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Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 1830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003366	TACTAT	2	12	1970	1981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003366	CTATAG	2	12	2115	2126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	18308984
3	NC_003366	TAAAAT	2	12	2329	2340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308984
4	NC_003366	AAACTA	2	12	6177	6188	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	18308988
5	NC_003366	ACTTTA	2	12	16034	16045	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_003366	TTTTAG	2	12	16214	16225	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003366	GGAGCT	2	12	16580	16591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	18308993
8	NC_003366	TATAAA	2	12	16822	16833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308993
9	NC_003366	AAAATA	2	12	18366	18377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	18308993
10	NC_003366	GAATAA	2	12	19833	19844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18308994
11	NC_003366	TAAATA	2	12	21233	21244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003366	ACTGGT	2	12	21889	21900	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161485645
13	NC_003366	TTTTAT	2	12	23210	23221	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003366	AAAATG	2	12	24095	24106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003366	TTAAAT	2	12	24688	24699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003366	GATAAG	2	12	25094	25105	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	18309000
17	NC_003366	AAAATA	2	12	29432	29443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	18309002
18	NC_003366	ACAGGA	2	12	31487	31498	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	18309003
19	NC_003366	GTAAGT	2	12	31725	31736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
20	NC_003366	AGCTTC	2	12	32347	32358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	18309003
21	NC_003366	TAAATA	2	12	32665	32676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
22	NC_003366	ACTGTT	2	12	34706	34717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	18309004
23	NC_003366	ATTTAG	2	12	35163	35174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18309005
24	NC_003366	AATATT	2	12	37165	37176	50 %	50 %	0 %	0 %	18309006
25	NC_003366	ACATGA	2	12	38359	38370	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	18309007
26	NC_003366	TAAAAG	2	12	40727	40738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309009
27	NC_003366	TAAATT	2	12	41225	41236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003366	TTGAAG	2	12	43742	43753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309012
29	NC_003366	TTTAAT	2	12	45862	45873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309015
30	NC_003366	ATAGAA	2	12	46119	46130	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309016
31	NC_003366	TTTTCT	2	12	47190	47201	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	18309017
32	NC_003366	AGAAAA	2	12	49652	49663	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309018
33	NC_003366	ATTTTT	2	12	52638	52649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	18309022
34	NC_003366	CTTAAA	2	12	52700	52711	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	18309022
35	NC_003366	AAAGAA	2	12	53502	53513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309023
36	NC_003366	AATTTG	2	12	57052	57063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18309025
37	NC_003366	TACAGA	2	12	60397	60408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	18309029
38	NC_003366	ATAAGA	2	12	60572	60583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309029
39	NC_003366	AATATA	2	12	60903	60914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003366	TAAAAA	2	12	61614	61625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003366	TTTAAT	2	12	62411	62422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309032
42	NC_003366	TTCTTT	2	12	62543	62554	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	18309032
43	NC_003366	TTTATA	2	12	62565	62576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309032
44	NC_003366	ATTTGT	2	12	62720	62731	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	18309032
45	NC_003366	TAGAAT	2	12	64826	64837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309035
46	NC_003366	TGTTTT	2	12	69277	69288	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003366	TACTTA	2	12	70527	70538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	18309040
48	NC_003366	TTAAAT	2	12	70726	70737	50 %	50 %	0 %	0 %	18309041
49	NC_003366	ATTTAG	2	12	70864	70875	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18309041
50	NC_003366	ATAAAT	2	12	70950	70961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309041
51	NC_003366	TTTAAA	2	12	79343	79354	50 %	50 %	0 %	0 %	18309043
52	NC_003366	ATAGCT	2	12	79374	79385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	18309043
53	NC_003366	TTTTGC	2	12	79733	79744	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	18309043
54	NC_003366	TAAGTA	2	12	80821	80832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309045
55	NC_003366	GATGAG	2	12	81044	81055	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	18309045
56	NC_003366	CAACTA	2	12	85937	85948	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	18309047
57	NC_003366	TAAAGA	2	12	88190	88201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309048
