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Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	TAGCTG	2	12	36803	36814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003552	ATCTAA	2	12	37032	37043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_003552	AAAAAT	2	12	40018	40029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003552	AAATTC	2	12	66715	66726	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_003552	ACACTA	2	12	74759	74770	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_003552	AACACT	2	12	74773	74784	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_003552	GCTTAA	2	12	104694	104705	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_003552	ACAGCT	2	12	118362	118373	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_003552	AAACCT	2	12	124486	124497	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003552	AAATAA	2	12	126366	126377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003552	GTTCAG	2	12	133847	133858	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_003552	GTTCAG	2	12	133865	133876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_003552	GTTCAG	2	12	133883	133894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003552	TCACTT	2	12	155926	155937	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003552	ACTCTT	2	12	155946	155957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003552	AAAGAA	2	12	173836	173847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003552	AAAAAC	2	12	197168	197179	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_003552	TAAAAT	2	12	198106	198117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003552	GCTGGT	2	12	215562	215573	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_003552	TTAAGG	2	12	251362	251373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003552	ATTTTT	2	12	260572	260583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003552	CTTTTT	2	12	270862	270873	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_003552	ATATTT	2	12	271101	271112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003552	AAATTC	2	12	271390	271401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_003552	TCTTTT	2	12	311360	311371	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_003552	AGAATT	2	12	333617	333628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003552	ATTTTT	2	12	333881	333892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003552	ATTTCT	2	12	336723	336734	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003552	TAGCTG	2	12	348041	348052	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_003552	CTGAGC	2	12	350593	350604	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_003552	AAACTC	2	12	375076	375087	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_003552	ATGACA	2	12	376861	376872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_003552	ATATAA	2	12	383764	383775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003552	CTTTTA	2	12	410469	410480	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_003552	TAAATT	2	12	410527	410538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003552	AGGATT	2	12	421482	421493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003552	AGGATT	2	12	425841	425852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003552	AACAAA	2	12	458424	458435	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_003552	TGAAAC	2	12	478404	478415	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003552	AGAAAA	2	12	484751	484762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003552	AAAGAT	2	12	488777	488788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003552	AAAAGT	2	12	510541	510552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003552	ATTCTT	2	12	510579	510590	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_003552	GAAAAA	2	12	511705	511716	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003552	TTCCCT	2	12	518563	518574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_003552	CTCAAT	2	12	526708	526719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_003552	AAGAAA	2	12	534817	534828	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003552	TGTTTC	2	12	548877	548888	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_003552	ATTTGA	2	12	557498	557509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003552	TTTATT	2	12	577429	577440	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003552	TGAATC	2	12	588470	588481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_003552	GATCTC	2	12	594443	594454	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_003552	AAAGAG	2	12	598981	598992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003552	GTAATA	2	12	599512	599523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003552	GGTTTC	2	12	603092	603103	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_003552	TATATT	2	12	615294	615305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003552	TCCTGG	2	12	620504	620515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_003552	TCTTTC	2	12	622608	622619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_003552	TTTTGT	2	12	626719	626730	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003552	CTTGAA	2	12	655487	655498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_003552	TTCCGG	2	12	657649	657660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003552	AATATT	2	12	677058	677069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003552	AGATAA	2	12	683062	683073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003552	AGGACG	2	12	689154	689165	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_003552	CTTTTC	2	12	693622	693633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_003552	GGTTTC	2	12	709255	709266	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003552	GGGCAG	2	12	712027	712038	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_003552	TTTAAC	2	12	715394	715405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_003552	AAACTT	2	12	727528	727539	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_003552	TTCCTT	2	12	744110	744121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_003552	TAGCTA	2	12	753759	753770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_003552	ATTTTT	2	12	766988	766999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003552	TAAGGG	2	12	784724	784735	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003552	TCTTTT	2	12	788777	788788	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_003552	TTTTTA	2	12	800246	800257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003552	CAACCG	2	12	801511	801522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_003552	ATTTTA	2	12	821238	821249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003552	ATTTCA	2	12	842157	842168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_003552	TTTTGA	2	12	855655	855666	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003552	AAAGAA	2	12	858202	858213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003552	TAAAGG	2	12	865566	865577	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003552	ATTTTT	2	12	873203	873214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003552	ATTTTT	3	18	887690	887707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003552	CTGCGC	2	12	901199	901210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_003552	ATGGTA	2	12	906453	906464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003552	ATTTAT	2	12	907512	907523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003552	CTTATC	2	12	931995	932006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_003552	GAAAAG	2	12	934065	934076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003552	TTTTTA	2	12	938526	938537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003552	TTTTTA	2	12	960372	960383	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003552	CCAAAA	2	12	960626	