MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003366	TTATT	2	10	1858	1867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003366	ATTTT	2	10	3244	3253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003366	AATTA	2	10	9727	9736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003366	ATATA	2	10	9815	9824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003366	ATATA	2	10	9884	9893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003366	AGGAG	2	10	10801	10810	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003366	TCGTG	2	10	11211	11220	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003366	TAATT	2	10	11788	11797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003366	GGGAG	2	10	12391	12400	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003366	TAAGT	2	10	12917	12926	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003366	TAAAT	2	10	14780	14789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003366	ATTAT	2	10	16182	16191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003366	TTTTA	2	10	16231	16240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003366	TAAAA	2	10	23539	23548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003366	TAATT	2	10	23720	23729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003366	TAATA	2	10	24637	24646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003366	TATAA	2	10	43123	43132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003366	TTTTA	2	10	49865	49874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003366	AGATA	2	10	53243	53252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003366	TTAAA	2	10	54307	54316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003366	AGGAG	2	10	61717	61726	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003366	AAAGA	2	10	63107	63116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003366	AAATT	2	10	67983	67992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003366	ATCAT	2	10	68020	68029	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003366	AATAT	2	10	72423	72432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003366	TAAAT	2	10	72531	72540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003366	AGGAG	2	10	73413	73422	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003366	TCGTG	2	10	73822	73831	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003366	TAATT	2	10	74399	74408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003366	ACATA	2	10	74778	74787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_003366	GGGAG	2	10	75003	75012	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003366	TAAGT	2	10	75529	75538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003366	TAAAT	2	10	77391	77400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003366	ATTTA	2	10	91415	91424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003366	AGGAG	2	10	96885	96894	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003366	TCGTG	2	10	97294	97303	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_003366	TAATT	2	10	97871	97880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003366	GGGAG	2	10	98474	98483	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003366	TAAGT	2	10	99000	99009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003366	TAAAT	2	10	100863	100872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003366	TTAAG	2	10	102814	102823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003366	TATTT	2	10	103345	103354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003366	TAAAA	2	10	104922	104931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003366	AAAGA	2	10	105562	105571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003366	AGGAG	2	10	106724	106733	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003366	TCGTG	2	10	107133	107142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_003366	TAATT	2	10	107710	107719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003366	GGGAG	2	10	108311	108320	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003366	TAAGT	2	10	108836	108845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003366	TAAAT	2	10	110682	110691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003366	TTTAA	2	10	113937	113946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003366	TTAAA	2	10	113975	113984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003366	CTATA	2	10	115807	115816	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_003366	TAGGG	2	10	127088	127097	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003366	TTAAA	2	10	130078	130087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003366	AAGTT	2	10	130110	130119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003366	TTTTA	2	10	141782	141791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003366	TTAAA	2	10	143134	143143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003366	TATAA	2	10	143213	143222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003366	TAATT	2	10	143236	143245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003366	TTTTA	2	10	147126	147135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003366	ATTTA	2	10	149043	149052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003366	ATTTT	2	10	152368	152377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003366	TTAGT	2	10	161774	161783	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003366	ATAAA	2	10	164794	164803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003366	TTAAA	2	10	166393	166402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003366	ATAAA	2	10	167822	167831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003366	ATCAA	2	10	169502	169511	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003366	ATTTG	2	10	169636	169645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003366	TTCAT	2	10	170783	170792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_003366	AGCTT	2	10	172470	172479	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_003366	TAATA	2	10	172829	172838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003366	AATGA	2	10	176222	176231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003366	TAATA	2	10	178544	178553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003366	TTAAA	2	10	179674	179683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003366	ATTAA	2	10	180556	180565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003366	TATAA	2	10	183260	183269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003366	TTTTA	2	10	188383	188392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003366	AGTAT	2	10	189364	189373	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003366	TTAAA	2	10	196992	197001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003366	TTTAA	2	10	201190	201199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003366	AATGT	2	10	203337	203346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003366	ATTTT	2	10	203491	203500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003366	CTGAA	2	10	208760	208769	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_003366	GAAAA	2	10	208794	208803	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003366	ATTCT	2	10	211553	211562	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_003366	TTTAT	2	10	216070	216079	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003366	AAAAT	2	10	220423	220432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003366	ATTTA	2	10	222242	222251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003366	ATTTT	2	10	226658	226667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003366	AAAGT	2	10	226792	226801	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003366	GAAAT	2	10	237900	237909	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003366	TATTT	2	10	240046	240055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003366	TTTTA	2	10	240119	240128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003366	ATATT	2	10	241178	241187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003366	AGTTT	2	10	242236	242245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003366	TTAAT	2	10	242260	242269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003366	AAATT	2	10	247916	247925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003366	TTTAA	2	10	247990	247999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003366	ATGCA	2	10	248210	248219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_003366	AATAT	2	10	248374	248383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003366	TAAAA	2	10	248673	248682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003366	ATTAA	2	10	251429	251438	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003366	TTTTA	2	10	251477	251486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003366	TTAAG	2	10	251830	251839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003366	TAATA	2	10	260277	260286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003366	AATTA	2	10	260433	260442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003366	ATTAA	2	10	261730	261739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003366	AGGAG	2	10	262591	262600	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003366	TCGTG	2	10	263001	263010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_003366	TAATT	2	10	263578	263587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003366	GGGAG	2	10	264181	264190	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003366	TAAGT	2	10	264707	264716	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003366	TAAAT	2	10	266569	266578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003366	TTTTA	2	10	266798	266807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003366	TAATT	2	10	266931	266940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003366	ATATT	2	10	267328	267337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003366	TTAGT	2	10	267378	267387	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003366	ATATA	2	10	268121	268130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003366	AGAAT	2	10	268263	268272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003366	ATATT	2	10	268771	268780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003366	TTTAG	2	10	268847	268856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003366	TAAAA	2	10	269031	269040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003366	AATTT	2	10	269437	269446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003366	CTTTT	2	10	269796	269805	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_003366	ATTTT	2	10	269897	269906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003366	TAATA	2	10	271002	271011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003366	TAATA	2	10	278656	278665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003366	TTTTA	2	10	278747	278756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003366	TAAAT	2	10	279821	279830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003366	ATTTA	2	10	279845	279854	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003366	AAATT	2	10	280829	280838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003366	AAATA	2	10	287301	287310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003366	AGTTT	2	10	293292	293301	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003366	AAGTA	2	10	309084	309093	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003366	ATTAT	2	10	315371	315380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003366	AATAT	2	10	318944	318953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003366	AAAAT	2	10	324685	324694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003366	CATTT	2	10	326237	326246	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_003366	TAATA	2	10	326761	326770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003366	TAAAT	2	10	327746	327755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003366	TAATT	2	10	328613	328622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003366	TAAAA	2	10	328690	328699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003366	AAAAT	2	10	329495	329504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003366	TTTTA	2	10	338685	338694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003366	AGGAG	2	10	339682	339691	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003366	TCGTG	2	10	340092	340101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_003366	ACATA	2	10	341279	341288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_003366	GGGAG	2	10	341503	341512	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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