MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 10688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003901	CATT	2	8	256	263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003901	GATC	2	8	1226	1233	25 %	25 %	25 %	25 %	21226103
3	NC_003901	TTCC	2	8	1243	1250	0 %	50 %	0 %	50 %	21226103
4	NC_003901	CAGG	2	8	1430	1437	25 %	0 %	50 %	25 %	21226103
5	NC_003901	AGGC	2	8	1662	1669	25 %	0 %	50 %	25 %	21226103
6	NC_003901	GCTG	2	8	1949	1956	0 %	25 %	50 %	25 %	21226103
7	NC_003901	ATTA	2	8	2019	2026	50 %	50 %	0 %	0 %	21226103
8	NC_003901	TTCA	2	8	2194	2201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003901	TCTG	2	8	2598	2605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003901	GATG	2	8	2676	2683	25 %	25 %	50 %	0 %	21226104
11	NC_003901	CAGC	2	8	2729	2736	25 %	0 %	25 %	50 %	21226104
12	NC_003901	ACGG	2	8	2980	2987	25 %	0 %	50 %	25 %	21226104
13	NC_003901	AGCC	2	8	3198	3205	25 %	0 %	25 %	50 %	21226104
14	NC_003901	CTTC	2	8	3433	3440	0 %	50 %	0 %	50 %	21226104
15	NC_003901	TTCC	2	8	3459	3466	0 %	50 %	0 %	50 %	21226104
16	NC_003901	AGGC	2	8	3802	3809	25 %	0 %	50 %	25 %	21226104
17	NC_003901	TAAA	2	8	4327	4334	75 %	25 %	0 %	0 %	21226105
18	NC_003901	AAGT	2	8	4575	4582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003901	GTTT	2	8	4687	4694	0 %	75 %	25 %	0 %	21226106
20	NC_003901	CAGT	2	8	4760	4767	25 %	25 %	25 %	25 %	21226106
21	NC_003901	AAAG	2	8	4909	4916	75 %	0 %	25 %	0 %	21226106
22	NC_003901	GAAT	2	8	4997	5004	50 %	25 %	25 %	0 %	21226106
23	NC_003901	CTGG	2	8	5070	5077	0 %	25 %	50 %	25 %	21226106
24	NC_003901	CTGG	2	8	5983	5990	0 %	25 %	50 %	25 %	21226107
25	NC_003901	TTTC	2	8	5999	6006	0 %	75 %	0 %	25 %	21226107
26	NC_003901	ATGA	2	8	6480	6487	50 %	25 %	25 %	0 %	21226107
27	NC_003901	CAGA	2	8	6627	6634	50 %	0 %	25 %	25 %	21226108
28	NC_003901	AGAA	2	8	6815	6822	75 %	0 %	25 %	0 %	21226108
29	NC_003901	ACCC	2	8	7089	7096	25 %	0 %	0 %	75 %	21226108
30	NC_003901	GAAC	2	8	7422	7429	50 %	0 %	25 %	25 %	21226108
31	NC_003901	GTCT	2	8	7557	7564	0 %	50 %	25 %	25 %	21226109
32	NC_003901	GGCT	2	8	7832	7839	0 %	25 %	50 %	25 %	21226109
33	NC_003901	AGCA	2	8	8636	8643	50 %	0 %	25 %	25 %	21226110
34	NC_003901	GGGA	2	8	8723	8730	25 %	0 %	75 %	0 %	21226110
35	NC_003901	GCAA	2	8	8946	8953	50 %	0 %	25 %	25 %	21226110
36	NC_003901	TCTT	2	8	9438	9445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003901	TTTA	2	8	9758	9765	25 %	75 %	0 %	0 %	21226111
38	NC_003901	GGAA	2	8	9892	9899	50 %	0 %	50 %	0 %	21226111
39	NC_003901	TTCC	2	8	10003	10010	0 %	50 %	0 %	50 %	21226111
40	NC_003901	AAGA	2	8	12555	12562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003901	AAGC	2	8	13098	13105	50 %	0 %	25 %	25 %	21226113
42	NC_003901	ATTT	2	8	13283	13290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003901	TTTG	2	8	13304	13311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003901	AGAA	2	8	13624	13631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003901	GCAG	2	8	13830	13837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003901	GAAA	2	8	14324	14331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003901	ATGA	2	8	14697	14704	50 %	25 %	25 %	0 %	21226114
48	NC_003901	GAAA	2	8	14714	14721	75 %	0 %	25 %	0 %	21226114
49	NC_003901	GCCT	2	8	14819	14826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_003901	TTAT	2	8	15847	15854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003901	TGGG	2	8	16538	16545	0 %	25 %	75 %	0 %	21226116
52	NC_003901	CATC	2	8	17008	17015	25 %	25 %	0 %	50 %	21226117
