MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 chromosome

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003454	AGAAA	2	10	2599	2608	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003454	ATATT	2	10	10308	10317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003454	CAGGG	2	10	10355	10364	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_003454	TAATA	2	10	14342	14351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003454	TATTT	2	10	26249	26258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003454	TTAAG	2	10	26309	26318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003454	TATAT	2	10	26344	26353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003454	AATAT	2	10	26489	26498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003454	GTACT	2	10	41567	41576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003454	ATATT	2	10	43652	43661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003454	TTAAA	2	10	43742	43751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003454	ACTTA	2	10	74806	74815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003454	ATCTA	2	10	75208	75217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_003454	TCTTG	2	10	75311	75320	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003454	CCATT	2	10	75521	75530	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_003454	AAAAT	2	10	76249	76258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003454	AAACT	2	10	99642	99651	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_003454	TATTT	2	10	99820	99829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003454	CAATT	2	10	101937	101946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003454	TACTT	2	10	108991	109000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_003454	TTTAT	2	10	114066	114075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003454	TACAT	2	10	119732	119741	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_003454	TTAAA	2	10	126024	126033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003454	TTATT	2	10	127840	127849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003454	AAATA	2	10	129756	129765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003454	ATATT	2	10	171420	171429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003454	TTTAA	2	10	171456	171465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003454	TTTAT	2	10	172660	172669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003454	TAAAA	2	10	175876	175885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003454	ATATC	2	10	176852	176861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_003454	TCTTT	2	10	182344	182353	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_003454	AATTA	2	10	182551	182560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003454	TATAT	2	10	199160	199169	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003454	CAAAA	2	10	209551	209560	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003454	ACAAA	2	10	209578	209587	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_003454	GATTT	2	10	210959	210968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003454	TAAAA	2	10	220083	220092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003454	TTGTT	2	10	234563	234572	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003454	TCATT	2	10	235315	235324	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_003454	TTTCT	2	10	235764	235773	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_003454	ATTAT	2	10	240941	240950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003454	ATTTT	2	10	244409	244418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003454	ATATA	2	10	247325	247334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003454	TGAAA	2	10	248224	248233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003454	ATTTT	2	10	255003	255012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003454	TTTAT	2	10	264608	264617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003454	ATAAA	2	10	264743	264752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003454	CAAAA	2	10	265714	265723	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_003454	GGGAG	2	10	267888	267897	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003454	TTTTA	2	10	272965	272974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003454	AAATT	2	10	278027	278036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003454	TTTTC	2	10	278132	278141	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_003454	TTTTA	2	10	282640	282649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003454	AAATT	2	10	288765	288774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003454	ATTAA	2	10	290059	290068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003454	AATTA	2	10	295370	295379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003454	CTTTG	3	15	295470	295484	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_003454	TATAT	2	10	296150	296159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003454	ATTTT	2	10	307385	307394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003454	AAATA	2	10	307412	307421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003454	TAAAT	2	10	307430	307439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003454	TAATA	2	10	314076	314085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003454	TGAAA	2	10	314618	314627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003454	ATTTA	2	10	333574	333583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003454	AATTA	2	10	342222	342231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003454	TTAAT	2	10	346920	346929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003454	TTAAA	2	10	348376	348385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003454	TTTTA	2	10	348401	348410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003454	AGCTA	2	10	348627	348636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_003454	TTTTG	2	10	349788	349797	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003454	TATTT	2	10	349943	349952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003454	CCATA	2	10	358592	358601	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_003454	TAATA	2	10	362346	362355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003454	TTAAT	2	10	367232	367241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003454	TTTAT	2	10	368785	368794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003454	AATTT	2	10	372711	372720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003454	TTATC	2	10	380177	380186	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_003454	CTTTT	2	10	381246	381255	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_003454	ATAAA	2	10	386753	386762	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003454	TAAAA	2	10	415140	415149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003454	ATTTT	2	10	415170	415179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003454	TTTAT	2	10	421733	421742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003454	TCTAT	2	10	423095	423104	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_003454	TACCT	2	10	437159	437168	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_003454	AAAAT	2	10	439588	439597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003454	TATCT	2	10	441058	441067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_003454	TTTAT	2	10	441164	441173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003454	AATTT	2	10	444017	444026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003454	AATAG	2	10	451445	451454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003454	CACGA	2	10	451939	451948	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_003454	TCCTT	2	10	453083	453092	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_003454	ATTTT	2	10	453170	453179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003454	ATAAA	2	10	458430	458439	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003454	AAACT	2	10	459161	459170	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_003454	ATATT	2	10	460165	460174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003454	TATCA	2	10	464064	464073	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_003454	TATTT	2	10	465202	465211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003454	TAAAA	2	10	471489	471498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003454	TGTTT	2	10	471522	471531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003454	TTTTA	2	10	475640	475649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003454	AATTA	2	10	475663	475672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003454	CTTAG	2	10	481842	481851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_003454	ACTTT	2	10	483632	483641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_003454	TGATA	2	10	488854	488863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003454	ATTTT	2	10	488916	488925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003454	TTAAT	2	10	490998	491007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003454	ATTAT	2	10	492522	492531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003454	CTATT	2	10	494575	494584	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_003454	AAAAT	2	10	494703	494712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003454	GGATT	2	10	500725	500734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003454	AAACT	2	10	500829	500838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_003454	AATAG	2	10	530338	530347	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003454	CACGA	2	10	530832	530841	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_003454	TTTGG	2	10	547913	547922	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003454	TCTTT	2	10	558319	558328	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_003454	CCATT	2	10	558497	558506	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_003454	ATTTA	2	10	562656	562665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003454	TTTTC	2	10	564072	564081	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_003454	TCTAT	2	10	564477	564486	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_003454	AGAAA	2	10	565366	565375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003454	TATAT	2	10	565728	565737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003454	CCATT	2	10	572573	572582	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_003454	AATAA	2	10	575230	575239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003454	ATATA	2	10	575867	575876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003454	TTAAA	2	10	576919	576928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003454	AATTA	2	10	580491	580500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003454	ATATA	2	10	580573	580582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003454	TCTTT	2	10	586390	586399	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_003454	ATTAT	2	10	586441	586450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003454	CAATT	2	10	587918	587927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_003454	AGAAA	2	10	593282	593291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003454	TATAA	2	10	595081	595090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003454	AATTA	2	10	613266	613275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003454	TTTAA	2	10	618186	618195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003454	TTGTC	2	10	648075	648084	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_003454	ATTTT	2	10	652222	652231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003454	AAAGA	2	10	652625	652634	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003454	TATAA	2	10	653730	653739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003454	GAAAG	2	10	659736	659745	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003454	TAAAA	2	10	662938	662947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003454	TAATA	2	10	665038	665047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003454	TAATT	2	10	667129	667138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003454	ATTAT	2	10	667218	667227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003454	TTTTC	2	10	678658	678667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_003454	ATAAA	2	10	682287	682296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003454	ATACT	2	10	686229	686238	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_003454	TATAT	2	10	690955	690964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003454	TAATG	2	10	695711	695720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_003454	GAATA	2	10	698709	698718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_003454	AAATT	2	10	848459	848468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_003454	ATATA	2	10	1378570	1378579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.