MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 7558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003366	AGAA	2	8	693	700	75 %	0 %	25 %	0 %	18308983
2	NC_003366	ATGC	2	8	917	924	25 %	25 %	25 %	25 %	18308983
3	NC_003366	AAAT	2	8	2098	2105	75 %	25 %	0 %	0 %	18308984
4	NC_003366	AAAC	2	8	2849	2856	75 %	0 %	0 %	25 %	18308984
5	NC_003366	AAGG	2	8	2894	2901	50 %	0 %	50 %	0 %	18308984
6	NC_003366	TACT	2	8	3038	3045	25 %	50 %	0 %	25 %	18308984
7	NC_003366	AATT	3	12	3585	3596	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
8	NC_003366	AATT	2	8	3885	3892	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
9	NC_003366	GAAA	2	8	4043	4050	75 %	0 %	25 %	0 %	18308986
10	NC_003366	GATA	2	8	4841	4848	50 %	25 %	25 %	0 %	18308987
11	NC_003366	ATTA	2	8	4908	4915	50 %	50 %	0 %	0 %	18308987
12	NC_003366	TACA	2	8	5354	5361	50 %	25 %	0 %	25 %	18308988
13	NC_003366	AATG	2	8	6049	6056	50 %	25 %	25 %	0 %	18308988
14	NC_003366	ATAA	2	8	7136	7143	75 %	25 %	0 %	0 %	18308989
15	NC_003366	TTAG	2	8	7364	7371	25 %	50 %	25 %	0 %	18308989
16	NC_003366	ACAT	2	8	7727	7734	50 %	25 %	0 %	25 %	18308989
17	NC_003366	TGCT	2	8	8094	8101	0 %	50 %	25 %	25 %	18308989
18	NC_003366	TTAT	2	8	8927	8934	25 %	75 %	0 %	0 %	18308989
19	NC_003366	AAGA	2	8	8989	8996	75 %	0 %	25 %	0 %	18308989
20	NC_003366	TGTA	2	8	9352	9359	25 %	50 %	25 %	0 %	18308989
21	NC_003366	AATT	2	8	15921	15928	50 %	50 %	0 %	0 %	18308992
22	NC_003366	TATT	2	8	16443	16450	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
23	NC_003366	TTTA	2	8	16477	16484	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
24	NC_003366	TATT	2	8	16919	16926	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
25	NC_003366	AGAT	2	8	17416	17423	50 %	25 %	25 %	0 %	18308993
26	NC_003366	ATTT	2	8	17642	17649	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
27	NC_003366	GAAA	2	8	17798	17805	75 %	0 %	25 %	0 %	18308993
28	NC_003366	TGAT	2	8	18042	18049	25 %	50 %	25 %	0 %	18308993
29	NC_003366	TAAT	2	8	18099	18106	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
30	NC_003366	TTTA	2	8	18130	18137	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
31	NC_003366	ATGG	2	8	18506	18513	25 %	25 %	50 %	0 %	18308993
32	NC_003366	ATTT	2	8	18713	18720	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
33	NC_003366	TTCT	2	8	18765	18772	0 %	75 %	0 %	25 %	18308993
34	NC_003366	ATTT	2	8	18927	18934	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
35	NC_003366	TAAA	2	8	18990	18997	75 %	25 %	0 %	0 %	18308993
36	NC_003366	AATA	2	8	19608	19615	75 %	25 %	0 %	0 %	18308994
37	NC_003366	ATTT	2	8	19618	19625	25 %	75 %	0 %	0 %	18308994
38	NC_003366	AAAG	2	8	19677	19684	75 %	0 %	25 %	0 %	18308994
39	NC_003366	TAAA	2	8	20312	20319	75 %	25 %	0 %	0 %	18308994
40	NC_003366	GATT	2	8	20784	20791	25 %	50 %	25 %	0 %	18308995
41	NC_003366	AGTT	2	8	22127	22134	25 %	50 %	25 %	0 %	161485645
42	NC_003366	GATA	2	8	23133	23140	50 %	25 %	25 %	0 %	18308997
43	NC_003366	AGTA	2	8	24479	24486	50 %	25 %	25 %	0 %	18308999
44	NC_003366	ATGA	2	8	24769	24776	50 %	25 %	25 %	0 %	18309000