58	NC_003366	ATTGGT	2	12	89291	89302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	18309050
59	NC_003366	AAAAAG	2	12	89358	89369	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309050
60	NC_003366	ATGATA	2	12	90695	90706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309051
61	NC_003366	AAAAGA	2	12	91458	91469	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309052
62	NC_003366	TTAGTA	2	12	93381	93392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18309053
63	NC_003366	AGTATT	2	12	95009	95020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18309054
64	NC_003366	TCAGCT	2	12	95178	95189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	18309054
65	NC_003366	TTTAAA	2	12	95627	95638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003366	TAGAAA	2	12	101807	101818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309055
67	NC_003366	TGCATA	2	12	101916	101927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	18309055
68	NC_003366	TCCTTC	2	12	102515	102526	0 %	50 %	0 %	50 %	18309057
69	NC_003366	AAGATT	2	12	104738	104749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309059
70	NC_003366	ATTTAA	2	12	105398	105409	50 %	50 %	0 %	0 %	18309060
71	NC_003366	AGTTTA	2	12	111295	111306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003366	ATTTAA	2	12	111386	111397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003366	TACTAA	2	12	111501	111512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_003366	ATTTTG	2	12	111835	111846	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	18309061
75	NC_003366	GAAAAA	2	12	111951	111962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309061
76	NC_003366	AGGAAG	2	12	113564	113575	50 %	0 %	50 %	0 %	18309061
77	NC_003366	TATTTT	2	12	116827	116838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003366	TGCAAC	2	12	121030	121041	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	18309068
79	NC_003366	TAAATT	2	12	124975	124986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003366	TGGAGA	2	12	126863	126874	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	18309073
81	NC_003366	ATTGAG	2	12	132535	132546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309078
82	NC_003366	AAAAAT	2	12	135167	135178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003366	CTTCAC	2	12	137578	137589	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	18309082
84	NC_003366	TAGAAA	2	12	138607	138618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309082
85	NC_003366	TAAATA	2	12	140523	140534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309083
86	NC_003366	TTTTCT	2	12	141895	141906	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	18309085
87	NC_003366	CCTTAT	2	12	142661	142672	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	18309085
88	NC_003366	ATAAAA	2	12	143419	143430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	18309086
89	NC_003366	ACTTGA	2	12	147780	147791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	18309090
90	NC_003366	GAAAGG	2	12	148236	148247	50 %	0 %	50 %	0 %	18309090
91	NC_003366	AATATG	2	12	149812	149823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003366	ATTTAA	2	12	150210	150221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003366	ACTTTT	2	12	151560	151571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	18309092
94	NC_003366	TATATT	2	12	152132	152143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003366	ATTATA	2	12	152211	152222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003366	TGGAGA	2	12	153403	153414	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	18309094
97	NC_003366	AAATAA	2	12	153775	153786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	18309094
98	NC_003366	CTAAAT	2	12	156384	156395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	18309098
99	NC_003366	ATTTTT	2	12	156415	156426	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	18309098
100	NC_003366	TTTATA	2	12	157516	157527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309099
101	NC_003366	ATTAAT	2	12	160164	160175	50 %	50 %	0 %	0 %	18309102
102	NC_003366	TAAGGA	2	12	161901	161912	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003366	TAATGA	2	12	163846	163857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309105
104	NC_003366	ATAAAA	2	12	165157	165168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	18309106
105	NC_003366	TAAAGA	2	12	165728	165739	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003366	TAAGAT	2	12	166344	166355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003366	ATCTTA	2	12	166360	166371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_003366	TAGTTT	2	12	168782	168793	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	18309111
109	NC_003366	AAAAAG	2	12	169771	169782	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003366	TAGAAC	2	12	172225	172236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	18309114
111	NC_003366	TTAGTT	2	12	176781	176792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003366	AAACCA	2	12	177814	177825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309119
113	NC_003366	TAAAAT	2	12	178581	178592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003366	AAAAAT	2	12	180541	180552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003366	AATTTT	2	12	180782	180793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309122
