MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces coelicolor A3(2) chromosome

Total Repeats: 8713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003888	TCGCT	2	10	198	207	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_003888	TAGTG	2	10	342	351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003888	CGGCG	2	10	747	756	0 %	0 %	60 %	40 %	21218583
4	NC_003888	GGCGC	2	10	886	895	0 %	0 %	60 %	40 %	21218583
5	NC_003888	CCGGT	2	10	1505	1514	0 %	20 %	40 %	40 %	21218584
6	NC_003888	CCATC	2	10	2271	2280	20 %	20 %	0 %	60 %	21218584
7	NC_003888	GCATC	2	10	5128	5137	20 %	20 %	20 %	40 %	21218585
8	NC_003888	TGGCA	2	10	5601	5610	20 %	20 %	40 %	20 %	21218585
9	NC_003888	TGGGC	2	10	6806	6815	0 %	20 %	60 %	20 %	21226092
10	NC_003888	CTGGC	2	10	7415	7424	0 %	20 %	40 %	40 %	32141096
11	NC_003888	CGGTG	2	10	8691	8700	0 %	20 %	60 %	20 %	32141096
12	NC_003888	CGGCA	2	10	12756	12765	20 %	0 %	40 %	40 %	21218592
13	NC_003888	AGCGC	2	10	13672	13681	20 %	0 %	40 %	40 %	21218593
14	NC_003888	GTCCG	2	10	13909	13918	0 %	20 %	40 %	40 %	21218593
15	NC_003888	CCCGG	2	10	14352	14361	0 %	0 %	40 %	60 %	21218594
16	NC_003888	CTGAG	2	10	14522	14531	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003888	CGTCA	2	10	15233	15242	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_003888	CGGCC	2	10	17737	17746	0 %	0 %	40 %	60 %	21218598
19	NC_003888	GCCCG	2	10	18079	18088	0 %	0 %	40 %	60 %	21218599
20	NC_003888	CCGCG	2	10	18664	18673	0 %	0 %	40 %	60 %	21218600
21	NC_003888	GACGC	2	10	20554	20563	20 %	0 %	40 %	40 %	32141097
22	NC_003888	TCCGC	2	10	23654	23663	0 %	20 %	20 %	60 %	21218605
23	NC_003888	GGCCC	2	10	24334	24343	0 %	0 %	40 %	60 %	21218606
24	NC_003888	CCGGG	2	10	25398	25407	0 %	0 %	60 %	40 %	21218609
25	NC_003888	CGGGC	2	10	26683	26692	0 %	0 %	60 %	40 %	21218612
26	NC_003888	CGACC	2	10	28326	28335	20 %	0 %	20 %	60 %	21218612
27	NC_003888	CGGCT	2	10	29175	29184	0 %	20 %	40 %	40 %	21218613
28	NC_003888	AGCCG	2	10	29451	29460	20 %	0 %	40 %	40 %	21218613
29	NC_003888	GCGAG	2	10	30121	30130	20 %	0 %	60 %	20 %	21218615
30	NC_003888	GGACG	2	10	30327	30336	20 %	0 %	60 %	20 %	21218615
31	NC_003888	GCGCG	2	10	30562	30571	0 %	0 %	60 %	40 %	21218616
32	NC_003888	GCCCG	2	10	31310	31319	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_003888	GCCGG	2	10	32058	32067	0 %	0 %	60 %	40 %	21218618
34	NC_003888	CGTCG	2	10	32077	32086	0 %	20 %	40 %	40 %	21218618
35	NC_003888	CGGTG	2	10	33309	33318	0 %	20 %	60 %	20 %	21218619
36	NC_003888	CTGGA	2	10	33582	33591	20 %	20 %	40 %	20 %	21218620
37	NC_003888	CCGGC	2	10	34324	34333	0 %	0 %	40 %	60 %	21218621
38	NC_003888	GGGCC	2	10	38951	38960	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_003888	GGCCC	2	10	38968	38977	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_003888	TCGGC	2	10	40735	40744	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_003888	CGGTC	2	10	40888	40897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_003888	CCACC	2	10	41088	41097	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_003888	GCCAG	2	10	42641	42650	20 %	0 %	40 %	40 %	21218630
44	NC_003888	CCCTG	2	10	43960	43969	0 %	20 %	20 %	60 %	21218632
45	NC_003888	CCGGC	2	10	43978	43987	0 %	0 %	40 %	60 %	21218632
46	NC_003888	CGCAT	2	10	44327	44336	20 %	20 %	20 %	40 %	21218633
47	NC_003888	ACCAC	2	10	45847	45856	40 %	0 %	0 %	60 %	21218634