960637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_003552	CTTTTT	2	12	963429	963440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003552	GACTCT	2	12	1024576	1024587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_003552	TTTCTT	2	12	1057719	1057730	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_003552	TTTGCT	2	12	1068977	1068988	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_003552	TTTTAT	2	12	1072200	1072211	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003552	ACGGGT	2	12	1073304	1073315	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_003552	TCCGTA	2	12	1085231	1085242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_003552	TTCCGT	2	12	1085445	1085456	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_003552	TTTTAT	2	12	1102743	1102754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003552	GATTTT	2	12	1132488	1132499	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003552	TAGGAA	2	12	1132746	1132757	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003552	AGAAGG	2	12	1132822	1132833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003552	TTTCCA	2	12	1136053	1136064	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003552	GAAAAC	2	12	1163273	1163284	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_003552	TAGCTG	2	12	1164775	1164786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_003552	TGAGAT	2	12	1176813	1176824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003552	TCCCTC	2	12	1178167	1178178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_003552	CTGGTT	2	12	1196743	1196754	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_003552	ATGGAA	2	12	1205660	1205671	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003552	AAAGTA	2	12	1214846	1214857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003552	TACTTT	2	12	1222673	1222684	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_003552	AGCCAG	2	12	1232349	1232360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_003552	TAAGGA	2	12	1236996	1237007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003552	TAGCTG	2	12	1239631	1239642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_003552	ACAGCT	2	12	1243485	1243496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003552	TCCTTA	2	12	1251353	1251364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_003552	GAATTT	2	12	1256757	1256768	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003552	ATTGTT	2	12	1282531	1282542	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003552	TTAATT	2	12	1311794	1311805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003552	AATTTA	2	12	1395430	1395441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003552	TCTCCT	2	12	1406650	1406661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_003552	CTCTGC	2	12	1415707	1415718	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_003552	TATATT	2	12	1440030	1440041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003552	AAAATT	2	12	1445362	1445373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003552	AATAAA	2	12	1457825	1457836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003552	TAGAAA	2	12	1468427	1468438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003552	TATTTT	2	12	1472226	1472237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003552	AGTTTT	2	12	1477243	1477254	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003552	TAGATG	2	12	1517962	1517973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003552	AAATTC	2	12	1518691	1518702	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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133	NC_003552	AATTAT	2	12	1590376	1590387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_003552	GAGAAA	2	12	2722744	2722755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_003552	CGCGGA	2	12	2723414	2723425	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_003552	TGTAAT	2	12	2724287	2724298	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_003552	CCGGGA	2	12	2730163	2730174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_003552	TGTGCC	2	12	2733763	2733774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_003552	CCAGGA	2	12	2736941	2736952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_003552	TAAGGT	2	12	2745702	2745713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_003552	ACCTTA	2	12	2745919	2745930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_003552	GGGTTG	2	12	2751676	2751687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_003552	TTAATT	2	12	2783939	2783950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_003552	CTTTTT	2	12	2827134	2827145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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273	NC_003552	CTTTTT	2	12	2845525	2845536	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
274	NC_003552	ATTATC	2	12	2850766	2850777	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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280	NC_003552	ATTGAT	2	12	2882224	2882235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_003552	AAAAGG	2	12	2882307	2882318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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364	NC_003552	CTTGGA	2	12	3463821	3463832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
365	NC_003552	TTATAT	2	12	3465475	3465486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_003552	GGTATT	2	12	3473422	3473433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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369	NC_003552	TCTTCC	2	12	3477544	3477555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
370	NC_003552	TATGAT	2	12	3478916	3478927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
371	NC_003552	TTTTTA	2	12	3485678	3485689	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
372	NC_003552	GTTGAC	2	12	3487925	3487936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
373	NC_003552	GAGCAA	2	12	3493094	3493105	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
374	NC_003552	AATGTG	2	12	3495611	3495622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
375	NC_003552	TGAATA	2	12	3497389	3497400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
376	NC_003552	TCAGGT	2	12	3503786	3503797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
377	NC_003552	AACTTT	2	12	3519007	3519018	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
378	NC_003552	ACTAAA	2	12	3556271	3556282	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
379	NC_003552	CAGAGT	2	12	3561881	3561892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
380	NC_003552	GTTTAA	2	12	3569066	3569077	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_003552	CAATTA	2	12	3570216	3570227	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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395	NC_003552	CCTGAA	2	12	3677276	3677287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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401	NC_003552	TTATAA	2	12	3701834	3701845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_003552	TCAGTT	3	18	3709155	3709172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
403	NC_003552	TATTTA	2	12	3729912	3729923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_003552	TTTGGA	2	12	4653743	4653754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
496	NC_003552	AAAAAT	2	12	4709375	4709386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_003552	ATATAA	2	12	4721425	4721436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_003552	AATCAA	2	12	4728544	4728555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
499	NC_003552	TTAATT	2	12	4729459	4729470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_003552	AAGAAA	2	12	4736235	4736246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

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