MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 chromosome

Total Repeats: 1283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003869	TAAA	2	8	61	68	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003869	CGCT	2	8	7064	7071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_003869	TTTC	2	8	9716	9723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003869	CCCT	2	8	15172	15179	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_003869	CTTA	2	8	15268	15275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003869	ACAA	2	8	17279	17286	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003869	AAAG	2	8	26497	26504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003869	CTTT	2	8	26516	26523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003869	ATTT	2	8	27935	27942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003869	ATCC	2	8	28657	28664	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003869	TACT	2	8	30382	30389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003869	TCCC	2	8	31730	31737	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_003869	GTAG	2	8	31747	31754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003869	AAAC	2	8	31767	31774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003869	TTTA	2	8	33279	33286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003869	GATA	2	8	34755	34762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003869	AGAC	2	8	34979	34986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003869	ATTT	2	8	34992	34999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003869	AATT	2	8	35366	35373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003869	ACAG	2	8	35561	35568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003869	ATGG	2	8	35770	35777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003869	ATCA	2	8	36562	36569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003869	TGAG	2	8	39332	39339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003869	TTAA	2	8	39362	39369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003869	AAAT	2	8	41777	41784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003869	AATT	2	8	43317	43324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003869	AAAT	2	8	43375	43382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003869	AAGT	2	8	46347	46354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003869	GGAA	2	8	46408	46415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003869	AAAT	2	8	46620	46627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003869	TTGG	2	8	52959	52966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003869	GGGA	2	8	54869	54876	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003869	AGGG	2	8	55295	55302	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003869	GCAG	2	8	55560	55567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_003869	AAAG	2	8	55686	55693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003869	GGCC	2	8	55815	55822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_003869	AGCG	2	8	56182	56189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003869	GACT	2	8	56458	56465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_003869	AGTG	2	8	57938	57945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003869	TTAG	2	8	58696	58703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003869	ATTT	2	8	58950	58957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003869	ACTG	2	8	78464	78471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_003869	AGGA	2	8	78613	78620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003869	AGGG	2	8	85259	85266	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003869	GCAG	2	8	85524	85531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003869	AAAG	2	8	85649	85656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003869	GGCC	2	8	85778	85785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_003869	AGCG	2	8	86145	86152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_003869	GACT	2	8	86421	86428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003869	AGTG	2	8	87901	87908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003869	TGTT	2	8	89719	89726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003869	GAGG	2	8	94132	94139	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003869	TTCC	2	8	104204	104211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003869	TCCC	2	8	108209	108216	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_003869	AGGA	2	8	109840	109847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003869	TTAC	2	8	114403	114410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003869	GCGA	2	8	117478	117485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_003869	AGCG	2	8	117486	117493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_003869	CGCT	2	8	122113	122120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_003869	AATT	2	8	124879	124886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003869	TGAG	2	8	138950	138957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003869	CGAG	2	8	142859	142866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003869	TATT	2	8	147232	147239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003869	GAGT	2	8	147766	147773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003869	GTAT	2	8	148374	148381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003869	TTGA	2	8	150338	150345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003869	TTTA	2	8	158978	158985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003869	AGCG	2	8	159091	159098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_003869	ATTA	2	8	159394	159401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003869	GCGA	2	8	181409	181416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003869	AGCG	2	8	181417	181424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003869	AAGA	2	8	217715	217722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003869	AAAG	2	8	218589	218596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003869	AAAG	2	8	228411	228418	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003869	GTAT	2	8	228560	228567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003869	AAAT	2	8	229687	229694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003869	TAAA	2	8	229958	229965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003869	AAGA	2	8	230062	230069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003869	TAAA	2	8	231507	231514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003869	TAAG	2	8	241784	241791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003869	GAGG	2	8	241879	241886	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003869	GCTT	2	8	242884	242891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_003869	TTGG	2	8	243599	243606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003869	AATT	2	8	243842	243849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003869	TTGA	2	8	245615	245622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003869	ATTG	2	8	255442	255449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003869	CGGA	2	8	255561	255568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_003869	AGTT	2	8	257014	257021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003869	TTTA	2	8	266082	266089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003869	TTAA	2	8	266092	266099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003869	TTTG	2	8	266437	266444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003869	CAAG	2	8	267664	267671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003869	TAAA	2	8	282564	282571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003869	GCGA	2	8	289290	289297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003869	CTTT	2	8	297923	297930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_003869	AATA	2	8	298095	298102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003869	TGAG	2	8	312932	312939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003869	AAGG	2	8	322795	322802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003869	ATTT	2	8	322889	322896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003869	TATT	2	8	324818	324825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003869	GAGT	2	8	325352	325359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003869	GTAT	2	8	325962	325969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003869	TTGA	2	8	327926	327933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003869	GATT	2	8	336977	336984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003869	TTAA	2	8	337008	337015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003869	ATTT	2	8	341042	341049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003869	ATTT	2	8	346720	346727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003869	ATTT	2	8	346740	346747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003869	AAGA	2	8	351343	351350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003869	TAAG	2	8	354656	354663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003869	TAAG	2	8	372434	372441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003869	GAGG	2	8	372529	372536	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003869	ATTT	2	8	373395	373402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003869	AACA	2	8	373448	373455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003869	GAAT	2	8	380394	380401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003869	TGTA	2	8	382427	382434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003869	TAAG	2	8	384415	384422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003869	GAGG	2	8	384510	384517	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003869	TTCC	2	8	389492	389499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_003869	CCAA	2	8	389587	389594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003869	TTAA	2	8	391585	391592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003869	GAGG	2	8	395211	395218	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003869	GAGG	2	8	396133	396140	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003869	TTCG	2	8	406616	406623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003869	TTTG	2	8	409154	409161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003869	CAAA	2	8	409988	409995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_003869	TTAT	2	8	413292	413299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003869	CATT	2	8	413354	413361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_003869	TTTG	2	8	415268	415275	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003869	AATA	2	8	417068	417075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003869	GAGG	2	8	417214	417221	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003869	TTAT	2	8	423781	423788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003869	AGGA	2	8	423889	423896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003869	AAAC	2	8	429925	429932	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_003869	GAAA	2	8	430096	430103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003869	TAAG	2	8	432581	432588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003869	GAGG	2	8	432676	432683	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003869	TAAA	2	8	432731	432738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003869	AAAT	2	8	433424	433431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003869	TAAT	2	8	437767	437774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003869	CAAT	2	8	438335	438342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003869	GTAT	2	8	440002	440009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003869	TTAA	2	8	441683	441690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003869	CTGC	2	8	441832	441839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_003869	GAAA	2	8	444021	444028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003869	GGTT	2	8	444057	444064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003869	ACTA	2	8	444075	444082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_003869	CATT	2	8	444577	444584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003869	CTGC	2	8	446097	446104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_003869	CAAA	2	8	446310	446317	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_003869	TTTG	2	8	448747	448754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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