48	NC_003888	TGCCG	2	10	46417	46426	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_003888	GTGCC	2	10	46914	46923	0 %	20 %	40 %	40 %	21218636
50	NC_003888	CGGCC	2	10	48121	48130	0 %	0 %	40 %	60 %	21218637
51	NC_003888	GCCGG	2	10	48954	48963	0 %	0 %	60 %	40 %	21218638
52	NC_003888	GTCCG	2	10	48976	48985	0 %	20 %	40 %	40 %	21218638
53	NC_003888	GCCGC	2	10	49243	49252	0 %	0 %	40 %	60 %	21218638
54	NC_003888	TCGCG	2	10	50975	50984	0 %	20 %	40 %	40 %	21218639
55	NC_003888	GCCCG	2	10	51156	51165	0 %	0 %	40 %	60 %	21218639
56	NC_003888	GGCCC	2	10	54292	54301	0 %	0 %	40 %	60 %	21218642
57	NC_003888	CGGCA	2	10	56963	56972	20 %	0 %	40 %	40 %	21218644
58	NC_003888	GGCCT	2	10	57191	57200	0 %	20 %	40 %	40 %	21218644
59	NC_003888	GGTCA	2	10	59516	59525	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_003888	GGTCG	2	10	61115	61124	0 %	20 %	60 %	20 %	32141098
61	NC_003888	AGGTC	2	10	61846	61855	20 %	20 %	40 %	20 %	32141098
62	NC_003888	GGTCG	2	10	62060	62069	0 %	20 %	60 %	20 %	32141098
63	NC_003888	TCGTC	2	10	62863	62872	0 %	40 %	20 %	40 %	32141098
64	NC_003888	GGCTT	2	10	63855	63864	0 %	40 %	40 %	20 %	32141098
65	NC_003888	CCCAC	2	10	64636	64645	20 %	0 %	0 %	80 %	21218647
66	NC_003888	CCCTG	2	10	64795	64804	0 %	20 %	20 %	60 %	21218647
67	NC_003888	CACGA	2	10	66489	66498	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_003888	GGCAC	2	10	66932	66941	20 %	0 %	40 %	40 %	21218650
69	NC_003888	TGAAC	2	10	68107	68116	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_003888	GGCAC	2	10	68713	68722	20 %	0 %	40 %	40 %	21218651
71	NC_003888	CGGTC	2	10	69355	69364	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_003888	GTTCG	2	10	69826	69835	0 %	40 %	40 %	20 %	21218652
73	NC_003888	TCGGG	2	10	70025	70034	0 %	20 %	60 %	20 %	21218652
74	NC_003888	AGGCG	2	10	72097	72106	20 %	0 %	60 %	20 %	21218654
75	NC_003888	CCGCG	2	10	73111	73120	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_003888	GCCGG	2	10	76538	76547	0 %	0 %	60 %	40 %	21218658
77	NC_003888	CGGGA	2	10	79482	79491	20 %	0 %	60 %	20 %	21218661
78	NC_003888	CAGAG	2	10	81383	81392	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_003888	AGTTG	2	10	82168	82177	20 %	40 %	40 %	0 %	21218664
80	NC_003888	GTGGC	2	10	83390	83399	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003888	AGCGA	2	10	83803	83812	40 %	0 %	40 %	20 %	161353684
82	NC_003888	CGCGC	2	10	85204	85213	0 %	0 %	40 %	60 %	21218666
83	NC_003888	GGAGG	2	10	85250	85259	20 %	0 %	80 %	0 %	21218666
84	NC_003888	TCGCA	2	10	85443	85452	20 %	20 %	20 %	40 %	21218667
85	NC_003888	GGCAT	2	10	85791	85800	20 %	20 %	40 %	20 %	21218667
86	NC_003888	GAACG	2	10	87002	87011	40 %	0 %	40 %	20 %	21218668
87	NC_003888	GAGTC	2	10	88983	88992	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_003888	ACCGG	2	10	90064	90073	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_003888	CCGGT	2	10	90868	90877	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_003888	ACGGG	2	10	92085	92094	20 %	0 %	60 %	20 %	21218675
91	NC_003888	ACCGC	2	10	92256	92265	20 %	0 %	20 %	60 %	21218675
92	NC_003888	CGACA	2	10	95192	95201	40 %	0 %	20 %	40 %	21218678
93	NC_003888	ACCCG	2	10	95741	95750	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_003888	CGCAC	2	10	96933	96942	20 %	0 %	20 %	60 %	21218679
95	NC_003888	AGCGG	2	10	98184	98193	20 %	0 %	60 %	20 %	21218680
96	NC_003888	GCCGG	2	10	98488	98497	0 %	0 %	60 %	40 %	32141099
