MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003383	AT	3	6	1034	1039	50 %	50 %	0 %	0 %	18450289
2	NC_003383	AT	3	6	1246	1251	50 %	50 %	0 %	0 %	18450289
3	NC_003383	TG	3	6	1427	1432	0 %	50 %	50 %	0 %	18450289
4	NC_003383	TC	4	8	1888	1895	0 %	50 %	0 %	50 %	18450289
5	NC_003383	CA	3	6	2200	2205	50 %	0 %	0 %	50 %	18450290
6	NC_003383	GC	3	6	2482	2487	0 %	0 %	50 %	50 %	18450290
7	NC_003383	AT	3	6	2534	2539	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
8	NC_003383	AT	3	6	3060	3065	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
9	NC_003383	CT	3	6	3704	3709	0 %	50 %	0 %	50 %	18450290
10	NC_003383	AT	3	6	4104	4109	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
11	NC_003383	AT	3	6	4773	4778	50 %	50 %	0 %	0 %	18450291
12	NC_003383	AC	3	6	5533	5538	50 %	0 %	0 %	50 %	18450293
13	NC_003383	CT	3	6	7154	7159	0 %	50 %	0 %	50 %	18450295
14	NC_003383	AT	3	6	8283	8288	50 %	50 %	0 %	0 %	18450295
15	NC_003383	AT	3	6	8388	8393	50 %	50 %	0 %	0 %	18450295
16	NC_003383	TG	3	6	8692	8697	0 %	50 %	50 %	0 %	18450296
17	NC_003383	TC	3	6	8764	8769	0 %	50 %	0 %	50 %	18450296
18	NC_003383	CT	3	6	8794	8799	0 %	50 %	0 %	50 %	18450296
19	NC_003383	TA	3	6	10227	10232	50 %	50 %	0 %	0 %	18450298
20	NC_003383	CT	3	6	10254	10259	0 %	50 %	0 %	50 %	18450298
21	NC_003383	TA	4	8	10619	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	18450299
22	NC_003383	AT	4	8	11024	11031	50 %	50 %	0 %	0 %	18450300
23	NC_003383	AT	3	6	11584	11589	50 %	50 %	0 %	0 %	18450301
24	NC_003383	GT	3	6	11932	11937	0 %	50 %	50 %	0 %	18450301
25	NC_003383	AC	3	6	12558	12563	50 %	0 %	0 %	50 %	18450301
26	NC_003383	AG	3	6	13583	13588	50 %	0 %	50 %	0 %	18450302
27	NC_003383	AT	3	6	14968	14973	50 %	50 %	0 %	0 %	18450303
28	NC_003383	TG	3	6	15072	15077	0 %	50 %	50 %	0 %	18450303
29	NC_003383	TA	3	6	15880	15885	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
30	NC_003383	AT	3	6	16324	16329	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
31	NC_003383	AG	3	6	16911	16916	50 %	0 %	50 %	0 %	18450304
32	NC_003383	TC	3	6	18591	18596	0 %	50 %	0 %	50 %	18450304
33	NC_003383	AT	3	6	18674	18679	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
34	NC_003383	AT	3	6	19078	19083	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
35	NC_003383	CT	3	6	19678	19683	0 %	50 %	0 %	50 %	18450304
36	NC_003383	AG	3	6	20890	20895	50 %	0 %	50 %	0 %	18450306
37	NC_003383	TC	3	6	21318	21323	0 %	50 %	0 %	50 %	18450306
38	NC_003383	GA	3	6	21684	21689	50 %	0 %	50 %	0 %	18450306
39	NC_003383	AG	3	6	22203	22208	50 %	0 %	50 %	0 %	18450307
40	NC_003383	AT	3	6	22592	22597	50 %	50 %	0 %	0 %	18450307
41	NC_003383	TG	3	6	22696	22701	0 %	50 %	50 %	0 %	18450307
42	NC_003383	TA	3	6	23393	23398	50 %	50 %	0 %	0 %	18450309
43	NC_003383	TA	3	6	24328	24333	50 %	50 %	0 %	0 %	18450310
44	NC_003383	TA	3	6	25819	25824	50 %	50 %	0 %	0 %	18450310
45	NC_003383	AT	3	6	26183	26188	50 %	50 %	0 %	0 %	18450310
46	NC_003383	AG	3	6	26780	26785	50 %	0 %	50 %	0 %	18450311
47	NC_003383	TA	3	6	26807	26812	50 %	50 %	0 %	0 %	18450311
48	NC_003383	TG	3	6	27076	27081	0 %	50 %	50 %	0 %	18450311
49	NC_003383	AT	3	6	28033	28038	50 %	50 %	0 %	0 %	18450312
50	NC_003383	AC	3	6	29690	29695	50 %	0 %	0 %	50 %	18450315
51	NC_003383	TA	3	6	29960	29965	50 %	50 %	0 %	0 %	18450315
52	NC_003383	CT	3	6	29987	29992	0 %	50 %	0 %	50 %	18450315
53	NC_003383	CT	3	6	31292	31297	0 %	50 %	0 %	50 %	18450318
54	NC_003383	AT	3	6	33350	33355	50 %	50 %	0 %	0 %	18450319
55	NC_003383	GC	3	6	34281	34286	0 %	0 %	50 %	50 %	18450320
56	NC_003383	TG	3	6	34945	34950	0 %	50 %	50 %	0 %	18450321
