MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 chromosome

Total Repeats: 2077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003869	TATTT	2	10	149	158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003869	AATTA	2	10	322	331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003869	ATTCA	2	10	1001	1010	40 %	40 %	0 %	20 %	20806543
4	NC_003869	AACAA	2	10	1397	1406	80 %	0 %	0 %	20 %	20806543
5	NC_003869	ACCAC	2	10	1587	1596	40 %	0 %	0 %	60 %	20806543
6	NC_003869	GAAAA	2	10	3517	3526	80 %	0 %	20 %	0 %	20806546
7	NC_003869	AAGAG	2	10	4764	4773	60 %	0 %	40 %	0 %	20806548
8	NC_003869	AGAAA	2	10	4787	4796	80 %	0 %	20 %	0 %	20806548
9	NC_003869	TGTGA	2	10	5433	5442	20 %	40 %	40 %	0 %	20806548
10	NC_003869	ATAGA	2	10	6622	6631	60 %	20 %	20 %	0 %	20806548
11	NC_003869	ACTAA	2	10	6996	7005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003869	TATTT	2	10	7595	7604	20 %	80 %	0 %	0 %	20806549
13	NC_003869	TAAGA	2	10	8224	8233	60 %	20 %	20 %	0 %	20806550
14	NC_003869	ATAAA	2	10	9748	9757	80 %	20 %	0 %	0 %	20806552
15	NC_003869	TGAGA	2	10	11748	11757	40 %	20 %	40 %	0 %	20806553
16	NC_003869	GGAAT	2	10	12590	12599	40 %	20 %	40 %	0 %	20806553
17	NC_003869	GAAAG	2	10	13078	13087	60 %	0 %	40 %	0 %	20806553
18	NC_003869	TTTGC	2	10	14889	14898	0 %	60 %	20 %	20 %	20806554
19	NC_003869	GAAGA	2	10	15637	15646	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003869	TTGAT	2	10	15661	15670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003869	TTCCC	2	10	16399	16408	0 %	40 %	0 %	60 %	20806555
22	NC_003869	AGGAC	2	10	18093	18102	40 %	0 %	40 %	20 %	20806556
23	NC_003869	TATGC	2	10	19696	19705	20 %	40 %	20 %	20 %	20806558
24	NC_003869	TCCGA	2	10	21689	21698	20 %	20 %	20 %	40 %	20806560
25	NC_003869	AGATA	2	10	29041	29050	60 %	20 %	20 %	0 %	20806566
26	NC_003869	TCCTT	2	10	35243	35252	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_003869	TTTTC	2	10	36529	36538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_003869	ATTTA	2	10	37263	37272	40 %	60 %	0 %	0 %	20806569
29	NC_003869	ATTGG	2	10	38965	38974	20 %	40 %	40 %	0 %	20806569
30	NC_003869	AAAAG	2	10	39720	39729	80 %	0 %	20 %	0 %	20806570
31	NC_003869	GAATG	2	10	41978	41987	40 %	20 %	40 %	0 %	20806572
32	NC_003869	GAAGA	2	10	42633	42642	60 %	0 %	40 %	0 %	20806572
33	NC_003869	GTGCA	2	10	42965	42974	20 %	20 %	40 %	20 %	20806572
34	NC_003869	GCAAG	2	10	43887	43896	40 %	0 %	40 %	20 %	20806573
35	NC_003869	AAGAG	2	10	44222	44231	60 %	0 %	40 %	0 %	20806574
36	NC_003869	ATGAA	2	10	45469	45478	60 %	20 %	20 %	0 %	20806574
37	NC_003869	TAGAA	2	10	49772	49781	60 %	20 %	20 %	0 %	20806577
38	NC_003869	TGTGT	2	10	50877	50886	0 %	60 %	40 %	0 %	20806579
39	NC_003869	ATCAG	2	10	51751	51760	40 %	20 %	20 %	20 %	20806580
40	NC_003869	TAAAT	2	10	53460	53469	60 %	40 %	0 %	0 %	20806583
41	NC_003869	GTATA	2	10	53701	53710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003869	GATAA	2	10	53773	53782	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003869	TCGTG	2	10	54909	54918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_003869	GGGAG	2	10	55990	55999	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003869	AAGAG	2	10	56108	56117	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003869	ATGTA	2	10	58760	58769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003869	ATTTT	2	10	58931	58940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003869	ATTGC	2	10	59537	59546	20 %	40 %	20 %	20 %	20806584
