MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 chromosome

Total Repeats: 1412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003454	TCTATT	2	12	1107	1118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19704829
2	NC_003454	TCTTTT	2	12	6712	6723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704833
3	NC_003454	TTTTGT	2	12	7125	7136	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	19704834
4	NC_003454	CAGAAA	2	12	15540	15551	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	19704843
5	NC_003454	TAAAAG	2	12	16733	16744	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	19704844
6	NC_003454	GAAAAT	2	12	18758	18769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	19704846
7	NC_003454	TGAAGA	2	12	19254	19265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	19704847
8	NC_003454	ATTTCC	2	12	22151	22162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19704849
9	NC_003454	TTAATT	2	12	23203	23214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19704849
10	NC_003454	GCAATA	2	12	27839	27850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19704854
11	NC_003454	TAAAAA	2	12	27945	27956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	19704854
12	NC_003454	TAAAGA	2	12	27994	28005	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	19704854
13	NC_003454	ATAGTT	2	12	28217	28228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19704854
14	NC_003454	TTTTCT	2	12	31930	31941	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704858
15	NC_003454	ATTTAT	2	12	32624	32635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19704858
16	NC_003454	TTGTAG	2	12	32990	33001	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	19704858
17	NC_003454	AGATTT	2	12	33042	33053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19704858
18	NC_003454	TCATAT	2	12	33884	33895	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19704858
19	NC_003454	CATTAC	2	12	34070	34081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19704858
20	NC_003454	TTTTAT	2	12	37832	37843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704858
21	NC_003454	AAATAA	2	12	42621	42632	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	19704859
22	NC_003454	TTTTTC	2	12	42849	42860	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704860
23	NC_003454	TTCTTT	2	12	43308	43319	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704861
24	NC_003454	CATCTT	2	12	45535	45546	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19704865
25	NC_003454	TTTTTA	2	12	46488	46499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704866
26	NC_003454	CTGTTT	2	12	46695	46706	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19704866
27	NC_003454	TATCCA	2	12	47329	47340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19704867
28	NC_003454	CCTTCT	2	12	47665	47676	0 %	50 %	0 %	50 %	19704867
29	NC_003454	TTTGTT	2	12	48029	48040	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	19704867
30	NC_003454	TCATAA	2	12	49480	49491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19704868
31	NC_003454	ATTCCA	2	12	52103	52114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19704870
32	NC_003454	ATTGTA	2	12	53129	53140	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19704871
33	NC_003454	AGCTGA	2	12	64664	64675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19704881
34	NC_003454	AGCTGA	2	12	64736	64747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19704881
35	NC_003454	ATTCCT	2	12	65287	65298	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19704882
36	NC_003454	CTTTTT	2	12	65636	65647	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704882
37	NC_003454	TCTTTT	2	12	67760	67771	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704885
38	NC_003454	AAATAG	2	12	68022	68033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	19704885
39	NC_003454	CTTTTT	2	12	68145	68156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704885
40	NC_003454	TACTTT	2	12	69631	69642	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19704886
41	NC_003454	TCCTGT	2	12	71707	71718	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	19704886
42	NC_003454	AATTTA	2	12	71829	71840	50 %	50 %	0 %	0 %	19704886
43	NC_003454	TGTTTT	2	12	73126	73137	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	19704886
44	NC_003454	AGTTGT	2	12	77440	77451	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	19704887
45	NC_003454	CAAATT	2	12	78121	78132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19704888
46	NC_003454	CAACTG	2	12	78454	78465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	19704888
47	NC_003454	TTCAAC	2	12	79418	79429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19704888
48	NC_003454	TGAACT	2	12	83025	83036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19704892
49	NC_003454	ATTTTT	2	12	86299	86310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704896
50	NC_003454	ATTTAT	2	12	89504	89515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19704900
51	NC_003454	AAATTT	2	12	90804	90815	50 %	50 %	0 %	0 %	19704901
52	NC_003454	ATTCCA	2	12	96331	96342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19704906
53	NC_003454	TGCAGA	2	12	96429	96440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	19704906
54	NC_003454	ACTTTT	2	12	98109	98120	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19704907
55	NC_003454	TCTTCA	2	12	101888	101899	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19704911
56	NC_003454	TTGCAT	2	12	102646	102657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19704912
57	NC_003454	ACTTCA	2	12	103128	103139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19704912
58	NC_003454	CAAATG	2	12	105485	105496	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	19704916
59	NC_003454	TCTGCA	2	12	107057	107068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19704917
60	NC_003454	TTATTT	2	12	110862	110873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704922
61	NC_003454	AACTTA	2	12	111764	111775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19704924
62	NC_003454	ATCTAA	2	12	111970	111981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19704924
63	NC_003454	TATACA	2	12	115996	116007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19704927
64	NC_003454	ACATCA	2	12	117742	117753	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	19704928
65	NC_003454	ATCTTC	2	12	118656	118667	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19704929
66	NC_003454	ATGAGT	2	12	119176	119187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19704930
67	NC_003454	TTTCTT	2	12	119907	119918	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704931
68	NC_003454	TTTATT	2	12	122493	122504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704933
69	NC_003454	ATTTTT	2	12	123151	123162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704934
70	NC_003454	TATTTT	2	12	125494	125505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704936
71	NC_003454	TGTTTC	2	12	126819	126830	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19704939
72	NC_003454	CAACTT	2	12	127566	127577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19704940
73	NC_003454	TCCTAG	2	12	133500	133511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19704948
74	NC_003454	TCTCCA	2	12	133525	133536	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	19704948
75	NC_003454	CCTTTA	2	12	134117	134128	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19704950
76	NC_003454	TTTTCT	2	12	137176	137187	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704959
77	NC_003454	CCTTTA	2	12	137329	137340	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19704959
78	NC_003454	ATTTTT	2	12	139771	139782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704963
