MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM2

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003385	TA	3	6	353	358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003385	TA	3	6	2739	2744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003385	TC	3	6	6837	6842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_003385	AG	3	6	11755	11760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003385	TA	3	6	13058	13063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003385	AT	3	6	13065	13070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003385	TG	3	6	15315	15320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003385	TA	3	6	17536	17541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003385	GT	3	6	23602	23607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003385	AC	3	6	27469	27474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003385	TA	4	8	32097	32104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003385	CA	3	6	40270	40275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003385	AG	3	6	52513	52518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003385	TA	3	6	53355	53360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003385	TA	3	6	62429	62434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003385	TA	4	8	62456	62463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003385	AT	3	6	69242	69247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003385	TG	3	6	70583	70588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003385	CT	3	6	70992	70997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003385	TC	3	6	74770	74775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003385	GT	3	6	74842	74847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003385	TC	3	6	74851	74856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003385	CT	3	6	75084	75089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_003385	AG	3	6	85073	85078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003385	TG	3	6	85255	85260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003385	AC	3	6	85276	85281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_003385	CG	3	6	86264	86269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_003385	TC	3	6	86643	86648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_003385	TA	4	8	87194	87201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003385	AT	3	6	87224	87229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003385	CT	3	6	87956	87961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_003385	GT	3	6	92768	92773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003385	AT	3	6	102147	102152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003385	TG	3	6	102409	102414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003385	AG	3	6	104134	104139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003385	AG	3	6	104243	104248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003385	CT	3	6	104279	104284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003385	CA	3	6	104422	104427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003385	AG	3	6	104605	104610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003385	AG	3	6	104647	104652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003385	AG	3	6	105826	105831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003385	CT	3	6	106028	106033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003385	AG	3	6	106116	106121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003385	CT	3	6	106192	106197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.