MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 2411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003366	ATTCA	2	10	1082	1091	40 %	40 %	0 %	20 %	18308983
2	NC_003366	AAATC	2	10	1356	1365	60 %	20 %	0 %	20 %	18308983
3	NC_003366	ACAAT	2	10	2634	2643	60 %	20 %	0 %	20 %	18308984
4	NC_003366	AACAT	2	10	2714	2723	60 %	20 %	0 %	20 %	18308984
5	NC_003366	AACTA	2	10	8938	8947	60 %	20 %	0 %	20 %	18308989
6	NC_003366	ATATT	2	10	9069	9078	40 %	60 %	0 %	0 %	18308989
7	NC_003366	AGGAA	2	10	15599	15608	60 %	0 %	40 %	0 %	18308991
8	NC_003366	ATTAT	2	10	15671	15680	40 %	60 %	0 %	0 %	18308992
9	NC_003366	AAATG	2	10	17173	17182	60 %	20 %	20 %	0 %	18308993
10	NC_003366	TGAAG	2	10	18328	18337	40 %	20 %	40 %	0 %	18308993
11	NC_003366	AGAAT	2	10	18585	18594	60 %	20 %	20 %	0 %	18308993
12	NC_003366	TTAGA	2	10	19772	19781	40 %	40 %	20 %	0 %	18308994
13	NC_003366	ACTAT	2	10	19886	19895	40 %	40 %	0 %	20 %	18308994
14	NC_003366	TAAAT	2	10	20295	20304	60 %	40 %	0 %	0 %	18308994
15	NC_003366	ATAAA	2	10	21515	21524	80 %	20 %	0 %	0 %	161485645
16	NC_003366	AGACA	2	10	22988	22997	60 %	0 %	20 %	20 %	18308997
17	NC_003366	TAAAA	2	10	25108	25117	80 %	20 %	0 %	0 %	18309000
18	NC_003366	TAGAA	2	10	25636	25645	60 %	20 %	20 %	0 %	18309000
19	NC_003366	AAAAT	2	10	28439	28448	80 %	20 %	0 %	0 %	18309002
20	NC_003366	TAAAT	2	10	28926	28935	60 %	40 %	0 %	0 %	18309002
21	NC_003366	AGCAA	2	10	31897	31906	60 %	0 %	20 %	20 %	18309003
22	NC_003366	GATTG	2	10	32414	32423	20 %	40 %	40 %	0 %	18309003
23	NC_003366	ATCAC	2	10	35812	35821	40 %	20 %	0 %	40 %	18309005
24	NC_003366	TTTCC	2	10	36311	36320	0 %	60 %	0 %	40 %	18309006
25	NC_003366	TAATA	2	10	37032	37041	60 %	40 %	0 %	0 %	18309006
26	NC_003366	AGAAA	2	10	38274	38283	80 %	0 %	20 %	0 %	18309007
27	NC_003366	AAATA	2	10	42695	42704	80 %	20 %	0 %	0 %	18309011
28	NC_003366	ATGAA	2	10	44982	44991	60 %	20 %	20 %	0 %	18309014
29	NC_003366	ATGTT	2	10	45300	45309	20 %	60 %	20 %	0 %	18309014
30	NC_003366	AAATA	2	10	47576	47585	80 %	20 %	0 %	0 %	18309017
31	NC_003366	ATAGT	2	10	47628	47637	40 %	40 %	20 %	0 %	18309017
32	NC_003366	TATAA	2	10	49772	49781	60 %	40 %	0 %	0 %	18309018
33	NC_003366	TTAAT	2	10	51254	51263	40 %	60 %	0 %	0 %	18309020
34	NC_003366	TAGTA	2	10	51542	51551	40 %	40 %	20 %	0 %	18309021
35	NC_003366	AATTT	2	10	52420	52429	40 %	60 %	0 %	0 %	18309022
36	NC_003366	TAAAT	2	10	55186	55195	60 %	40 %	0 %	0 %	18309024
37	NC_003366	TTTCT	2	10	62171	62180	0 %	80 %	0 %	20 %	18309032
38	NC_003366	TTTAG	2	10	62271	62280	20 %	60 %	20 %	0 %	18309032
39	NC_003366	ATTTA	2	10	63594	63603	40 %	60 %	0 %	0 %	18309034
40	NC_003366	AAGTT	2	10	64391	64400	40 %	40 %	20 %	0 %	18309035
41	NC_003366	AAAAG	2	10	65012	65021	80 %	0 %	20 %	0 %	18309036
42	NC_003366	TAAAT	2	10	66799	66808	60 %	40 %	0 %	0 %	18309037
43	NC_003366	AATAT	2	10	66963	66972	60 %	40 %	0 %	0 %	18309037
44	NC_003366	GGAAT	2	10	67397	67406	40 %	20 %	40 %	0 %	18309038
45	NC_003366	CATAT	2	10	67668	67677	40 %	40 %	0 %	20 %	18309038
46	NC_003366	GTTTA	2	10	69907	69916	20 %	60 %	20 %	0 %	18309040
