MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS8232 chromosome

Total Repeats: 634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003485	CTATTC	2	12	1788	1799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19745203
2	NC_003485	TTACGT	2	12	4935	4946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19745205
3	NC_003485	GATTCA	2	12	6730	6741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19745206
4	NC_003485	ATTTTC	2	12	6976	6987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19745206
5	NC_003485	CTTAAC	2	12	7489	7500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745206
6	NC_003485	TAGATA	2	12	9992	10003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	19745209
7	NC_003485	GTATTG	2	12	11065	11076	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	19745210
8	NC_003485	ATCAGA	2	12	11099	11110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19745210
9	NC_003485	AGATTT	2	12	11687	11698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19745210
10	NC_003485	TAAAAT	2	12	14004	14015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745212
11	NC_003485	GAATCT	2	12	14731	14742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19745212
12	NC_003485	CTGCAA	2	12	31741	31752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	19745214
13	NC_003485	ACTGAG	2	12	37459	37470	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19745220
14	NC_003485	CAGGCG	2	12	37913	37924	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	19745220
15	NC_003485	ATTGCT	2	12	39871	39882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19745220
16	NC_003485	ATATCG	2	12	44489	44500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19745224
17	NC_003485	AAAGCC	2	12	47492	47503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19745226
18	NC_003485	AAAAGT	2	12	53379	53390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	19745232
19	NC_003485	CGAACA	2	12	55424	55435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19745233
20	NC_003485	ATAACT	2	12	55843	55854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19745234
21	NC_003485	AAGGAA	2	12	56349	56360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745235
22	NC_003485	GCCTTT	2	12	62351	62362	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	19745238
23	NC_003485	GGCAAC	2	12	63697	63708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745239
24	NC_003485	AAAGGT	2	12	65253	65264	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	19745241
25	NC_003485	CTTGTT	2	12	66023	66034	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19745242
26	NC_003485	AGCTGA	2	12	66471	66482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19745243
27	NC_003485	CGCAAT	2	12	67874	67885	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	19745246
28	NC_003485	ATTGAA	2	12	68286	68297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	19745247
29	NC_003485	ACATCA	2	12	68422	68433	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	19745247
30	NC_003485	CAAAGG	2	12	72465	72476	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	19745256
31	NC_003485	AAATTA	2	12	73527	73538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745259
32	NC_003485	GCGGTG	2	12	74041	74052	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	19745260
33	NC_003485	TAAAGA	2	12	74402	74413	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	19745261
34	NC_003485	ATTGAA	2	12	76602	76613	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	19745263
35	NC_003485	CGAAGG	2	12	99430	99441	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	19745278
36	NC_003485	CTGGTA	2	12	101427	101438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	19745278
37	NC_003485	ATATTT	2	12	102209	102220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745280
38	NC_003485	CTTTTT	2	12	103418	103429	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19745281
39	NC_003485	AACCTT	2	12	116120	116131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745299
40	NC_003485	CTTTTT	2	12	118267	118278	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19745300
41	NC_003485	TGGTGT	2	12	121185	121196	0 %	50 %	50 %	0 %	19745303
42	NC_003485	TGGTTT	2	12	121962	121973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745304
43	NC_003485	CCATTA	2	12	123101	123112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745305
44	NC_003485	TATTGA	2	12	126658	126669	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19745307
45	NC_003485	TGTTAT	2	12	127793	127804	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	19745308
46	NC_003485	ATTTTT	2	12	128653	128664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19745309
47	NC_003485	TTTTTA	2	12	129235	129246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19745309
48	NC_003485	AATAGC	2	12	132053	132064	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19745312
49	NC_003485	ATCTTG	2	12	136556	136567	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19745318
50	NC_003485	AAAAGC	2	12	138130	138141	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	19745318
51	NC_003485	TTTATT	2	12	138316	138327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19745318
52	NC_003485	ATGTCA	2	12	138467	138478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19745318
53	NC_003485	AAAGCT	2	12	139953	139964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19745321
54	NC_003485	AAGGTA	2	12	147785	147796	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	19745328
55	NC_003485	AAAACT	2	12	150402	150413	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	19745329
56	NC_003485	TATTGA	2	12	151996	152007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19745331
57	NC_003485	AAGGCT	2	12	155399	155410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19745334
58	NC_003485	TGCTGT	2	12	162359	162370	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	19745339
59	NC_003485	CAATTC	2	12	162507	162518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745339
60	NC_003485	GATGTT	2	12	167053	167064	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	19745345
61	NC_003485	AGATCA	2	12	167077	167088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19745345
62	NC_003485	GATGTT	2	12	176403	176414	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	19745351
63	NC_003485	TCTTTG	2	12	176716	176727	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19745352
64	NC_003485	TGGGAG	2	12	178461	178472	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	19745353
65	NC_003485	TGACTG	2	12	178630	178641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	19745353
66	NC_003485	TTGACC	2	12	179092	179103	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19745354
67	NC_003485	CCTATC	2	12	180097	180108	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	19745356
68	NC_003485	ATCGGT	2	12	185999	186010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	19745362