97	NC_003888	TCGCT	2	10	99949	99958	0 %	40 %	20 %	40 %	21218681
98	NC_003888	CCTCG	2	10	100246	100255	0 %	20 %	20 %	60 %	21218682
99	NC_003888	CGGGG	2	10	102079	102088	0 %	0 %	80 %	20 %	21218683
100	NC_003888	CGGGG	2	10	102926	102935	0 %	0 %	80 %	20 %	21218683
101	NC_003888	GGGCG	2	10	102988	102997	0 %	0 %	80 %	20 %	21218683
102	NC_003888	GCGCG	2	10	103630	103639	0 %	0 %	60 %	40 %	21218684
103	NC_003888	CCGTC	2	10	105033	105042	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_003888	CGGGC	2	10	105167	105176	0 %	0 %	60 %	40 %	21218685
105	NC_003888	TCCCG	2	10	105669	105678	0 %	20 %	20 %	60 %	21218685
106	NC_003888	CGCCC	2	10	105704	105713	0 %	0 %	20 %	80 %	21218685
107	NC_003888	ACCAC	2	10	107292	107301	40 %	0 %	0 %	60 %	21218686
108	NC_003888	CACTG	2	10	108777	108786	20 %	20 %	20 %	40 %	21218686
109	NC_003888	GGCGC	2	10	108823	108832	0 %	0 %	60 %	40 %	21218686
110	NC_003888	TCGCC	2	10	109227	109236	0 %	20 %	20 %	60 %	21218686
111	NC_003888	CGCTG	2	10	109957	109966	0 %	20 %	40 %	40 %	21218686
112	NC_003888	TCCCG	2	10	110068	110077	0 %	20 %	20 %	60 %	21218686
113	NC_003888	GCGGG	2	10	111097	111106	0 %	0 %	80 %	20 %	21218686
114	NC_003888	GCCCG	2	10	111217	111226	0 %	0 %	40 %	60 %	21218686
115	NC_003888	GGCCG	2	10	111971	111980	0 %	0 %	60 %	40 %	21218686
116	NC_003888	ACCCC	2	10	113311	113320	20 %	0 %	0 %	80 %	21218687
117	NC_003888	CCCCG	2	10	115281	115290	0 %	0 %	20 %	80 %	21218687
118	NC_003888	CCCGC	2	10	115410	115419	0 %	0 %	20 %	80 %	21218687
119	NC_003888	GCCCG	2	10	115495	115504	0 %	0 %	40 %	60 %	21218687
120	NC_003888	CCGCC	2	10	117594	117603	0 %	0 %	20 %	80 %	21218687
121	NC_003888	GGCCG	2	10	118295	118304	0 %	0 %	60 %	40 %	21218687
122	NC_003888	GACGC	2	10	119565	119574	20 %	0 %	40 %	40 %	21218687
123	NC_003888	GGGTG	2	10	120312	120321	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003888	CGGGC	2	10	120754	120763	0 %	0 %	60 %	40 %	21218690
125	NC_003888	GGGCG	2	10	121411	121420	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
126	NC_003888	GGTCC	2	10	121430	121439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_003888	CGTGC	2	10	121574	121583	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_003888	CCTGG	2	10	123810	123819	0 %	20 %	40 %	40 %	21218692
129	NC_003888	CAGCG	2	10	125233	125242	20 %	0 %	40 %	40 %	21218692
130	NC_003888	GGGCC	2	10	126308	126317	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_003888	CGAGC	2	10	128940	128949	20 %	0 %	40 %	40 %	21218696
132	NC_003888	ACGGC	2	10	131592	131601	20 %	0 %	40 %	40 %	21218697
133	NC_003888	GACCT	2	10	133362	133371	20 %	20 %	20 %	40 %	21218699
134	NC_003888	CGTGG	2	10	133487	133496	0 %	20 %	60 %	20 %	21218699
135	NC_003888	GGGTG	2	10	134535	134544	0 %	20 %	80 %	0 %	21218701
136	NC_003888	GCTCG	2	10	134775	134784	0 %	20 %	40 %	40 %	21218701
137	NC_003888	CTCAC	2	10	134806	134815	20 %	20 %	0 %	60 %	21218701
138	NC_003888	GGGCC	2	10	135088	135097	0 %	0 %	60 %	40 %	21218701
139	NC_003888	TCCCG	2	10	135143	135152	0 %	20 %	20 %	60 %	21218701
140	NC_003888	CACGG	2	10	135243	135252	20 %	0 %	40 %	40 %	21218701
141	NC_003888	GGCCG	2	10	135429	135438	0 %	0 %	60 %	40 %	21218701
142	NC_003888	GACGG	2	10	136247	136256	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_003888	CGGCG	2	10	136463	136472	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_003888	GACAC	2	10	136473	136482	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_003888	CGTAC	2	10	139003	139012	20 %	20 %	20 %	40 %	21218705