47	NC_003366	AAGAT	2	10	69979	69988	60 %	20 %	20 %	0 %	18309040
48	NC_003366	TATAA	2	10	70107	70116	60 %	40 %	0 %	0 %	18309040
49	NC_003366	TAGTT	2	10	70409	70418	20 %	60 %	20 %	0 %	18309040
50	NC_003366	AGTAA	2	10	70556	70565	60 %	20 %	20 %	0 %	18309040
51	NC_003366	GAGTA	2	10	70581	70590	40 %	20 %	40 %	0 %	18309041
52	NC_003366	GATAG	2	10	71590	71599	40 %	20 %	40 %	0 %	18309042
53	NC_003366	TTGGA	2	10	78830	78839	20 %	40 %	40 %	0 %	18309043
54	NC_003366	ATATT	2	10	79543	79552	40 %	60 %	0 %	0 %	18309043
55	NC_003366	GAAAA	2	10	80535	80544	80 %	0 %	20 %	0 %	18309045
56	NC_003366	GAAAA	2	10	81034	81043	80 %	0 %	20 %	0 %	18309045
57	NC_003366	GATTT	2	10	81699	81708	20 %	60 %	20 %	0 %	18309045
58	NC_003366	AAGGA	2	10	87621	87630	60 %	0 %	40 %	0 %	18309048
59	NC_003366	TAATA	2	10	91374	91383	60 %	40 %	0 %	0 %	18309051
60	NC_003366	TTATA	2	10	91625	91634	40 %	60 %	0 %	0 %	18309052
61	NC_003366	ATTAT	2	10	101509	101518	40 %	60 %	0 %	0 %	18309055
62	NC_003366	CTTTA	2	10	111667	111676	20 %	60 %	0 %	20 %	18309061
63	NC_003366	GAAAA	2	10	112081	112090	80 %	0 %	20 %	0 %	18309061
64	NC_003366	GATAA	2	10	112584	112593	60 %	20 %	20 %	0 %	18309061
65	NC_003366	AAATT	2	10	113101	113110	60 %	40 %	0 %	0 %	18309061
66	NC_003366	TACAT	2	10	113267	113276	40 %	40 %	0 %	20 %	18309061
67	NC_003366	TGGAA	2	10	113468	113477	40 %	20 %	40 %	0 %	18309061
68	NC_003366	GAATG	2	10	117504	117513	40 %	20 %	40 %	0 %	18309065
69	NC_003366	AAGAG	2	10	119890	119899	60 %	0 %	40 %	0 %	18309067
70	NC_003366	AATGC	2	10	120014	120023	40 %	20 %	20 %	20 %	18309067
71	NC_003366	AAGAG	2	10	121820	121829	60 %	0 %	40 %	0 %	18309069
72	NC_003366	TAAAA	2	10	122400	122409	80 %	20 %	0 %	0 %	18309070
73	NC_003366	CAAAA	2	10	123234	123243	80 %	0 %	0 %	20 %	18309071
74	NC_003366	GAAAA	2	10	126202	126211	80 %	0 %	20 %	0 %	18309073
75	NC_003366	CAAAT	2	10	129132	129141	60 %	20 %	0 %	20 %	18309075
76	NC_003366	AATTT	2	10	130220	130229	40 %	60 %	0 %	0 %	18309076
77	NC_003366	AAAAG	2	10	131317	131326	80 %	0 %	20 %	0 %	18309077
78	NC_003366	GAAAT	2	10	136433	136442	60 %	20 %	20 %	0 %	18309081
79	NC_003366	AATTA	2	10	137272	137281	60 %	40 %	0 %	0 %	18309081
80	NC_003366	AGATA	2	10	137284	137293	60 %	20 %	20 %	0 %	18309081
81	NC_003366	CTAAT	2	10	141837	141846	40 %	40 %	0 %	20 %	18309085
82	NC_003366	TAATT	2	10	144820	144829	40 %	60 %	0 %	0 %	18309087
83	NC_003366	AGAAA	2	10	146216	146225	80 %	0 %	20 %	0 %	18309089
84	NC_003366	CTATT	2	10	147316	147325	20 %	60 %	0 %	20 %	18309090
85	NC_003366	TAACA	2	10	151689	151698	60 %	20 %	0 %	20 %	18309092
86	NC_003366	TTCTT	2	10	151921	151930	0 %	80 %	0 %	20 %	18309093
87	NC_003366	CAAGA	2	10	152988	152997	60 %	0 %	20 %	20 %	18309094
88	NC_003366	GATTA	2	10	153234	153243	40 %	40 %	20 %	0 %	18309094
89	NC_003366	ATTTC	2	10	156122	156131	20 %	60 %	0 %	20 %	18309098
90	NC_003366	TATAT	2	10	158950	158959	40 %	60 %	0 %	0 %	18309100
91	NC_003366	TAGAT	2	10	159426	159435	40 %	40 %	20 %	0 %	18309101
92	NC_003366	AAGAG	2	10	159478	159487	60 %	0 %	40 %	0 %	18309101
