MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 4646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	ACAG	2	8	1591	1598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003552	GAAG	2	8	2220	2227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003552	CATC	2	8	3088	3095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_003552	AGTA	2	8	5960	5967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003552	AAAT	2	8	6536	6543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003552	AATC	2	8	6714	6721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003552	AATT	2	8	6898	6905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003552	CTAA	2	8	6925	6932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003552	TAAA	2	8	9543	9550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003552	ATGC	2	8	10908	10915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003552	CAAA	2	8	11025	11032	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003552	ATAA	2	8	11334	11341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003552	GACT	2	8	12790	12797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_003552	CATT	2	8	12933	12940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003552	ACTT	2	8	15193	15200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_003552	TAAT	2	8	16692	16699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003552	AATG	2	8	16717	16724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003552	AAAT	2	8	16851	16858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003552	TGAA	2	8	16897	16904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003552	GAAT	2	8	16941	16948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003552	ATAA	2	8	17032	17039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003552	TTGT	2	8	17578	17585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003552	ATCA	2	8	17660	17667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003552	CTTT	2	8	19555	19562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_003552	TGCC	2	8	21535	21542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_003552	GTAA	2	8	21654	21661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003552	TTCA	2	8	21690	21697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003552	TTTA	2	8	22837	22844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003552	TATT	2	8	23058	23065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003552	AACA	2	8	24031	24038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003552	ATTT	2	8	24140	24147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003552	CATA	2	8	24246	24253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003552	ACTA	2	8	24479	24486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_003552	CCTG	2	8	25586	25593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_003552	TTTC	2	8	30143	30150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003552	CTTA	2	8	30972	30979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003552	ATCT	2	8	34594	34601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003552	TTCA	2	8	35146	35153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_003552	TTCT	2	8	39239	39246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003552	AAAT	2	8	39408	39415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003552	TAAT	2	8	39872	39879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003552	AGAA	2	8	39953	39960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003552	ATTA	2	8	41118	41125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003552	TTGA	2	8	45901	45908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003552	GTTG	2	8	45918	45925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003552	TGGC	2	8	46090	46097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003552	TCTG	2	8	47004	47011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003552	TGAT	2	8	47274	47281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003552	AGAA	2	8	49316	49323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003552	ATTT	2	8	51017	51024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003552	CCTT	2	8	52220	52227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003552	CCTT	2	8	52284	52291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003552	AATC	2	8	52984	52991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_003552	AATC	2	8	53000	53007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003552	AATC	2	8	53016	53023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003552	AATC	2	8	53032	53039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003552	AATC	2	8	53048	53055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_003552	AATC	2	8	53064	53071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_003552	AATC	2	8	53080	53087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003552	AATC	2	8	53096	53103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003552	AATC	2	8	53112	53119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_003552	AATC	2	8	53128	53135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003552	AATC	2	8	53144	53151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003552	AATC	2	8	53160	53167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003552	AATC	2	8	53176	53183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_003552	AATC	2	8	53192	53199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_003552	AATC	2	8	53208	53215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_003552	AATC	2	8	53224	53231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_003552	AATC	2	8	53240	53247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_003552	AATC	2	8	53256	53263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003552	AATC	2	8	53272	53279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003552	AATC	2	8	53288	53295	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003552	TTAA	2	8	54687	54694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003552	TGAA	2	8	56768	56775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003552	TTGA	2	8	56805	56812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003552	AAAT	2	8	57410	57417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003552	CGGA	2	8	57522	57529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_003552	ATTA	2	8	63449	63456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003552	ATTT	2	8	64009	64016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003552	GTTC	2	8	67187	67194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_003552	TGAT	2	8	67434	67441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003552	ATTA	2	8	68068	68075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003552	AATT	2	8	68224	68231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003552	AATT	2	8	68917	68924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003552	CTAA	2	8	69503	69510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_003552	TTTG	2	8	69562	69569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003552	GTTT	2	8	69636	69643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003552	TCGA	2	8	71443	71450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_003552	GTTC	2	8	71917	71924	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003552	TATT	2	8	75750	75757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003552	CTTT	2	8	75837	75844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_003552	TTTA	2	8	80684	80691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003552	ATGG	2	8	80991	80998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003552	TAAA	2	8	81996	82003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003552	CTTA	2	8	85075	85082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_003552	GAAA	2	8	87740	87747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003552	CTTA	2	8	87842	87849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003552	GGAT	2	8	88111	88118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003552	ATCA	2	8	89395	89402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_003552	TTTC	2	8	90698	90705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003552	TTTG	2	8	94521	94528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003552	GGAT	2	8	97518	97525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003552	TGAC	2	8	97651	97658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003552	AAAT	2	8	100112	100119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003552	TTAT	2	8	104979	104986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003552	ACTC	2	8	105047	105054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_003552	ATTC	2	8	108611	108618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_003552	ATTT	2	8	108713	108720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003552	TAAT	2	8	114013	114020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003552	TTCT	2	8	115076	115083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_003552	TTTC	2	8	115205	115212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_003552	ATTT	2	8	115230	115237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003552	AGAA	2	8	115348	115355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003552	TTTC	2	8	115554	115561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003552	TTTC	2	8	117346	117353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_003552	GTAT	2	8	117519	117526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003552	ATTC	2	8	118297	118304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_003552	TAAG	2	8	127919	127926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003552	AAAG	2	8	128690	128697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003552	AAAC	2	8	128756	128763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_003552	TTTG	2	8	128830	128837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003552	ATGG	2	8	130949	130956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003552	TTCC	2	8	130961	130968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_003552	TCTT	2	8	133990	133997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003552	TGAA	2	8	135023	135030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003552	AAAT	2	8	137508	137515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003552	TATC	2	8	137532	137539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_003552	CTTT	2	8	137572	137579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_003552	TCCT	2	8	138565	138572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_003552	GTAT	2	8	139167	139174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003552	ATTA	2	8	139353	139360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003552	TTAA	2	8	142420	142427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003552	TATT	2	8	144853	144860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003552	ATTC	2	8	146495	146502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_003552	ATTT	2	8	146657	146664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003552	AAAT	2	8	147324	147331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003552	CTTC	2	8	149889	149896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_003552	TTTC	2	8	150032	150039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_003552	AATG	2	8	151915	151922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003552	AATG	2	8	151930	151937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003552	AATG	2	8	151945	151952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003552	AATG	2	8	151960	151967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003552	AATG	2	8	151975	151982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003552	AATG	2	8	151990	151997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003552	ATAA	2	8	152032	152039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003552	AAAC	2	8	152324	152331	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_003552	TTAT	2	8	155938	155945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003552	CATC	2	8	161038	161045	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_003552	ATTT	2	8	161047	161054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003552	TTCA	2	8	161143	161150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_003552	TGTT	2	8	161193	161200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003552	ATTA	2	8	161713	161720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003552	TTAT	2	8	161892	161899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003552	AATT	2	8	163520	163527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_003552	TTAT	2	8	171157	171164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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