53	NC_003901	TTCA	2	8	17398	17405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_003901	ATAA	2	8	17487	17494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003901	CAAA	2	8	17568	17575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003901	TTGT	2	8	17798	17805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003901	AAGA	2	8	18768	18775	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003901	GGAG	2	8	19470	19477	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003901	TTAT	2	8	19741	19748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003901	GCCT	2	8	20427	20434	0 %	25 %	25 %	50 %	21226119
61	NC_003901	CTTT	2	8	20470	20477	0 %	75 %	0 %	25 %	21226119
62	NC_003901	AAAC	2	8	20846	20853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003901	ATCT	2	8	21201	21208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003901	ACCC	2	8	21568	21575	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_003901	CCTT	2	8	22985	22992	0 %	50 %	0 %	50 %	21226121
66	NC_003901	TAGG	2	8	23117	23124	25 %	25 %	50 %	0 %	21226121
67	NC_003901	TGAT	2	8	23328	23335	25 %	50 %	25 %	0 %	21226121
68	NC_003901	TGTT	2	8	24193	24200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003901	GCTT	2	8	25008	25015	0 %	50 %	25 %	25 %	21226122
70	NC_003901	CCTT	2	8	25506	25513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_003901	CAAA	2	8	25965	25972	75 %	0 %	0 %	25 %	21226123
72	NC_003901	AATT	2	8	26277	26284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003901	TCAA	2	8	26464	26471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_003901	AGTT	2	8	26648	26655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003901	GCCT	2	8	26874	26881	0 %	25 %	25 %	50 %	21226124
76	NC_003901	GCTG	2	8	27012	27019	0 %	25 %	50 %	25 %	21226125
77	NC_003901	AGGA	2	8	27061	27068	50 %	0 %	50 %	0 %	21226125
78	NC_003901	ACAT	2	8	27345	27352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_003901	CGTT	2	8	28233	28240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_003901	GCAG	2	8	28654	28661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_003901	TTCC	2	8	28741	28748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_003901	TGTT	2	8	28862	28869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003901	AAAT	2	8	29322	29329	75 %	25 %	0 %	0 %	21226128
84	NC_003901	CCTT	2	8	29334	29341	0 %	50 %	0 %	50 %	21226128
85	NC_003901	TATT	2	8	29560	29567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003901	TGAT	2	8	29611	29618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003901	TTCC	2	8	29945	29952	0 %	50 %	0 %	50 %	21226129
88	NC_003901	AAAG	2	8	30186	30193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003901	ATGT	2	8	30462	30469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003901	CATA	2	8	30484	30491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003901	ATTT	2	8	30589	30596	25 %	75 %	0 %	0 %	21226130
92	NC_003901	CATT	2	8	30620	30627	25 %	50 %	0 %	25 %	21226130
93	NC_003901	GAGT	2	8	30940	30947	25 %	25 %	50 %	0 %	21226130
94	NC_003901	TGAC	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	21226130
95	NC_003901	TCAT	2	8	31270	31277	25 %	50 %	0 %	25 %	21226130
96	NC_003901	GAAA	2	8	31281	31288	75 %	0 %	25 %	0 %	21226130
97	NC_003901	GATG	2	8	31650	31657	25 %	25 %	50 %	0 %	21226130
98	NC_003901	TTCA	2	8	32038	32045	25 %	50 %	0 %	25 %	21226130
99	NC_003901	ATCA	2	8	32099	32106	50 %	25 %	0 %	25 %	21226130
100	NC_003901	GATT	2	8	32209	32216	25 %	50 %	25 %	0 %	21226130
