MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS8232 chromosome

Total Repeats: 22304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003485	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745202
2	NC_003485	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
3	NC_003485	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
4	NC_003485	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745202
5	NC_003485	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
6	NC_003485	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745202
7	NC_003485	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745202
8	NC_003485	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745202
9	NC_003485	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
10	NC_003485	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745202
11	NC_003485	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745202
12	NC_003485	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
13	NC_003485	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	19745202
14	NC_003485	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
15	NC_003485	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
16	NC_003485	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745202
17	NC_003485	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745202
18	NC_003485	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745202
19	NC_003485	ATT	2	6	1735	1740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
20	NC_003485	TCA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745203
21	NC_003485	TTA	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
22	NC_003485	ATT	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
23	NC_003485	AAC	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745203
24	NC_003485	GTT	2	6	2018	2023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745203
25	NC_003485	AAG	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745203
26	NC_003485	ATT	2	6	2128	2133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
27	NC_003485	TAT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
28	NC_003485	GTC	2	6	2181	2186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745203
29	NC_003485	CAG	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745203
30	NC_003485	CAG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745203
31	NC_003485	GAT	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745203
32	NC_003485	TTA	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
33	NC_003485	GTT	2	6	2498	2503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745203
34	NC_003485	CTT	2	6	2542	2547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745203
35	NC_003485	GAA	2	6	2801	2806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745203
36	NC_003485	CAG	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
37	NC_003485	GCT	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745204
38	NC_003485	TGA	3	9	3767	3775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
39	NC_003485	AGA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
40	NC_003485	GTT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745204
41	NC_003485	AAC	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745204
42	NC_003485	AGT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
43	NC_003485	AGA	3	9	4190	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
44	NC_003485	AGA	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
45	NC_003485	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
46	NC_003485	ATC	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745204
47	NC_003485	CAG	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
48	NC_003485	GCT	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745204
49	NC_003485	TAT	2	6	4388	4393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745204
50	NC_003485	ATG	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
51	NC_003485	AAG	2	6	4480	4485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
52	NC_003485	GAA	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
53	NC_003485	GTT	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745204
54	NC_003485	CAT	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745204
55	NC_003485	TTG	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745205
56	NC_003485	GAT	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745205
57	NC_003485	TTA	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745205
58	NC_003485	CTA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745205
59	NC_003485	AAT	2	6	4833	4838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745205
60	NC_003485	CTA	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745205
61	NC_003485	ATG	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745205
62	NC_003485	CAG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745205
63	NC_003485	GAC	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745205
64	NC_003485	TTA	2	6	5062	5067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745205
65	NC_003485	ATA	2	6	5098	5103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745205
66	NC_003485	ATT	2	6	5218	5223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
67	NC_003485	ACC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19745206
68	NC_003485	GAT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
69	NC_003485	TGA	2	6	5419	5424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
70	NC_003485	TGA	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
71	NC_003485	TTA	2	6	5703	5708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
72	NC_003485	GAT	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
73	NC_003485	AAC	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745206
74	NC_003485	TTA	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
75	NC_003485	ATA	2	6	5955	5960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745206
76	NC_003485	AGA	2	6	5974	5979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
77	NC_003485	ATT	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
78	NC_003485	ATT	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
79	NC_003485	GAT	2	6	6101	6106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
80	NC_003485	AGA	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
81	NC_003485	ACT	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745206
82	NC_003485	AAC	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745206
83	NC_003485	TGA	2	6	6553	6558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
84	NC_003485	ACG	2	6	6607	6612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745206
85	NC_003485	CTG	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745206
86	NC_003485	TAA	2	6	6862	6867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745206
87	NC_003485	ATG	2	6	6873	6878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
88	NC_003485	TGA	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
89	NC_003485	AAG	2	6	6958	6963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
90	NC_003485	GAT	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
91	NC_003485	TGA	3	9	7015	7023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
92	NC_003485	AGA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
93	NC_003485	TAG	2	6	7113	7118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
94	NC_003485	AGT	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
95	NC_003485	CAG	2	6	7223	7228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745206
96	NC_003485	GTA	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
97	NC_003485	ATT	2	6	7352	7357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
98	NC_003485	GAA	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
99	NC_003485	CCG	2	6	7571	7576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	19745206
100	NC_003485	TAT	2	6	7639	7644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
101	NC_003485	GGA	2	6	7661	7666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	19745206
102	NC_003485	ACA	2	6	7683	7688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745206
103	NC_003485	AAG	2	6	7706	7711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
104	NC_003485	ATG	2	6	7821	7826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
105	NC_003485	ACA	2	6	7838	7843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745206
106	NC_003485	ATC	2	6	7844	7849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745206
107	NC_003485	GAA	2	6	7947	7952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
108	NC_003485	GAG	2	6	8094	8099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	19745206
109	NC_003485	GAT	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
110	NC_003485	AAT	2	6	8468	8473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745206
111	NC_003485	CTT	2	6	8499	8504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745206
112	NC_003485	ATT	2	6	8526	8531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
113	NC_003485	CCA	2	6	8611	8616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19745206
114	NC_003485	AGA	2	6	8635	8640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
115	NC_003485	ATA	2	6	8704	8709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745206
116	NC_003485	TTA	2	6	8903	8908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745207
117	NC_003485	CGT	2	6	8911	8916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745207
118	NC_003485	AAG	2	6	8927	8932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745207
119	NC_003485	GAA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745207
120	NC_003485	AAT	2	6	9155	9160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745208
121	NC_003485	GAA	4	12	9197	9208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745208
122	NC_003485	ATG	2	6	9251	9256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745208
123	NC_003485	GGT	2	6	9325	9330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745208
124	NC_003485	GAT	2	6	9404	9409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745208
125	NC_003485	ATG	3	9	9496	9504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745208
126	NC_003485	ATT	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745209
127	NC_003485	CAG	2	6	9845	9850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745209
128	NC_003485	TTA	2	6	9878	9883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745209
129	NC_003485	CTT	3	9	10073	10081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745209
130	NC_003485	TTA	2	6	10137	10142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745209
131	NC_003485	TGA	2	6	10149	10154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745209
132	NC_003485	AAG	2	6	10172	10177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745209
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134	NC_003485	ATT	2	6	10247	10252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745209
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158	NC_003485	ATT	2	6	11720	11725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745210
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161	NC_003485	ATT	3	9	11887	11895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745210
162	NC_003485	ATT	2	6	12253	12258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745211
163	NC_003485	GTA	2	6	12403	12408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745211
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253	NC_003485	TGG	2	6	33128	33133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745215
254	NC_003485	TCC	2	6	33163	33168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	19745215
255	NC_003485	CGT	2	6	33195	33200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745215
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