49	NC_003869	TTCTT	2	10	60493	60502	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003869	ACTTT	2	10	60509	60518	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003869	AAATT	2	10	60739	60748	60 %	40 %	0 %	0 %	20806586
52	NC_003869	TCCAT	2	10	61929	61938	20 %	40 %	0 %	40 %	20806587
53	NC_003869	ACCCA	2	10	65310	65319	40 %	0 %	0 %	60 %	20806589
54	NC_003869	TACTT	2	10	67123	67132	20 %	60 %	0 %	20 %	20806591
55	NC_003869	ATGGT	2	10	69947	69956	20 %	40 %	40 %	0 %	20806594
56	NC_003869	GCAAG	2	10	70298	70307	40 %	0 %	40 %	20 %	20806594
57	NC_003869	ATTCC	2	10	74923	74932	20 %	40 %	0 %	40 %	20806599
58	NC_003869	AGAAA	2	10	75119	75128	80 %	0 %	20 %	0 %	20806599
59	NC_003869	AGAGA	2	10	75402	75411	60 %	0 %	40 %	0 %	20806599
60	NC_003869	GCAAT	2	10	75445	75454	40 %	20 %	20 %	20 %	20806599
61	NC_003869	AGGAA	2	10	77812	77821	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003869	AATAT	2	10	78447	78456	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003869	GGGGA	2	10	78492	78501	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003869	TTAAA	2	10	78560	78569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003869	GAGAA	2	10	78992	79001	60 %	0 %	40 %	0 %	20806603
66	NC_003869	TCCTG	2	10	81033	81042	0 %	40 %	20 %	40 %	20806605
67	NC_003869	GATTT	2	10	82501	82510	20 %	60 %	20 %	0 %	20806608
68	NC_003869	TCGTG	2	10	84873	84882	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003869	GGGAG	2	10	85953	85962	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003869	AAGAG	2	10	86071	86080	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003869	AATTT	2	10	88642	88651	40 %	60 %	0 %	0 %	20806610
72	NC_003869	AGAGG	2	10	89926	89935	40 %	0 %	60 %	0 %	20806612
73	NC_003869	ATTAA	2	10	90339	90348	60 %	40 %	0 %	0 %	20806613
74	NC_003869	AAGGG	2	10	94738	94747	40 %	0 %	60 %	0 %	20806619
75	NC_003869	TGATA	2	10	95531	95540	40 %	40 %	20 %	0 %	20806620
76	NC_003869	TGAAA	2	10	98424	98433	60 %	20 %	20 %	0 %	20806625
77	NC_003869	AATAG	2	10	99713	99722	60 %	20 %	20 %	0 %	20806626
78	NC_003869	TTTAC	2	10	100157	100166	20 %	60 %	0 %	20 %	20806627
79	NC_003869	GGTGT	2	10	103442	103451	0 %	40 %	60 %	0 %	20806630
80	NC_003869	ATTTC	2	10	104412	104421	20 %	60 %	0 %	20 %	20806631
81	NC_003869	AAGAG	2	10	106858	106867	60 %	0 %	40 %	0 %	20806633
82	NC_003869	TTCAA	2	10	109086	109095	40 %	40 %	0 %	20 %	20806636
83	NC_003869	GGAGC	2	10	109546	109555	20 %	0 %	60 %	20 %	20806637
84	NC_003869	GAAAT	2	10	112172	112181	60 %	20 %	20 %	0 %	20806639
85	NC_003869	GAAAA	2	10	113158	113167	80 %	0 %	20 %	0 %	20806639
86	NC_003869	TTAAT	2	10	114383	114392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003869	TTGCA	2	10	115345	115354	20 %	40 %	20 %	20 %	20806641
88	NC_003869	GAAGG	2	10	116448	116457	40 %	0 %	60 %	0 %	20806643
89	NC_003869	GAAGA	2	10	116847	116856	60 %	0 %	40 %	0 %	20806643
90	NC_003869	TTAGT	2	10	117553	117562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003869	ATATT	2	10	118384	118393	40 %	60 %	0 %	0 %	20806645
92	NC_003869	ACTAA	2	10	122044	122053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_003869	AGGTG	2	10	124913	124922	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003869	AAGTT	2	10	128148	128157	40 %	40 %	20 %	0 %	20806655
