MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 1519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	TATGA	2	10	148	157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003552	CAAAT	2	10	1617	1626	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_003552	GTTTT	2	10	1690	1699	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003552	ACAAT	2	10	2767	2776	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_003552	TTGGA	2	10	6287	6296	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003552	CAATT	2	10	6513	6522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003552	TCTTT	2	10	7158	7167	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003552	CCTTA	2	10	7232	7241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_003552	CTTTT	2	10	10776	10785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003552	TAGTT	2	10	12721	12730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003552	TTTTC	2	10	14766	14775	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003552	TTTAA	2	10	22807	22816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003552	ATCCA	2	10	22868	22877	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_003552	GTTTA	2	10	23078	23087	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003552	ATTTT	2	10	23685	23694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003552	GATTA	2	10	24121	24130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003552	TTTTC	2	10	24382	24391	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_003552	TGAAA	2	10	31005	31014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003552	GGTTC	2	10	34563	34572	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003552	TTAAT	2	10	39713	39722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003552	TTTAT	2	10	46704	46713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003552	CATTT	2	10	46732	46741	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_003552	ATTAA	2	10	52529	52538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003552	ATTTT	2	10	59055	59064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003552	ATTTT	2	10	73689	73698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003552	TTTGT	2	10	85121	85130	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003552	TTTTG	2	10	86235	86244	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003552	ATTTT	2	10	90667	90676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003552	TGAAT	2	10	94469	94478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003552	TTTTA	2	10	94550	94559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003552	AGTGG	2	10	96735	96744	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003552	ATTAA	2	10	105060	105069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003552	TGTAA	2	10	114051	114060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003552	TTTCT	2	10	115021	115030	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003552	TTTAG	2	10	115485	115494	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003552	CTTCT	2	10	127757	127766	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_003552	AAAAG	2	10	128154	128163	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003552	ATCAA	2	10	128722	128731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_003552	GAAAA	2	10	129621	129630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003552	TTTTC	2	10	131116	131125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_003552	TCTGA	2	10	132268	132277	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_003552	TTCTT	2	10	132424	132433	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003552	TGAAT	2	10	141950	141959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003552	TTAAT	2	10	144893	144902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003552	TTTCT	2	10	146665	146674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_003552	AAAAC	2	10	154730	154739	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_003552	AAATT	2	10	155890	155899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003552	CCTGT	2	10	158700	158709	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_003552	AAAAC	2	10	160203	160212	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003552	ATTTT	2	10	160316	160325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003552	CCATA	2	10	162037	162046	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_003552	AAATG	2	10	164351	164360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003552	CCACA	2	10	168772	168781	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_003552	ATTTT	2	10	168921	168930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003552	ATATT	2	10	173736	173745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003552	ACTTA	2	10	182448	182457	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003552	GCTCA	2	10	194133	194142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_003552	TCTCT	2	10	197482	197491	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_003552	ATTTG	2	10	210375	210384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003552	GACAT	2	10	212518	212527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_003552	CATAG	2	10	238461	238470	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_003552	GTACC	2	10	240325	240334	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_003552	TTAAA	2	10	242877	242886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003552	TTAAA	2	10	242897	242906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003552	TTAAA	2	10	242918	242927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003552	TTAAA	2	10	242939	242948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003552	TTAAA	2	10	242960	242969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003552	AGTAC	2	10	251453	251462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003552	GAGAG	2	10	256198	256207	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003552	CTCTT	2	10	259373	259382	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_003552	AGGGT	2	10	259469	259478	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003552	TCGCT	2	10	265445	265454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_003552	TTATT	2	10	268034	268043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003552	TATTT	2	10	274788	274797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003552	TTTAA	2	10	281916	281925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003552	ATTTT	2	10	288674	288683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003552	TTTAT	2	10	304553	304562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003552	TCTTT	2	10	311324	311333	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_003552	GAAAA	2	10	318537	318546	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003552	AATAC	2	10	320311	320320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003552	CTGCA	2	10	322672	322681	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_003552	ATCCT	2	10	322754	322763	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_003552	ATTAT	2	10	322918	322927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003552	TCTTT	2	10	332513	332522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_003552	AAATG	2	10	334573	334582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003552	TACTT	2	10	336792	336801	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_003552	TTCTT	2	10	336930	336939	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_003552	TCTTT	2	10	336940	336949	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_003552	CTGTA	2	10	345587	345596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_003552	TACAT	2	10	346608	346617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_003552	TTTTA	2	10	353522	353531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003552	GCTTT	2	10	354472	354481	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_003552	CTTCG	2	10	361607	361616	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_003552	CTGTT	2	10	362372	362381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_003552	TGAGC	2	10	370538	370547	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_003552	ATAAA	7	35	373664	373698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003552	TTTTA	2	10	374662	374671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003552	