MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 1678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003552	ATTAAC	2	12	5159757	5159768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	20093024
1502	NC_003552	GCAAGG	2	12	5167375	5167386	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093032
1503	NC_003552	TTGCAA	2	12	5167427	5167438	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20093032
1504	NC_003552	AAAAAT	2	12	5170277	5170288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	20093037
1505	NC_003552	GATTCC	2	12	5170352	5170363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20093037
1506	NC_003552	GACCTG	2	12	5175069	5175080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20093041
1507	NC_003552	AAGCAG	2	12	5175762	5175773	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20093041
1508	NC_003552	AGGAAA	2	12	5178695	5178706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093045
1509	NC_003552	TGACCA	2	12	5181857	5181868	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20093049
1510	NC_003552	TTGCGA	2	12	5182101	5182112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20093049
1511	NC_003552	ACCGGA	2	12	5193312	5193323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093060
1512	NC_003552	GCAGAA	2	12	5197881	5197892	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20093066
1513	NC_003552	GAAACG	2	12	5198521	5198532	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20093067
1514	NC_003552	CAGAAA	2	12	5200976	5200987	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20093068
1515	NC_003552	ATGGGA	2	12	5210081	5210092	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20093073
1516	NC_003552	ATGGGA	2	12	5211785	5211796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20093073
1517	NC_003552	CCGGCA	2	12	5214361	5214372	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	20093074
1518	NC_003552	CCGGCA	2	12	5214460	5214471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	20093074
1519	NC_003552	CAGTGA	2	12	5216747	5216758	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20093074
1520	NC_003552	TGCAAA	2	12	5217905	5217916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20093074
1521	NC_003552	AGACGG	2	12	5221734	5221745	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093076
1522	NC_003552	CTATAC	2	12	5228965	5228976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093078
1523	NC_003552	TGCAAA	2	12	5231797	5231808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20093078
1524	NC_003552	GACGGA	2	12	5232578	5232589	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093078
1525	NC_003552	AAGAAA	2	12	5232756	5232767	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20093078
1526	NC_003552	TGCAGG	2	12	5238614	5238625	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	20093080
1527	NC_003552	AAGAAA	2	12	5248461	5248472	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20093081
1528	NC_003552	GAAATA	2	12	5249401	5249412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20093082
1529	NC_003552	GGAATT	2	12	5249887	5249898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093082
1530	NC_003552	TTACTT	2	12	5250015	5250026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20093082
1531	NC_003552	ACTCCT	2	12	5250206	5250217	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	20093082
1532	NC_003552	TATCAG	2	12	5251757	5251768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20093083
1533	NC_003552	TTCCTC	2	12	5252844	5252855	0 %	50 %	0 %	50 %	20093084
1534	NC_003552	ATTTTT	2	12	5258323	5258334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	20093084
1535	NC_003552	TGATGG	2	12	5265961	5265972	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	20093086
1536	NC_003552	TCTGGA	2	12	5266618	5266629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20093086
1537	NC_003552	GACGGA	2	12	5267897	5267908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093086
1538	NC_003552	AACGGA	2	12	5268020	5268031	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20093086
1539	NC_003552	CTTCTC	2	12	5268277	5268288	0 %	50 %	0 %	50 %	20093087
1540	NC_003552	TAAAAG	2	12	5269842	5269853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20093088
1541	NC_003552	ATGGGA	2	12	5271838	5271849	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20093088
1542	NC_003552	AGGTGC	2	12	5282438	5282449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	20093094
1543	NC_003552	AATTGA	2	12	5282822	5282833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20093094
1544	NC_003552	ACGGAG	2	12	5286430	5286441	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093094
1545	NC_003552	GACGGA	2	12	5287842	5287853	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093094
1546	NC_003552	AACGGA	2	12	5287965	5287976	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20093094
1547	NC_003552	AGCTGG	2	12	5295130	5295141	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	20093098
1548	NC_003552	AAGAAA	2	12	5297549	5297560	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20093098
1549	NC_003552	CCTGAC	2	12	5298789	5298800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20093099
1550	NC_003552	ACCTAT	2	12	5301134	5301145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093101
1551	NC_003552	ACGGAA	2	12	5301942	5301953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20093101
1552	NC_003552	CCTGGG	2	12	5302413	5302424	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	20093101
1553	NC_003552	ACGGAG	2	12	5305452	5305463	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093101
1554	NC_003552	GACGGA	2	12	5306870	5306881	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093101
1555	NC_003552	AACGGA	2	12	5306993	5307004	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20093101
1556	NC_003552	AATTCC	2	12	5309480	5309491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093103
1557	NC_003552	GACGGC	2	12	5310666	5310677	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	20093104
1558	NC_003552	CTGGGA	2	12	5310872	5310883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	20093104