95	NC_003869	AGGCA	2	10	130955	130964	40 %	0 %	40 %	20 %	20806659
96	NC_003869	AAGAA	2	10	132990	132999	80 %	0 %	20 %	0 %	20806660
97	NC_003869	GTGGG	2	10	135166	135175	0 %	20 %	80 %	0 %	20806663
98	NC_003869	TTATT	2	10	135617	135626	20 %	80 %	0 %	0 %	20806664
99	NC_003869	CGGAA	2	10	136764	136773	40 %	0 %	40 %	20 %	20806666
100	NC_003869	TTATT	2	10	138413	138422	20 %	80 %	0 %	0 %	20806667
101	NC_003869	TAGAG	2	10	139064	139073	40 %	20 %	40 %	0 %	20806668
102	NC_003869	ATTTA	2	10	139157	139166	40 %	60 %	0 %	0 %	20806668
103	NC_003869	AGCAA	2	10	139353	139362	60 %	0 %	20 %	20 %	20806669
104	NC_003869	GCTAT	2	10	139911	139920	20 %	40 %	20 %	20 %	20806670
105	NC_003869	TCTTT	2	10	140508	140517	0 %	80 %	0 %	20 %	20806670
106	NC_003869	AGGAA	2	10	145196	145205	60 %	0 %	40 %	0 %	20806675
107	NC_003869	CAGAA	2	10	146563	146572	60 %	0 %	20 %	20 %	20806677
108	NC_003869	TGCAG	2	10	147777	147786	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_003869	TTGAC	2	10	147816	147825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_003869	GTGTT	2	10	150257	150266	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003869	AAATA	2	10	151370	151379	80 %	20 %	0 %	0 %	20806680
112	NC_003869	TAAAT	2	10	151906	151915	60 %	40 %	0 %	0 %	20806681
113	NC_003869	AAAAG	2	10	152566	152575	80 %	0 %	20 %	0 %	20806681
114	NC_003869	GAAAA	2	10	160057	160066	80 %	0 %	20 %	0 %	20806689
115	NC_003869	AAGAG	2	10	160214	160223	60 %	0 %	40 %	0 %	20806689
116	NC_003869	CCCAA	2	10	163152	163161	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_003869	ATAAA	2	10	163225	163234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003869	GACAG	2	10	164837	164846	40 %	0 %	40 %	20 %	20806691
119	NC_003869	ACTTT	2	10	168964	168973	20 %	60 %	0 %	20 %	20806692
120	NC_003869	TCAAA	2	10	169326	169335	60 %	20 %	0 %	20 %	20806692
121	NC_003869	TAAAA	2	10	174981	174990	80 %	20 %	0 %	0 %	20806696
122	NC_003869	ATAAG	2	10	176126	176135	60 %	20 %	20 %	0 %	20806697
123	NC_003869	TCAAA	2	10	176836	176845	60 %	20 %	0 %	20 %	20806698
124	NC_003869	CTGTC	2	10	179458	179467	0 %	40 %	20 %	40 %	20806702
125	NC_003869	TTAAT	2	10	179782	179791	40 %	60 %	0 %	0 %	20806702
126	NC_003869	TTTAG	2	10	181480	181489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003869	TAAAA	2	10	184997	185006	80 %	20 %	0 %	0 %	20806706
128	NC_003869	AAGAA	2	10	185108	185117	80 %	0 %	20 %	0 %	20806706
129	NC_003869	ATATG	2	10	189826	189835	40 %	40 %	20 %	0 %	20806712
130	NC_003869	GAAGA	2	10	191997	192006	60 %	0 %	40 %	0 %	20806714
131	NC_003869	CCCTT	2	10	193313	193322	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_003869	GGGAA	2	10	193333	193342	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003869	AGGGC	2	10	193776	193785	20 %	0 %	60 %	20 %	20806716
134	NC_003869	GCAGT	2	10	194938	194947	20 %	20 %	40 %	20 %	20806716
135	NC_003869	GAATA	2	10	197525	197534	60 %	20 %	20 %	0 %	20806717
136	NC_003869	AAGAA	2	10	198557	198566	80 %	0 %	20 %	0 %	20806718
137	NC_003869	TAAAT	2	10	202368	202377	60 %	40 %	0 %	0 %	20806721
138	NC_003869	GACTT	2	10	206776	206785	20 %	40 %	20 %	20 %	20806726
139	NC_003869	TAGGT	2	10	208682	208691	20 %	40 %	40 %	0 %	20806728
140	NC_003869	TTATT	2	10	209213	209222	20 %	80 %	0 %	0 %	20806728
141	NC_003869	AGGAG	2	10	209443	209452	40 %	0 %	60 %	0 %	20806728
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