93	NC_003366	TTAAT	2	10	161231	161240	40 %	60 %	0 %	0 %	18309103
94	NC_003366	TGGAA	2	10	162973	162982	40 %	20 %	40 %	0 %	18309105
95	NC_003366	ATTAA	2	10	163229	163238	60 %	40 %	0 %	0 %	18309105
96	NC_003366	ATACC	2	10	164899	164908	40 %	20 %	0 %	40 %	18309106
97	NC_003366	ATTTA	2	10	164936	164945	40 %	60 %	0 %	0 %	18309106
98	NC_003366	ATTTT	2	10	165009	165018	20 %	80 %	0 %	0 %	18309106
99	NC_003366	AGAAA	2	10	165507	165516	80 %	0 %	20 %	0 %	18309107
100	NC_003366	TTAAA	2	10	165589	165598	60 %	40 %	0 %	0 %	18309107
101	NC_003366	AGTTT	2	10	166194	166203	20 %	60 %	20 %	0 %	18309108
102	NC_003366	AAAAG	2	10	166244	166253	80 %	0 %	20 %	0 %	18309108
103	NC_003366	TAAAA	2	10	169112	169121	80 %	20 %	0 %	0 %	18309111
104	NC_003366	TAACA	2	10	170152	170161	60 %	20 %	0 %	20 %	18309113
105	NC_003366	AAGAG	2	10	171322	171331	60 %	0 %	40 %	0 %	18309114
106	NC_003366	TTTAT	2	10	173284	173293	20 %	80 %	0 %	0 %	18309115
107	NC_003366	ATTTA	2	10	175879	175888	40 %	60 %	0 %	0 %	18309118
108	NC_003366	GATGA	2	10	177232	177241	40 %	20 %	40 %	0 %	18309119
109	NC_003366	AGAAA	2	10	179043	179052	80 %	0 %	20 %	0 %	18309120
110	NC_003366	AAAAT	2	10	179951	179960	80 %	20 %	0 %	0 %	18309121
111	NC_003366	CTAGA	2	10	181012	181021	40 %	20 %	20 %	20 %	18309122
112	NC_003366	TAAAT	2	10	181385	181394	60 %	40 %	0 %	0 %	18309122
113	NC_003366	AGAAA	2	10	185328	185337	80 %	0 %	20 %	0 %	18309127
114	NC_003366	AAATG	2	10	186363	186372	60 %	20 %	20 %	0 %	18309128
115	NC_003366	GTATG	2	10	186766	186775	20 %	40 %	40 %	0 %	18309129
116	NC_003366	ATGGT	2	10	190974	190983	20 %	40 %	40 %	0 %	18309133
117	NC_003366	AATGA	2	10	192023	192032	60 %	20 %	20 %	0 %	18309134
118	NC_003366	AGATT	2	10	192698	192707	40 %	40 %	20 %	0 %	18309134
119	NC_003366	TGGTA	2	10	193246	193255	20 %	40 %	40 %	0 %	18309134
120	NC_003366	AAATG	2	10	194896	194905	60 %	20 %	20 %	0 %	18309135
121	NC_003366	AATAA	2	10	194937	194946	80 %	20 %	0 %	0 %	18309135
122	NC_003366	CCATT	2	10	196610	196619	20 %	40 %	0 %	40 %	18309136
123	NC_003366	ATTAT	2	10	198334	198343	40 %	60 %	0 %	0 %	18309137
124	NC_003366	AGAAA	2	10	202468	202477	80 %	0 %	20 %	0 %	18309140
125	NC_003366	ATTAA	2	10	202607	202616	60 %	40 %	0 %	0 %	18309140
126	NC_003366	GATTT	2	10	203128	203137	20 %	60 %	20 %	0 %	18309140
127	NC_003366	ACTTT	2	10	203865	203874	20 %	60 %	0 %	20 %	18309141
128	NC_003366	TAACA	2	10	204083	204092	60 %	20 %	0 %	20 %	18309141
129	NC_003366	AGAGT	2	10	205951	205960	40 %	20 %	40 %	0 %	18309143
130	NC_003366	TGATT	2	10	210956	210965	20 %	60 %	20 %	0 %	18309146
131	NC_003366	TTATT	2	10	212746	212755	20 %	80 %	0 %	0 %	18309148
132	NC_003366	AAATA	2	10	215936	215945	80 %	20 %	0 %	0 %	18309149
133	NC_003366	AAGGA	2	10	217097	217106	60 %	0 %	40 %	0 %	18309150
134	NC_003366	TTACT	2	10	217243	217252	20 %	60 %	0 %	20 %	18309150
135	NC_003366	ATTAA	2	10	217492	217501	60 %	40 %	0 %	0 %	18309150
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137	NC_003366	TAAAT	2	10	219950	219959	60 %	40 %	0 %	0 %	18309152
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