79	NC_003454	TTGTTT	2	12	140281	140292	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	19704965
80	NC_003454	ACTGTT	2	12	140880	140891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19704966
81	NC_003454	TTCCTT	2	12	141043	141054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19704966
82	NC_003454	ATTTGA	2	12	142875	142886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19704969
83	NC_003454	ACTGCT	2	12	142941	142952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	19704969
84	NC_003454	TATATT	2	12	144125	144136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19704970
85	NC_003454	ATAAAA	2	12	145888	145899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	19704972
86	NC_003454	CTATTC	2	12	149297	149308	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19704975
87	NC_003454	AATTTT	2	12	153950	153961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19704979
88	NC_003454	AACTTA	2	12	155695	155706	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19704980
89	NC_003454	CTATAT	2	12	156882	156893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19704981
90	NC_003454	CTTTTT	2	12	157233	157244	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704981
91	NC_003454	GCTTTT	2	12	158630	158641	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19704982
92	NC_003454	AAGTCT	2	12	158650	158661	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19704982
93	NC_003454	AAAATC	2	12	161672	161683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	19704984
94	NC_003454	TATATT	2	12	163675	163686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19704988
95	NC_003454	TTCTTT	2	12	164808	164819	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19704989
96	NC_003454	TCAAAT	2	12	165010	165021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19704989
97	NC_003454	TAACAA	2	12	165872	165883	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	19704990
98	NC_003454	TCAATT	2	12	168067	168078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19704991
99	NC_003454	TTTTTA	2	12	168628	168639	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	19704992
100	NC_003454	ATTAAT	2	12	168717	168728	50 %	50 %	0 %	0 %	19704992
101	NC_003454	ATATTT	2	12	172458	172469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19704996
102	NC_003454	CAAAAC	2	12	174916	174927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19705000
103	NC_003454	CTTTTT	2	12	175702	175713	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19705000
104	NC_003454	ATATAA	2	12	177715	177726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19705003
105	NC_003454	TATCAT	2	12	179499	179510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19705005
106	NC_003454	AATTAA	2	12	180477	180488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19705006
107	NC_003454	TAAATT	2	12	180867	180878	50 %	50 %	0 %	0 %	19705006
108	NC_003454	TCATAA	2	12	184847	184858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19705010
109	NC_003454	TTTTAA	2	12	186162	186173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545721675
110	NC_003454	CTTTTT	2	12	188184	188195	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19705013
111	NC_003454	AACTTT	2	12	191080	191091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19705017
112	NC_003454	TATTTG	2	12	192676	192687	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	19705017
113	NC_003454	TCTTTT	2	12	194124	194135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19705019
114	NC_003454	TTTTGC	2	12	194267	194278	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19705019
115	NC_003454	TCTGTT	2	12	198829	198840	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	19705024
116	NC_003454	TTATCT	2	12	198919	198930	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19705024
117	NC_003454	TTGAAA	2	12	199363	199374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	19705025
118	NC_003454	ATGTTA	2	12	199639	199650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19705025
119	NC_003454	AAAATC	2	12	201080	201091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	19705025
120	NC_003454	TGAATT	2	12	201251	201262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19705025
121	NC_003454	TTTTAA	2	12	202300	202311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19705027
122	NC_003454	TAAAAA	2	12	202443	202454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	19705028
123	NC_003454	TTGAAA	2	12	207791	207802	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	19705034
124	NC_003454	ATGTTG	2	12	212174	212185	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	19705036
125	NC_003454	TTAGAT	2	12	213105	213116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	19705037
126	NC_003454	CTATTT	2	12	214018	214029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19705038
127	NC_003454	AGAAAG	2	12	214174	214185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19705038
128	NC_003454	AGAGAT	2	12	216414	216425	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	19705039
129	NC_003454	TCTTTA	2	12	219210	219221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19705041
130	NC_003454	CATCTT	2	12	222024	222035	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19705044
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132	NC_003454	TCCAAA	2	12	225574	225585	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	19705047
133	NC_003454	CTTTTT	2	12	228786	228797	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19705050
134	NC_003454	TTTTCT	2	12	230709	230720	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	19705052
135	NC_003454	ATTTTA	2	12	231807	231818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19705053
136	NC_003454	TACATC	2	12	231851	231862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19705053
137	NC_003454	TTTCAT	2	12	232382	232393	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19705054
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141	NC_003454	TTTACT	2	12	237913	237924	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19705060
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143	NC_003454	TAATCG	2	12	244714	244725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19705067
144	NC_003454	AGAAAT	2	12	249655	249666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	19705074
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147	NC_003454	CATTAA	2	12	256205	256216	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	19705082
148	NC_003454	GCAACA	2	12	256928	256939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	19705083
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150	NC_003454	TCTACT	2	12	258017	258028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19705083
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152	NC_003454	TAATTC	2	12	264392	264403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19705087
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234	NC_003454	ATACCT	2	12	363778	363789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19705179
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236	NC_003454	TCATTA	2	12	364871	364882	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	19705181
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238	NC_003454	AAATTA	2	12	368233	368244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19705185
239	NC_003454	TTTTAC	2	12	370421	370432	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19705189
240	NC_003454	GAAAAA	2	12	372201	372212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	19705192
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353	NC_003454	AGTAAT	2	12	569812	569823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	19705348
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