MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 chromosome

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003869	TATTT	2	10	149	158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003869	AATTA	2	10	322	331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003869	ACTAA	2	10	6996	7005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_003869	GAAGA	2	10	15637	15646	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003869	TTGAT	2	10	15661	15670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003869	TCCTT	2	10	35243	35252	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_003869	TTTTC	2	10	36529	36538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003869	GTATA	2	10	53701	53710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003869	GATAA	2	10	53773	53782	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003869	TCGTG	2	10	54909	54918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003869	GGGAG	2	10	55990	55999	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003869	AAGAG	2	10	56108	56117	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003869	ATGTA	2	10	58760	58769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003869	ATTTT	2	10	58931	58940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003869	TTCTT	2	10	60493	60502	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003869	ACTTT	2	10	60509	60518	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003869	AGGAA	2	10	77812	77821	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003869	AATAT	2	10	78447	78456	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003869	GGGGA	2	10	78492	78501	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003869	TTAAA	2	10	78560	78569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003869	TCGTG	2	10	84873	84882	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_003869	GGGAG	2	10	85953	85962	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003869	AAGAG	2	10	86071	86080	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003869	TTAAT	2	10	114383	114392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003869	TTAGT	2	10	117553	117562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003869	ACTAA	2	10	122044	122053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_003869	AGGTG	2	10	124913	124922	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003869	TGCAG	2	10	147777	147786	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003869	TTGAC	2	10	147816	147825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_003869	GTGTT	2	10	150257	150266	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003869	CCCAA	2	10	163152	163161	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_003869	ATAAA	2	10	163225	163234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003869	TTTAG	2	10	181480	181489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003869	CCCTT	2	10	193313	193322	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_003869	GGGAA	2	10	193333	193342	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003869	GAGTG	2	10	213595	213604	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003869	ATCAA	2	10	241388	241397	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_003869	GCTCA	2	10	243729	243738	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_003869	GTGTT	2	10	245534	245543	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003869	TGTTT	2	10	267506	267515	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003869	TAAAT	2	10	285240	285249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003869	GAAGG	2	10	299297	299306	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003869	TTTTA	2	10	315949	315958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003869	AAGGG	3	15	315981	315995	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003869	TATAA	2	10	318257	318266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003869	TTGAC	2	10	325402	325411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_003869	GTGTT	2	10	327845	327854	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003869	CTTTT	2	10	329163	329172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_003869	ATCAA	2	10	354261	354270	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003869	ATTTA	2	10	364460	364469	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003869	ATCAA	2	10	372039	372048	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_003869	AAAAG	2	10	374685	374694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003869	GAGAA	2	10	380261	380270	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003869	GTATG	2	10	380315	380324	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003869	AATAA	2	10	382537	382546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003869	ATCAA	2	10	384020	384029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003869	TGAGA	2	10	386095	386104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003869	TAAAA	2	10	395114	395123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003869	GAAGG	2	10	395430	395439	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003869	GTAAT	2	10	413314	413323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003869	TTTTA	2	10	414720	414729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003869	ATCAA	2	10	419524	419533	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_003869	CTTTT	2	10	426501	426510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_003869	GTATT	2	10	427197	427206	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003869	ATCAA	2	10	432186	432195	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_003869	GAAAA	2	10	437877	437886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003869	ATTGG	2	10	438173	438182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003869	GAAAA	2	10	444212	444221	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003869	ATTGG	2	10	444509	444518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003869	GAGTT	2	10	444630	444639	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003869	AGGAG	2	10	448124	448133	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003869	TATAT	2	10	459983	459992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003869	AAAAT	2	10	483718	483727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003869	CCGCT	2	10	501664	501673	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_003869	TTTGC	2	10	514482	514491	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_003869	CTTTC	2	10	518123	518132	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_003869	TATAA	2	10	519261	519270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003869	ATTAT	2	10	519279	519288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003869	TAGCG	2	10	525057	525066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_003869	ATATA	2	10	528262	528271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003869	GATAA	2	10	539499	539508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003869	ATTTC	2	10	545132	545141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_003869	AATGA	2	10	545151	545160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003869	TGAGG	2	10	549805	549814	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003869	TTTTG	2	10	558191	558200	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003869	TTATT	2	10	558272	558281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003869	ATATT	2	10	563325	563334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003869	AAGGG	2	10	569141	569150	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003869	TTAAT	2	10	605046	605055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003869	TGTTT	2	10	616930	616939	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003869	TTAAA	2	10	618800	618809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003869	AAAGG	2	10	622684	622693	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003869	AAAAT	2	10	626486	626495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003869	ACTAA	2	10	627606	627615	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_003869	TGAGG	2	10	632316	632325	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003869	TAAAA	2	10	644712	644721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003869	ATTTT	2	10	650630	650639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003869	ATTGG	2	10	651635	651644	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003869	ATATA	2	10	651799	651808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003869	TGAGC	2	10	672377	672386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_003869	ATTTT	2	10	673863	673872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003869	AAGAC	2	10	674012	674021	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_003869	TTTTA	2	10	674457	674466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003869	TTTAA	2	10	674650	674659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003869	CTCTG	2	10	677973	677982	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_003869	ATTAA	2	10	679119	679128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003869	TTCTA	2	10	712314	712323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_003869	ATATA	2	10	719265	719274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003869	AAGAA	2	10	753329	753338	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003869	TTAAA	2	10	774280	774289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003869	AAAAT	2	10	774354	774363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003869	TCAAA	2	10	777152	777161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_003869	AGGAG	2	10	779453	779462	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003869	AATAT	2	10	800915	800924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003869	TTAAC	2	10	828681	828690	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_003869	TAAAA	2	10	829065	829074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003869	GGGTT	2	10	831267	831276	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003869	AATAA	2	10	840663	840672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003869	AGAGG	2	10	854153	854162	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003869	GAAGA	2	10	861866	861875	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003869	TTGAT	2	10	861890	861899	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003869	TAATT	2	10	867774	867783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003869	AGAGG	2	10	873143	873152	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003869	AGATG	2	10	878568	878577	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003869	ATGTA	2	10	890758	890767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003869	AAACA	2	10	891967	891976	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_003869	AGTAT	2	10	896054	896063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003869	AGGAG	2	10	898952	898961	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003869	AATGG	2	10	912319	912328	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003869	AAAAT	2	10	915039	915048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003869	ATTTT	2	10	927211	927220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003869	AATTT	2	10	946062	946071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003869	TTTAC	2	10	946111	946120	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_003869	ATCAA	2	10	947593	947602	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_003869	TAAAA	2	10	963683	963692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003869	TAAAA	2	10	966920	966929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003869	TATAA	2	10	966976	966985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003869	ACTAA	2	10	969563	969572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_003869	TATAA	2	10	988848	988857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003869	GGTGA	2	10	991725	991734	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003869	GTAAA	2	10	997611	997620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003869	TTAGA	2	10	1022322	1022331	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003869	TATAA	2	10	1023237	1023246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003869	GAAAT	2	10	1025278	1025287	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003869	TAATA	2	10	1027542	1027551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003869	ACTAT	2	10	1030525	1030534	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_003869	TATAA	2	10	1030630	1030639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003869	TAGTA	2	10	1033274	1033283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.