CATTT	2	10	374978	374987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_003552	ATTTG	2	10	378613	378622	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003552	TTTTA	2	10	380854	380863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003552	CTTTA	2	10	380871	380880	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_003552	TTTCC	2	10	385756	385765	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_003552	CTTTT	2	10	402060	402069	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_003552	GATTT	2	10	424886	424895	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003552	AGATG	2	10	426134	426143	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003552	TTTAT	2	10	446114	446123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003552	AAATA	2	10	447140	447149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003552	ATTAA	2	10	447346	447355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003552	AAATA	2	10	448559	448568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003552	AAATA	2	10	448572	448581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003552	TACTT	2	10	458309	458318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_003552	TTTAC	2	10	464802	464811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_003552	GAAAA	2	10	464956	464965	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003552	TTCTT	2	10	464982	464991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_003552	AAGTT	2	10	478905	478914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003552	ATTTG	2	10	480688	480697	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003552	ATTAG	2	10	480823	480832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003552	GGAAA	2	10	481027	481036	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003552	ATTTA	2	10	495556	495565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003552	AACTT	2	10	498759	498768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_003552	GATAA	2	10	511691	511700	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003552	TTATT	2	10	515053	515062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003552	AAGAA	2	10	529236	529245	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003552	AGTGC	2	10	534798	534807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_003552	TTTTG	2	10	539859	539868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003552	CCCTA	2	10	542472	542481	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_003552	CTTTA	6	30	546502	546531	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_003552	AGTGC	2	10	546616	546625	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_003552	ATTTA	2	10	548708	548717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003552	CGGAA	2	10	548730	548739	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_003552	CCCTG	2	10	548969	548978	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_003552	GATAT	2	10	549753	549762	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003552	GTAAG	2	10	551413	551422	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003552	TTAAA	2	10	552404	552413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003552	ATTTC	2	10	552828	552837	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_003552	TTTGT	2	10	554362	554371	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003552	AGGAA	2	10	557288	557297	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003552	TCCGA	2	10	558271	558280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_003552	TCAAC	2	10	560596	560605	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_003552	TACAA	2	10	576542	576551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_003552	TAAAT	2	10	577285	577294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003552	AAATC	2	10	588260	588269	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_003552	AGAAA	2	10	592911	592920	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003552	AATCT	2	10	593132	593141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_003552	ATTAG	2	10	594336	594345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003552	TTTAT	2	10	595283	595292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003552	GAAAT	2	10	597743	597752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003552	CATTT	2	10	600864	600873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_003552	TGAAA	2	10	602642	602651	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003552	ATGAA	2	10	602954	602963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003552	TAAAG	2	10	603136	603145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003552	TTTTC	2	10	603974	603983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_003552	TTCTT	2	10	604026	604035	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_003552	AAAAC	2	10	605875	605884	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_003552	TTATA	2	10	606250	606259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003552	ATTCC	2	10	608587	608596	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
158	NC_003552	GGAAT	2	10	613570	613579	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
159	NC_003552	TCCTG	2	10	622126	622135	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_003552	TTTTG	2	10	631137	631146	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_003552	ATGAA	2	10	676068	676077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_003552	ATTTT	2	10	682873	682882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_003552	TTAAG	2	10	683206	683215	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_003552	TCAAT	2	10	685023	685032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_003552	GGCCT	2	10	721063	721072	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
174	NC_003552	GTGCA	2	10	732642	732651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_003552	ATTCT	2	10	744307	744316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_003552	TTTTC	2	10	746894	746903	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_003552	AAAGA	2	10	750856	750865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_003552	AAAAT	2	10	773930	773939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_003552	GTTTT	2	10	773957	773966	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_003552	AGCGA	2	10	783722	783731	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_003552	TGAAA	2	10	786062	786071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_003552	CGCTC	2	10	794277	794286	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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225	NC_003552	TCATT	2	10	889886	889895	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_003552	TGGAT	2	10	974258	974267	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_003552	GACGA	2	10	1077091	1077100	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
275	NC_003552	TACTG	2	10	1077758	1077767	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_003552	GAACA	2	10	1084454	1084463	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_003552	CCTGC	2	10	1092364	1092373	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
278	NC_003552	CAATA	2	10	1103157	1103166	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_003552	TTATT	2	10	1105424	1105433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_003552	TTTGC	2	10	1111335	1111344	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
281	NC_003552	TTCAG	2	10	1111379	1111388	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
282	NC_003552	ATAAA	2	10	1114033	1114042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_003552	ATTTC	2	10	1123151	1123160	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_003552	AGAAT	2	10	1138177	1138186	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_003552	AGTAC	2	10	1142495	1142504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_003552	TATAA	2	10	1142547	1142556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_003552	AAGGT	2	10	1149780	1149789	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
288	NC_003552	TAAAA	2	10	1154412	1154421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_003552	CAAAA	2	10	1163146	1163155	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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