MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS8232 chromosome

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003485	TGAAA	2	10	2943	2952	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003485	ACATT	2	10	16489	16498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_003485	TCGTG	2	10	18110	18119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_003485	GTTAA	2	10	19006	19015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003485	GGGAG	2	10	19525	19534	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003485	AGGGA	2	10	21736	21745	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003485	GCTTA	2	10	22102	22111	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003485	TCGTG	2	10	24111	24120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003485	GTTAA	2	10	25007	25016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003485	GGGAG	2	10	25526	25535	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003485	AGGGA	2	10	27737	27746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003485	GCTTA	2	10	28103	28112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003485	TTCTT	2	10	29934	29943	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_003485	CTTTT	2	10	30040	30049	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003485	TATAA	2	10	32475	32484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003485	CAAAT	2	10	51781	51790	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003485	TTTTA	2	10	53255	53264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003485	ATTTT	2	10	61272	61281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003485	AAATA	2	10	62539	62548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003485	TATAT	2	10	62624	62633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003485	AAGGA	2	10	70482	70491	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003485	GTTTC	2	10	77751	77760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_003485	TCGTG	2	10	81013	81022	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003485	GTTAA	2	10	81909	81918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003485	GGGAG	2	10	82428	82437	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003485	AGGGA	2	10	84639	84648	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003485	GCTTA	2	10	85005	85014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_003485	ATTAT	2	10	85295	85304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003485	TATAT	2	10	85378	85387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003485	AGCTC	2	10	90296	90305	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_003485	TAGTT	2	10	110897	110906	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003485	TTGAA	2	10	116818	116827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003485	TTTAG	2	10	118692	118701	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003485	TTGGC	2	10	135797	135806	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003485	GTATC	2	10	152954	152963	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_003485	ATATT	2	10	155498	155507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003485	TTGAC	2	10	160828	160837	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_003485	CGTCA	2	10	160860	160869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_003485	AACAA	2	10	162599	162608	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_003485	TCTAA	2	10	183208	183217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_003485	TTAAA	2	10	188984	188993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003485	TGTCT	2	10	198101	198110	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003485	TAAGA	2	10	199618	199627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003485	GTAAA	2	10	202760	202769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003485	ATGAA	2	10	209179	209188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003485	CCTTT	2	10	211878	211887	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_003485	GTTCA	2	10	220339	220348	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003485	TCATT	2	10	250442	250451	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_003485	TTGTA	2	10	257065	257074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003485	TCGTG	2	10	259070	259079	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003485	GTTAA	2	10	259966	259975	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003485	GGGAG	2	10	260485	260494	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003485	AGGGA	2	10	262696	262705	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003485	TTATC	2	10	264172	264181	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_003485	GTTAT	2	10	272547	272556	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003485	ATTAT	2	10	277130	277139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003485	ATTAT	2	10	277267	277276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003485	TGTGT	2	10	290520	290529	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003485	TTATT	2	10	298381	298390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003485	AAAAG	2	10	300013	300022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003485	GAAAT	2	10	309183	309192	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003485	AGAAA	2	10	312454	312463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003485	AAAAG	2	10	337929	337938	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003485	TGCTA	2	10	351337	351346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_003485	CAGGG	2	10	351357	351366	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_003485	TAAAA	2	10	357003	357012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003485	TTGAT	2	10	381463	381472	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003485	AGTAG	2	10	385264	385273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003485	TTTTC	2	10	390885	390894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_003485	TGAGA	2	10	394571	394580	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003485	TTTAT	2	10	404160	404169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003485	AAATC	2	10	407915	407924	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_003485	AGAAA	2	10	409701	409710	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003485	AAGGA	2	10	418387	418396	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003485	CTTTT	2	10	421061	421070	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_003485	AGTTT	2	10	421572	421581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003485	TGATT	2	10	421769	421778	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003485	CATGG	2	10	423083	423092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_003485	CGTTT	2	10	423796	423805	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_003485	TATAA	2	10	426585	426594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003485	CTTTT	2	10	430358	430367	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_003485	TAAAA	2	10	430375	430384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003485	TATCT	2	10	430718	430727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_003485	CTTTT	2	10	430952	430961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_003485	TAGAG	2	10	435946	435955	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003485	AAAGC	2	10	439753	439762	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_003485	GATTT	2	10	501289	501298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003485	TTATT	2	10	504141	504150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003485	GAATG	2	10	505448	505457	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003485	TCCTT	2	10	523282	523291	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_003485	GTTAT	2	10	526528	526537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003485	TTTCC	2	10	528095	528104	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_003485	AAAAT	2	10	528178	528187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003485	AGAAA	2	10	528233	528242	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003485	TTAGT	2	10	532647	532656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003485	CTTTT	2	10	542897	542906	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_003485	ATGGG	2	10	546303	546312	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003485	TTTAG	2	10	546346	546355	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003485	TAGAA	2	10	548045	548054	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003485	TAAAA	2	10	548651	548660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003485	TTTCC	2	10	554418	554427	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_003485	AAAAG	2	10	554428	554437	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003485	