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Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM1

Total Repeats: 2202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003384	TTC	2	6	769	774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466426
2	NC_003384	CAG	2	6	814	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466426
3	NC_003384	ACG	2	6	862	867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466426
4	NC_003384	TGA	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466426
5	NC_003384	TGG	2	6	951	956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466426
6	NC_003384	CAT	2	6	1048	1053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466426
7	NC_003384	GCG	2	6	1391	1396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466427
8	NC_003384	TGC	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466428
9	NC_003384	CAC	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466428
10	NC_003384	CAG	2	6	2110	2115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466428
11	NC_003384	CAA	2	6	2166	2171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466428
12	NC_003384	CGG	2	6	2465	2470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466429
13	NC_003384	CAC	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466429
14	NC_003384	AGG	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466429
15	NC_003384	TTC	2	6	2704	2709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466430
16	NC_003384	CGG	2	6	2838	2843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466430
17	NC_003384	ACC	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466430
18	NC_003384	TGA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466430
19	NC_003384	GCC	2	6	2914	2919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466430
20	NC_003384	GCA	2	6	2963	2968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466430
21	NC_003384	TCG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466430
22	NC_003384	CAG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466430
23	NC_003384	GAC	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466430
24	NC_003384	AGA	3	9	3407	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466430
25	NC_003384	CGT	3	9	3434	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466430
26	NC_003384	TCG	3	9	3532	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466430
27	NC_003384	TGA	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466431
28	NC_003384	CTG	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466431
29	NC_003384	CGG	2	6	4283	4288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466431
30	NC_003384	ATC	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466432
31	NC_003384	CCG	2	6	4491	4496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466432
32	NC_003384	CAT	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466432
33	NC_003384	ATT	2	6	4568	4573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466432
34	NC_003384	TAA	2	6	4605	4610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466433
35	NC_003384	TTC	2	6	4616	4621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466433
36	NC_003384	TTG	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32765045
37	NC_003384	ACG	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765045
38	NC_003384	CCG	2	6	4970	4975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32765045
39	NC_003384	CGA	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765045
40	NC_003384	GAG	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32765045
41	NC_003384	TCA	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32765045
42	NC_003384	CGA	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765045
43	NC_003384	CGG	2	6	5318	5323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32765045
44	NC_003384	ACA	3	9	5599	5607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466435
45	NC_003384	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466435
46	NC_003384	ATC	2	6	5941	5946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466436
47	NC_003384	GCC	2	6	5947	5952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466436
48	NC_003384	CCT	2	6	5958	5963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18466436
49	NC_003384	TCA	3	9	5981	5989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466436
50	NC_003384	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466436
51	NC_003384	GAG	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466436
52	NC_003384	CCG	2	6	6206	6211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466436
53	NC_003384	CCG	2	6	6261	6266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466436
54	NC_003384	TTC	2	6	6274	6279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466436
55	NC_003384	GAG	2	6	6280	6285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466436
56	NC_003384	CAG	2	6	6388	6393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466437
57	NC_003384	GAC	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466437
58	NC_003384	GGT	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466437
59	NC_003384	TTA	2	6	6624	6629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466437
60	NC_003384	GCT	2	6	6850	6855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466438
61	NC_003384	AGC	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466438
62	NC_003384	TCA	2	6	7400	7405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466439
63	NC_003384	GGC	2	6	7443	7448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466439
64	NC_003384	TTC	2	6	7481	7486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466439
65	NC_003384	GAA	2	6	7494	7499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466439
66	NC_003384	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466439
67	NC_003384	TGG	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466439
68	NC_003384	AAT	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466440
69	NC_003384	TAT	2	6	7862	7867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466440
70	NC_003384	GAA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466440
71	NC_003384	ATC	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466440
72	NC_003384	CAC	2	6	8003	8008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466441
73	NC_003384	CCA	2	6	8039	8044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466441
74	NC_003384	ACT	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466441
75	NC_003384	CAT	2	6	8213	8218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466441
76	NC_003384	TAA	2	6	8372	8377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466442
77	NC_003384	CAG	2	6	8544	8549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466442
78	NC_003384	CAG	2	6	8649	8654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466442
79	NC_003384	CCA	2	6	8825	8830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466442
80	NC_003384	TTG	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466442
81	NC_003384	CAA	2	6	8861	8866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466442
82	NC_003384	ATT	2	6	9002	9007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466443
83	NC_003384	AGA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466443
