MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003383	CTTT	2	8	630	637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003383	TAAA	2	8	4957	4964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003383	GGTT	2	8	6898	6905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003383	TTTA	2	8	10341	10348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003383	TTTC	2	8	12686	12693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003383	TTGA	2	8	12869	12876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003383	TTTA	2	8	13086	13093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003383	TGTT	2	8	13279	13286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003383	TGAA	2	8	13828	13835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003383	TTGA	2	8	14221	14228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003383	TTTA	2	8	14438	14445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003383	AAAT	2	8	14666	14673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003383	TAAA	2	8	15255	15262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003383	TAAA	2	8	22879	22886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003383	TGAA	2	8	22935	22942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003383	TTTA	2	8	30074	30081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003383	CAAT	2	8	30099	30106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003383	ATAG	2	8	31160	31167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003383	TATG	2	8	31200	31207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003383	GATA	2	8	33386	33393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003383	TCTA	2	8	33402	33409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003383	AAAT	2	8	37406	37413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003383	TAAG	2	8	37562	37569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003383	TAAA	2	8	39264	39271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003383	ATTT	2	8	43475	43482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003383	GTAA	2	8	43534	43541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003383	ACTT	2	8	43578	43585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003383	GAAA	2	8	45787	45794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003383	TCAG	2	8	47437	47444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003383	ATTA	2	8	47571	47578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003383	ATCC	2	8	51267	51274	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_003383	TGTA	2	8	56143	56150	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003383	TAAA	2	8	56155	56162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003383	ATTT	2	8	56429	56436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003383	AGTA	2	8	56548	56555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003383	ATCA	2	8	56667	56674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003383	GATT	2	8	56692	56699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003383	GTTT	2	8	56774	56781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003383	ATTT	2	8	57471	57478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003383	AAAC	2	8	60005	60012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_003383	GATG	2	8	60886	60893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003383	CAAA	2	8	60911	60918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_003383	AATA	2	8	63962	63969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003383	TTTA	2	8	63986	63993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003383	AAAC	2	8	64004	64011	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003383	TAAA	2	8	64049	64056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003383	TCAC	2	8	64510	64517	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_003383	TTTA	2	8	64569	64576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003383	TAAA	2	8	66909	66916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003383	TTTG	2	8	67005	67012	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003383	ATTT	2	8	68690	68697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003383	ATGT	2	8	68753	68760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003383	TTGA	2	8	68965	68972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003383	TAAA	2	8	70367	70374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003383	CAAA	2	8	70554	70561	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003383	TTTA	2	8	72782	72789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003383	AATA	2	8	74438	74445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003383	GAAA	2	8	74876	74883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003383	ATAA	2	8	77271	77278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003383	ATGG	2	8	77520	77527	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003383	TTCC	2	8	79130	79137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_003383	TTGG	2	8	79933	79940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003383	ATGC	2	8	80152	80159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003383	CAAT	2	8	80211	80218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003383	AAGG	2	8	80385	80392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.