MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 chromosome

Total Repeats: 978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003869	TGGAAG	2	12	2859	2870	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20806544
2	NC_003869	TAAAGA	2	12	4904	4915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20806548
3	NC_003869	CAAATA	2	12	9819	9830	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	20806552
4	NC_003869	GCAAGA	2	12	10923	10934	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20806552
5	NC_003869	ACAAGC	2	12	12954	12965	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	20806553
6	NC_003869	CATGCG	2	12	18247	18258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20806557
7	NC_003869	AGCTTT	2	12	18465	18476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20806557
8	NC_003869	TAGCTT	2	12	18650	18661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20806557
9	NC_003869	GATAGA	2	12	20426	20437	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20806559
10	NC_003869	AATGGC	2	12	23479	23490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20806562
11	NC_003869	TGACAG	2	12	24183	24194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20806562
12	NC_003869	TTGCAA	2	12	25268	25279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20806563
13	NC_003869	GGCAGT	2	12	26243	26254	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	20806563
14	NC_003869	ATAGGA	2	12	28246	28257	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20806565
15	NC_003869	GAAGCT	2	12	32019	32030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20806568
16	NC_003869	TGTTGA	2	12	32075	32086	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	20806568
17	NC_003869	TTGCTG	2	12	37526	37537	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	20806569
18	NC_003869	AATGCC	2	12	38781	38792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20806569
19	NC_003869	TCTTTG	2	12	40311	40322	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20806571
20	NC_003869	AGAAGG	2	12	40677	40688	50 %	0 %	50 %	0 %	20806571
21	NC_003869	GAAATG	2	12	62530	62541	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20806587
22	NC_003869	TTTCTA	2	12	71578	71589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20806596
23	NC_003869	GCCAGA	2	12	74704	74715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20806598
24	NC_003869	GGTATG	2	12	90399	90410	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	20806613
25	NC_003869	GAGAAG	2	12	94788	94799	50 %	0 %	50 %	0 %	20806619
26	NC_003869	AGATAT	2	12	105143	105154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20806631
27	NC_003869	CTACAG	2	12	109178	109189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20806636
28	NC_003869	TTTGAA	2	12	110183	110194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	20806638
29	NC_003869	CTTCCT	2	12	112444	112455	0 %	50 %	0 %	50 %	20806639
30	NC_003869	TTGAAA	2	12	116056	116067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20806642
31	NC_003869	TCTTTT	2	12	120089	120100	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	20806646
32	NC_003869	GGTTTT	2	12	124453	124464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806651
33	NC_003869	GAGATG	2	12	125273	125284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20806652
34	NC_003869	GTTCTG	2	12	129537	129548	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	20806656
35	NC_003869	AAGGCA	2	12	130772	130783	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20806659
36	NC_003869	AGAAGT	2	12	131175	131186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20806660
37	NC_003869	GTTGTA	2	12	135279	135290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	20806663
38	NC_003869	TTTGAA	2	12	135630	135641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	20806664
39	NC_003869	AAAAGA	2	12	137568	137579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20806667
40	NC_003869	TCTCAG	2	12	137884	137895	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20806667
41	NC_003869	GAAGAG	2	12	140084	140095	50 %	0 %	50 %	0 %	20806670
42	NC_003869	GCGGTG	2	12	143378	143389	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	20806673
43	NC_003869	CAATTG	2	12	150943	150954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20806680
44	NC_003869	TGTTTT	2	12	157437	157448	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	20806686
45	NC_003869	AAATAA	2	12	160332	160343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	20806689
46	NC_003869	TACCTA	2	12	164672	164683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806691
47	NC_003869	ACTATG	2	12	173974	173985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20806695
48	NC_003869	GATAAA	2	12	175731	175742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20806697
49	NC_003869	ACAGCA	2	12	180710	180721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	20806703
50	NC_003869	ATTTCA	2	12	184197	184208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20806706
51	NC_003869	TAGATG	2	12	185287	185298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806706
52	NC_003869	ATGTAA	2	12	186038	186049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20806707
53	NC_003869	GATACA	2	12	187149	187160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20806709
54	NC_003869	CTATAT	2	12	188128	188139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20806710
55	NC_003869	AGATGT	2	12	188558	188569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806710
56	NC_003869	TATGAC	2	12	191726	191737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20806714
57	NC_003869	AATGGC	2	12	193803	193814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20806716
58	NC_003869	TTTTGA	2	12	194966	194977	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	20806716
59	NC_003869	AGTAAA	2	12	199012	199023	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20806719
60	NC_003869	TAAATG	2	12	200097	200108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20806720
61	NC_003869	AGAGCT	2	12	200513	200524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20806720
62	NC_003869	AATAGC	2	12	200644	200655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20806720
63	NC_003869	ATAAAA	2	12	202790	202801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	20806722
64	NC_003869	AACCTA	2	12	204072	204083	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	20806722
65	NC_003869	AAAACT	2	12	207693	207704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	20806727
66	NC_003869	TGCAAA	2	12	218114	218125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20806737
67	NC_003869	GGGGAT	2	12	220364	220375	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	20806739
68	NC_003869	CATAAA	2	12	222133	222144	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	20806741
