MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS8232 chromosome

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003485	AGTGTA	2	12	21849	21860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003485	ACTAAT	2	12	21877	21888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_003485	AGTGTA	2	12	27850	27861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003485	ACTAAT	2	12	27878	27889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_003485	TATTTT	2	12	64782	64793	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003485	AGTGTA	2	12	84752	84763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003485	ACTAAT	2	12	84780	84791	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_003485	TTCGGG	2	12	85722	85733	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_003485	TTGTCT	2	12	87111	87122	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_003485	ATAAAA	2	12	113971	113982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003485	AGATAA	2	12	124744	124755	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003485	AGATAA	2	12	136171	136182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003485	CTTTAT	2	12	161097	161108	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003485	CTCTTT	2	12	162961	162972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003485	GGTGTT	2	12	166027	166038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003485	CAGTTC	2	12	187338	187349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_003485	TTTAAA	2	12	189186	189197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003485	AGTGTA	2	12	262809	262820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003485	ACTAAT	2	12	262837	262848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_003485	TTAAAA	2	12	283229	283240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003485	TAATTT	2	12	298441	298452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003485	TAGCAA	2	12	330139	330150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_003485	TTTAAT	2	12	339321	339332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003485	TTTTAG	2	12	352849	352860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003485	AAGACC	2	12	367994	368005	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_003485	GCTTTG	2	12	381656	381667	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_003485	ATTTAA	2	12	399764	399775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003485	TGACAA	2	12	424050	424061	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003485	AGAAAT	2	12	445833	445844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003485	ATTTTA	2	12	483685	483696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003485	GAGTAA	2	12	489474	489485	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003485	TAAAAA	2	12	505376	505387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003485	AGGACT	2	12	510499	510510	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_003485	AAAAGA	2	12	522954	522965	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003485	TAAAAA	2	12	529920	529931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003485	AAAAGA	2	12	530103	530114	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003485	AAATAA	2	12	582224	582235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003485	CCTTGT	2	12	638138	638149	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_003485	TAAATA	2	12	753498	753509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003485	AGGTAA	2	12	764297	764308	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003485	TTCGGG	2	12	799397	799408	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_003485	TGAAGC	2	12	853993	854004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_003485	GAAAAG	2	12	877867	877878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003485	TTAAAA	2	12	909299	909310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003485	TAACAA	2	12	957717	957728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_003485	TTTAAA	2	12	1019468	1019479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003485	AGTCTT	2	12	1022329	1022340	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_003485	ATATGA	2	12	1120510	1120521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003485	AGTCTT	2	12	1140337	1140348	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_003485	TCTTTT	2	12	1167655	1167666	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_003485	CCTTGG	2	12	1199644	1199655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_003485	TGACTT	2	12	1257513	1257524	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_003485	ATGATA	2	12	1264019	1264030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003485	TAGAAT	2	12	1273866	1273877	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003485	CTTAAG	2	12	1281720	1281731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_003485	TCCTTC	2	12	1338826	1338837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_003485	TATTAG	2	12	1344342	1344353	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003485	TACACT	2	12	1344371	1344382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_003485	GAAAAA	2	12	1349839	1349850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003485	CAATTC	2	12	1368928	1368939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_003485	TATTTT	2	12	1370000	1370011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003485	AATACC	2	12	1379018	1379029	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_003485	AGCCTT	2	12	1469487	1469498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003485	TAAAAA	2	12	1476445	1476456	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003485	AGAAAA	2	12	1489855	1489866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003485	AGAAAA	2	12	1490341	1490352	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003485	AATATT	2	12	1591800	1591811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003485	TATCAC	2	12	1603350	1603361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003485	TTTGCT	2	12	1608605	1608616	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_003485	TATAAT	2	12	1611451	1611462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003485	TAACAA	2	12	1622552	1622563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_003485	TTTTTC	2	12	1624938	1624949	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_003485	AGAAAA	2	12	1627634	1627645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003485	TATTAG	2	12	1633966	1633977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003485	TACACT	2	12	1633995	1634006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_003485	GTTAAA	2	12	1649120	1649131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003485	TTTTCA	2	12	1681186	1681197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_003485	TTATTT	2	12	1709476	1709487	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003485	CCTTTA	2	12	1768546	1768557	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_003485	ATTTTA	2	12	1822714	1822725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003485	TTTTCA	2	12	1829908	1829919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_003485	TGACAT	2	12	1845152	1845163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_003485	AATTTA	3	18	1854382	1854399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003485	GAAAAA	2	12	1890766	1890777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.