116	NC_003366	ATTTTA	2	12	182028	182039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309122
117	NC_003366	ACATAG	2	12	182424	182435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	18309123
118	NC_003366	ATGAAA	2	12	183081	183092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309125
119	NC_003366	ATATAA	2	12	186437	186448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309128
120	NC_003366	AGAAGG	2	12	187248	187259	50 %	0 %	50 %	0 %	18309129
121	NC_003366	TAGAAG	2	12	189720	189731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	18309131
122	NC_003366	AACACC	2	12	190069	190080	50 %	0 %	0 %	50 %	18309131
123	NC_003366	GTTGGA	2	12	190771	190782	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	18309132
124	NC_003366	ATAGGA	2	12	194813	194824	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	18309135
125	NC_003366	CTTATT	2	12	195934	195945	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	18309136
126	NC_003366	TAAAAA	2	12	197109	197120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003366	ATACAA	2	12	197192	197203	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_003366	TAAATT	2	12	199123	199134	50 %	50 %	0 %	0 %	18309137
129	NC_003366	TTTGGA	2	12	200591	200602	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	18309138
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131	NC_003366	ATTAAT	2	12	202496	202507	50 %	50 %	0 %	0 %	18309140
132	NC_003366	TTAATG	2	12	209614	209625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18309145
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137	NC_003366	GGAAAT	2	12	215893	215904	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	18309149
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139	NC_003366	AGATGC	2	12	221153	221164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	18309153
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146	NC_003366	CCTATA	2	12	233653	233664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309163
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166	NC_003366	ATGAAT	2	12	267002	267013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_003366	AAATAT	2	12	273757	273768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_003366	GATTTA	2	12	391539	391550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18309290
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239	NC_003366	AATTAA	2	12	399639	399650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_003366	TTTCGC	2	12	401073	401084	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	18309298
241	NC_003366	AAAGAT	2	12	404195	404206	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309300
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243	NC_003366	CAGTTG	2	12	406659	406670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	18309304
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245	NC_003366	AATAAA	2	12	408028	408039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_003366	TACAAA	2	12	408379	408390	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	18309306
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250	NC_003366	AGTATT	2	12	416530	416541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18309312
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252	NC_003366	TAATTA	2	12	417878	417889	50 %	50 %	0 %	0 %	18309314
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349	NC_003366	ATAATT	2	12	578135	578146	50 %	50 %	0 %	0 %	18309440
350	NC_003366	AGTAAT	2	12	583897	583908	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309445
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352	NC_003366	GAAAAA	2	12	587949	587960	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309447
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359	NC_003366	AAAATT	2	12	592952	592963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
360	NC_003366	TGTTCA	2	12	595028	595039	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	18309457
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362	NC_003366	ACAAAG	2	12	595236	595247	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	18309457
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485	NC_003366	ATGTTG	2	12	812260	812271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	18309631
486	NC_003366	GTAATA	2	12	812813	812824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309632
487	NC_003366	TGATAA	2	12	813817	813828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309633
488	NC_003366	TAAGAT	2	12	816486	816497	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309635
489	NC_003366	AGAAAA	2	12	821225	821236	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309639
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491	NC_003366	TAAACA	2	12	828939	828950	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
492	NC_003366	ATTTAA	2	12	828968	828979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_003366	ATTTAT	2	12	829079	829090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_003366	TTAATT	2	12	829964	829975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_003366	ATAAAA	2	12	830452	830463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	18309647
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499	NC_003366	TTTAAA	2	12	837225	837236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_003366	AGTTTT	2	12	841773	841784	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	18309658

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