69	NC_003869	ATATAC	2	12	238077	238088	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	20806755
70	NC_003869	TAACAG	2	12	245785	245796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20806761
71	NC_003869	GAAAAA	2	12	255329	255340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20806772
72	NC_003869	CAAAAC	2	12	260265	260276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20806777
73	NC_003869	AAAATC	2	12	261431	261442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	20806777
74	NC_003869	ATGCCA	2	12	261449	261460	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20806777
75	NC_003869	TGGAAT	2	12	263281	263292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806779
76	NC_003869	CTTTAA	2	12	263400	263411	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20806779
77	NC_003869	TCTTTT	2	12	263519	263530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	20806779
78	NC_003869	CAAAGG	2	12	269600	269611	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20806784
79	NC_003869	TGAAAT	2	12	278731	278742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20806787
80	NC_003869	TTTCTT	2	12	281162	281173	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	20806789
81	NC_003869	GGTAGG	2	12	283234	283245	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	20806790
82	NC_003869	TTTTAA	2	12	291359	291370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806799
83	NC_003869	ATTTAT	2	12	291437	291448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806799
84	NC_003869	TATCGC	2	12	291500	291511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20806799
85	NC_003869	GCTTTA	2	12	294294	294305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20806803
86	NC_003869	GATGTA	2	12	295559	295570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806804
87	NC_003869	ATATGA	2	12	296686	296697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20806805
88	NC_003869	ATAACT	2	12	297870	297881	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	20806805
89	NC_003869	TCTTAA	2	12	300900	300911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20806808
90	NC_003869	AGAAAA	2	12	302585	302596	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20806809
91	NC_003869	GCTTTA	2	12	304140	304151	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20806810
92	NC_003869	GAAGTA	2	12	314880	314891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20806819
93	NC_003869	GCAAAA	2	12	316642	316653	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20806821
94	NC_003869	AGTTAC	2	12	324203	324214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20806827
95	NC_003869	GGAAGA	2	12	328744	328755	50 %	0 %	50 %	0 %	20806830
96	NC_003869	GCATTA	2	12	332541	332552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20806832
97	NC_003869	CTACAA	2	12	333328	333339	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	20806833
98	NC_003869	CTTTTT	2	12	339621	339632	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	20806839
99	NC_003869	ATTTCT	2	12	340612	340623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20806840
100	NC_003869	GAAAAG	2	12	342232	342243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806841
101	NC_003869	AAAAAT	2	12	345672	345683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	20806844
102	NC_003869	GGCTTT	2	12	346653	346664	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	20806845
103	NC_003869	GGAGAT	2	12	348160	348171	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20806847
104	NC_003869	TATTGA	2	12	349838	349849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	20806848
105	NC_003869	ATAGAG	2	12	355134	355145	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20806851
106	NC_003869	ACTTGG	2	12	359686	359697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20806856
107	NC_003869	AGAGGA	2	12	363316	363327	50 %	0 %	50 %	0 %	20806859
108	NC_003869	CATACT	2	12	365368	365379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806860
109	NC_003869	CGGTGG	2	12	367620	367631	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	20806860
110	NC_003869	ATAGAC	2	12	373178	373189	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20806865
111	NC_003869	GTTTAT	2	12	375658	375669	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	20806867
112	NC_003869	GCTTAC	2	12	392465	392476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20806880
113	NC_003869	TTTTTG	2	12	394081	394092	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	20806882
114	NC_003869	AAAAGT	2	12	396998	397009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20806884
115	NC_003869	GCTTAT	2	12	399885	399896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20806887
116	NC_003869	TAAAAA	2	12	403857	403868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	20806891
117	NC_003869	TTGACT	2	12	407311	407322	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20806896
118	NC_003869	TCAGTG	2	12	408548	408559	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20806897
119	NC_003869	TACTTC	2	12	422190	422201	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	20806911
120	NC_003869	AAAAGA	2	12	423518	423529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20806913
121	NC_003869	GATAAA	2	12	423539	423550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20806913
122	NC_003869	TCTTCA	2	12	443636	443647	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	20806937
123	NC_003869	AGATAC	2	12	445080	445091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20806940
124	NC_003869	TCAACC	2	12	447279	447290	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	20806942
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126	NC_003869	GATTTT	2	12	448282	448293	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	20806944
127	NC_003869	TAGCTA	2	12	448460	448471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20806944
128	NC_003869	CAATTA	2	12	449919	449930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	20806946
129	NC_003869	ACGTAG	2	12	452231	452242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20806950
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131	NC_003869	CTTATT	2	12	468693	468704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20806962
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142	NC_003869	TATAAT	2	12	491146	491157	50 %	50 %	0 %	0 %	20806985
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231	NC_003869	ACAGAT	2	12	716291	716302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20807201
232	NC_003869	TACAGG	2	12	730467	730478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20807214
233	NC_003869	GTAGGT	2	12	732121	732132	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	20807215
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