MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003869	AGCTAG	2	12	33736	33747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003869	GACATA	2	12	34743	34754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_003869	CAAAAT	2	12	36008	36019	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_003869	CATTTA	2	12	46221	46232	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_003869	AAGCGA	2	12	56218	56229	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_003869	TTAAAT	2	12	60634	60645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003869	TCTTTT	2	12	75909	75920	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_003869	AAGCGA	2	12	86181	86192	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_003869	AATGAA	2	12	95970	95981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003869	CTATTT	2	12	157726	157737	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_003869	TTTTTA	2	12	207419	207430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003869	TCTTTT	2	12	237839	237850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_003869	TAGGAA	2	12	256880	256891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003869	TTATTT	2	12	333182	333193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003869	TTTTAT	2	12	344311	344322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003869	AAATAA	2	12	381069	381080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003869	AGAAGT	2	12	382212	382223	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003869	GCTTTT	2	12	389967	389978	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_003869	AAATCT	2	12	413093	413104	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_003869	AATGAA	2	12	433403	433414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003869	TTTAAT	2	12	433508	433519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003869	GAGGTA	2	12	471368	471379	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003869	ATTATA	2	12	519719	519730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003869	ATTTTA	2	12	527578	527589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003869	AAAACA	2	12	532210	532221	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_003869	GCTGGG	2	12	535995	536006	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_003869	AAAATA	2	12	541494	541505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003869	GCAAAG	2	12	615121	615132	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003869	TTTTTA	2	12	627800	627811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003869	GAAAAA	2	12	671965	671976	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003869	TATTTT	2	12	674509	674520	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003869	TTTCGG	2	12	690109	690120	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_003869	AACAAA	2	12	692401	692412	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_003869	TAAAAA	2	12	706235	706246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003869	AATAAA	2	12	710233	710244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003869	CTTTCT	2	12	732477	732488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_003869	AATTAA	2	12	754108	754119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003869	TAAAAT	2	12	765319	765330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003869	TTTTGA	2	12	766500	766511	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003869	GAAGCG	2	12	771326	771337	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_003869	CCTGCC	2	12	771518	771529	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_003869	AATGAA	2	12	793564	793575	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003869	AAAGAT	2	12	822663	822674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003869	GTTAAT	2	12	826212	826223	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003869	AATAAA	2	12	826338	826349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003869	AAGGGG	2	12	836482	836493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003869	GGTTTT	2	12	866786	866797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003869	ATAAAA	2	12	931682	931693	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003869	CTTTTT	2	12	940312	940323	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_003869	TTTTTC	2	12	1023853	1023864	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_003869	AAAGGC	2	12	1024478	1024489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_003869	AAGTAA	2	12	1048559	1048570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003869	TCAAAA	2	12	1064007	1064018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_003869	TAAAAG	2	12	1067847	1067858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003869	TTGAAA	2	12	1070060	1070071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003869	ACTTAT	2	12	1074091	1074102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_003869	GAGATA	2	12	1082814	1082825	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003869	TATTTT	2	12	1096574	1096585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003869	AGCTGG	2	12	1101213	1101224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_003869	TTTCTA	2	12	1116452	1116463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_003869	ATGCCA	2	12	1118002	1118013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003869	ATTTTT	2	12	1139942	1139953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003869	AAATTT	2	12	1147712	1147723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003869	TGTTTT	2	12	1182076	1182087	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003869	AAAAAT	2	12	1234978	1234989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003869	CTTTTA	2	12	1282975	1282986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003869	TAAATT	2	12	1302995	1303006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003869	GCATAA	2	12	1316926	1316937	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_003869	GAAAGT	2	12	1349574	1349585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003869	ATAAAA	2	12	1440434	1440445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003869	TCGCTT	2	12	1487658	1487669	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_003869	TCTTCC	2	12	1488526	1488537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_003869	AATAAA	2	12	1519183	1519194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003869	AAAAGC	2	12	1527388	1527399	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_003869	ATTTTA	2	12	1543400	1543411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003869	GACTTT	2	12	1560221	1560232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_003869	CTCATT	2	12	1570576	1570587	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_003869	GGTTTT	2	12	1619089	1619100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003869	TATAGT	2	12	1647648	1647659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003869	AAAAGA	2	12	1659696	1659707	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003869	AATTTA	2	12	1659744	1659755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003869	ATTTTA	2	12	1663965	1663976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003869	CCCAGC	2	12	1666030	1666041	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_003869	ACAATT	2	12	1671657	1671668	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_003869	GCTAAG	2	12	1675343	1675354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_003869	GCTTCC	2	12	1680537	1680548	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_003869	ATATCC	2	12	1680900	1680911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_003869	TTTATT	2	12	1681547	1681558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003869	AGAAAC	2	12	1682032	1682043	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_003869	AAAAAG	2	12	1682276	1682287	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003869	CAAAAA	2	12	1687713	1687724	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_003869	TAAAAA	2	12	1705606	1705617	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003869	TCTAAA	2	12	1729649	1729660	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_003869	ATGGAT	2	12	1731373	1731384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003869	ACTTTA	2	12	1757236	1757247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_003869	TAAAAA	2	12	1762348	1762359	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003869	CCCAGC	2	12	1907037	1907048	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_003869	CCCAGC	2	12	1933659	1933670	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_003869	CATTTT	2	12	1969077	1969088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_003869	TTGTTT	2	12	1969097	1969108	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003869	TTTTGT	2	12	1972348	1972359	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003869	AAAAGG	2	12	1974369	1974380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003869	TAAAAA	2	12	1979199	1979210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003869	AAAGAA	2	12	2001879	2001890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003869	TAAAAA	2	12	2026354	2026365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003869	CAATTT	2	12	2039179	2039190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_003869	CCCAGC	2	12	2081145	2081156	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_003869	CTTTTA	2	12	2082229	2082240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_003869	AATTTT	2	12	2147635	2147646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003869	AAAATA	2	12	2151344	2151355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003869	TCGCTT	2	12	2154140	2154151	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_003869	TCGCTA	2	12	2239821	2239832	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_003869	AATTTT	2	12	2243223	2243234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003869	TCATAT	2	12	2248693	2248704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_003869	AACCAA	2	12	2250242	2250253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_003869	TAATTT	2	12	2250444	2250455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003869	TTATCA	2	12	2254110	2254121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_003869	AATTAA	2	12	2271156	2271167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003869	TTTTCT	2	12	2297687	2297698	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_003869	ATTTTT	2	12	2320455	2320466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003869	TTCAAC	2	12	2328749	2328760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003869	AGTGGA	2	12	2331311	2331322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003869	AGATGG	2	12	2331347	2331358	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003869	CCACAA	2	12	2336017	2336028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_003869	TACTTT	2	12	2341090	2341101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_003869	TTCATC	2	12	2348176	2348187	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_003869	ATTTAT	2	12	2388827	2388838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003869	CTGTAT	2	12	2398078	2398089	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_003869	AATTGA	2	12	2423583	2423594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003869	CCCAGC	2	12	2429629	2429640	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_003869	CTTTTA	2	12	2430713	2430724	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_003869	GGTTTT	2	12	2431354	2431365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003869	AATTAC	2	12	2431671	2431682	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_003869	TTTTTG	2	12	2488770	2488781	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003869	AAAATT	2	12	2508185	2508196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003869	AATTAA	2	12	2508289	2508300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003869	GTTTAC	2	12	2514681	2514692	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_003869	CTTTTA	2	12	2596001	2596012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_003869	TCAATT	2	12	2621279	2621290	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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144	NC_003869	TTATTT	2	12	2649060	2649071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.