MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003383	AT	3	6	1034	1039	50 %	50 %	0 %	0 %	18450289
2	NC_003383	AT	3	6	1246	1251	50 %	50 %	0 %	0 %	18450289
3	NC_003383	TG	3	6	1427	1432	0 %	50 %	50 %	0 %	18450289
4	NC_003383	TC	4	8	1888	1895	0 %	50 %	0 %	50 %	18450289
5	NC_003383	CA	3	6	2200	2205	50 %	0 %	0 %	50 %	18450290
6	NC_003383	GC	3	6	2482	2487	0 %	0 %	50 %	50 %	18450290
7	NC_003383	AT	3	6	2534	2539	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
8	NC_003383	AT	3	6	3060	3065	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
9	NC_003383	CT	3	6	3704	3709	0 %	50 %	0 %	50 %	18450290
10	NC_003383	AT	3	6	4104	4109	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
11	NC_003383	AT	3	6	4773	4778	50 %	50 %	0 %	0 %	18450291
12	NC_003383	AC	3	6	5533	5538	50 %	0 %	0 %	50 %	18450293
13	NC_003383	CA	3	6	7060	7065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_003383	CT	3	6	7154	7159	0 %	50 %	0 %	50 %	18450295
15	NC_003383	AT	3	6	8283	8288	50 %	50 %	0 %	0 %	18450295
16	NC_003383	AT	3	6	8388	8393	50 %	50 %	0 %	0 %	18450295
17	NC_003383	TG	3	6	8692	8697	0 %	50 %	50 %	0 %	18450296
18	NC_003383	TC	3	6	8764	8769	0 %	50 %	0 %	50 %	18450296
19	NC_003383	CT	3	6	8794	8799	0 %	50 %	0 %	50 %	18450296
20	NC_003383	TA	3	6	10227	10232	50 %	50 %	0 %	0 %	18450298
21	NC_003383	CT	3	6	10254	10259	0 %	50 %	0 %	50 %	18450298
22	NC_003383	TA	4	8	10619	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	18450299
23	NC_003383	AT	4	8	11024	11031	50 %	50 %	0 %	0 %	18450300
24	NC_003383	AT	3	6	11584	11589	50 %	50 %	0 %	0 %	18450301
25	NC_003383	GT	3	6	11932	11937	0 %	50 %	50 %	0 %	18450301
26	NC_003383	AC	3	6	12558	12563	50 %	0 %	0 %	50 %	18450301
27	NC_003383	TA	3	6	12972	12977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003383	CT	3	6	12999	13004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_003383	AG	3	6	13305	13310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003383	AG	3	6	13583	13588	50 %	0 %	50 %	0 %	18450302
31	NC_003383	TA	3	6	14324	14329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003383	CT	3	6	14351	14356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_003383	TC	3	6	14638	14643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003383	AT	3	6	14968	14973	50 %	50 %	0 %	0 %	18450303
35	NC_003383	TG	3	6	15072	15077	0 %	50 %	50 %	0 %	18450303
36	NC_003383	TA	3	6	15880	15885	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
37	NC_003383	AT	3	6	16324	16329	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
38	NC_003383	AG	3	6	16911	16916	50 %	0 %	50 %	0 %	18450304
39	NC_003383	TC	3	6	18591	18596	0 %	50 %	0 %	50 %	18450304
40	NC_003383	AT	3	6	18674	18679	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
41	NC_003383	AT	3	6	19078	19083	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
42	NC_003383	CT	3	6	19678	19683	0 %	50 %	0 %	50 %	18450304
43	NC_003383	AG	3	6	20890	20895	50 %	0 %	50 %	0 %	18450306
44	NC_003383	TC	3	6	21318	21323	0 %	50 %	0 %	50 %	18450306
45	NC_003383	GA	3	6	21684	21689	50 %	0 %	50 %	0 %	18450306
46	NC_003383	TC	3	6	21935	21940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_003383	AT	3	6	22029	22034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003383	AG	3	6	22203	22208	50 %	0 %	50 %	0 %	18450307
49	NC_003383	AT	3	6	22592	22597	50 %	50 %	0 %	0 %	18450307
50	NC_003383	TG	3	6	22696	22701	0 %	50 %	50 %	0 %	18450307
51	NC_003383	GT	3	6	22995	23000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003383	TC	3	6	23327	23332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003383	TA	3	6	23393	23398	50 %	50 %	0 %	0 %	18450309
54	NC_003383	TA	3	6	24328	24333	50 %	50 %	0 %	0 %	18450310
