10	579620	579629	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_003901	AGAAA	2	10	585199	585208	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_003901	TGGAC	2	10	587688	587697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_003901	AGATT	2	10	603877	603886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_003901	GATTC	2	10	603894	603903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_003901	GAAAA	2	10	604826	604835	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_003901	AAAAG	2	10	604879	604888	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003901	AAAAG	2	10	604931	604940	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_003901	AGTTT	2	10	606123	606132	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_003901	AAGAA	2	10	609912	609921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_003901	TGGAC	2	10	619500	619509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_003901	AATAA	2	10	629011	629020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_003901	GAAAA	2	10	632336	632345	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_003901	ATAAA	2	10	632564	632573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_003901	CTTTC	2	10	635732	635741	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
197	NC_003901	GAAAA	2	10	637514	637523	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_003901	ACCGG	2	10	637590	637599	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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202	NC_003901	AGAAT	2	10	663294	663303	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_003901	ATTTG	2	10	668222	668231	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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206	NC_003901	TTACT	2	10	677914	677923	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
207	NC_003901	TTCTT	2	10	678883	678892	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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209	NC_003901	CTTAA	2	10	701385	701394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
210	NC_003901	TACAC	2	10	705453	705462	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
211	NC_003901	TATAA	2	10	705762	705771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_003901	TTATC	2	10	804808	804817	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
235	NC_003901	TATAT	2	10	806564	806573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_003901	AAAAG	2	10	808325	808334	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_003901	ATGAA	2	10	812496	812505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_003901	AAGAT	2	10	819872	819881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
243	NC_003901	AAAGG	2	10	825293	825302	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_003901	AATAA	2	10	843482	843491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_003901	CCTAT	2	10	849365	849374	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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251	NC_003901	TTTGT	2	10	856695	856704	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
252	NC_003901	GTCAA	2	10	858184	858193	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_003901	AATAG	2	10	862822	862831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_003901	TTATG	2	10	862898	862907	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_003901	CATTG	2	10	887784	887793	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
256	NC_003901	TGAAG	2	10	893155	893164	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_003901	CTTTT	2	10	896806	896815	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_003901	CTTTT	2	10	917900	917909	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_003901	TCCAT	2	10	918897	918906	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_003901	TCAAA	2	10	978797	978806	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_003901	ATACT	2	10	992650	992659	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_003901	AGGGG	2	10	992926	992935	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
285	NC_003901	GAAAA	2	10	998503	998512	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_003901	CTTAA	2	10	1002237	1002246	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_003901	TTAAT	2	10	1005263	1005272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_003901	TTAGA	2	10	1009159	1009168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_003901	AGGCA	2	10	1013848	1013857	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_003901	TTAGC	2	10	1032597	1032606	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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495	NC_003901	TCTTT	2	10	1697932	1697941	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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