MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM1

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003384	T	6	6	2284	2289	0 %	100 %	0 %	0 %	18466428
2	NC_003384	T	7	7	4901	4907	0 %	100 %	0 %	0 %	32765045
3	NC_003384	T	8	8	5146	5153	0 %	100 %	0 %	0 %	32765045
4	NC_003384	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	32765045
5	NC_003384	A	7	7	5380	5386	100 %	0 %	0 %	0 %	32765045
6	NC_003384	C	6	6	6152	6157	0 %	0 %	0 %	100 %	18466436
7	NC_003384	T	6	6	6287	6292	0 %	100 %	0 %	0 %	18466436
8	NC_003384	A	6	6	6944	6949	100 %	0 %	0 %	0 %	18466438
9	NC_003384	A	6	6	6979	6984	100 %	0 %	0 %	0 %	18466438
10	NC_003384	C	6	6	8408	8413	0 %	0 %	0 %	100 %	18466442
11	NC_003384	T	6	6	9424	9429	0 %	100 %	0 %	0 %	18466443
12	NC_003384	T	6	6	9554	9559	0 %	100 %	0 %	0 %	18466444
13	NC_003384	T	6	6	10911	10916	0 %	100 %	0 %	0 %	18466446
14	NC_003384	A	9	9	11295	11303	100 %	0 %	0 %	0 %	18466447
15	NC_003384	C	7	7	12020	12026	0 %	0 %	0 %	100 %	32765046
16	NC_003384	C	7	7	12637	12643	0 %	0 %	0 %	100 %	32765046
17	NC_003384	T	6	6	14919	14924	0 %	100 %	0 %	0 %	18466450
18	NC_003384	T	6	6	18076	18081	0 %	100 %	0 %	0 %	18466453
19	NC_003384	A	6	6	18530	18535	100 %	0 %	0 %	0 %	18466455
20	NC_003384	G	6	6	19305	19310	0 %	0 %	100 %	0 %	18466456
21	NC_003384	C	8	8	23460	23467	0 %	0 %	0 %	100 %	18466463
22	NC_003384	T	6	6	24062	24067	0 %	100 %	0 %	0 %	18466464
23	NC_003384	G	6	6	25123	25128	0 %	0 %	100 %	0 %	18466464
24	NC_003384	A	7	7	26771	26777	100 %	0 %	0 %	0 %	18466465
25	NC_003384	G	7	7	28626	28632	0 %	0 %	100 %	0 %	18466469
26	NC_003384	A	6	6	30555	30560	100 %	0 %	0 %	0 %	18466471
27	NC_003384	T	6	6	32240	32245	0 %	100 %	0 %	0 %	18466472
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33	NC_003384	A	8	8	40281	40288	100 %	0 %	0 %	0 %	18466478
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41	NC_003384	A	6	6	45886	45891	100 %	0 %	0 %	0 %	18466485
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.