55	NC_003383	TA	3	6	25819	25824	50 %	50 %	0 %	0 %	18450310
56	NC_003383	AT	3	6	26183	26188	50 %	50 %	0 %	0 %	18450310
57	NC_003383	AG	3	6	26780	26785	50 %	0 %	50 %	0 %	18450311
58	NC_003383	TA	3	6	26807	26812	50 %	50 %	0 %	0 %	18450311
59	NC_003383	TG	3	6	27076	27081	0 %	50 %	50 %	0 %	18450311
60	NC_003383	AT	3	6	28033	28038	50 %	50 %	0 %	0 %	18450312
61	NC_003383	AC	3	6	29690	29695	50 %	0 %	0 %	50 %	18450315
62	NC_003383	TA	3	6	29960	29965	50 %	50 %	0 %	0 %	18450315
63	NC_003383	CT	3	6	29987	29992	0 %	50 %	0 %	50 %	18450315
64	NC_003383	GA	3	6	30126	30131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003383	CT	3	6	31292	31297	0 %	50 %	0 %	50 %	18450318
66	NC_003383	AT	3	6	33350	33355	50 %	50 %	0 %	0 %	18450319
67	NC_003383	GC	3	6	34281	34286	0 %	0 %	50 %	50 %	18450320
68	NC_003383	TG	3	6	34945	34950	0 %	50 %	50 %	0 %	18450321
69	NC_003383	TA	3	6	35767	35772	50 %	50 %	0 %	0 %	18450322
70	NC_003383	AT	3	6	36523	36528	50 %	50 %	0 %	0 %	18450322
71	NC_003383	AG	3	6	38493	38498	50 %	0 %	50 %	0 %	18450325
72	NC_003383	TA	3	6	38520	38525	50 %	50 %	0 %	0 %	18450325
73	NC_003383	TG	3	6	38789	38794	0 %	50 %	50 %	0 %	18450325
74	NC_003383	AC	3	6	40048	40053	50 %	0 %	0 %	50 %	18450326
75	NC_003383	AT	3	6	40706	40711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003383	GC	3	6	40882	40887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_003383	AT	3	6	41409	41414	50 %	50 %	0 %	0 %	18450327
78	NC_003383	CA	3	6	42049	42054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_003383	AT	3	6	42173	42178	50 %	50 %	0 %	0 %	18450328
80	NC_003383	AG	3	6	42292	42297	50 %	0 %	50 %	0 %	18450328
81	NC_003383	TA	3	6	42504	42509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003383	GA	3	6	43155	43160	50 %	0 %	50 %	0 %	18450329
83	NC_003383	AG	3	6	44587	44592	50 %	0 %	50 %	0 %	18450330
84	NC_003383	AG	4	8	45730	45737	50 %	0 %	50 %	0 %	18450330
85	NC_003383	CT	3	6	45872	45877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_003383	TA	3	6	45972	45977	50 %	50 %	0 %	0 %	18450331
87	NC_003383	TA	3	6	46119	46124	50 %	50 %	0 %	0 %	18450331
88	NC_003383	CT	3	6	46582	46587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_003383	AG	3	6	46760	46765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003383	AT	3	6	47025	47030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003383	TA	3	6	47086	47091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003383	TA	3	6	47582	47587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003383	TA	3	6	47850	47855	50 %	50 %	0 %	0 %	18450332
94	NC_003383	CA	3	6	47936	47941	50 %	0 %	0 %	50 %	18450332
95	NC_003383	TA	3	6	48870	48875	50 %	50 %	0 %	0 %	18450332
96	NC_003383	TA	3	6	49716	49721	50 %	50 %	0 %	0 %	18450332
97	NC_003383	AC	3	6	50823	50828	50 %	0 %	0 %	50 %	18450333
98	NC_003383	AC	3	6	51485	51490	50 %	0 %	0 %	50 %	18450334
99	NC_003383	TG	4	8	52233	52240	0 %	50 %	50 %	0 %	18450334
100	NC_003383	TA	3	6	53127	53132	50 %	50 %	0 %	0 %	18450335
101	NC_003383	TA	3	6	53238	53243	50 %	50 %	0 %	0 %	18450335
102	NC_003383	AG	3	6	53539	53544	50 %	0 %	50 %	0 %	18450335
103	NC_003383	AT	3	6	54250	54255	50 %	50 %	0 %	0 %	18450335
104	NC_003383	AT	3	6	55573	55578	50 %	50 %	0 %	0 %	18450337
105	NC_003383	AT	3	6	56711	56716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003383	TA	3	6	57546	57551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003383	CT	3	6	57653	57658	0 %	50 %	0 %	50 %	18450339
108	NC_003383	AT	3	6	57850	57855	50 %	50 %	0 %	0 %	18450339
109	NC_003383	AT	3	6	58069	58074	50 %	50 %	0 %	0 %	18450339
110	NC_003383	AT	3	6	58401	58406	50 %	50 %	0 %	0 %	18450339
