MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003383	TTTCTT	2	12	6981	6992	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003383	GAAAAA	2	12	9817	9828	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18450298
3	NC_003383	CTGAGA	2	12	16483	16494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	18450304
4	NC_003383	CGTCAA	2	12	20582	20593	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	18450305
5	NC_003383	ATTGAA	2	12	21279	21290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18450306
6	NC_003383	TCAAAC	2	12	21549	21560	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	18450306
7	NC_003383	TGAAAA	2	12	24179	24190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18450310
8	NC_003383	GATTTT	2	12	25098	25109	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	18450310
9	NC_003383	TTTTTC	2	12	27211	27222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	18450311
10	NC_003383	TTTCAT	2	12	27960	27971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	18450312
11	NC_003383	GAAAAA	2	12	29550	29561	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18450315
12	NC_003383	TGGTCA	2	12	33092	33103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	18450319
13	NC_003383	TTTTTC	2	12	33759	33770	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	18450320
14	NC_003383	CTAAAG	2	12	37481	37492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_003383	TTTTTC	2	12	38924	38935	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	18450325
16	NC_003383	TGTCGT	2	12	45490	45501	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	18450330
17	NC_003383	TTTCGG	2	12	48765	48776	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	18450332
18	NC_003383	GAAAAA	2	12	49532	49543	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18450332
19	NC_003383	AAAGCA	2	12	49699	49710	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	18450332
20	NC_003383	ACAAAT	2	12	51631	51642	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	18450334
21	NC_003383	TCAGGT	2	12	55915	55926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	18450337
22	NC_003383	CCTCTA	2	12	59098	59109	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	18450340
23	NC_003383	TTAGAG	2	12	59267	59278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450340
24	NC_003383	GAAAAT	2	12	60067	60078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18450341
25	NC_003383	AAAAGA	2	12	60313	60324	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18450341
26	NC_003383	TGAATC	2	12	66631	66642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	18450347
27	NC_003383	ATCGAG	2	12	67073	67084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	18450348
28	NC_003383	CTATAT	2	12	68841	68852	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003383	CTATAT	2	12	68927	68938	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_003383	CTATAT	2	12	69005	69016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_003383	ATCGAT	2	12	71238	71249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	18450352
32	NC_003383	CTAGTA	2	12	77723	77734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.