146	NC_003888	GGCCG	2	10	140800	140809	0 %	0 %	60 %	40 %	21218708
147	NC_003888	CGAGA	2	10	140949	140958	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_003888	GGGCG	2	10	142388	142397	0 %	0 %	80 %	20 %	32141101
149	NC_003888	GGGAC	2	10	142796	142805	20 %	0 %	60 %	20 %	32141101
150	NC_003888	CGGCA	2	10	143350	143359	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_003888	GCCCC	2	10	143625	143634	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
152	NC_003888	CGCCA	2	10	145414	145423	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_003888	GCCGC	2	10	146122	146131	0 %	0 %	40 %	60 %	21218712
154	NC_003888	AGCCC	2	10	146834	146843	20 %	0 %	20 %	60 %	21218714
155	NC_003888	CCCGG	2	10	147494	147503	0 %	0 %	40 %	60 %	21218715
156	NC_003888	CGGCC	2	10	148521	148530	0 %	0 %	40 %	60 %	21218716
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159	NC_003888	CGGAG	2	10	150282	150291	20 %	0 %	60 %	20 %	21218718
160	NC_003888	GCGCC	2	10	151904	151913	0 %	0 %	40 %	60 %	21218720
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162	NC_003888	CGCGC	2	10	153787	153796	0 %	0 %	40 %	60 %	21218721
163	NC_003888	GGGCC	2	10	154339	154348	0 %	0 %	60 %	40 %	21218721
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165	NC_003888	CCGGG	2	10	156658	156667	0 %	0 %	60 %	40 %	21218723
166	NC_003888	GCCCG	2	10	158643	158652	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
167	NC_003888	CGGCC	2	10	160246	160255	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
168	NC_003888	GCGGT	2	10	161645	161654	0 %	20 %	60 %	20 %	21218728
169	NC_003888	CGCTG	2	10	162728	162737	0 %	20 %	40 %	40 %	21218729
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171	NC_003888	GGCCC	2	10	166816	166825	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
172	NC_003888	CCCGG	2	10	167405	167414	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
173	NC_003888	GCCGT	2	10	167950	167959	0 %	20 %	40 %	40 %	21218736
174	NC_003888	GACCG	2	10	168561	168570	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
175	NC_003888	GTGGC	2	10	171667	171676	0 %	20 %	60 %	20 %	21218740
176	NC_003888	CCAGG	2	10	171963	171972	20 %	0 %	40 %	40 %	21218740
177	NC_003888	GACGG	2	10	172798	172807	20 %	0 %	60 %	20 %	21218741
178	NC_003888	CCGGC	2	10	173477	173486	0 %	0 %	40 %	60 %	21218741
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180	NC_003888	GGCGA	2	10	175270	175279	20 %	0 %	60 %	20 %	21218743
181	NC_003888	GACCG	2	10	176283	176292	20 %	0 %	40 %	40 %	21218743
182	NC_003888	GCCCC	2	10	176474	176483	0 %	0 %	20 %	80 %	21218743
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186	NC_003888	GCCGT	2	10	181941	181950	0 %	20 %	40 %	40 %	21218747
187	NC_003888	GCCGC	2	10	182152	182161	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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191	NC_003888	CAGGA	2	10	184223	184232	40 %	0 %	40 %	20 %	21218749
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195	NC_003888	TGTCG	2	10	187995	188004	0 %	40 %	40 %	20 %	21218754
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199	NC_003888	CGACC	2	10	194739	194748	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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201	NC_003888	GCCCG	2	10	196577	196586	0 %	0 %	40 %	60 %	21218761
