MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM1

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003384	A	7	7	617	623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003384	A	7	7	629	635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003384	A	6	6	1691	1696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003384	T	6	6	2284	2289	0 %	100 %	0 %	0 %	18466428
5	NC_003384	A	6	6	2635	2640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003384	A	7	7	2666	2672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003384	A	7	7	3987	3993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003384	A	6	6	4847	4852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003384	T	7	7	4901	4907	0 %	100 %	0 %	0 %	32765045
10	NC_003384	T	8	8	5146	5153	0 %	100 %	0 %	0 %	32765045
11	NC_003384	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	32765045
12	NC_003384	A	7	7	5380	5386	100 %	0 %	0 %	0 %	32765045
13	NC_003384	C	6	6	6152	6157	0 %	0 %	0 %	100 %	18466436
14	NC_003384	T	6	6	6287	6292	0 %	100 %	0 %	0 %	18466436
15	NC_003384	A	6	6	6706	6711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003384	A	6	6	6796	6801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003384	A	6	6	6944	6949	100 %	0 %	0 %	0 %	18466438
18	NC_003384	A	6	6	6979	6984	100 %	0 %	0 %	0 %	18466438
19	NC_003384	A	6	6	7305	7310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003384	C	6	6	8408	8413	0 %	0 %	0 %	100 %	18466442
21	NC_003384	T	6	6	9424	9429	0 %	100 %	0 %	0 %	18466443
22	NC_003384	T	6	6	9554	9559	0 %	100 %	0 %	0 %	18466444
23	NC_003384	C	6	6	10669	10674	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_003384	T	6	6	10911	10916	0 %	100 %	0 %	0 %	18466446
25	NC_003384	A	9	9	11295	11303	100 %	0 %	0 %	0 %	18466447
26	NC_003384	A	7	7	11499	11505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003384	T	6	6	11629	11634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003384	C	7	7	12020	12026	0 %	0 %	0 %	100 %	32765046
29	NC_003384	C	7	7	12637	12643	0 %	0 %	0 %	100 %	32765046
30	NC_003384	T	6	6	14919	14924	0 %	100 %	0 %	0 %	18466450
31	NC_003384	A	6	6	15697	15702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003384	A	6	6	16052	16057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003384	T	8	8	16477	16484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003384	A	7	7	16630	16636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003384	T	6	6	18076	18081	0 %	100 %	0 %	0 %	18466453
36	NC_003384	A	6	6	18423	18428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003384	A	6	6	18530	18535	100 %	0 %	0 %	0 %	18466455
38	NC_003384	T	6	6	18985	18990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003384	A	6	6	19078	19083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003384	G	6	6	19305	19310	0 %	0 %	100 %	0 %	18466456
41	NC_003384	T	7	7	19684	19690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003384	A	7	7	19691	19697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003384	A	6	6	20622	20627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003384	C	8	8	23460	23467	0 %	0 %	0 %	100 %	18466463
45	NC_003384	T	6	6	24062	24067	0 %	100 %	0 %	0 %	18466464
46	NC_003384	G	6	6	25123	25128	0 %	0 %	100 %	0 %	18466464
47	NC_003384	C	7	7	26407	26413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_003384	A	7	7	26771	26777	100 %	0 %	0 %	0 %	18466465
49	NC_003384	A	6	6	27106	27111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003384	G	7	7	28626	28632	0 %	0 %	100 %	0 %	18466469
51	NC_003384	T	6	6	29532	29537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003384	A	6	6	30555	30560	100 %	0 %	0 %	0 %	18466471
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55	NC_003384	A	7	7	36029	36035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003384	G	6	6	36057	36062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003384	T	6	6	36647	36652	0 %	100 %	0 %	0 %	18466475
58	NC_003384	T	6	6	37310	37315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003384	A	9	9	37350	37358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003384	A	6	6	37442	37447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003384	T	6	6	37495	37500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003384	A	8	8	37511	37518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003384	A	6	6	37521	37526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003384	T	6	6	37563	37568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73	NC_003384	T	7	7	41064	41070	0 %	100 %	0 %	0 %	18466480
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.