84	NC_003384	GGC	2	6	9125	9130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466443
85	NC_003384	CAT	2	6	9446	9451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466443
86	NC_003384	GAG	2	6	9468	9473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466443
87	NC_003384	TCG	2	6	9778	9783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466444
88	NC_003384	AGG	2	6	9811	9816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466444
89	NC_003384	GAC	2	6	9899	9904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466445
90	NC_003384	ACA	2	6	9995	10000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466445
91	NC_003384	TCA	2	6	10173	10178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466445
92	NC_003384	GCT	2	6	10239	10244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466445
93	NC_003384	TGT	2	6	10264	10269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466445
94	NC_003384	CCA	2	6	10400	10405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466445
95	NC_003384	CCG	2	6	10487	10492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466445
96	NC_003384	TCA	2	6	10533	10538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466445
97	NC_003384	CCG	2	6	10757	10762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466446
98	NC_003384	GCA	3	9	10862	10870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466446
99	NC_003384	GGT	2	6	10906	10911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466446
100	NC_003384	TTC	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466447
101	NC_003384	CAA	2	6	11291	11296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466447
102	NC_003384	CAA	2	6	11372	11377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466447
103	NC_003384	AAG	2	6	11382	11387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466447
104	NC_003384	TTA	2	6	11407	11412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466447
105	NC_003384	CAG	2	6	11669	11674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765046
106	NC_003384	AAC	2	6	11703	11708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32765046
107	NC_003384	GCC	2	6	11709	11714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32765046
108	NC_003384	TTC	2	6	11888	11893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32765046
109	NC_003384	TGT	2	6	11988	11993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32765046
110	NC_003384	CGT	2	6	12008	12013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32765046
111	NC_003384	TGT	2	6	12037	12042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32765046
112	NC_003384	CGG	2	6	12159	12164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32765046
113	NC_003384	GCG	2	6	12184	12189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32765046
114	NC_003384	GCC	3	9	12303	12311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32765046
115	NC_003384	CTT	2	6	12412	12417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32765046
116	NC_003384	TCA	2	6	12451	12456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32765046
117	NC_003384	TCC	2	6	12477	12482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32765046
118	NC_003384	GTG	2	6	12571	12576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32765046
119	NC_003384	TCG	2	6	12618	12623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32765046
120	NC_003384	AGA	2	6	12624	12629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32765046
121	NC_003384	GCA	2	6	12724	12729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765046
122	NC_003384	CCT	2	6	12736	12741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32765046
123	NC_003384	GCG	2	6	12770	12775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32765046
124	NC_003384	GAC	2	6	12891	12896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765046
125	NC_003384	GCA	2	6	13085	13090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765046
126	NC_003384	CGC	2	6	13303	13308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32765046
127	NC_003384	TGT	2	6	13357	13362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32765046
128	NC_003384	TCA	2	6	13380	13385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32765046
129	NC_003384	TTG	2	6	13413	13418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32765046
130	NC_003384	AGA	2	6	13505	13510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32765046
131	NC_003384	TGA	2	6	13653	13658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32765046
132	NC_003384	GTG	2	6	13703	13708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32765046
133	NC_003384	CGC	2	6	13789	13794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32765046
134	NC_003384	CGT	2	6	13853	13858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32765046
135	NC_003384	GCC	2	6	13974	13979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32765046
136	NC_003384	CTG	2	6	14224	14229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466449
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139	NC_003384	GTT	2	6	14360	14365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466449
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143	NC_003384	CGG	2	6	14508	14513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466449
144	NC_003384	GCC	2	6	14540	14545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466449
145	NC_003384	AGA	2	6	14586	14591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466449
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149	NC_003384	CAT	2	6	15005	15010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466450
150	NC_003384	TCA	2	6	15020	15025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466450
151	NC_003384	CTT	2	6	15044	15049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466450
152	NC_003384	GTG	2	6	15054	15059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466450
153	NC_003384	CAC	2	6	15072	15077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466450
154	NC_003384	CCG	2	6	15088	15093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466450
155	NC_003384	ACA	2	6	15167	15172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466450
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161	NC_003384	TCG	2	6	15846	15851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466451
162	NC_003384	TCA	3	9	15918	15926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466451
163	NC_003384	CAT	2	6	15929	15934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466451
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166	NC_003384	CCG	2	6	17056	17061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466453
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171	NC_003384	TCA	2	6	17206	17211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466453
172	NC_003384	CAT	2	6	17257	17262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466453
173	NC_003384	TGA	2	6	17443	17448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466453
174	NC_003384	TCG	2	6	17571	17576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466453
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499	NC_003384	GTC	2	6	50564	50569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466490
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