69	NC_003485	CAAACT	2	12	187564	187575	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	19745363
70	NC_003485	TCAACA	2	12	188352	188363	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	19745363
71	NC_003485	TGAAAA	2	12	194057	194068	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	19745368
72	NC_003485	ATTAGC	2	12	200559	200570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19745374
73	NC_003485	TCATGC	2	12	207485	207496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19745380
74	NC_003485	TCCCAT	2	12	211422	211433	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	19745384
75	NC_003485	AAGGCC	2	12	215546	215557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745389
76	NC_003485	TTGGCT	2	12	218034	218045	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	19745392
77	NC_003485	TACCCA	2	12	221434	221445	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	19745395
78	NC_003485	GATACG	2	12	222462	222473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19745397
79	NC_003485	AGGCAA	2	12	226855	226866	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	19745402
80	NC_003485	GCAAGA	2	12	230933	230944	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	19745405
81	NC_003485	TTCGAA	2	12	232332	232343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19745405
82	NC_003485	TGGCAA	2	12	234972	234983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19745408
83	NC_003485	CCAGAA	2	12	235304	235315	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19745408
84	NC_003485	CAGCAA	2	12	236329	236340	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19745409
85	NC_003485	TGGCGG	2	12	239079	239090	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	19745410
86	NC_003485	GGCTGT	2	12	241692	241703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	19745413
87	NC_003485	AGTGAC	2	12	243567	243578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19745415
88	NC_003485	AGCCAA	2	12	246093	246104	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19745418
89	NC_003485	ACTTAT	2	12	250832	250843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19745421
90	NC_003485	AAAAGC	2	12	251785	251796	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	19745421
91	NC_003485	GAAACA	2	12	251966	251977	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	19745421
92	NC_003485	AAAATC	2	12	256312	256323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	19745425
93	NC_003485	TAAAAA	2	12	266079	266090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	19745428
94	NC_003485	TCAAGA	2	12	272328	272339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19745436
95	NC_003485	GGGTTA	2	12	277335	277346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	19745441
96	NC_003485	GACAAT	2	12	279371	279382	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19745443
97	NC_003485	CCAGCT	2	12	281196	281207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	19745444
98	NC_003485	CCAATT	2	12	290096	290107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745453
99	NC_003485	CCAACG	2	12	290262	290273	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	19745453
100	NC_003485	ATAACC	2	12	292706	292717	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	19745454
101	NC_003485	TCTTTG	2	12	294207	294218	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19745455
102	NC_003485	GATTTT	2	12	295491	295502	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	19745456
103	NC_003485	TTTAAC	2	12	298589	298600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19745462
104	NC_003485	ACAGCA	2	12	298954	298965	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19745462
105	NC_003485	GTGGAA	2	12	303485	303496	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	19745470
106	NC_003485	TAAAAA	2	12	304562	304573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	19745472
107	NC_003485	ATTTAT	2	12	305189	305200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745473
108	NC_003485	ACCAGA	2	12	306079	306090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19745475
109	NC_003485	AAGCAA	2	12	307310	307321	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	19745477
110	NC_003485	TACTGT	2	12	308225	308236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19745479
111	NC_003485	CTTAAC	2	12	309028	309039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745480
112	NC_003485	GATGAA	2	12	317933	317944	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	19745494
113	NC_003485	TGGAGC	2	12	319146	319157	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	19745496
114	NC_003485	TAGAAG	2	12	325201	325212	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	19745498
115	NC_003485	TCAGAA	2	12	326412	326423	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19745499
116	NC_003485	AGAGGA	2	12	329534	329545	50 %	0 %	50 %	0 %	19745502
117	NC_003485	GCACCT	2	12	334307	334318	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	19745509
118	NC_003485	AGCAGG	2	12	336157	336168	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	19745511
119	NC_003485	ATGATT	2	12	351568	351579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19745531
120	NC_003485	TATCGC	2	12	351801	351812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19745531
121	NC_003485	AAGACC	2	12	352444	352455	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19745532
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223	NC_003485	ACGTAA	2	12	679416	679427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19745863
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229	NC_003485	TTTAGT	2	12	697212	697223	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	19745879
230	NC_003485	TTCGCG	2	12	701459	701470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745885
231	NC_003485	TTCCAA	2	12	704312	704323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745888
232	NC_003485	TGTGAT	2	12	706072	706083	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	19745889
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234	NC_003485	GTAATG	2	12	711971	711982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745895
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341	NC_003485	TTAATA	2	12	1042280	1042291	50 %	50 %	0 %	0 %	19746213
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345	NC_003485	TTTATT	2	12	1050956	1050967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19746225
346	NC_003485	TATCAA	2	12	1052760	1052771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19746226
347	NC_003485	GCCAGC	2	12	1055674	1055685	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	19746228
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349	NC_003485	CGTTGA	2	12	1063031	1063042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	19746240
350	NC_003485	CTTTCT	2	12	1063151	1063162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19746240