45	NC_003366	TATC	2	8	24914	24921	25 %	50 %	0 %	25 %	18309000
46	NC_003366	AAAT	2	8	24943	24950	75 %	25 %	0 %	0 %	18309000
47	NC_003366	ATTT	2	8	25383	25390	25 %	75 %	0 %	0 %	18309000
48	NC_003366	GAAT	2	8	25477	25484	50 %	25 %	25 %	0 %	18309000
49	NC_003366	ATAA	2	8	26191	26198	75 %	25 %	0 %	0 %	18309002
50	NC_003366	AATT	2	8	26213	26220	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
51	NC_003366	GATG	2	8	26677	26684	25 %	25 %	50 %	0 %	18309002
52	NC_003366	AGAT	2	8	27221	27228	50 %	25 %	25 %	0 %	18309002
53	NC_003366	TGGA	2	8	27418	27425	25 %	25 %	50 %	0 %	18309002
54	NC_003366	GAAA	2	8	27563	27570	75 %	0 %	25 %	0 %	18309002
55	NC_003366	GCAG	2	8	27732	27739	25 %	0 %	50 %	25 %	18309002
56	NC_003366	GAAA	2	8	28341	28348	75 %	0 %	25 %	0 %	18309002
57	NC_003366	AGAT	2	8	28743	28750	50 %	25 %	25 %	0 %	18309002
58	NC_003366	CCTT	2	8	28875	28882	0 %	50 %	0 %	50 %	18309002
59	NC_003366	TTTA	2	8	28895	28902	25 %	75 %	0 %	0 %	18309002
60	NC_003366	TAGA	2	8	28913	28920	50 %	25 %	25 %	0 %	18309002
61	NC_003366	TAAA	2	8	28997	29004	75 %	25 %	0 %	0 %	18309002
62	NC_003366	CAAG	2	8	30278	30285	50 %	0 %	25 %	25 %	18309003
63	NC_003366	AGAA	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	18309003
64	NC_003366	TAAA	2	8	31206	31213	75 %	25 %	0 %	0 %	18309003
65	NC_003366	CTTA	2	8	31408	31415	25 %	50 %	0 %	25 %	18309003
66	NC_003366	ATTT	2	8	31795	31802	25 %	75 %	0 %	0 %	18309003
67	NC_003366	ATAA	2	8	31952	31959	75 %	25 %	0 %	0 %	18309003
68	NC_003366	ATTA	2	8	32290	32297	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
69	NC_003366	GGAT	2	8	33205	33212	25 %	25 %	50 %	0 %	18309003
70	NC_003366	ATAA	2	8	33269	33276	75 %	25 %	0 %	0 %	18309003
71	NC_003366	ATTG	2	8	34039	34046	25 %	50 %	25 %	0 %	18309004
72	NC_003366	TTCT	2	8	34370	34377	0 %	75 %	0 %	25 %	18309004
73	NC_003366	GAAA	2	8	35033	35040	75 %	0 %	25 %	0 %	18309005
74	NC_003366	AGAA	2	8	35956	35963	75 %	0 %	25 %	0 %	18309005
75	NC_003366	AAAT	2	8	36204	36211	75 %	25 %	0 %	0 %	18309006
76	NC_003366	TAAT	2	8	37157	37164	50 %	50 %	0 %	0 %	18309006
77	NC_003366	TGCT	2	8	37583	37590	0 %	50 %	25 %	25 %	18309007
78	NC_003366	ATTT	2	8	37628	37635	25 %	75 %	0 %	0 %	18309007
79	NC_003366	TAAA	2	8	38308	38315	75 %	25 %	0 %	0 %	18309007
80	NC_003366	ATTT	2	8	38512	38519	25 %	75 %	0 %	0 %	18309007
81	NC_003366	TTGT	2	8	38906	38913	0 %	75 %	25 %	0 %	18309008
82	NC_003366	TAAT	2	8	39532	39539	50 %	50 %	0 %	0 %	18309008
83	NC_003366	ATTT	2	8	40132	40139	25 %	75 %	0 %	0 %	18309009
84	NC_003366	TTCT	2	8	40372	40379	0 %	75 %	0 %	25 %	18309009
85	NC_003366	ACTA	2	8	40543	40550	50 %	25 %	0 %	25 %	18309009
86	NC_003366	ATTT	2	8	40788	40795	25 %	75 %	0 %	0 %	18309009
87	NC_003366	CTAT	2	8	41373	41380	25 %	50 %	0 %	25 %	18309010
88	NC_003366	TCTT	2	8	41391	41398	0 %	75 %	0 %	25 %	18309010
89	NC_003366	CTTA	2	8	42008	42015	25 %	50 %	0 %	25 %	18309010
90	NC_003366	TAAA	2	8	43667	43674	75 %	25 %	0 %	0 %	18309012
91	NC_003366	CTAC	2	8	43850	43857	25 %	25 %	0 %	50 %	18309012
92	NC_003366	TAGA	2	8	44393	44400	50 %	25 %	25 %	0 %	18309012
93	NC_003366	ATGT	2	8	44667	44674	25 %	50 %	25 %	0 %	18309013