ATAAA	2	10	564516	564525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003485	TTTTG	2	10	567386	567395	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003485	AAGCC	2	10	568373	568382	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_003485	TGATA	2	10	578005	578014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003485	TACTA	2	10	579572	579581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_003485	AGTTT	2	10	581017	581026	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003485	TTCAA	2	10	583125	583134	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_003485	TTATA	2	10	595180	595189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003485	ACGTA	2	10	628731	628740	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_003485	TAAAT	2	10	629399	629408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003485	AGGAA	2	10	629601	629610	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003485	TCTTT	2	10	637551	637560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_003485	AAAAG	2	10	646951	646960	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003485	ATAAA	2	10	650787	650796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003485	GAATA	2	10	654142	654151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003485	GCCTA	2	10	662645	662654	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_003485	CGACA	2	10	663082	663091	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_003485	ATAGA	2	10	663588	663597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003485	AGCAC	2	10	670224	670233	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_003485	TATAA	2	10	671305	671314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003485	AGCAT	2	10	679984	679993	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_003485	GAAAG	2	10	683238	683247	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003485	ATTTA	2	10	718005	718014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003485	AAAGA	2	10	721088	721097	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003485	TCTTT	2	10	721142	721151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_003485	AAATA	2	10	721169	721178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003485	TTCGG	2	10	732241	732250	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_003485	AAAAG	2	10	734138	734147	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003485	TGAAA	2	10	734762	734771	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003485	AGATT	2	10	734772	734781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003485	GCCTT	2	10	751995	752004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_003485	ATTAT	2	10	752774	752783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003485	TTTTA	2	10	753199	753208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003485	ATGTT	2	10	758093	758102	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003485	AAAGG	2	10	781877	781886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003485	ATTGA	2	10	781904	781913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003485	ATGTT	2	10	787050	787059	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003485	TCTTA	2	10	788738	788747	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_003485	AGAAT	2	10	797904	797913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003485	CTAAT	2	10	799440	799449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_003485	CATCT	2	10	801808	801817	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_003485	ATAAA	2	10	803828	803837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003485	GGAAA	2	10	819751	819760	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003485	TAAGG	2	10	833041	833050	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003485	CACCT	2	10	835264	835273	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
148	NC_003485	ATATA	2	10	845456	845465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003485	TAGAA	2	10	852913	852922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003485	AACAA	12	60	853839	853898	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_003485	ATAAA	2	10	856773	856782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003485	TACTA	2	10	863098	863107	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_003485	TAAAA	2	10	866627	866636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003485	AATGT	2	10	867296	867305	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_003485	AATAA	2	10	874088	874097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003485	AGTGT	2	10	875363	875372	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003485	CAAAA	2	10	925614	925623	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_003485	TAAGA	2	10	931636	931645	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_003485	AGTTG	2	10	940275	940284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_003485	ATTTT	2	10	958108	958117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_003485	AATTG	2	10	961754	961763	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_003485	CCATT	2	10	966437	966446	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_003485	TTAAA	2	10	971282	971291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_003485	TCATA	2	10	975477	975486	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_003485	CTTTG	2	10	991225	991234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_003485	TAATA	2	10	1043519	1043528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_003485	ATTTC	2	10	1045893	1045902	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_003485	CTAAA	2	10	1084440	1084449	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_003485	GTTGT	2	10	1084704	1084713	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_003485	TATAA	2	10	1105042	1105051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_003485	ATGTT	2	10	1107153	1107162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003485	CCTGC	2	10	1117891	1117900	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
187	NC_003485	AAAAG	2	10	1127015	1127024	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_003485	AGTTA	2	10	1155333	1155342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_003485	ATTCT	2	10	1182460	1182469	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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288	NC_003485	TTTTG	2	10	1751214	1751223	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_003485	TAGGT	2	10	1753457	1753466	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
290	NC_003485	GTTCT	2	10	1754083	1754092	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_003485	CAACC	2	10	1755465	1755474	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
292	NC_003485	CTCAT	2	10	1755483	1755492	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
293	NC_003485	TTTTG	2	10	1758276	1758285	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
294	NC_003485	TTACT	2	10	1758364	1758373	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_003485	AAAAG	2	10	1767593	1767602	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_003485	TATAC	2	10	1777155	1777164	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
297	NC_003485	GGTAA	2	10	1784720	1784729	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
298	NC_003485	AATTA	2	10	1785318	1785327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_003485	TAGAC	2	10	1789180	1789189	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_003485	CATAT	2	10	1816741	1816750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
303	NC_003485	TCCTC	2	10	1833480	1833489	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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311	NC_003485	ACTTG	2	10	1848110	1848119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
312	NC_003485	ATTTC	2	10	1860679	1860688	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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317	NC_003485	TACTT	2	10	1878795	1878804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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320	NC_003485	TATCA	2	10	1883282	1883291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
321	NC_003485	TTATC	2	10	1883487	1883496	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
322	NC_003485	AGAAC	2	10	1890541	1890550	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
323	NC_003485	GTCAA	2	10	1890980	1890989	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
324	NC_003485	TAAAC	2	10	1891263	1891272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
325	NC_003485	AAAAG	2	10	1892820	1892829	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
326	NC_003485	CTTTT	2	10	1892851	1892860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.