351	NC_003485	CATCTG	2	12	1063253	1063264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19746240
352	NC_003485	CCTTTA	2	12	1068710	1068721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19746248
353	NC_003485	TATCAA	2	12	1074965	1074976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19746259
354	NC_003485	TCAGTT	2	12	1075829	1075840	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19746260
355	NC_003485	CATCTT	2	12	1076790	1076801	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19746260
356	NC_003485	TCGGTT	2	12	1076924	1076935	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	19746260
357	NC_003485	TGCTTT	2	12	1077222	1077233	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19746261
358	NC_003485	AAAATC	2	12	1082599	1082610	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	19746272
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361	NC_003485	ATTACG	2	12	1100147	1100158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19746289
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364	NC_003485	TAACTG	2	12	1106224	1106235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19746295
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368	NC_003485	TCGCCA	2	12	1109870	1109881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	19746297
369	NC_003485	ATCCTT	2	12	1118785	1118796	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19746307
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372	NC_003485	CATACT	2	12	1120194	1120205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484700
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377	NC_003485	ATTCTT	2	12	1132974	1132985	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19746322
378	NC_003485	ATTTTT	2	12	1133781	1133792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19746323
379	NC_003485	CAATAT	2	12	1137367	1137378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19746326
380	NC_003485	TTGGTC	2	12	1142496	1142507	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	19746331
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422	NC_003485	AATATT	2	12	1273734	1273745	50 %	50 %	0 %	0 %	19746474
423	NC_003485	ACCGAT	2	12	1275661	1275672	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	19746476
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449	NC_003485	TTCCTG	2	12	1355220	1355231	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	19746546
450	NC_003485	AATGGT	2	12	1357874	1357885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19746548
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452	NC_003485	TCCTTC	2	12	1362892	1362903	0 %	50 %	0 %	50 %	19746553
453	NC_003485	TTCCTC	2	12	1366224	1366235	0 %	50 %	0 %	50 %	19746555
454	NC_003485	GTTATT	2	12	1373518	1373529	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	19746563
455	NC_003485	GATCTA	2	12	1376561	1376572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19746565
456	NC_003485	TAGCAA	2	12	1379081	1379092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19746568
457	NC_003485	CAAAAT	2	12	1383524	1383535	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	19746571
458	NC_003485	TTAATA	2	12	1384880	1384891	50 %	50 %	0 %	0 %	19746572
459	NC_003485	ATAGGT	2	12	1385475	1385486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19746573
460	NC_003485	ATCTCA	2	12	1385497	1385508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19746573
461	NC_003485	CATTAA	2	12	1385516	1385527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19746573
462	NC_003485	AGCATG	2	12	1386066	1386077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19746573
463	NC_003485	ACTGAC	2	12	1386308	1386319	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	19746573
464	NC_003485	AAATTG	2	12	1386477	1386488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	19746573
465	NC_003485	CTTTTT	2	12	1391568	1391579	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19746579
466	NC_003485	TTGGTC	2	12	1397316	1397327	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	19746583
467	NC_003485	CAATCA	2	12	1402087	1402098	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	19746588
468	NC_003485	GTCACC	2	12	1404514	1404525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161484698
469	NC_003485	CAGAGC	2	12	1407599	1407610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19746593
470	NC_003485	CAGAGC	2	12	1407875	1407886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19746593
471	NC_003485	GTCCGT	2	12	1410561	1410572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19746595
472	NC_003485	TGGCTA	2	12	1413679	1413690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	19746597
473	NC_003485	TGATGG	2	12	1417356	1417367	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	19746600
474	NC_003485	CTTCAG	2	12	1423337	1423348	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19746605
475	NC_003485	TGAGCA	2	12	1423711	1423722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19746606
476	NC_003485	AAAGCT	2	12	1427844	1427855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19746610
477	NC_003485	AAGCAA	2	12	1435010	1435021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	19746619
478	NC_003485	TAGCCA	2	12	1437605	1437616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	19746622
479	NC_003485	ACCTTT	2	12	1438747	1438758	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19746623
480	NC_003485	CCTTAG	2	12	1439391	1439402	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19746623
481	NC_003485	TTTTTA	2	12	1439654	1439665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19746623
482	NC_003485	TCTGCT	2	12	1454026	1454037	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	19746641
483	NC_003485	TGATTT	2	12	1457112	1457123	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	19746646
484	NC_003485	TTTATT	2	12	1459385	1459396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19746648
485	NC_003485	TCCTCT	2	12	1466447	1466458	0 %	50 %	0 %	50 %	19746652
486	NC_003485	CCGTCA	2	12	1467789	1467800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	19746654
487	NC_003485	ACTTGT	2	12	1468478	1468489	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19746656
488	NC_003485	TTAGCT	2	12	1472205	1472216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19746663
489	NC_003485	AGCTAC	2	12	1483776	1483787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	19746681
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491	NC_003485	CTCTTT	2	12	1487072	1487083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19746688
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499	NC_003485	CAAAAG	2	12	1508884	1508895	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	19746710
500	NC_003485	CCTTTG	2	12	1510916	1510927	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	19746713

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