202	NC_003888	CCGGG	2	10	196664	196673	0 %	0 %	60 %	40 %	21218761
203	NC_003888	CGTCG	2	10	196728	196737	0 %	20 %	40 %	40 %	21218761
204	NC_003888	GCGGG	2	10	197100	197109	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
205	NC_003888	GCACC	2	10	198656	198665	20 %	0 %	20 %	60 %	21218762
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218	NC_003888	CCGGT	2	10	214183	214192	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
219	NC_003888	CCCCG	2	10	214584	214593	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
220	NC_003888	GCCGG	2	10	216342	216351	0 %	0 %	60 %	40 %	21218777
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222	NC_003888	GCATG	2	10	218327	218336	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
223	NC_003888	GAGCG	2	10	219515	219524	20 %	0 %	60 %	20 %	21218782
224	NC_003888	GCACC	2	10	220607	220616	20 %	0 %	20 %	60 %	21218783
225	NC_003888	CGGTA	2	10	221026	221035	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_003888	CCGCG	2	10	229179	229188	0 %	0 %	40 %	60 %	21218793
231	NC_003888	GTCGT	2	10	229790	229799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
232	NC_003888	CCGAG	2	10	234645	234654	20 %	0 %	40 %	40 %	21218798
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234	NC_003888	CCCCG	2	10	237345	237354	0 %	0 %	20 %	80 %	21218800
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243	NC_003888	TCCGC	2	10	250649	250658	0 %	20 %	20 %	60 %	21218812
244	NC_003888	CCGCA	2	10	250757	250766	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
245	NC_003888	GCCGG	2	10	253861	253870	0 %	0 %	60 %	40 %	21218816
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250	NC_003888	CCGCA	2	10	257243	257252	20 %	0 %	20 %	60 %	21218820
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253	NC_003888	GTCCG	2	10	258255	258264	0 %	20 %	40 %	40 %	21218820
254	NC_003888	ACCGG	2	10	258538	258547	20 %	0 %	40 %	40 %	21218820
255	NC_003888	TCCGG	2	10	258832	258841	0 %	20 %	40 %	40 %	21218820
256	NC_003888	CGGGC	2	10	259396	259405	0 %	0 %	60 %	40 %	21218820
257	NC_003888	CGCGG	2	10	259974	259983	0 %	0 %	60 %	40 %	21218821
258	NC_003888	CCTGG	2	10	260475	260484	0 %	20 %	40 %	40 %	21218821
259	NC_003888	GCCTG	2	10	261238	261247	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
260	NC_003888	GCGCC	2	10	261432	261441	0 %	0 %	40 %	60 %	21218822
261	NC_003888	CGGCC	2	10	264244	264253	0 %	0 %	40 %	60 %	32141105
262	NC_003888	CGCAA	2	10	264746	264755	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
263	NC_003888	GTCCC	2	10	266475	266484	0 %	20 %	20 %	60 %	21218825
264	NC_003888	CCGGT	2	10	266813	266822	0 %	20 %	40 %	40 %	21218825
265	NC_003888	ACCGG	2	10	267605	267614	20 %	0 %	40 %	40 %	21218826
266	NC_003888	ACGGC	2	10	270696	270705	20 %	0 %	40 %	40 %	21218829
267	NC_003888	CCCCG	2	10	270932	270941	0 %	0 %	20 %	80 %	21218829
268	NC_003888	ACGCC	2	10	271156	271165	20 %	0 %	20 %	60 %	21218829
269	NC_003888	CCTCG	2	10	273506	273515	0 %	20 %	20 %	60 %	21218832
270	NC_003888	CGGCG	2	10	273657	273666	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
271	NC_003888	CCGGC	2	10	277920	277929	0 %	0 %	40 %	60 %	21218835
272	NC_003888	GGTCG	2	10	278005	278014	0 %	20 %	60 %	20 %	21218835
273	NC_003888	CCGCC	2	10	279077	279086	0 %	0 %	20 %	80 %	21218836
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