57	NC_003383	TA	3	6	35767	35772	50 %	50 %	0 %	0 %	18450322
58	NC_003383	AT	3	6	36523	36528	50 %	50 %	0 %	0 %	18450322
59	NC_003383	AG	3	6	38493	38498	50 %	0 %	50 %	0 %	18450325
60	NC_003383	TA	3	6	38520	38525	50 %	50 %	0 %	0 %	18450325
61	NC_003383	TG	3	6	38789	38794	0 %	50 %	50 %	0 %	18450325
62	NC_003383	AC	3	6	40048	40053	50 %	0 %	0 %	50 %	18450326
63	NC_003383	AT	3	6	41409	41414	50 %	50 %	0 %	0 %	18450327
64	NC_003383	AT	3	6	42173	42178	50 %	50 %	0 %	0 %	18450328
65	NC_003383	AG	3	6	42292	42297	50 %	0 %	50 %	0 %	18450328
66	NC_003383	GA	3	6	43155	43160	50 %	0 %	50 %	0 %	18450329
67	NC_003383	AG	3	6	44587	44592	50 %	0 %	50 %	0 %	18450330
68	NC_003383	AG	4	8	45730	45737	50 %	0 %	50 %	0 %	18450330
69	NC_003383	TA	3	6	45972	45977	50 %	50 %	0 %	0 %	18450331
70	NC_003383	TA	3	6	46119	46124	50 %	50 %	0 %	0 %	18450331
71	NC_003383	TA	3	6	47850	47855	50 %	50 %	0 %	0 %	18450332
72	NC_003383	CA	3	6	47936	47941	50 %	0 %	0 %	50 %	18450332
73	NC_003383	TA	3	6	48870	48875	50 %	50 %	0 %	0 %	18450332
74	NC_003383	TA	3	6	49716	49721	50 %	50 %	0 %	0 %	18450332
75	NC_003383	AC	3	6	50823	50828	50 %	0 %	0 %	50 %	18450333
76	NC_003383	AC	3	6	51485	51490	50 %	0 %	0 %	50 %	18450334
77	NC_003383	TG	4	8	52233	52240	0 %	50 %	50 %	0 %	18450334
78	NC_003383	TA	3	6	53127	53132	50 %	50 %	0 %	0 %	18450335
79	NC_003383	TA	3	6	53238	53243	50 %	50 %	0 %	0 %	18450335
80	NC_003383	AG	3	6	53539	53544	50 %	0 %	50 %	0 %	18450335
81	NC_003383	AT	3	6	54250	54255	50 %	50 %	0 %	0 %	18450335
82	NC_003383	AT	3	6	55573	55578	50 %	50 %	0 %	0 %	18450337
83	NC_003383	CT	3	6	57653	57658	0 %	50 %	0 %	50 %	18450339
84	NC_003383	AT	3	6	57850	57855	50 %	50 %	0 %	0 %	18450339
85	NC_003383	AT	3	6	58069	58074	50 %	50 %	0 %	0 %	18450339
86	NC_003383	AT	3	6	58401	58406	50 %	50 %	0 %	0 %	18450339
87	NC_003383	CT	3	6	58599	58604	0 %	50 %	0 %	50 %	18450340
88	NC_003383	AT	4	8	59482	59489	50 %	50 %	0 %	0 %	18450340
89	NC_003383	AG	3	6	60448	60453	50 %	0 %	50 %	0 %	18450341
90	NC_003383	AG	3	6	60567	60572	50 %	0 %	50 %	0 %	18450341
91	NC_003383	TC	3	6	61577	61582	0 %	50 %	0 %	50 %	18450343
92	NC_003383	TA	3	6	61654	61659	50 %	50 %	0 %	0 %	18450343
93	NC_003383	AC	3	6	62940	62945	50 %	0 %	0 %	50 %	18450343
94	NC_003383	TC	3	6	64091	64096	0 %	50 %	0 %	50 %	18450344
95	NC_003383	CA	3	6	64754	64759	50 %	0 %	0 %	50 %	18450345
96	NC_003383	AT	3	6	64858	64863	50 %	50 %	0 %	0 %	18450345
97	NC_003383	TC	3	6	65246	65251	0 %	50 %	0 %	50 %	18450345
98	NC_003383	GA	3	6	65790	65795	50 %	0 %	50 %	0 %	18450346
99	NC_003383	AT	3	6	65919	65924	50 %	50 %	0 %	0 %	18450346
100	NC_003383	TA	3	6	66095	66100	50 %	50 %	0 %	0 %	18450346
101	NC_003383	GA	3	6	67323	67328	50 %	0 %	50 %	0 %	18450348
102	NC_003383	GA	3	6	67337	67342	50 %	0 %	50 %	0 %	18450348
103	NC_003383	AG	3	6	68577	68582	50 %	0 %	50 %	0 %	18450349
104	NC_003383	TC	3	6	69504	69509	0 %	50 %	0 %	50 %	18450351
105	NC_003383	TA	3	6	69875	69880	50 %	50 %	0 %	0 %	18450351
106	NC_003383	GC	3	6	71500	71505	0 %	0 %	50 %	50 %	18450352
107	NC_003383	CA	3	6	72967	72972	50 %	0 %	0 %	50 %	18450353
108	NC_003383	AT	3	6	73071	73076	50 %	50 %	0 %	0 %	18450353
109	NC_003383	TC	3	6	73459	73464	0 %	50 %	0 %	50 %	18450353
110	NC_003383	AT	3	6	74230	74235	50 %	50 %	0 %	0 %	18450354
111	NC_003383	AT	3	6	76469	76474	50 %	50 %	0 %	0 %	18450357
112	NC_003383	GA	3	6	78256	78261	50 %	0 %	50 %	0 %	18450358
113	NC_003383	GA	3	6	78888	78893	50 %	0 %	50 %	0 %	18450359
114	NC_003383	GT	3	6	80440	80445	0 %	50 %	50 %	0 %	18450360

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.