1559	NC_003552	TCCACA	2	12	5312136	5312147	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	20093104
1560	NC_003552	GACGGG	2	12	5312307	5312318	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	20093104
1561	NC_003552	GAACCG	2	12	5313837	5313848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093104
1562	NC_003552	GACGGA	2	12	5314545	5314556	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20093104
1563	NC_003552	ATCAGC	2	12	5317791	5317802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20093106
1564	NC_003552	AGGTCC	2	12	5325387	5325398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20093113
1565	NC_003552	CAGGAA	2	12	5328712	5328723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20093116
1566	NC_003552	GAAGAT	2	12	5329162	5329173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20093116
1567	NC_003552	GAATTT	2	12	5329321	5329332	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	20093116
1568	NC_003552	AGTTCC	2	12	5332200	5332211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20093118
1569	NC_003552	CAAGCC	2	12	5333005	5333016	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	20093119
1570	NC_003552	ATTGCA	2	12	5343090	5343101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20093125
1571	NC_003552	GAAAAA	2	12	5348810	5348821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20093130
1572	NC_003552	TTTCGG	2	12	5350662	5350673	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	20093133
1573	NC_003552	AACCAT	2	12	5351670	5351681	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	20093133
1574	NC_003552	TGCAAC	2	12	5351796	5351807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20093133
1575	NC_003552	ATCAGG	2	12	5352781	5352792	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20093135
1576	NC_003552	ATCGTC	2	12	5361819	5361830	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20093140
1577	NC_003552	CTGTCC	2	12	5367543	5367554	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	20093142
1578	NC_003552	TAATAC	2	12	5373409	5373420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	20093146
1579	NC_003552	TTTCGG	2	12	5374907	5374918	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	20093148
1580	NC_003552	GATTCC	2	12	5379383	5379394	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20093150
1581	NC_003552	CCGTAC	2	12	5386874	5386885	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20093155
1582	NC_003552	CCCTGA	2	12	5388608	5388619	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20093157
1583	NC_003552	ATAGGG	3	18	5389803	5389820	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20093158
1584	NC_003552	GAGGAT	2	12	5395732	5395743	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20093164
1585	NC_003552	TCTACA	2	12	5397845	5397856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093164
1586	NC_003552	GAAAAA	2	12	5405117	5405128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20093167
1587	NC_003552	GGTTCG	2	12	5408574	5408585	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	20093169
1588	NC_003552	TTTGTA	2	12	5421895	5421906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	20093180
1589	NC_003552	CGGGAG	2	12	5422741	5422752	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	20093181
1590	NC_003552	CGTATC	2	12	5424258	5424269	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20093182
1591	NC_003552	CCCTTC	2	12	5425269	5425280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093182
1592	NC_003552	TTACTG	2	12	5428948	5428959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20093184
1593	NC_003552	GGAAAA	2	12	5436843	5436854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093190
1594	NC_003552	GTTTTG	2	12	5438008	5438019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093191
1595	NC_003552	GATCGA	2	12	5438669	5438680	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20093191
1596	NC_003552	AAGTAT	2	12	5453674	5453685	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20093204
1597	NC_003552	TCGATA	2	12	5456807	5456818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20093207
1598	NC_003552	TTGCTT	2	12	5456890	5456901	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20093207
1599	NC_003552	GCCGCA	2	12	5456911	5456922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	20093207
1600	NC_003552	CCTGCG	2	12	5459878	5459889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	20093209
1601	NC_003552	CAGCCG	2	12	5475345	5475356	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	20093216
1602	NC_003552	ATGGTG	2	12	5487221	5487232	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	20093228
1603	NC_003552	AAGACA	2	12	5488436	5488447	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20093228
1604	NC_003552	TTCTTT	2	12	5492672	5492683	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	20093232
1605	NC_003552	TGCCCT	2	12	5500006	5500017	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	20093236
1606	NC_003552	AAAAGC	2	12	5507083	5507094	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20093243
1607	NC_003552	CTGAAG	2	12	5516559	5516570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20093251
1608	NC_003552	TATTGC	2	12	5517221	5517232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20093252
1609	NC_003552	GAAAAT	2	12	5517527	5517538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20093252
1610	NC_003552	GATTTC	2	12	5518249	5518260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20093253
1611	NC_003552	TGAAAA	2	12	5518380	5518391	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20093253
1612	NC_003552	CCAGGT	2	12	5518716	5518727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20093254
1613	NC_003552	CTGAAT	2	12	5524154	5524165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20093261
1614	NC_003552	CTGAAT	2	12	5524168	5524179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20093261
1615	NC_003552	TTCTGA	2	12	5530112	5530123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20093266
1616	NC_003552	ATGACC	2	12	5534806	5534817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20093271
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