MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 chromosome

Total Repeats: 31511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003869	TAG	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806543
2	NC_003869	CCA	2	6	429	434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20806543
3	NC_003869	AGA	2	6	478	483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
4	NC_003869	TAA	2	6	525	530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806543
5	NC_003869	AGA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
6	NC_003869	GAA	3	9	614	622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
7	NC_003869	GGA	2	6	806	811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806543
8	NC_003869	TCA	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806543
9	NC_003869	AAT	2	6	883	888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806543
10	NC_003869	GAA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
11	NC_003869	CTA	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806543
12	NC_003869	GAT	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806543
13	NC_003869	AGA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
14	NC_003869	CCA	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20806543
15	NC_003869	TAA	2	6	1311	1316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806543
16	NC_003869	AAG	3	9	1431	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
17	NC_003869	ACA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20806543
18	NC_003869	AGA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
19	NC_003869	GAA	2	6	1571	1576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
20	NC_003869	GAA	2	6	1664	1669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
21	NC_003869	TTA	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806543
22	NC_003869	TTG	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806544
23	NC_003869	TCC	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806544
24	NC_003869	ACC	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20806544
25	NC_003869	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
26	NC_003869	GTT	2	6	2135	2140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806544
27	NC_003869	AGA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
28	NC_003869	AGA	2	6	2371	2376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
29	NC_003869	GAA	2	6	2501	2506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
30	NC_003869	TAA	2	6	2586	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806544
31	NC_003869	CTT	2	6	2651	2656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806544
32	NC_003869	TTC	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806544
33	NC_003869	GAA	3	9	2939	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
34	NC_003869	TAA	3	9	2982	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806544
35	NC_003869	TGA	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806545
36	NC_003869	AAG	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806545
37	NC_003869	GAG	2	6	3265	3270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806545
38	NC_003869	TGA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806546
39	NC_003869	TTA	2	6	3560	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806546
40	NC_003869	ATA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806546
41	NC_003869	AAG	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
42	NC_003869	AGA	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
43	NC_003869	ATT	2	6	3716	3721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806546
44	NC_003869	CTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806546
45	NC_003869	AGA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
46	NC_003869	TGA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806546
47	NC_003869	AAT	2	6	3852	3857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806546
48	NC_003869	AAT	2	6	3868	3873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806546
49	NC_003869	GAA	2	6	3979	3984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
50	NC_003869	AGA	3	9	4182	4190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
51	NC_003869	TGT	2	6	4330	4335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806546
52	NC_003869	ATG	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806546
53	NC_003869	GTA	3	9	4408	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806547
54	NC_003869	ATC	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806547
55	NC_003869	TCC	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806547
56	NC_003869	GAA	2	6	4498	4503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806547
57	NC_003869	TGT	2	6	4512	4517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806547
58	NC_003869	GAG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806547
59	NC_003869	GAA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
60	NC_003869	AAG	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
61	NC_003869	AGA	2	6	4994	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
62	NC_003869	ACA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20806548
63	NC_003869	GAA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
64	NC_003869	TAT	2	6	5223	5228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806548
65	NC_003869	ATT	2	6	5254	5259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806548
66	NC_003869	GTA	2	6	5289	5294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
67	NC_003869	TCC	2	6	5330	5335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806548
68	NC_003869	CAG	2	6	5355	5360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20806548
69	NC_003869	CTC	2	6	5377	5382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806548
70	NC_003869	AGT	2	6	5552	5557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
71	NC_003869	TTG	2	6	5563	5568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806548
72	NC_003869	ATT	2	6	5626	5631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806548
73	NC_003869	TGG	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20806548
74	NC_003869	ATA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806548
75	NC_003869	AAG	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
76	NC_003869	AGC	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20806548
77	NC_003869	TGC	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20806548
78	NC_003869	ATA	2	6	6016	6021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806548
79	NC_003869	CCT	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806548
80	NC_003869	ATG	3	9	6045	6053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
81	NC_003869	AGG	2	6	6107	6112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806548
82	NC_003869	GCT	2	6	6159	6164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20806548
83	NC_003869	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
84	NC_003869	AGG	2	6	6364	6369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806548
85	NC_003869	ATT	3	9	6523	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806548
86	NC_003869	TAG	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
87	NC_003869	AAG	2	6	6571	6576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
88	NC_003869	GAA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
89	NC_003869	GGT	2	6	6638	6643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20806548
90	NC_003869	GAT	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
91	NC_003869	TGA	2	6	6842	6847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
92	NC_003869	GAA	2	6	6873	6878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
93	NC_003869	AGA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
94	NC_003869	CTT	2	6	7228	7233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806549
95	NC_003869	GAA	2	6	7339	7344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806549
96	NC_003869	CTT	2	6	7390	7395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806549
97	NC_003869	TAT	2	6	7424	7429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806549
98	NC_003869	TTA	2	6	7551	7556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806549
99	NC_003869	TCT	2	6	7674	7679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806549
100	NC_003869	TTA	2	6	7687	7692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806549
101	NC_003869	TCC	2	6	7748	7753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806549
102	NC_003869	CTT	2	6	8004	8009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806550
103	NC_003869	TCT	2	6	8105	8110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806550
104	NC_003869	TTA	2	6	8127	8132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806550
105	NC_003869	TTC	2	6	8161	8166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806550
106	NC_003869	TAT	2	6	8308	8313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806550
107	NC_003869	GTC	2	6	8346	8351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20806550
108	NC_003869	TAG	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806550
109	NC_003869	ATC	2	6	8395	8400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806550
110	NC_003869	AAG	2	6	8407	8412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806550
111	NC_003869	CAG	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20806550
112	NC_003869	TGT	2	6	8439	8444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806550
113	NC_003869	AGT	3	9	8589	8597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806550
114	NC_003869	GAA	2	6	8672	8677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806550
115	NC_003869	ATC	2	6	8695	8700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806550
116	NC_003869	AAG	2	6	8870	8875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806550
117	NC_003869	GCG	2	6	8951	8956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20806550
118	NC_003869	ACT	2	6	8980	8985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806550
119	NC_003869	TGT	2	6	9036	9041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806550
120	NC_003869	TTC	2	6	9051	9056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806550
121	NC_003869	AAG	2	6	9067	9072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806550
122	NC_003869	AGT	3	9	9091	9099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806550
123	NC_003869	TCC	2	6	9208	9213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806550
124	NC_003869	TAA	2	6	9291	9296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806551
125	NC_003869	ACG	2	6	9339	9344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20806551
126	NC_003869	ACA	2	6	9420	9425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20806551
127	NC_003869	ACT	2	6	9429	9434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806551
128	NC_003869	TCT	2	6	9450	9455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806551
129	NC_003869	ATT	2	6	9567	9572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806551
130	NC_003869	GCA	2	6	9886	9891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20806552
131	NC_003869	CAT	2	6	9900	9905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806552
132	NC_003869	GTT	2	6	9918	9923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806552
133	NC_003869	ACA	2	6	9925	9930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20806552
134	NC_003869	GGA	2	6	10092	10097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806552
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139	NC_003869	GAA	2	6	10425	10430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806552
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261	NC_003869	ACA	2	6	20521	20526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20806559
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