101	NC_003901	AGAT	2	8	32980	32987	50 %	25 %	25 %	0 %	21226130
102	NC_003901	ATGA	2	8	33032	33039	50 %	25 %	25 %	0 %	21226130
103	NC_003901	TAAA	2	8	33182	33189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003901	TGAT	2	8	33440	33447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003901	CTTT	2	8	34611	34618	0 %	75 %	0 %	25 %	21226132
106	NC_003901	AATT	2	8	34978	34985	50 %	50 %	0 %	0 %	21226132
107	NC_003901	TACC	2	8	35638	35645	25 %	25 %	0 %	50 %	21226132
108	NC_003901	TTAT	2	8	35750	35757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003901	TTCT	2	8	35986	35993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_003901	AGTT	2	8	36295	36302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003901	GCCT	2	8	36521	36528	0 %	25 %	25 %	50 %	21226133
112	NC_003901	GCTG	2	8	36659	36666	0 %	25 %	50 %	25 %	21226134
113	NC_003901	AGGA	2	8	36708	36715	50 %	0 %	50 %	0 %	21226134
114	NC_003901	ATTC	2	8	37381	37388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003901	TAAA	2	8	37719	37726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003901	AAAT	2	8	37961	37968	75 %	25 %	0 %	0 %	21226136
117	NC_003901	ATTA	2	8	38403	38410	50 %	50 %	0 %	0 %	21226136
118	NC_003901	AAAT	2	8	38451	38458	75 %	25 %	0 %	0 %	21226136
119	NC_003901	GTTT	2	8	38861	38868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003901	ATTT	2	8	38938	38945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003901	GTAA	2	8	40039	40046	50 %	25 %	25 %	0 %	21226137
122	NC_003901	CTGA	2	8	40116	40123	25 %	25 %	25 %	25 %	21226137
123	NC_003901	TTTC	2	8	40634	40641	0 %	75 %	0 %	25 %	21226137
124	NC_003901	AGAT	2	8	41124	41131	50 %	25 %	25 %	0 %	21226137
125	NC_003901	TACT	2	8	41826	41833	25 %	50 %	0 %	25 %	21226137
126	NC_003901	AAAT	2	8	41876	41883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003901	TTTG	2	8	42069	42076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003901	TTCA	2	8	42749	42756	25 %	50 %	0 %	25 %	21226138
129	NC_003901	GTAC	2	8	43617	43624	25 %	25 %	25 %	25 %	21226138
130	NC_003901	ATTT	2	8	43817	43824	25 %	75 %	0 %	0 %	21226138
131	NC_003901	TTAA	2	8	44322	44329	50 %	50 %	0 %	0 %	21226138
132	NC_003901	TTTC	2	8	44382	44389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_003901	ATCA	2	8	44473	44480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_003901	GGGC	2	8	45504	45511	0 %	0 %	75 %	25 %	161485685
135	NC_003901	ATCG	2	8	45599	45606	25 %	25 %	25 %	25 %	161485685
136	NC_003901	CTTC	2	8	46174	46181	0 %	50 %	0 %	50 %	21226140
137	NC_003901	CTTG	2	8	46352	46359	0 %	50 %	25 %	25 %	21226140
138	NC_003901	CACC	2	8	48549	48556	25 %	0 %	0 %	75 %	21226140
139	NC_003901	GGTC	2	8	49219	49226	0 %	25 %	50 %	25 %	21226140
140	NC_003901	CTTT	2	8	49363	49370	0 %	75 %	0 %	25 %	21226140
141	NC_003901	CCTG	2	8	49454	49461	0 %	25 %	25 %	50 %	21226141
142	NC_003901	GTAA	2	8	50332	50339	50 %	25 %	25 %	0 %	21226141
143	NC_003901	GTCA	2	8	50368	50375	25 %	25 %	25 %	25 %	21226141
144	NC_003901	TTCT	2	8	50694	50701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003901	TTAC	2	8	50943	50950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_003901	AATG	2	8	51251	51258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003901	TATT	2	8	51362	51369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003901	TTGA	2	8	51686	51693	25 %	50 %	25 %	0 %	21226142
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477	NC_003901	ATTT	2	8	164739	164746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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