94	NC_003366	GTAA	2	8	44888	44895	50 %	25 %	25 %	0 %	18309013
95	NC_003366	ATAA	2	8	45542	45549	75 %	25 %	0 %	0 %	18309015
96	NC_003366	GAAG	2	8	46013	46020	50 %	0 %	50 %	0 %	18309016
97	NC_003366	CCTA	2	8	46584	46591	25 %	25 %	0 %	50 %	18309016
98	NC_003366	ATGA	2	8	47510	47517	50 %	25 %	25 %	0 %	18309017
99	NC_003366	TATT	2	8	47586	47593	25 %	75 %	0 %	0 %	18309017
100	NC_003366	TACT	2	8	47773	47780	25 %	50 %	0 %	25 %	18309017
101	NC_003366	TTGA	2	8	48235	48242	25 %	50 %	25 %	0 %	18309017
102	NC_003366	AAAG	2	8	48594	48601	75 %	0 %	25 %	0 %	18309018
103	NC_003366	CATG	2	8	48805	48812	25 %	25 %	25 %	25 %	18309018
104	NC_003366	GAAA	2	8	49142	49149	75 %	0 %	25 %	0 %	18309018
105	NC_003366	AATT	2	8	50144	50151	50 %	50 %	0 %	0 %	18309019
106	NC_003366	AATA	2	8	50312	50319	75 %	25 %	0 %	0 %	18309019
107	NC_003366	TAAG	2	8	50515	50522	50 %	25 %	25 %	0 %	18309019
108	NC_003366	AGAA	2	8	50531	50538	75 %	0 %	25 %	0 %	18309019
109	NC_003366	TAAA	2	8	50866	50873	75 %	25 %	0 %	0 %	18309019
110	NC_003366	AAGG	2	8	51445	51452	50 %	0 %	50 %	0 %	18309020
111	NC_003366	AAAG	2	8	51472	51479	75 %	0 %	25 %	0 %	18309020
112	NC_003366	TAAA	2	8	51517	51524	75 %	25 %	0 %	0 %	18309021
113	NC_003366	AGAT	2	8	51991	51998	50 %	25 %	25 %	0 %	18309021
114	NC_003366	ATTT	2	8	53537	53544	25 %	75 %	0 %	0 %	18309023
115	NC_003366	ATTT	2	8	53694	53701	25 %	75 %	0 %	0 %	18309023
116	NC_003366	AGAT	2	8	53973	53980	50 %	25 %	25 %	0 %	18309023
117	NC_003366	TTAG	2	8	54091	54098	25 %	50 %	25 %	0 %	18309023
118	NC_003366	GAAA	2	8	54152	54159	75 %	0 %	25 %	0 %	18309023
119	NC_003366	CAAT	2	8	55044	55051	50 %	25 %	0 %	25 %	18309024
120	NC_003366	TTAT	2	8	56424	56431	25 %	75 %	0 %	0 %	18309025
121	NC_003366	CTTG	2	8	56736	56743	0 %	50 %	25 %	25 %	18309025
122	NC_003366	CTTA	2	8	57020	57027	25 %	50 %	0 %	25 %	18309025
123	NC_003366	TCTT	2	8	57625	57632	0 %	75 %	0 %	25 %	18309026
124	NC_003366	ATTT	2	8	58136	58143	25 %	75 %	0 %	0 %	18309027
125	NC_003366	ATTT	2	8	58757	58764	25 %	75 %	0 %	0 %	18309027
126	NC_003366	TTTA	2	8	59060	59067	25 %	75 %	0 %	0 %	18309027
127	NC_003366	AATA	2	8	59133	59140	75 %	25 %	0 %	0 %	18309027
128	NC_003366	AAGA	2	8	59471	59478	75 %	0 %	25 %	0 %	18309027
129	NC_003366	AAGC	2	8	59821	59828	50 %	0 %	25 %	25 %	18309028
130	NC_003366	CAAT	2	8	59851	59858	50 %	25 %	0 %	25 %	18309028
131	NC_003366	GAAA	2	8	59930	59937	75 %	0 %	25 %	0 %	18309028
132	NC_003366	AAGC	2	8	60022	60029	50 %	0 %	25 %	25 %	18309028
133	NC_003366	GTTA	2	8	61021	61028	25 %	50 %	25 %	0 %	18309030
134	NC_003366	AGTA	2	8	62429	62436	50 %	25 %	25 %	0 %	18309032
135	NC_003366	TTAT	2	8	62605	62612	25 %	75 %	0 %	0 %	18309032
136	NC_003366	TAGA	2	8	62653	62660	50 %	25 %	25 %	0 %	18309032
137	NC_003366	TTTA	2	8	62688	62695	25 %	75 %	0 %	0 %	18309032
138	NC_003366	TTAT	2	8	63775	63782	25 %	75 %	0 %	0 %	18309035
139	NC_003366	GGAG	2	8	63957	63964	25 %	0 %	75 %	0 %	18309035
140	NC_003366	ATGA	2	8	64180	64187	50 %	25 %	25 %	0 %	18309035
141	NC_003366	AGTT	2	8	64248	64255	25 %	50 %	25 %	0 %	18309035
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