111	NC_003383	CT	3	6	58599	58604	0 %	50 %	0 %	50 %	18450340
112	NC_003383	AT	4	8	59482	59489	50 %	50 %	0 %	0 %	18450340
113	NC_003383	AT	3	6	59945	59950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003383	GT	3	6	60034	60039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003383	AG	3	6	60448	60453	50 %	0 %	50 %	0 %	18450341
116	NC_003383	AG	3	6	60567	60572	50 %	0 %	50 %	0 %	18450341
117	NC_003383	TC	3	6	61577	61582	0 %	50 %	0 %	50 %	18450343
118	NC_003383	TA	3	6	61654	61659	50 %	50 %	0 %	0 %	18450343
119	NC_003383	AC	3	6	62940	62945	50 %	0 %	0 %	50 %	18450343
120	NC_003383	AG	3	6	63667	63672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003383	AT	3	6	63834	63839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003383	AT	3	6	63855	63860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003383	TC	3	6	64091	64096	0 %	50 %	0 %	50 %	18450344
124	NC_003383	CA	3	6	64754	64759	50 %	0 %	0 %	50 %	18450345
125	NC_003383	AT	3	6	64858	64863	50 %	50 %	0 %	0 %	18450345
126	NC_003383	TC	3	6	65246	65251	0 %	50 %	0 %	50 %	18450345
127	NC_003383	GA	3	6	65790	65795	50 %	0 %	50 %	0 %	18450346
128	NC_003383	AT	3	6	65919	65924	50 %	50 %	0 %	0 %	18450346
129	NC_003383	TA	3	6	66095	66100	50 %	50 %	0 %	0 %	18450346
130	NC_003383	GA	3	6	67323	67328	50 %	0 %	50 %	0 %	18450348
131	NC_003383	GA	3	6	67337	67342	50 %	0 %	50 %	0 %	18450348
132	NC_003383	AG	3	6	68577	68582	50 %	0 %	50 %	0 %	18450349
133	NC_003383	AG	3	6	68780	68785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003383	AT	4	8	68903	68910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003383	AT	3	6	68989	68994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003383	TC	3	6	69504	69509	0 %	50 %	0 %	50 %	18450351
137	NC_003383	TA	3	6	69875	69880	50 %	50 %	0 %	0 %	18450351
138	NC_003383	TA	4	8	70263	70270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003383	TA	3	6	70295	70300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003383	TA	3	6	70303	70308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003383	TA	3	6	70348	70353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003383	AT	3	6	70450	70455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003383	TA	3	6	70473	70478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003383	TA	3	6	70489	70494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003383	GC	3	6	71500	71505	0 %	0 %	50 %	50 %	18450352
146	NC_003383	TG	3	6	72607	72612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003383	CA	3	6	72967	72972	50 %	0 %	0 %	50 %	18450353
148	NC_003383	AT	3	6	73071	73076	50 %	50 %	0 %	0 %	18450353
149	NC_003383	TC	3	6	73459	73464	0 %	50 %	0 %	50 %	18450353
150	NC_003383	AT	3	6	74230	74235	50 %	50 %	0 %	0 %	18450354
151	NC_003383	GT	3	6	74666	74671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003383	AT	3	6	74689	74694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003383	CT	3	6	74751	74756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_003383	AT	3	6	76469	76474	50 %	50 %	0 %	0 %	18450357
155	NC_003383	AG	3	6	77174	77179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003383	AT	3	6	77216	77221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003383	AT	4	8	77596	77603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_003383	GA	3	6	78256	78261	50 %	0 %	50 %	0 %	18450358
159	NC_003383	GA	3	6	78888	78893	50 %	0 %	50 %	0 %	18450359
160	NC_003383	TA	3	6	79068	79073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_003383	CT	3	6	79531	79536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_003383	GT	3	6	80440	80445	0 %	50 %	50 %	0 %	18450360

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.